Tetrahymena thermophila: TTHERM_00295120
Help
Entry
TTHERM_00295120 CDS
T01020
Name
(RefSeq) vacuolar protein sorting-associated protein 35 containing protein
KO
K18468
vacuolar protein sorting-associated protein 35
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Pathway
tet04144
Endocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tet00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04144 Endocytosis
TTHERM_00295120
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
tet04131
]
TTHERM_00295120
Membrane trafficking [BR:
tet04131
]
Endosome - Lysosome transport
Rab GTPases and associated proteins
Retromer subcomplex
TTHERM_00295120
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Vps35
FANCI_S2
ARM_CUL7_CUL9
zf-RING_11
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7829474
NCBI-ProteinID:
XP_001013144
TGD:
TTHERM_00295120
UniProt:
I7LUE5
LinkDB
All DBs
AA seq
774 aa
AA seq
DB search
MQEDVDQERLLDQARQKVKEQAYFMKKALDQVNLRDGLRHASTMLEELGVREQVQLNPKN
YYIVFMQIFDELRTLEQYFKEEYRRGRKMMDLYESVQHATKLIPRLYLLITVGSVYIQTH
EVGAKEILLDLLEMIKAVQHPTRGLFLRYYFLKMCKDRLPDKDSEYFGEGGDVDDCINII
TRNLNEMNKLWIRMSGKSRDKPRREKERVDLKITVGENIHRLSSLEGVNSEIYQTTVLPK
LLDLIVSSKDAISQNYLIDCVISCFPDEYHLITLHDILGVCTTQLEPKVDIKSIFISLMD
RLAEYALRSEDVQATFNSDNHIYSMFKNNIDNLVERSSSTEFKNVLDLMVAFLKFSLRCY
SSNGDYVNQILKSCVKICEKQHEQDFQDDCLKNIVKFLTMPLETMSLTILTMDEYPNLMK
YLPFSKRRQVAQKITQAVVSLKRNINDQKIAEQLVLFIHPLLVTEKDYIEVSQNDFEEEQ
NLVCKMLHLVHHDDAQEYWNILRLFFDNFQKGEIKRQKFTYPTMFYALAKFTRSVYEKNQ
QNEVLNYNNIFEIMKQLIETLAQEYHSLALKLYIQFILIINEFDHEKTLDEFTYDIATTA
LTIYQDDLGDADIKLQAIQVISGALNKVSCLSEENYDTLSSNTTQYSAKLLKKQDQVLSI
LNCTHLFHGELIKDEESVKKCLKKAIKIAQTLLKTQNKSINLYIYILNRYFVFWNYVQFD
AAEVQELINIINEKIGTLEKSAETDALQKYWRNTVQYIKSKQEQNIAGFAELHV
NT seq
2325 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtaagaagacgttgattaggagagactattagattaggctcgttaaaaagtaaaagaa
taagcttactttatgaaaaaagcattggatcaagtcaatttaagggatggcttgagacac
gcttccaccatgttagaagaattaggtgttagggaataggtttaattaaatccaaaaaac
tattacatagtgtttatgcaaatttttgatgagctccgtactttagaataatattttaaa
gaagaatacagaagaggccgtaaaatgatggatttgtatgagtctgtttagcatgctact
aagttaattcctagactttatcttttaatcacagttggttctgtttatattcaaactcat
gaagtaggtgccaaggaaattcttctcgatttgttagaaatgattaaagcagttcaacat
cctacaagaggtctatttttacgttattatttccttaaaatgtgcaaagatcgtctcccc
gataaggactctgaatattttggagaaggcggtgatgttgatgattgcattaacattatt
actagaaatcttaatgaaatgaataagttgtggatcagaatgagcggaaagtctagagat
aaaccaagaagagaaaaggaaagagtagacttaaagattacagtaggtgaaaatattcat
agattgagcagcttggaaggtgtaaatagtgaaatttattaaactaccgttttacctaaa
ttacttgatttgattgttagctctaaggatgctatttcttaaaattatttgatagattgc
gttatctcttgtttccctgatgagtatcacttgataacccttcacgatattttaggtgtt
tgtactacccaacttgagcctaaagttgacatcaagtcaatcttcatatccttgatggat
cgtttggctgaatatgctctccgttcagaagacgtttaggctactttcaactctgataac
cacatttattctatgttcaaaaataacattgacaatttggttgaaagatctagcagtact
gaatttaaaaatgttttagatttaatggttgcatttttgaagttctctttgagatgttat
tcatcaaacggcgattatgttaactaaattttaaaaagctgtgttaagatttgtgaaaag
taacatgaataggatttctaagatgattgcttaaagaatattgtcaaatttttgaccatg
ccccttgaaactatgtccttaacaattctcactatggatgaatatcccaacttgatgaag
tacttacctttctctaaaagacgttaagtcgcttaaaagattacctaagcagttgttagc
ttaaagagaaacattaatgattagaaaattgcagaataattagttctctttatccatccc
ttattagtaactgaaaaagactatattgaagtttcctaaaatgattttgaagaagaataa
aatttagtttgcaaaatgcttcatcttgttcatcatgatgacgcttaagagtattggaat
attttaagactcttctttgataacttctaaaaaggagaaattaagagatagaaattcact
tatcctaccatgttctacgctcttgccaaattcactcgctcagtctatgaaaagaactaa
caaaatgaagtcctcaattacaataacatttttgagattatgaagtaattgattgaaact
ttagcttaggaatatcactcacttgccctcaagctctacatttagttcattttaattata
aatgaattcgaccatgaaaaaactcttgatgaattcacatatgatattgctacaacagct
ttaactatttatcaagacgatctaggtgatgctgatattaagctctaagcaatttaggta
attagtggtgcccttaacaaagtctcatgcttaagtgaagaaaactatgacactctttca
tcaaacaccacctaatattctgccaagttacttaaaaagcaagattaggttctctcaata
ttaaattgcactcatctcttccatggtgaacttattaaagatgaagaatctgttaagaaa
tgtttaaagaaagctattaaaatagcttaaactttacttaaaacctaaaataagagtatt
aacttgtatatttatatcttgaatcgttacttcgtattctggaattatgttcaatttgat
gcagcagaggttcaagagcttattaatattatcaatgaaaaaattggaactttagaaaaa
tcagctgaaactgatgctctctaaaaatattggagaaatacagtataatatattaaatca
aagtaagaataaaatatagctggattcgctgagcttcatgtttga
DBGET
integrated database retrieval system