Tetrahymena thermophila: TTHERM_00259670
Help
Entry
TTHERM_00259670 CDS
T01020
Name
(RefSeq) von willebrand factor type A domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
VWA_2
RHD3_GTPase
MMR_HSR1
Dynamin_N
Ycf15
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7846116
NCBI-ProteinID:
XP_001009013
TGD:
TTHERM_00259670
UniProt:
Q22UB9
LinkDB
All DBs
AA seq
2411 aa
AA seq
DB search
MQKTDNQNQNLLGILQNFLQEHSPERDLSINIMEDLDQNQSFYMNDLIEFKNFISKHIEK
FQNDINCDQQIRDLYKNCQNFYLINSSIGKCNKLPSQEEEEKKEDFDSIEKEKLKEQIKI
KDEFVRFCKECDFESIVQKQTDLESDATKIFEESRDQILNDNFKEIQHLTDIGSKIRKNI
IQKYEESNLKQMVIKYKQWQQTLLDSNNQTNDYDESLLINLLKENIEEFKEQDDNQLKLM
VKEMKEKGYQSTLYCQFIQDRDRVDKIIYETHLKSPFLNLKTNKVCQFYFLSLGISETES
QDLIDSYFFKLPNCQMNEEQIERLKLIEQHIQENQLVRDYIEKILNLSIRNEIQLQFSNI
QINDQFLKEKLINSECSEDQFQKLINQYQLDKTHPXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXKLQNLENYYIQLLLFACSHNDETKLKLISFILKKVLLKHQLESEQIQYLSKQ
ILKTGLKFIYQLNDQEYNRTNNKSKIDIEEKLKKSELLKKVYGGDLYEIQDKSVCFYLDF
DKQFELQNKLDKLFQVSQKIDINQLLNYHNSQEKTTSIKNWVEEIADLYISGDLSFSQRL
FDLLIYLSKRNQNLDSIYKDIQDNIKLKKQEKDDKILINKKTVPEYMMQSSDSESMFKLT
IMLGFANPVPLLITRIVPPSQNNSYKLQQELFYQSFWLINQFDKVVASIGVGFQKGKSTL
INNTFITNFAISDGTYSFMQSAEIQSNSIFQQNKRQYFLADFHGDASLLNEQYILGFFVY
YIIQVNASIFKNKQTESLLKIIKLLEENDKKFCILIRDYDEKINASQYKDIKLASEKLEY
PDLKKYDTILLNNFCNIYQQDLDLHCNQLRIVINDLIIKNLGQQNSRDLFINRFFSQFQK
QPDQIYNNFNKELEQKGEEIAAAAQIYYSYQLVQNVCNQLKNQKQLESQNIFKLYNVFSE
YQKIKMEFNHGKFQSMSQKQVSERNSQYESKYFEYKKSQIEDKSELVKQFEQLVIDNNKN
HYMSMLFFIQQLRDVNNYYINQLKNKKIVLQQSQTIQQNDISKQIYEIEKQILDESISVE
LFWREVIQHWYKSNNSSLNEKLIEAYSLNIYNGFPFEIIDGETFYYPYEFLKKCFSHQLF
TNKKFCIISIIGPQNSGKSTLLNYFLGCDFYVSEGRCTRGIYGTLVKSKVPQFDYILVID
SEGLLSQEKKDPDYDRKLTLFCLSVSQFLIINVKELTTEISNILELCIDVSTDLKTNKIP
KKVVEIVFNQKGDPNNQNNCVAVENALKNFQDKKKIIDHIDIKSKNVTNLPTAFSYKHKV
VQNDQVWNFLETQINFVEGVQKLGDKIIDKLINLCQEDEKQAFRLVKTIPEFLELMNNIY
ETINQNQDLTAFRDILQKQNDKRIKEFMKKKMNDEIDETFLKEIDSITQNNQIKNVDSQI
KDLFDCLEQKIKKKMQEEFQIEQELLNKNFDYLHLKLQTLLENTINDIEFGKQIKNLEEF
INKKTLELLSQAEQQKNNSQEEQIEYFEEKLHEIEQIVQKNSQLNNIDVLFSFIKDNYEL
QLGKQFTTKIIQNYQFDFDLQETLHKKTSLIHFLETKDHLLNCQKKDNEIINHQLLQQIY
EIFYIRLDYLKKYLDFTSNQIKPNFLKNACNITINKKNLNSILFEDLYKYIDMNFELKDI
ISKEKEQKRINQISFQTQSSIYTFKEHQIEQKTNIFDDQSKNLIELKLKDITNNVLSQWL
KTQLQANFNCNILKIDSYFSRINQKINQAINNRTNVDRQLISEVANIVQDEIKQSQEQLR
FYQIQLSEISIHFLNNMAIQELYKFQLQNQQNKLNNIIDQNFSADKKQSLKGKFLENAKD
KDKQLLNEFIQNLQMLSKRYLDSNSKIVINKNLEIYKDSLSKEDIVKEIQQKIYQKQDFS
LDQIDTYLEDPNKVIIDTALSKQNEFVKYVSYQLSEIQNELFKTLKAILNQTNQTIEFLM
GEEQIKNNETPKLFIDNIFQILSNKQVNIDQNTFDQAYSLQLKNQKDIQFFKEFWDITQQ
SSFYSIEQIKLIFSQLKITIQDKIFQEEIIKAYAVDLIDKEFSNITQYLSCNSKCPCCGQ
PCDQDHWKYLYDRIGTGENKHTAKNGHRFAAFNGVKIEQENLPALIMCSDYDDETQFKYK
QTQLKWSNFKKMNDDWDWNKEVQNQKLQLQRLTYQKIWSIVGQKICNKNNIQYQEICDAS
IIKKCKSQINPVHFIIVFDESGSMEGEKWITLRKELLNFIDNRSRATAQDFITLIGFAHT
VKLYTKVEKLNEQIKQKVPQEFMDGGTNYSAPLQQALNILSQEQCQTFKKNNVIFFLSDG
DAKEPKTEIQQLQKLGHLIKLIQFVGYGDENFQTLKSMANDLQNVEASYSNVINIDTLQD
ELKYLSLIIPS
NT seq
7236 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtaaaaaactgataatcaaaatcaaaatcttttaggtattctttagaattttttgcaa
gaacattcacctgaaagagatttaagtataaatataatggaagatttagattaaaattaa
agtttttacatgaatgacttgattgaattcaaaaattttatttctaagcatattgaaaaa
ttttaaaatgatattaactgtgactaataaataagagatctttataagaattgctagaat
ttttatttgataaactcaagtattggcaaatgtaataaattaccttcttaagaagaagaa
gaaaaaaaagaagatttcgattctatagaaaaggaaaaattaaaagaataaataaaaata
aaagatgagttcgtaaggttttgcaaggaatgcgattttgaatctatagtataaaaataa
acagatttagaaagtgatgccacaaaaatttttgaagaatcaagagactaaattttaaat
gataattttaaagaaatttaacatctcaccgatattggaagtaaaataagaaagaatata
atacaaaagtatgaggaatctaatttaaaataaatggttattaaatataaacagtggcag
taaacccttttagattcaaacaattaaacaaatgattatgatgaaagcttattaattaac
ttattaaaagagaacatcgaagagtttaaggagcaagatgataactaactaaaattaatg
gtgaaagaaatgaaagagaaaggttattaatctacactttactgctaattcatataagat
agagatagagttgataaaataatttatgaaacccatctaaaaagtccattcctaaattta
aagactaacaaggtttgctaattttactttttaagtttgggtatttctgaaacagaaagt
taagatttaattgactcatacttttttaaattaccaaactgctagatgaatgaagaataa
atagaaagactcaaattaatagaatagcatatataagaaaatcaattagttagagattac
attgaaaaaatattaaatttaagcataagaaatgaaattcagctctaatttagtaatatt
cagatcaatgatcaatttttaaaagaaaaacttatcaattctgaatgttctgaagattag
ttctaaaagttaattaatcaatattaattggataaaactcatccnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagctataaaatctagaaaattactacatttaactg
ttactctttgcatgttcacataatgatgaaaccaaattaaaattaatatcattcattcta
aaaaaagtattgttaaaacatcaattagaaagcgagtaaatttaatatttgtcaaaataa
atcttaaagacaggcttaaaatttatttactaactgaatgatcaagaatacaataggaca
aataataaatctaaaattgatattgaagaaaagctaaaaaaaagtgaattgttaaagaaa
gtttatggaggagacctttatgaaatataagataaaagtgtatgcttttatttagatttc
gacaaataatttgaactttaaaataaactagataaattattctaagtgagttaaaaaata
gatatcaaccaattattaaattatcacaattcataagaaaaaacaacatcaataaaaaat
tgggttgaagaaatagctgatttatacatttcaggagatctgagcttttcttagagactc
tttgacctcttaatatatttatctaaaagaaatcaaaatcttgatagcatatacaaagac
atataagataatattaagcttaaaaaataagaaaaggatgataaaatcttaattaacaaa
aaaactgtaccagaatatatgatgcaatcatctgactctgagtctatgtttaaacttaca
ataatgctaggatttgctaatcctgtgcctttactaattactagaatagtacctccttct
taaaataattcctataaattgtaacaagaacttttttactaatccttttggttaatcaac
taatttgataaagtagttgcttcaattggtgtaggattttagaaaggtaaatctacactt
ataaataatacttttataactaattttgctattagtgatggtacttatagctttatgtag
agtgctgaaatttaatctaatagcattttctaatagaataaaagataatattttttagct
gattttcatggtgatgcaagtctcttaaatgagtaatatattttaggtttctttgtttat
tacataatataagtcaatgcaagtatctttaaaaataaataaactgaaagtctacttaaa
attataaagttattagaagaaaatgacaaaaagttttgtattctaatacgcgattatgat
gaaaaaataaatgctagttagtataaagatataaaattagcctctgagaaattagaatat
cctgatctaaaaaaatatgatactattttacttaataacttttgtaatatatattaataa
gacttagatttacactgtaattaattaagaatagtaataaatgacctaataataaaaaat
ttaggataataaaattcaagagatttatttataaacagattcttctcttaattttaaaaa
taacctgattaaatttataataatttcaataaagaattggaacaaaaaggagaagaaata
gcagcagcagcttaaatctattactcttattaattggtataaaatgtttgcaattaactt
aaaaactaaaaatagttagaatcttaaaatatattcaagttgtataacgttttttcagag
taccaaaaaataaaaatggaatttaatcatggcaaattttaaagtatgtcataaaaataa
gtgagtgaaagaaactcataatatgaatctaaatattttgaatataaaaaatcttaaatt
gaagataagagtgagcttgtaaaataatttgaataattagtaattgataataataaaaat
cattacatgtcaatgctctttttcatataatagttaagagatgtgaataattattacata
aatcaattaaaaaataagaaaatagtactttaataaagctaaacaattcaataaaatgat
atttcaaaataaatttatgaaatagaaaaacaaatattagacgaatctatttcagttgag
cttttctggagagaagtcatataacattggtataaatcaaacaacagttctcttaatgag
aaattaatagaagcttattcattaaatatttataatggattcccttttgaaataattgat
ggagaaacattttattatccatacgaattcttaaaaaaatgcttttctcattaattattt
acaaataaaaaattttgtatcataagcataataggaccacaaaattcaggtaaatcaacc
ttattgaattatttcttaggatgtgacttttacgtgagtgaagggagatgtacgagagga
atatatggcactctcgtaaagtcaaaggtaccatagtttgactacatattagtaattgat
tctgaaggtcttttatcataagagaaaaaagatccagattatgacagaaaactaactcta
ttctgcttatcagtgagctaattcctaatcattaacgttaaagagctaacaacagaaata
agtaatatattggagctttgcattgatgtctcaactgatttaaaaactaataaaatacct
aaaaaagtagttgagatcgtttttaattaaaaaggggatccaaataactaaaacaattgt
gtggcagtagaaaatgctctgaaaaatttttaagataagaaaaaaataattgatcacata
gatattaaaagtaaaaatgttactaatttgccaacggcattttcatataagcacaaagtt
gttcagaatgactaagtatggaattttttagagacttaaatcaattttgttgaaggcgta
taaaaattaggagataaaattattgataagttaataaatctttgctaagaggatgaaaag
taagcatttaggttggttaagaccattccagaatttcttgagttaatgaataacatttat
gaaaccataaattaaaatcaagacttaacagccttcagagatattttgcagaaataaaat
gataaaagaataaaagagtttatgaagaagaaaatgaatgatgaaatagatgaaacattt
ttaaaagaaattgatagcattacctaaaataatcaaattaaaaatgttgatagttaaatc
aaggatttatttgattgcttagaataaaaaataaagaaaaaaatgcaagaagaattttaa
attgaataagaattattaaataaaaattttgattatttgcatttaaagctgtaaactctc
ttggaaaacacaataaatgacattgaatttggcaagcaaataaaaaatttggaagaattt
atcaataaaaaaacacttgagttactgagctaagcagagtagtaaaaaaacaacagttaa
gaagaatagattgaatattttgaggaaaagcttcatgaaatagaataaattgtttagaaa
aattcacagttaaataatatagatgtgctattttcttttatcaaagacaattatgagttg
taattaggaaaacaatttactacaaaaataatccaaaattattaattcgattttgatcta
taagaaactttacataagaagactagcttaatacattttttagaaactaaagatcattta
cttaattgttaaaaaaaggataatgaaataattaatcattaacttttataataaatttat
gaaatattttatatccgattagactatttaaaaaaatatttagattttacaagcaactaa
attaaacctaattttttgaaaaatgcatgcaatattacaataaataagaaaaatcttaac
tcaatattatttgaagatttgtataaatatattgatatgaattttgaattaaaagatatt
atatcaaaagaaaaagagtaaaaaagaattaatcaaatttctttttaaacttaaagttca
atttacacatttaaagaacattaaattgagtaaaaaacaaatatctttgatgattaaagt
aaaaatttaattgaactaaaattaaaagatattacaaataatgttctaagctaatggttg
aaaactcaactttaagctaatttcaattgtaatattcttaaaattgattcctatttcagc
agaattaattaaaaaataaattaagctatcaataatagaacaaatgtagatagacagtta
atttcagaagtagcaaatatagtttaagatgaaattaaataatcttaagagcaattacgt
ttttatcaaattcaactatctgaaatttcaatacattttttgaataatatggctatttaa
gaattatacaaatttcaattacaaaactaataaaacaaacttaataatattatagattaa
aattttagtgctgataagaagtaatctctaaaaggaaaattcttagaaaatgcaaaagac
aaagataaatagctgcttaatgagtttatacaaaatttataaatgctctctaaaagatat
cttgattcaaattctaaaatagtaataaataagaaccttgagatttataaagactctctt
tctaaggaagatattgttaaagaaatataataaaaaatttatcaaaaataagattttagt
ttagactaaattgatacctatctcgaagatccaaataaagttataattgataccgcttta
agcaaataaaatgaatttgtgaaatatgtgagttattaactatctgagatttaaaatgag
ttatttaaaacattaaaggctatcttaaattaaacaaaccaaacaattgaatttttaatg
ggtgaagaacaaataaaaaataatgaaacacctaaattatttatagataatattttttaa
atcctatcaaataaacaggttaatatagattagaatactttcgatcaagcttatagctta
taattaaaaaattaaaaagatatttagttttttaaagaattttgggatataacataatag
tcatccttttactctattgaataaattaagttaattttcagttaattaaaaattacaata
caggataaaatattttaagaagaaattataaaagcctatgctgtagatttaattgataaa
gaattttcaaatattactcaatatttatcatgtaattccaagtgcccttgttgtggttaa
ccatgtgatcaagatcactggaaatacttgtatgataggataggtactggtgaaaataaa
catacagctaagaacggtcataggtttgcagcctttaatggagtaaaaattgagtaagaa
aatttgccagctcttattatgtgttctgattacgatgatgaaacataattcaaatataag
taaactcaattaaaatggagtaatttcaagaaaatgaatgatgattgggattggaataag
gaagtttaaaattaaaagctataactttaaagattgacatactaaaaaatttggtcaata
gtaggacaaaaaatttgcaataaaaataatatatagtactaagaaatatgtgacgcttca
attataaaaaaatgcaagtcataaattaatccagttcattttataattgtttttgatgaa
agtggaagtatggaaggagaaaagtggattactctgagaaaagaactattaaattttata
gacaacagaagcagagctacagcataggattttatcactcttattggttttgctcatact
gtaaagctgtatacaaaagtagagaaattgaatgagtaaattaaataaaaagttcctcag
gaatttatggatggaggtacaaattattctgctccactttagtaagcattaaatatttta
agctaagaacagtgttaaacttttaagaaaaacaatgttatatttttcttatcagatggt
gatgcaaaagaacctaaaactgaaatacaacaactctaaaaattaggtcatttaattaaa
ttaatatagtttgttggctatggtgatgaaaatttttaaactctaaaatctatggcaaat
gatctttaaaacgtagaggcttcttattcaaatgttattaatatcgatacattacaagat
gaattaaaatatctttccttaattattccaagctga
DBGET
integrated database retrieval system
