Tetrahymena thermophila: TTHERM_00290710
Help
Entry
TTHERM_00290710 CDS
T01020
Name
(RefSeq) corvet complex core vacuolar protein
KO
K20178
vacuolar protein sorting-associated protein 8
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Pathway
tet04148
Efferocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tet00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04148 Efferocytosis
TTHERM_00290710
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
tet04131
]
TTHERM_00290710
Membrane trafficking [BR:
tet04131
]
Endosome - Lysosome transport
Tethering complex
CORVET complex
TTHERM_00290710
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
WD40_CDC20-Fz
WD40_2
WDR90_beta-prop_4th
ANAPC4_WD40
Beta-prop_RSE1_2nd
zf-C3HC4
WD40_Prp19
Beta-prop_EML_2
TPR_7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7839571
NCBI-ProteinID:
XP_001018688
TGD:
TTHERM_00290710
UniProt:
I7M8M2
LinkDB
All DBs
AA seq
1499 aa
AA seq
DB search
MDQKDKKLLADSNIDINSFLLDNLNSLDMNQLDDILQNENNYSDNKKVEKQIKVVDDNAI
TLEEIEKLESSNVNLLKQKQQQIQFEEIYKKDPLEAVNSIEMQTACLDKKTIEYYQIEFP
QIFGQQQTYIGNNQIKTISFTNIDYIKLYEKSKIKITTLYVGSGEVFLGTNSGEILRYKK
EEDKPLVLYESSQKSPVTCMDIRQQFIVVGYLDGSINLFNLKKAQLSMQVKIHNTEVYFV
KFFHDIYSADPLHEKEVEKITELSFLSCDSGELQKTIFSKGMLSGIKSSSENYPDLYSYY
DIIKRSQKSREEVKIQNQDEMIFQKVINYKCQPISLKNITVLLQAFVTKDSIIILSESAR
TQPMIVFYEKRNNERFRDVDSDCIPVIDFHKDILMIGWGSIVYVVKLQLQFKQTTNNEQI
VENQFPLKHRFYINQTNILYSSFIRNNIIFLIDNTNTCHIVNFLKFAKDQYKYNDNGGAE
QSLNAHVFQSYNIQKITKSRQLQIDNRLIKSFYNSIQILNEKIYVLSLTTTNVEQQHQIL
EGEILQWEIQLNLKFDSRKDLASQIQTLEICLQIYQGKNQSFGEISTFKSDLKNYIARKV
KESFERYLIDLINFRIKNSPQKIKMISDISEINTKPFVDIIGENVLEIVKQNNALMMYMK
YLIFTDNVQFMFTEFLNRIRHVQLLKDSFFQSLEPYIVLEYIKFIPNEEIFKEFFTYFDS
KNKHDIIAKFIFCIDKQQQLEYRYIKRLCNKLELLSASIFISTNFENNFKAPLQQMVSDL
DSLSSSSSLQKSSDGSSQTNLIYTKEWIGYKLLWYIKRSLSSIVFPNTQMDDTQWSEAVN
SIFEWIFFERNLIKILKIDPDLALQNILMFFKGYSSEFLKIKEQEYKQKFQKLLQYDDKI
NRNVQSDKNGNGEAIKIKDSLKTLICKYIKYVISQENTDKYLPKDTFNYFYLLLAEVKEK
DVQIDQELSTEAIYFLLENPNSHFYRNKDWALEIEYRSKQIIKLIEPHISKNKLNLSEIL
RKALNSPFVEVCSYIYRYQGDFEQAIKIYLETSFVDIRFKIFSFIKELLDTNSEKQAQII
EKIFIHLPKLLAINYHYTKELLEKIQNYDIHAIIKALNGQEELTFKILSEYIHDQRKKII
EESLSIPQNEIYLYMLYMKLLIKFQPSEVVNELKTQLYSLEEVQQILKESNHLQGTAYVL
SRFGNIKGALEIHLDLIKRYLNRKDKPHSIKEFTDGTELLLKNNKRGDEDSENNWFFWIT
GIQRIEQNIPKEMIEFQKKFEEESFEALIHNVQLSSILQNKDLLPLLGSNSSENFNQKSK
LYETLQTLLKSYSFEQKIFEYSKDILYFEYCRKENVSFRLQKKGIKINFACSNCKKELQK
DFTHYYCYHTYCSDCDKSLCLICFENQKNTFQNILNREEQKSINLKYQKYIQLEEEKKKK
VQEDKEKKNNNNNNLNQKQIQEQKNAQEQQLQKNRKLKKLKNFDKNLQESRAEQLNFFE
NT seq
4500 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatcagaaagataaaaaacttcttgctgatagcaatattgatataaattcttttctt
ctagacaatctcaattcactagatatgaattaattggatgatattctttaaaacgaaaat
aattattcagataataaaaaagttgaaaaataaataaaagttgttgatgataatgcaatc
accttagaggaaattgagaaattagagtcttctaatgtaaatttactaaaataaaaacag
cagtaaatttaatttgaagaaatttacaaaaaagatccattagaagctgtaaattctatt
gagatgcagactgcatgcttagataaaaaaacaatagaatattattaaattgaatttcct
tagatatttggataataacagacttatataggaaataatcaaataaagactattagcttt
acaaacattgattatatcaagctctacgaaaaaagcaagataaaaataacgactttatat
gttggaagcggagaagtgtttttaggaactaatagtggcgaaatacttagatataaaaag
gaagaagataagcctttagtattatatgaatcaagttaaaaatctccagttacatgcatg
gatattcgataacaatttattgttgtaggctacctggatgggagcattaatctttttaat
ttaaagaaagcataactatctatgcaagtaaaaattcataatacagaagtatactttgtt
aaattctttcatgatatttactcagctgatcctttgcacgaaaaggaagtagaaaaaatt
actgaattatcctttctaagttgtgatagtggagaactttaaaagactattttttctaaa
ggaatgctatctggtataaaatcaagcagcgaaaactatccagatttatacagttattat
gatataataaaaagaagttaaaaatcaagagaagaagtcaaaatataaaatcaagacgaa
atgatattttaaaaggttattaattataaatgctagcctatcagcttaaaaaatataacg
gttttactgtaagcctttgttaccaaagatagcattatcatactttcagaaagtgcaagg
acttagccaatgatagttttttatgaaaagaggaacaatgagagattcagagatgttgat
tctgactgtattcctgtaatagacttccataaagatatacttatgattggatgggggagt
attgtttatgttgtaaagttacagctgtaatttaaataaacaacaaataacgaataaatt
gtagaaaattaatttccacttaagcatagattttacataaattaaactaacattctttat
agtagttttataagaaataacattatattcttaatagacaataccaatacttgtcatata
gtaaattttcttaaatttgcaaaagattaatataaatataatgataatggtggtgcagag
taatctcttaatgcacatgtattctagtcttacaatatctagaaaatcactaaatcgaga
tagcttcaaatagataatcgcttaatcaaatctttttacaattcaatctaaattttaaat
gaaaaaatttatgtcctgtctttgactacaacaaatgtagaataataacactaaatatta
gaaggcgagatattatagtgggaaatatagttaaatctaaaatttgattctagaaaagat
ctagctagttaaattcaaaccctagaaatatgcctacaaatatattaaggaaaaaactaa
agttttggtgaaatttctacttttaagagtgatcttaaaaattacattgccagaaaagtt
aaagagtcatttgaaagatacttgatagatttaataaattttagaataaaaaatagcccc
caaaaaataaaaatgatttcagatatttctgaaataaacacgaaaccttttgttgatata
attggtgaaaatgttcttgaaatagttaagtaaaataatgcccttatgatgtatatgaag
tatctaatattcacagataacgtttaatttatgttcactgaatttttaaatcgcataagg
catgtctaattgcttaaagatagtttcttttagtcgttagagccttacattgtactagaa
tatattaaatttattcctaatgaagaaatttttaaagaattttttacttactttgatagt
aaaaataagcatgatattattgctaaatttatcttttgtatagataaatagcaataacta
gaatatagatatataaaaagactctgcaataaattagaattgctttcagcctcaatattt
atctctactaactttgaaaataacttcaaggctcctctctagcaaatggtgtcagactta
gattccctttcttcaagtagtagtttataaaaatcttcagatggttcatcgtaaacaaat
ttgatatacacaaaagaatggataggctacaaacttttgtggtacatcaaaagatctctg
tcttcgattgttttccctaacacttaaatggatgacacttaatggtcagaagcagtcaac
agtatttttgaatggatcttctttgaaagaaatcttataaaaatcttaaaaatcgatcct
gatctcgctttacaaaatattttgatgttttttaaaggttattcaagtgaatttctaaaa
atcaaagaataagaatacaaataaaaatttcaaaaactcttgcaatatgatgataaaatt
aatcgaaatgtttaatctgataaaaatgggaatggtgaagcaataaaaataaaagatagt
ttaaaaacactaatttgtaaatatattaaatatgtaatcagttaagaaaacacagataaa
tacttaccaaaagatacttttaactacttttatttgctcttagctgaagtcaaagagaaa
gatgtgcaaattgattaagaactttcaaccgaagctatttactttttgttagaaaatcct
aattctcatttttatagaaataaagattgggccttagaaatagaatatagaagcaaataa
attattaaattgatcgaaccccatattagcaaaaataaactaaatctaagcgaaatctta
agaaaagctctgaattcccctttcgttgaagtatgctcttacatttatcgttatcaagga
gattttgaataggctataaaaatatatcttgaaacatcttttgtagacatcagatttaaa
atttttagctttattaaggagctgcttgacacaaattcagaaaaataagcataaattata
gaaaaaatatttatccaccttccaaaattattagcaatcaactatcattacacaaaagaa
ctgctcgaaaaaatttaaaattatgacattcatgctataattaaagctctaaatggttaa
gaagagcttactttcaaaattttatctgaatacattcatgattaaaggaaaaaaataata
gaagagtctctaagtataccataaaatgagatatacctatacatgctttacatgaagctc
ctaattaaattttaaccatctgaagtagtcaatgaactcaaaactcaactctatagccta
gaagaagtttaataaattttaaaggaatccaaccatctacaaggaactgcatatgtttta
agccgctttggaaatatcaaaggagcattggaaattcatttagacttgataaaaagatat
ttaaatagaaaggacaaacctcactctattaaggagtttacagacggaacagagctcctt
cttaaaaataacaaaagaggtgatgaagattcagaaaataattggtttttctggatcact
ggaatacaaagaatagaacagaatatacctaaagaaatgattgaattttaaaagaaattt
gaagaagaatcttttgaagctttaatacataatgtatagctctcttctattttataaaat
aaagatttactacctttattaggttctaactcttcagaaaattttaactaaaaatcaaaa
ctctatgagacactttaaactcttcttaaaagttacagttttgagcaaaagatatttgag
tattcaaaggatatactttattttgaatactgcagaaaggaaaatgtttcttttagatta
taaaaaaaagggattaaaataaatttcgcttgctcaaactgcaagaaagagttgcaaaaa
gactttactcattattattgttatcacacttattgttcagattgtgataaaagtttatgt
ttaatctgctttgaaaaccaaaaaaacacattttaaaacattttaaatagagaagagtaa
aaatcaattaacttgaaatattaaaagtatatctagcttgaggaagaaaagaaaaagaaa
gtgcaagaagataaggaaaaaaagaataataataataataatttaaattaaaagtaaatt
taagaataaaaaaatgcttaggaacaacaactttaaaaaaatagaaaactaaaaaaactt
aaaaactttgataaaaatctttaagaatctagagctgaatagctaaatttttttgaatga
DBGET
integrated database retrieval system