Tetrahymena thermophila: TTHERM_00275930
Help
Entry
TTHERM_00275930 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Ephrin_rec_like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7842795
NCBI-ProteinID:
XP_001016031
TGD:
TTHERM_00275930
UniProt:
I7MJ41
LinkDB
All DBs
AA seq
2719 aa
AA seq
DB search
MQIIIQKKALIVIAFQVKCCKKIITKYLTIRNKQSQIQTYLQIQMSQGKVRVCFLMINKQ
QLMQVRMYFTFMIVSQVTQITCTTLMVTQWILSSQVKIYQYLARIKYQTITSQNIQFNQS
VNMTCHSIKLALTLQQVYKILFIYTILLKQCQQNQTSCKCSNKARQYTPSQPYRALFFQF
YLIKFIYKMMKMICKFLLFQIKVCKSSINLILHNTFFYLARIVVKLFLFMMELTLLFMTQ
IYYNLFAKALLSIMILFYCYMHKSKLQQCKIVRQVYSIWIQCKQLNNYKILIFQIQKNSI
TITYYKSSSLNKRIIKQIQFLVLILTLDKQNKSQTQTAKQIKIIYLFNFNIFKNQFKQEL
VIILNDMKTNTFYSITPNGLNKISLFVEKYDFYQITFDDNEYPYCDFDMDRNTMYLMAYY
CIIRNQYFIQIINILNNSIQLNYSETGYDYYDLTIIPLININSIAVIKKIGFKIVDLTLQ
ISIFDLNFSTKNQSYLKFNFFHYLEDTKQIIYSYDNTVEVHQYNSSGFNKVCQFSCDASQ
VFTDFINIQKQEDIIYLLSKSTQVEIFIPLIQIIYQFNIASCALKNSGQLFKSDNPFLFY
QDQQLENLSQQIILYTQSQILAVSFSGQGFSQSVYQYSSIFVGKDVFYLLYNDVLVNYSR
LQDKLGDQLTSIVLHSVPLYVRQSEDKIYIISSSMIEVYDTVLKKGLLQIKSSFQIQNVF
TLADQSSILLISPFIDFAIFDINTQAFVQQLKFSSIQQIPTSIKYFSSINVLIIICQNVM
YQIDLNYIFDFQKSVQMQNFYTIIAEQPQQIYSQINSIQHVSIYLFDTKQILWWFNQQNK
FQIIATFYGENLVQYLMNGESNSILLGLRSYFAFIYNNNQQTLMRNESLSGIDILCQNRY
FVLQEQRKNIYEIVANSSTFNSQLYYSIDQNDDTTISYFLVFSDYLTIVYTNKNQLMANN
TLIYDFSQYFQKDDNLTFVDLILADGKQNCFAVSFNSYFFIYYYSTSVNDQTINLAFYQI
YSSINNLDNGFIIDKLLMFQNTVYFTISYNRVCVAYSLPTQIINSPKALQGLDPNIIYST
KVSHLEYLNFTNKFYQSLQKSLLIAPCSDKNKKIFVNNYVSILFCKYSMNVYLKNNNMFV
FSQVYQMFGLIEIFNIQNTNLLILRSNDEMHVLLYSIPDQTLILQKIIEQNTDKIVQLNL
IDGIQKGNGKNQITPNSVINVQAILQYDVISFQIVLSLYYDQQGSYLNIMSNTVNSLTCY
QNYDTGMSTDIVSNQIQETYNNLNYIGQFYQISSIFLKLPTSGQQQIKKQKLDQIINQTL
DYNKFSNEFTFYSPNLEDTQTQSLQRFFNYNISSLKMKNIPINLSNKTEIKSQFIIDSLI
MEQLYIKHILNFSKVSLSNMSTLIITDMTIENLKFITNQLFLFQNITTILLKNIVIRNIS
GFTQSLFTIKETTKITIDGLYIADINHFDFKSIFNINNSIELQMNNITIRNISSKSEQST
IFNTSIINQQTITALEAENLLNIVIHQSVNYDQEYDMLQILQKDVFSYFQLRINNCTQNY
SLFNVMSNQCLFYSCQVSNILSKDSLGSFLVFQGGQISIIQSNFTNNTAKEGGSIYLFNS
QVNNVIKDSYFTHCKALGRGGAIYLDTTFIQIKDTYFTSCSSLIGGSIFYNSYRPQIFIQ
NKIQTSYPFQGFSNNSAQIYGQNIGSYPAEFYIIDGQSQENNKIVQSDNNYFLGNLRSGE
VVSFQIQIVDEENNPITIRQDYQTAYPAFINQMILEFSIKIQIANPVNNDIEISDQTYAD
ISNYVHQTKTWSFTNLKITSSTDYQSSQKIGVIQIVCYGVKKNNDLGKLLDQDYSKNLSI
SFRQCKKGEVLNARNGISECIPCPNGFFSMDQPVASQFIECKPCPQEAYECEKDQIYLKQ
GYWRNNNSLNIYYCNNRPENCEGSLKGNRNYCSEGFVGALCESCDSYGSVWGQKYMKMGQ
FNCVPCVDAKSYYFIFPIIIFLILIVFYVVFSINNAIKISKQLSQAYYFKKIGIFNLGRS
SLRILSPFLAKQLMHFLQISGLINSYKLALPSFFVVLTNVISQPITNFQYVLDCFFVPDQ
HSQLQSDGDSSAHQTTNTTIPLVFMRAIWNLCIPFIILLLVSIVYSILFCIKAVQYKHFY
AYNGVFFLMIFLQPNIVSSLISVVSCKTIDGISYIKSDSNYQCYTYEHVKYSLLILLPTL
ILWAFIIPLFILSRLIIQRNNLESISTRLKFGFLYQEFKSKYFYWEFIKSYKKILLVIIY
NFGQDFFYLKSCLMLLVLFIYYLSILKRSPYQLNSFNKTDQNLIICMLFILIMNIILQDT
NIYWITVTGEFFTALFTIFIICFLIIQILYQKIYSIIPHKIYSIQMFLKAKLPLILFWVQ
PKKPLNAMRAFKNWKKVKNILLTKGVFKQNERETNQNQRQSTSLANQNKPQNDNSQQNQQ
VQIIKQIQQIQAFTPKNNQQKQKKGSNKPIQLESSSSQELSNSDISSSEQSKNEQKTTYK
KQKKQNKQGNIKQITNNVFISDYQDIYQNHSNTLNINDINSQNQFHFASSNQLSTSNNFH
QQKGLQMLSNSTDKGHFKKIMNGESIDTSQIDMCKLLNVYPSILNHRQDLVEASQISHIN
FEQNNSPSLINSNTDLNNKTIQRSYFQKNINLDKQEQNQEQNTQVKSEDSNNQQNQTTAQ
NKINDNNDNNNLIVFDESE
NT seq
8160 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtaaataataatttaaaaaaaagctttaatagtaatagcattctaagttaaatgctgc
aaaaagataataactaaatacttaactatcagaaataaataatcacaaatataaacgtat
ctatagatttaaatgagctaaggaaaggtaagagtatgttttctgatgataaacaaatag
taattaatgtaggttagaatgtattttacttttatgatagtgtcttaggtaacttaaatc
acttgtacaactttgatggtaacatagtggattttgtcgtcacaggtcaaaatctattaa
tacttagctcgaattaaatattaaactataacatcttaaaatattcaatttaactaatca
gtcaatatgacttgtcattcaatcaagctagctttaactctatagtaagtatataaaatt
ctatttatttatacaatcctactcaagtagtgctaataaaattagacttcctgcaaatgc
agtaacaaagctagataatatactcctagttaaccatatagagcactattcttttagttt
tatttaataaaatttatttataaaatgatgaaaatgatatgtaaatttttactattttag
atcaaagtttgtaagtcatcaataaatttgattttacataatactttcttctatttagct
cggatagtggttaagctattcttgtttatgatggaattaactctactatttatgactcaa
atttattataacctatttgctaaagctttgctttcaattatgatcctattttactgttat
atgcataaaagtaaattatagtaatgtaaaatagtaagataagtatattcaatttggatt
taatgtaagtaattaaataattacaaaattcttattttttaaatttagaaaaattctatt
acaataacatattataaaagctcatcattaaataaaagaataataaagtaaattcaattt
ctagtgttaatcttaactctggataagtagaataagtcataaacttagacagccaagtaa
ataaaaattatctatctttttaattttaatatctttaaaaattaatttaaataggaatta
gttatcattttaaatgatatgaaaacaaatactttttactctataacaccaaatggatta
aataaaattagcttgtttgtagaaaaatatgatttttattaaatcacctttgatgataat
gaatatccatactgtgatttcgatatggatagaaataccatgtatttaatggcttattac
tgcataattagaaactaatactttatttaaattattaatatcctaaataactctatttag
ttaaactatagtgaaactggatatgattactatgatttaacaatcatacccttgatcaat
attaattcgattgctgtaatcaaaaaaattgggtttaaaatcgttgatttaaccttataa
atttctatttttgatttgaacttctcaactaaaaattaatcttatttaaagtttaatttt
tttcattatcttgaagatactaaacaaataatttacagctatgataacacagttgaggta
cattaatataatagttctgggttcaataaagtttgttaattttcttgtgatgcgagctaa
gtatttactgattttattaatatataaaaataagaagacataatctatctgctttctaaa
tctacataagttgaaatattcattccgttaatatagataatttattaatttaatatagca
agctgtgctctcaaaaatagtggatagcttttcaaaagcgataatccttttttattttat
caagactaataattagaaaatcttagttaacaaataattctttatacataatcttaaatt
ttagctgtaagcttttctggataaggattctcttaatcagtctactagtattcctctatt
tttgttggcaaagatgtattttacttactttacaatgatgtattagtaaattattcaaga
ttgtaagataaattaggtgattaattaacatcaatagttttacattctgttcctctctac
gtcagataatcagaagataaaatttacataatttcttcaagcatgatagaagtatatgat
actgttcttaaaaagggtttactacaaataaaatcttctttttagattcaaaatgttttt
actttagcggactaatcttcaattcttttaatttctccttttattgattttgctattttt
gatataaacacttaagcattcgtatagtagcttaagttttcctcaatacaacaaatacct
actagcataaagtatttttcctctataaatgttttaattatcatttgttaaaatgtaatg
taccaaatagatttaaattacatatttgattttcaaaagagtgtttagatgtagaatttt
tatacaattattgctgaatagcctcaataaatttactcctaaatcaatagcatctagcat
gttagcatatatctttttgatactaagtaaattctatggtggtttaattaataaaataaa
ttttagattattgcaactttttatggagagaacttggttcaatatttaatgaatggagaa
tcaaatagtattttacttggactaagatcttattttgccttcatttataataacaatcaa
taaactctaatgagaaatgaatcactatcgggtattgatatcttatgccaaaatagatac
tttgtgcttcaagaataaaggaagaatatctacgagatagtagctaattcaagcacattt
aatagttagctatattattccattgatcaaaatgatgacacaactataagctactttttg
gttttttctgattatctaactattgtatatacaaataaaaactaattgatggcaaacaat
actttaatttatgacttcagtcaatacttttagaaagatgataatttaacatttgtagat
ttaatattggctgatggaaaacagaattgttttgctgtttcttttaatagttattttttt
atttattattacagcacatcagttaacgattaaactatcaatctcgccttttatcaaatt
tattcatccatcaataacttagataacggatttatcatcgataagctgcttatgttttaa
aatactgtttactttacaatatcatataatagggtttgtgttgcttattctttacctaca
taaattataaatagcccaaaggcattatagggattagacccaaatattatttattctact
aaagtttcgcatttagaatatttaaattttactaacaaattttaccaatcgttacagaaa
tcattattaatagcaccatgcagtgataaaaataagaaaattttcgttaacaattatgta
agcattttgttctgcaaatactcaatgaatgtttacttaaaaaataataatatgtttgta
tttagctaagtttatcaaatgtttgggttaattgaaatattcaacattcaaaatacaaac
ttactgattttgcgatctaacgatgaaatgcatgttcttctatattctattccagattaa
acattgattttacaaaagataattgagtaaaatactgataaaattgtttaacttaacttg
atagatggtattcagaaaggaaatggaaaaaattaaataacaccaaactctgtaataaat
gtctaagcaatactttaatatgatgttatttcttttcagatagtactgtcattatactat
gattaataaggctcttacttaaatattatgagtaatacggttaattcgcttacttgctat
taaaattatgatacaggtatgtcaactgatattgtaagcaattagatttaagaaacttac
aacaatttaaactatataggctaattttattaaatatcttcaatatttttaaaacttcca
acttcaggataataacagattaaaaagtaaaaactagatcaaataataaattaaactcta
gattataataaatttagtaatgaatttactttttattcacccaatttagaagatacttaa
acatagtcattacaaagattctttaattacaacatatcatctctaaaaatgaaaaacatc
ccaattaacttatcaaataaaacagagataaaatctcaatttataattgattctctcata
atggaacaattatacattaaacatattttaaattttagtaaagtcagtttaagtaacatg
tccactttaataatcacagacatgacaattgaaaatttgaaattcattacaaattaattg
tttttattctaaaacataaccacaatacttcttaagaatattgtgatcagaaatatttct
ggattcacatagagtctcttcactatcaaggaaacaacaaaaataactatagatggattg
tatatagctgatataaatcattttgatttcaaatctatttttaatataaacaattctata
gaactataaatgaataacatcactattagaaatatttcatcaaaatctgaataaagtact
atatttaacacatctatcataaattagtaaactatcactgcactggaagctgaaaatctc
ttaaacatagtgatacattagtcagttaactatgattaagaatatgatatgttataaatt
ttataaaaagatgttttctcttacttttaacttagaattaataactgtacataaaattat
tctctttttaatgttatgtcgaattaatgcttattttattcttgctaagtctcaaatatt
ttatctaaagattctttaggttcttttttggtgttttaaggaggttaaatttctataatt
taatctaactttacaaacaatacagctaaagaaggaggatcaatttatttattcaactcg
caagtaaacaatgttataaaagattcatacttcacccactgtaaagcattaggtagagga
ggcgcaatttatttagataccacatttatataaattaaagacacttatttcacttcttgt
tcttctctaataggcggatctatattctacaactcttatcgaccataaatttttatctaa
aacaagatccaaacttcttaccccttttaaggtttttctaataattctgcttaaatatat
ggctaaaatattggaagctaccctgcagaattttatataattgatgggtaaagttaagaa
aataataaaattgtgtaaagtgataataactattttttagggaacttaagaagtggagag
gtagtttcttttcagatttaaattgtagatgaggaaaataatccaataacaatcagataa
gattactaaacagcttatcctgcatttataaactaaatgattttagaatttagcatcaaa
atttaaattgcaaacccagtaaataatgatattgaaattagtgatcaaacttatgcagat
atttctaattatgttcatcaaactaaaacttggagttttactaatttaaagataacctca
agcacagattattaaagtagccaaaaaataggtgtcattcaaattgtttgttatggggtg
aaaaaaaataatgatctcggtaagcttttagactaagattactcaaaaaatttatcaata
agctttagatagtgtaagaaaggagaggtgcttaatgcaagaaatggtatttcagaatgt
ataccttgccctaatggatttttttcaatggattaacctgttgcaagttaatttatcgaa
tgcaaaccttgtccataagaagcctatgaatgtgaaaaagattaaatttatttaaagcaa
ggctattggagaaataataattcacttaacatttattattgcaataataggccagaaaat
tgtgaaggatctctaaaaggaaatagaaattattgcagtgaaggatttgtaggtgctttg
tgtgaaagttgtgacagttatggatcagtatggggttaaaagtatatgaaaatgggataa
tttaactgtgtcccttgtgttgatgctaaaagctactattttatctttcctattataatc
tttttgattttgatagtcttttatgtggtattttctataaataatgcaattaaaataagc
aaataattgtcctaagcttactatttcaaaaagattgggatctttaatttaggcagaagc
tctttaagaattttatcaccatttttggctaaatagctcatgcactttttataaatatct
ggattaattaattcatacaaattggctcttccttccttttttgttgtgttgacaaatgtt
atctcttagccaattacaaattttcagtatgttctagattgcttttttgttccagattag
cattcataattgtaaagtgacggagactctagtgcacattaaacaacaaatacaactatc
cctttagtttttatgagagctatttggaatttatgtattccttttatcatactgttattg
gtttctattgtatactctattctattttgtataaaagctgtttaatataaacacttttat
gcttacaatggagtcttttttttaatgatctttttgtagccaaatatagtatcaagcctt
atctctgttgtttcttgtaagacaatagatggaatttcttatataaaaagtgatagcaac
tatcaatgctacacatatgagcatgttaaatatagtcttttaatattacttcctactcta
atcctttgggcattcattattcctctatttattctttctagactaattatatagagaaat
aatttggaaagtatatcaactagattaaaatttggttttctctaccaggaatttaaaagt
aaatatttctattgggaattcatcaagtcttacaaaaaaatactgcttgtaattatttat
aattttggataagatttcttttacttaaaatcttgcttgatgcttctagttttatttatc
tactacttaagtattctaaagaggagtccatattaattaaatagctttaacaaaactgat
tagaacctaattatttgcatgctatttattttaataatgaatattattttacaagacacg
aatatatattggataacagtgacaggagaattttttactgctctattcactatatttata
atatgttttcttatcatttaaatcctttattaaaaaatctattctataataccccataaa
atttattcaatttaaatgtttttaaaagcaaaactgcccttaatcttattttgggtctaa
ccaaaaaaacctctaaatgctatgagagcctttaaaaattggaaaaaagtaaagaatatc
ctattaaccaaaggagtatttaaataaaatgagagagaaactaattagaatcagaggcaa
tctacttctttggcaaattaaaacaaaccataaaatgataatagctaataaaattaataa
gtataaattataaaataaatttagtaaatttaagcattcactcctaaaaataatcaatag
aaataaaagaaaggttcaaataaacctatttaattagaatcatcctcttcataagagctt
tctaattctgatatatccagttctgaataaagcaaaaatgaataaaaaacaacctataaa
aaataaaagaaatagaataaataaggcaatataaagtaaataacaaacaatgtttttata
tcagattatcaagacatatactaaaatcactctaacacattaaatattaatgatattaat
tcttaaaactaattccattttgcttcaagtaatcaattatctacttccaacaattttcat
caatagaaaggacttcaaatgctatcgaattcaacggataagggtcattttaaaaaaatt
atgaatggcgagtctattgacactagctaaatagatatgtgcaaacttttaaacgtttac
ccttcaattttgaatcatagataagatctggttgaagcaagttaaatttctcatattaat
tttgaataaaataattcaccatccctgataaattcaaatactgatctcaataataaaaca
attcaaagaagttacttttaaaaaaatataaatctagacaaacaagagtagaattaagaa
taaaatacttaggttaaaagtgaagatagtaataattaataaaattaaacaactgcctaa
aataaaataaacgataacaatgataataacaatttaatagtatttgatgaaagcgaatga
DBGET
integrated database retrieval system