Tetrahymena thermophila: TTHERM_00294810
Help
Entry
TTHERM_00294810 CDS
T01020
Name
(RefSeq) SMC family, carboxy-terminal domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Brite
Proteoglycans [BR:
tet00535
]
Extracellular matrix (ECM) proteoglycans
Basement membrane proteoglycans
TTHERM_00294810
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_23
AAA_21
AAA_15
SMC_hinge
SMC_N
AAA_29
SbcC_Walker_B
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7833294
NCBI-ProteinID:
XP_001013113
TGD:
TTHERM_00294810
UniProt:
I7LUD9
LinkDB
All DBs
AA seq
1288 aa
AA seq
DB search
MSIKSISIEKFKSYSNCKIEGLSDNINILYGKNGSGKSNLLAALSFISSDQYDRADRAQL
MKNYKEGDPKVEIELDNLVKIDKKDMEDEPKAQKVIPTSGDSVLLSRTLEQRENVYRVDD
RVVNLNQFNNIFECFGLSRKNPFTIVAQNRIQEISNMSDSEIYKLLQQVAGIEAFMNKQE
KAEELFEKAQREKEGIDQSLQEIEDKISQLSGEKEQYAQNQEQEIIIQSLQSIYYDKLKE
ELQKKKLECNKEINNQKLQEEKQKLQDLQNQKEAKNEELLRFKEKLQRLTVIEEQVKSDQ
MNLQNKVNSLEQNIQKLKSIKTNKDEKEIEARLKEVNIQCTKLQKDLDEVIDKITNEKDG
IDTKQQEYEQLVLREKFKTQQEKQSYFNQRIQDIKQSISEKSQTQQNLKEKVKKSEQRLN
LVNQEIEKLQNQINSFQTESNKAQKTINDKKNQIQKLRQEQLEKRKTINDKKIELEDLNN
QIKKRVDDIQKQLKSGLIQAIEQIEESIQKEGIQGYKGLLIDHLQFNSALTYAYDIAQKG
KLFSLIVDNQNTASLIIDIVKKLKIKTSNLNIIPLDWVEDDIDDEKENQIAGFGFQKLFD
TRYVKAKGDHADDIKRLAKNIFEKYGVIKEYEHALEVASQFKVNCITEKRQIVYSGGFIS
HVGFCTVAKVDKITLYNEYKSFKAKKDAIAKEIEQLEKSMNDIQLQQNDINSNVSKEQAS
LAKQSNTIFMNRQLIKSSEVEKKVLTDELNETNQLLQSFSQQLKDLEQEKIGLENTSKSS
KFEPLNQEDKQKMYKLQEEIKSKTTVLQKSLKEKQNVEKEYNKYRNEEQQLTNHLSQLSE
GGGMKDGEVLFQSIDQRISSSEQDLKHQESILKAQKAIVEKATQSKKTLEEQIKKIEGES
QDKLKEQIQSQQELCNNLEQQISALLLRKQQYISKEYEIDQKKELLVVSPDFIQKNSHLS
KDNLKDKLNRITQQTTIKKYTAKDKILFEKLKDLDEKYEEYKSKYTELTKNEEQAKNLID
QFKSKCEQTIKMAFSKFEHYMKNYFKQISSAGTIDVKLMHNHEISISVAFKQTTNETKKT
NRKELSGGEKSCLAILILMALQRCDPAPYYIFDEFDAALDAGYIRPIAKMQVNFQLSIKL
ITHTYLFIYYYAKEYLKIAKSLNFQLFHTSLNFYKLYNKKIVSASRYHQKTKQARQKRRL
YQLQQILLKMVENVLKRQIVFPKISLHIINYKLKYFSIYLLTVCNFNLNHQIEHSFFFLA
YKICGLQFNLIYLINFNQEAAQFSCVYL
NT seq
3867 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcattaaatcaatatctatagaaaaatttaaaagttactctaactgcaagatagaa
ggactctctgacaatataaatattctgtatggcaagaatggttctggaaaatctaatttg
ttggctgctttatcatttataagttctgattagtacgatagagctgatcgagcataatta
atgaaaaattataaagaaggtgatcctaaggtcgaaatagagttagataatttagttaaa
atagataaaaaagatatggaagatgagccaaaagcacaaaaagttattcctaccagcggt
gatagtgttttattaagtagaactttagagtaaagggagaatgtttatagggtagatgat
agagttgttaatttaaattagtttaataatatttttgagtgctttggtctttcaagaaag
aatccttttacaatagttgcataaaatagaatttaagaaatatcaaacatgagtgattca
gaaatctataagttgttacagcaagtagctggaatagaagcttttatgaataaataagaa
aaagcagaagagcttttcgaaaaagcttagagagaaaaggaaggcatagattaatcctta
caagaaatagaagataaaataagctagttaagtggtgagaaagaatagtatgcacaaaat
taagaataggaaattattatataaagcttgtaatctatctattatgataaattgaaagaa
gagctttaaaagaagaaattagaatgcaacaaagaaatcaataatcaaaaattgtaagaa
gagaagtaaaagcttcaggatttataaaattagaaagaagctaaaaatgaagaactatta
agatttaaagaaaaattgcaaagattaacagttatagaagagcaagtaaaatcagattaa
atgaatctttaaaacaaagtcaacagtcttgagtagaatatctaaaaattaaaatcaata
aaaactaacaaagatgaaaaagaaattgaagcaagattaaaagaagttaatatttaatgc
actaaattataaaaagatcttgatgaagtcattgataaaataacaaatgaaaaagatggg
attgacaccaagcagtaagaatatgagcaattagtcttaagagaaaagtttaaaacttag
taagaaaagcaaagctattttaatcagagaatccaagacattaaacaaagtattagtgaa
aaatcataaacttaacagaatcttaaagagaaagtgaaaaaatctgaataaagactaaac
ttagttaattaagaaattgaaaaattgtaaaatcaaataaatagtttttaaactgaatcc
aataaggcacaaaaaactataaatgataaaaagaattaaatctaaaaattgagacaagag
tagcttgaaaagagaaagacaattaatgataaaaaaatagagttggaagatttaaacaac
taaataaaaaagagagttgatgatatacaaaagtagttgaaatcaggattaatccaagca
attgagcaaatcgaggaatcaatataaaaagaaggtatttagggatataaaggactgctt
atagatcatctttaatttaattctgcacttacttatgcatatgatattgctcaaaaagga
aaattattttctttgatagtcgataatcaaaatactgcctctttaataattgatattgtt
aagaaattgaagattaaaacatcaaatttaaatattattcccctagattgggttgaagat
gatattgatgatgaaaaagaaaactaaattgcaggattcggattttaaaagctatttgat
actaggtatgttaaggcaaaaggagatcatgcagatgatataaaaaggttagctaagaat
atttttgaaaaatatggtgtaattaaagagtatgaacatgccctagaggtagcatcttaa
tttaaagtaaactgcattacagagaagagataaattgtttatagtggaggttttatttct
catgttggtttttgtactgtggctaaagtagataaaataacactttacaatgaatacaaa
agctttaaagctaagaaagatgctattgctaaagaaatagagcaactagagaagtctatg
aatgatatttaattgtaataaaatgatataaattcaaatgtaagcaaagaataagctagc
ttagcaaaatagagtaacactatatttatgaatcgttaactaattaaatcatctgaagta
gagaaaaaagtattgactgatgagttaaacgaaacaaattaactcctatagtctttttct
taataacttaaagatttagaataagagaaaataggtttagaaaatactagcaaatcctct
aaatttgaacccttgaattaagaggacaagtaaaaaatgtataaactataagaagaaatt
aagtctaaaactactgttttgtaaaaatctctgaaagaaaagtaaaatgtagaaaaagag
tataacaagtatagaaatgaagaataatagctaactaatcatttatcccaattatcagaa
ggtggtggtatgaaagatggtgaagtcttattttaaagcattgatcaaagaataagttct
tcagagtaagacctcaaacatcaagaaagtattctcaaagcttaaaaagcaattgtggaa
aaagctacacaaagtaagaaaacactcgaagaataaataaaaaagattgagggagaaagc
taagataagctgaaagagcaaattcaaagctagtaagaactttgcaataatttagaataa
taaatcagtgctttacttctccgtaaacaacaatatatttcaaaagagtacgaaatagat
taaaaaaaggaattactagtagtaagccctgattttatccaaaaaaattctcatctttct
aaagataatttaaaagataagctgaatagaattacttaataaacaaccattaagaaatac
acagcaaaagataaaattctatttgaaaaattaaaagatttggacgagaaatatgaagaa
tacaaatccaaatacactgaattaacaaaaaatgaagaataagccaaaaatctaattgat
taatttaaatcaaaatgtgaataaactattaaaatggcattttctaagtttgagcattat
atgaaaaattatttcaaataaatatcttctgcaggtacaatagacgttaaacttatgcat
aatcatgaaatcagtatatcagttgcttttaaataaactacaaatgaaacaaaaaagaca
aatagaaaagagctaagtggaggagaaaagagttgtcttgctattcttattttaatggct
ctatagagatgtgatccagctccatactatatatttgatgaatttgatgcagcattagac
gctggttatattagacctattgcaaagatgtaagttaatttttaattaagtattaaatta
ataacacatacttatttatttatttactattacgcaaaagaatatctgaaaatagctaaa
agtcttaatttttaattgtttcacacaagtttgaatttttataagctttacaacaagaaa
attgtaagtgcttctagatatcactaaaagacaaaataagcgagatagaagagaagactt
tatcagctgcaataaattttgttaaaaatggttgaaaatgtgttaaaaagataaatagtt
tttccaaaaattagtctccatataattaattataaattaaaatatttttccatatattta
ttaactgtatgtaattttaatctaaatcatcaaatagagcattcatttttttttttagct
tacaaaatttgtggcttataattcaatcttatttatttaattaattttaattaagaagct
gcttaattttcttgtgtttatttatga
DBGET
integrated database retrieval system
