Tetrahymena thermophila: TTHERM_00298300
Help
Entry
TTHERM_00298300 CDS
T01020
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_19
DEAD
TPR_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7839811
NCBI-ProteinID:
XP_001024464
TGD:
TTHERM_00298300
UniProt:
I7LX97
LinkDB
All DBs
AA seq
2372 aa
AA seq
DB search
MIEQSQTLQQQHYQRYDYQLDNYISTQRQLLKKSEEEYIIQYLRDHKSWVDQKLQYGDQN
QENPYKFIRSLWNWSVSDQFLNDFSKLNKSQMYNKLYYMEKILSGNFNGFEKLEIEDCEF
ENSQTKVGIQYLDIFYPNIVVVIGLQQIPMIRDSHVIKFKFEWYIMFQSIFDQQFQKTPN
TDFSNILEDPLKQNYITDLSNFINPLDMIRTSKQYQNRKERLANVDRYLPQQIPDYYLTY
QESMQYFNFGYGWIKKQYHKRNIQFNNKKRIQQMNQAYLYKMLQNEDISEQMKKIIDICK
IETPLTQQQTQVISNHSNLIVMGRSGTGKTLCALYHLLALEVLYKLHFDKNKNSQMNLID
SLSEKKIGLQSVFITASPILTRKIQKYYQKHKNYLQKAIINISNKQNSNDSQIYDQSISF
LIDSLISDFTVLQEESKIQIEDQYDDFDVLEIDDNIFIEPSEQEISAQLKSQSRIKFSQG
HPSFYTVRSYLMSLECCLERHFFERDKQGNIIQYSSQNSLGKFQHQRFQLNQIYQHLDQI
QDQQKEDFEINEQIFYKNNKLSNYDAFMRDQFLENNMHKQNQENDFIQDQKSRKFEIDYN
YFANYFWPFVSIKFKSSSLISCSSLWTEIYSVIKGSANCYKYKQRYVPRDEYLKQNSTNL
LTQEQKTTIYTMFELYERWKQNQSGYDILDLNNYILSELQEKRCNIPSIHFTVIDEVQDL
PFSVIQLFTQINEYNIFFSGDSTQNIARGVGFKFNDLKSLFEKIQPSQQGQVQIQVHHLT
VNFRSQKKILQLSNSIIDLLYNLFPTTLDVMQKETSEIEGISPIVLVDADQNFLFKILKG
QSESLDFGSNQAIIVRDEESKQRLPSILKHAICLTILEAKGLEFEDVILYDFFSDSSCTF
QQLNYCRPQVVINDNIKQINKSDQENEINLSINEFNPVNNVILCSELKQLYTAITRPKKR
LIIFDNQEYKRKPILQYWLQKNLVCQISPQDFKANNQEKPILEQEQNKEKQKIIKDLQNQ
MHLNQQVDWYQQGINMFKNKYYQQAIKCFEKIGKEKLIQQAKLHLELQNCSKEIQNTQNE
LQILKLNHGQYASLNQSSKNNLKFQFCKKLNSLKQSLSNLGDQFYQIDQKNQAAQCYFNS
EQYEMAGKIYEELQLYNQAAESYLLSNSQLHKAAEIYEKLNHLEQAIHILELQENWKQII
LLLSRNPQYKITDDQKSLYTENCLKQIFQNKFDELKMEKINQLLAQKNLEDSFTLFDFEL
DDVTLNEVDKDISFLEKQINETELQGSNHSFEDSDIDINIENENTESEQSKQINNLDDIS
QFTLVQDEKINNIINTQINEERLQEDQYIISLNQSFVSNSSFGKILSEENELFQQINQTV
KKQIYQILQVFMLSDNSFIKIVQESLNQDLDQNQFKSKFNLVEFLLQKLDFYCLNNKIMK
KFIFKMEQFQFQDQIWIFVVFLKQYQYIPTIIQKQIYEKFQHSSISNLVLSDYLKENNQS
LAKKQEYQRQSIFLIQSMLNVVQKILNDQKLDNKILNFTLEYLQQTVLLGFGELFIQFMQ
RYDMLNLYLLYGKYDQYLACVSSDKSYLQNSIQEGQIKSDEDIQLAIVQTQQCIYQIIDN
KFKLKINLKQQKIIQSLSFNQKFQLLIQNYQNKEEQYQSFTQELLQQLEILLKNQEELNE
IQIFDVVSAFFLTIKYFYRVEAFDLLLISQLNRIQLILQKLQNDLQYAELVQDRRLTYMT
KAMLTVFQVREIPDSQIFQIFGKQNVVMNFSNNLISQIFQEYKKNKKQEPQMYFCDQNFE
QVLAPLEVVISAIFQNLDQISKELQLLTEFDQTDQKSKNKIQNKKKQDLDKFIITDENET
EDQNLDTSFYVNEQEEEENKKLDQILLLINNFKSKQFDKNQIILDLKTIKLRQDSSFIKL
FEGKNSVTEQEISEIICQDKWLLQYGLSRMYNQRQQMKGQTNTEHIIYNIIINNLANQKV
KLIIPQKYVGYFYDLEKNQLLIRDINNAINFKQKNPNVVSVNLNEYDNDFDIKLIAQFID
KNKDKSQSFQKIYFVWILMILANVYDLSKQTLNQFIQLIQSIQLDQKTLKILQQNWHYKN
LLNATSAEEANDLAYELVTQNYFEEIFGYWEDITVYNDANHEANKLKFDQEKQNLSKKVN
QKNQSRKRIINFLIQNRTKIKFINEIELNFKKILNFLEPRVNMDNKELILKKLKQLLITN
FSLFQSILKLYQIQIQIISAIYLKKIKSQKEITILTQKLNQIYENKKQISQVVDQSLEYR
VRTKLIKYSNYDEFKVASNNLQEFLNDLQSELQFLLDKSVSKQKMKPYINQSQSRLNQFT
FEKQKCLHKKSKQQIKYQKEQLRKAIQKDLLF
NT seq
7119 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagaataatcttaaacattataataataacattatcaaagatatgattattagcta
gataattatatctctacttagcgttagctattaaaaaaatcagaagaagaatacattatt
taatatctcagagatcataaaagttgggtggatcaaaaactttaatatggtgattaaaat
taagaaaatccatacaaatttattagatcattgtggaattggagtgtttctgattagttt
ctaaatgatttttcaaagctaaataaatcttagatgtataataaattatattatatggaa
aaaatcttaagtggaaactttaatggatttgaaaagcttgaaatagaagattgtgaattt
gaaaatagctaaactaaagtaggaattcaatatttagatatcttttatccaaatattgta
gttgtcataggattataataaatacctatgataagagacagtcatgtgattaaatttaag
tttgaatggtacataatgttctaatcgatatttgactaacaattctaaaaaacaccaaat
actgatttttcaaatatacttgaagatcctttaaaatagaattacatcactgatcttagc
aattttattaatcctctagatatgattcgaacttctaaataatactaaaatagaaaagaa
aggctcgcaaatgttgatagatacttaccataataaatacctgattattatttaacttat
taagagagcatgcaatattttaactttggttatggttggataaaaaagcagtatcataag
agaaatatacaatttaataacaaaaagagaatttagtagatgaattaagcatatttatat
aagatgctttaaaacgaggatatatctgagtaaatgaaaaaaattattgatatttgtaaa
attgaaactcctttgacataataataaacttaagtcatatcaaatcattcaaatttaatt
gttatggggagatctggaacaggaaaaaccttatgtgcattatatcacttgctagctttg
gaagtattgtataaattgcattttgataagaacaaaaatagttaaatgaatcttattgat
tcattgtctgaaaaaaaaattgggttgcaaagcgtattcattacagcctccccaattctt
acaagaaagatataaaaatattactaaaagcacaaaaattatttataaaaagctataatt
aatatttcaaataaataaaatagcaatgatagctaaatttatgattaaagcattagcttt
ttgattgattctctaataagtgattttacagttttataagaagagtctaagatttaaatt
gaagactaatatgatgattttgatgttttagaaatagatgataacatttttattgaacct
tctgaataagaaatcagtgcttagcttaaaagctaaagcagaattaaattttcataagga
catccttctttttatacagtgcgctcctatctaatgagtttagaatgttgccttgaaaga
cacttctttgaaagggataaataaggaaatattatttaatatagctcatagaatagttta
gggaagttccaacattaaagattttagttaaattagatatattagcacttagattaaata
taagatcaataaaaagaggactttgaaataaatgaataaatattttacaaaaacaacaaa
ttatctaattatgatgcatttatgagagattagtttttagagaacaacatgcacaaataa
aattaagaaaatgattttatctaggattaaaaaagtagaaaatttgaaatagattataat
tactttgcaaactacttctggccgtttgtttcaattaaattcaaaagttcttctttgata
tcttgctctagcttatggacagaaatatattctgtaattaaaggctcagcaaattgttac
aaatataaataaagatacgtaccaagagatgaatacttaaagtagaattcaactaattta
ctgacttaagaacagaaaacaacgatttatactatgtttgaactctatgaaagatggaag
caaaattaaagtggttacgatattcttgatttaaataactatattcttagtgaattataa
gaaaaaagatgcaatattccttctattcactttacagttattgatgaggttcaagactta
ccatttagtgttatttaacttttcacttagatcaatgagtataacattttcttttcagga
gactctacatagaatatagcaagaggagttggttttaagttcaacgatcttaaaagtctt
tttgaaaaaatttaaccttcttaataaggataagtttaaatttaagtccatcacttgact
gtaaactttagatctcagaagaaaatattatagctctcaaatagtattattgacttatta
tacaatttgtttccaactactctagatgttatgcaaaaagagacttcagaaattgaagga
ataagtcctatagttttagtggatgctgattaaaattttctttttaagattttaaaagga
taatctgaaagtttagattttggttctaactaagctattattgtaagggatgaagaaagc
aaataaagattgccctctatcttaaaacatgccatatgcctcactatattagaagctaaa
ggtctagaatttgaagatgtcatattgtatgactttttttctgacagcagctgtacattt
taataattgaattactgcagaccataagttgttatcaatgacaacataaaataaataaac
aaatctgattaagaaaatgaaattaatttaagcataaatgagtttaacccagtaaataat
gtcattttatgttcagaattaaagcagctttatactgctattactcgtccaaaaaaaagg
ttgattatttttgataattaagagtataaaagaaaacctattctttaatattggctgtag
aaaaatcttgtttgttaaatttctccataagattttaaagcaaataattaggaaaaaccc
attttagaataggaataaaataaggagaagtaaaaaattattaaagatctgtaaaattaa
atgcatctaaactagtaagttgattggtattagtaaggaataaatatgtttaaaaataaa
tattatcaataagcaataaaatgctttgaaaaaataggaaaggaaaaattaatttagcaa
gctaagttacatcttgaactataaaattgttctaaggaaatacaaaatacataaaatgag
ctttaaattttaaagttgaatcacggataatatgcttctttaaattaaagctcgaaaaat
aatctcaaattttaattttgcaaaaaattaaattctttaaagtaaagtttaagcaatctt
ggagatcaattttattaaattgactaaaaaaaccaagcagctcagtgctattttaatagc
gaataatatgaaatggcagggaaaatatatgaagagttgtaactttataactaagcagca
gaatcatatttgttaagtaattcctagttgcacaaagcagctgaaatttatgaaaaactg
aatcatttagagtaagctatacacattttagagttacaagaaaattggaaataaattatc
ctacttttatcgagaaatccttaatataaaataactgatgaccagaaaagcttgtataca
gaaaactgcttaaaataaatattttagaacaagtttgatgaattaaaaatggaaaaaata
aactaattgcttgcacaaaagaatttggaggattcttttaccttgttcgatttcgaatta
gatgatgttactttaaatgaagtagataaagacatctcctttttagaaaaataaatcaat
gaaactgagctttagggttcaaatcattcatttgaagattcagatattgatattaatatt
gaaaatgaaaatactgagtctgaataatcaaaacaaataaataacctggatgatataagt
taatttactttagtgcaagatgagaagattaataatataataaatacttaaattaatgaa
gagaggttataagaagatcaatacataatatctttaaactagtcatttgtctctaactct
tcatttggaaaaatactatcagaggaaaatgagctattttagcaaataaattaaactgtg
aaaaaataaatttaccaaattctttaagtttttatgctatcagataacagttttattaaa
atagtctaagaaagtttaaattaagatttagattaaaattaatttaaatccaaatttaat
ttagttgagtttctgttataaaaactggatttttactgcttgaataataaaataatgaaa
aaatttatatttaaaatggaataattttagttctaagaccaaatatggatatttgtagtc
tttctcaagcaatattaatacatcccaacaatcatttaaaaataaatttatgaaaaattt
taacattctagcatttcaaatcttgtcctttcagattacctcaaagaaaataatcaaagt
ctagctaagaaacaagagtattaaagataatcgatttttctaattcaaagcatgttaaat
gttgtataaaaaattttaaatgattaaaaattagataataaaatattaaattttactcta
gaatatttacagcaaacagtattgcttggatttggagaattatttatttaattcatgtaa
aggtatgatatgctaaatttatatctattatatggcaaatacgattaatatttagcatgt
gtttctagtgataaaagctatttgcagaatagtatttaagaaggataaataaaatcagat
gaagatatttaattagctattgtttagacataataatgcatatatcaaatcatagacaat
aaatttaaattaaagataaatttaaaacaataaaaaataatctaaagtttaagctttaat
taaaagttttaattattaatttaaaattattaaaataaggaagaataatattaaagtttt
actcaggaattgttacaacaacttgaaattcttttaaaaaattaagaagaattaaatgaa
atctaaatatttgatgtagtctctgcattttttttgacaattaaatatttttatagagta
gaagcatttgatttgctattgatttcatagcttaacagaatacaacttattctttagaaa
ctttaaaacgatttgcagtatgctgaactggtataagatagaagattaacttatatgaca
aaagcaatgcttactgtattttaggtaagagaaattcctgatagttagattttttaaatc
tttggaaaacaaaatgttgttatgaatttttcaaataatcttataagctaaatattttaa
gaatacaaaaaaaacaaaaaataagaacctcaaatgtacttttgtgattaaaattttgaa
caggtacttgctcctctagaagtagtaatttcagctattttttaaaatttagattagatt
tcaaaagaattataacttctaactgaatttgattaaacagatcaaaaatctaaaaataaa
atccaaaataaaaaaaagtaagatttagataaatttattattacagatgaaaatgaaaca
gaagattagaacttagatacatctttttatgtaaatgaacaagaagaggaagaaaataaa
aaattagattagattttgttattgataaataattttaagagcaaatagtttgataaaaat
cagataattttagacctaaaaactattaaattaagataagacagtagctttataaaatta
tttgaaggaaaaaattctgttacagagtaagaaatttcggaaatcatttgctaagataag
tggttactataatatggattgtcaagaatgtataattaaagacaataaatgaaaggttaa
acaaatactgagcatataatttacaacataataattaacaatttagcaaaccaaaaagta
aagctgattattccttagaaatatgtgggatatttttatgatttagaaaaaaattaactt
ttaattagagatattaacaatgctataaatttcaagtaaaaaaatcctaatgtagtatct
gtaaatctaaatgaatatgacaatgattttgacattaagttgatagcctaatttattgat
aaaaacaaagataaatcttaatcattttagaaaatttattttgtttggatattaatgata
ttggctaatgtttatgatttaagtaaatagactttaaatcaattcattcaactaatacaa
tcaatttaattagatcaaaaaactttaaaaatactataataaaattggcattacaagaat
ctcctgaatgctacatctgctgaagaagccaacgacctagcatatgagttagttacttaa
aactattttgaagaaatatttgggtattgggaagatatcactgtttacaatgatgcaaac
catgaagcaaacaaactaaaatttgattaagaaaaataaaacttaagcaaaaaagttaat
taaaaaaatcaaagtagaaaaagaatcataaatttccttatttagaatagaacaaaaata
aaatttataaatgaaattgagctaaattttaaaaaaattttaaacttcttggaaccaaga
gtaaatatggataataaagaactaattttgaaaaaactcaaacagcttttaattactaac
ttttctttatttcagtcaattttaaagttgtactaaatttagatttaaataatttctgca
atttatttaaagaaaataaaaagctagaaggaaattaccattttaacttaaaaattaaac
taaatttatgaaaataaaaaacaaatttcataagttgttgattaaagtcttgaatacaga
gtaagaacaaagttaataaaatattcaaattatgacgaatttaaagttgcttcaaataat
ctttaagaatttttgaatgatttataatctgaattataatttttactggataaaagtgtc
tctaaataaaaaatgaagccttatattaattaatcctaaagtagattaaatcaatttact
tttgaaaagtaaaaatgcctccataaaaaatctaaatagtaaataaaatactaaaaagaa
taattaagaaaagcaatataaaaagatttacttttctga
DBGET
integrated database retrieval system