Tetrahymena thermophila: TTHERM_00299950
Help
Entry
TTHERM_00299950 CDS
T01020
Name
(RefSeq) WD domain, G-beta repeat protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
WD40_WDHD1_1st
WDR55
WD40
WD40_Prp19
WD40_CDC20-Fz
Beta-prop_EML_2
EIF3I
Beta-prop_TEP1_C
Beta-prop_DCAF4
Beta-prop_IP5PC_F
Nup54_57_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7833035
NCBI-ProteinID:
XP_001024522
TGD:
TTHERM_00299950
UniProt:
I7M3T7
LinkDB
All DBs
AA seq
1398 aa
AA seq
DB search
MSTNQQFKPNLFQQKTFFQGYLSSALLKDIHNTLGVLYYQQRSNEQDNYNQSENEKKLSQ
NKQIPYQIQDFDLNENDQIYNEYKEIGLAIAIGPQYLLCNIDNILINDQIVQEDRLLFRC
QNREYRVKQILYQQEEYVSNTDADILEQKTEDKIFSCDYAVLIIEREIQEYVGVLQIENS
FYFLQDYDQYNENKCLYVLSNTFLLERYVQDIQQNTVYIEQINQLEQICPVYIHMDSNQT
SSPLLIGFYKNVNKFKQGIIQLFDSNTFLQILSWVQGYQSIAYTSKYTQETQYPYQNDKY
LTKETLQKSIEERDKKLNVELKQNLYKQGCVWKLQRLNHRVMCSSSGDFKLKIWDTTTNT
LVRVLDLGNNICRDLVCFNDILICACDNVLQIFNWETGQIIQKLTFKDKIQCLGQFELHK
DVIATGHQNGYIHILKFSKRKSQWQAIQVIKNNQHEEHGHESFVNSIVGLNNYEMASAGT
NGQIKIWNWQSGEFVKELQAHLPNKSVYFMKYLADRDTLISGGSDKSIRIWDLKNNQFKE
FSFKNPLYTVELITSRYLCVGDGQDVIIYDINMNISTVIYSTTSRVNSIIKLNPNCLAVG
DTDGQILLFKYSFNQSINECYQFNPNAFNSQSSNKEENTISRSPSKNVAETFCQNEKSGI
KSQYQTESHPISSLASPLEYNTKQSQPPSNQNQDSSLLVQVNNQNANNDLNLLLSNRSNL
KKSETLSNQFKKYQTISQNLKDQFVNQSSQLTTSRNENNKQSIQENPLNSNFGQLSSNFT
LQGSSNNNFITQQLQDQQCEINENRQTLINEQNVFRLKLEDRDEQLKKVHQKYAKLFEQI
FIILENYEANKLVLQHLKKDFESINQDLRKYFTNMDLIYIKQVKNLESIMQNKDKEQQIQ
MKTIQDALQNKQIQLEELQKSFDNQKMIIESQVEDSLKKNAYIDLLSKQINEKDNMILDS
QDRIKELMQLINGLQNRMSGKTITKITTPSKETPLKIQQFNQQSRKDSQIEKENSSSFLT
DKVIYSYRNQSKFQSSENHQTTSEPKIPTIVNSTKLLKNAQYPQKGNLNQVDKILEQSQI
EKSITNSNNSNMTEKILQTNLILNTPIKKDQFDKHLKTDNNLTNSIKLTSTEFDQQDIYE
SLSYKLNNNISKNSQGVIRSKSYSKPSTYLQNSQTSTNINQENSTFRIIHSKNATPDIKE
KSLSTFESIQKPILQNNTSIINQTANTQISPIKSQFSPMSKTNGQIVIKIPQPTQVCTQS
REDLIKIVNDPQPPSLQQILQTASDIENMNSKQPFETNKNIQFQSNQNILDTQLSKENYE
TIFSYISKENQQSKKQLNQIQSFESNQQIINKQLPKQEKLNQFSDQISEKVIASKVGNIT
IQSRIVRSTSQKPHQIQQ
NT seq
4197 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcacaaatcaataattcaaacctaatttattctaataaaaaacatttttttaagga
tatttatcttccgcccttttaaaagatatacacaatactctaggagttctctactactag
taaagatcaaatgaataagataattataattaaagtgaaaatgaaaagaagctatcataa
aataagcaaataccctattaaatataggatttcgacctaaatgaaaatgattaaatttac
aatgagtacaaagaaataggactagctattgctataggtccttaatatttgctctgcaac
atagataacatcttaatcaatgattaaatagtttaagaagatagactcctatttaggtgc
taaaatagagaatacagggttaagcaaatcttatatcaataagaagagtatgtaagtaat
actgatgcagatattttggaataaaaaactgaggataaaatcttttcttgtgattatgct
gttttaattatagaaagagaaatttaagaatatgtaggagttcttcaaatagagaatagc
ttttatttcttataggattatgactaatataatgaaaataagtgtttatatgttctcagt
aatacttttttacttgaaagatatgtacaagacatttagcaaaatacagtttatatagaa
taaattaatcaattagaataaatatgccctgtttatattcacatggattctaatcaaact
tcatccccacttcttattggcttttacaaaaatgttaacaaatttaagtaaggaatcatt
caactttttgactcaaatacttttttgtaaatactttcttgggtttaaggatactagtcc
attgcttatacatcaaaatacactcaagagacctaatacccttattagaatgataaatat
ctgacaaaggagactctacaaaaatctattgaagaaagagataaaaagttgaatgtagaa
ctaaaatagaacttgtataaataaggatgtgtttggaaattataaagactcaatcatagg
gttatgtgcagtagctcaggagattttaaattgaaaatatgggatactacaactaatact
ttagttagagtattggatttgggaaataatatttgtagagatttagtctgttttaatgat
attctaatatgtgcctgcgataatgttttataaatttttaattgggaaactggataaatc
atataaaaattgacatttaaagataagatctaatgtttgggttaatttgagctacataaa
gatgtgattgccacaggacactaaaatggttacattcatattttgaaattttcaaaaaga
aagagtcaatggtaggctatataggtgataaaaaataattagcatgaagaacacggccat
gagtcatttgttaacagtattgttggacttaataattatgaaatggcaagtgcaggaact
aatggttaaattaaaatatggaattggtagagtggtgaatttgttaaagaattgcaagct
catctgccaaacaaaagtgtttatttcatgaaatatttagcagacagagatactttaatt
agtggaggttccgacaaatcaataagaatttgggacttaaagaataatcaattcaaagaa
tttagttttaaaaatcctctttatacagttgagttaataacttctaggtatctatgtgta
ggagatggttaagatgttattatttatgacatcaatatgaatatttctacagtaatttac
tcaaccacatcaagagtaaattcaataataaaattaaatcctaactgtctggcagtagga
gatactgatggataaatactactttttaaatactctttcaattagagtataaatgagtgc
tattagttcaatccaaatgcttttaattcacaatcatctaacaaagaagaaaacacaatt
agcagatcaccttccaaaaatgttgcagaaacattttgttaaaatgaaaaaagtggaatt
aaaagctaatattaaacagaaagccatcctatttcctctctggcttctccattagagtat
aatacaaaacagtcatagcctccatcaaattaaaatcaggattcttctctattagtataa
gtaaataatcaaaatgcaaacaatgatttgaatttgttgttaagcaacagatcaaattta
aaaaagagcgaaactctttcaaattaattcaagaagtattagacaattagctagaattta
aaagattaatttgtgaatcaaagcagccaattaacaacaagtcgaaatgaaaacaataag
tagagtatctaagaaaatcctttaaatagtaactttggatagttaagcagcaattttaca
ttgtagggttcctctaataataatttcataacataataactctaagactagcaatgtgaa
attaatgaaaatagataaacgcttattaatgaataaaatgtttttagacttaaattagaa
gatagggatgaataactcaaaaaggttcattaaaagtatgcaaagctatttgagtaaata
tttatcattttagagaactacgaagcaaacaaattagttttgtagcatttaaagaaagat
tttgaatctataaattaagacttaagaaaatactttactaatatggatttaatttacatc
aagcaagttaagaatttagaaagcataatgcagaataaagataaagaataataaatataa
atgaaaacaatacaggatgctcttcaaaataaataaatttaattagaagaactttagaaa
tcatttgataattaaaaaatgattattgaatcttaagtggaggattctttaaaaaaaaat
gcatatattgacctgctctcaaaataaataaatgaaaaagataatatgatactggattca
caagatagaattaaggaacttatgtaattaataaatgggctacaaaataggatgtctggt
aaaacaataacaaaaataactactccatccaaagaaactcctctaaaaatataataattt
aattaatagtcaaggaaagatagttaaatagagaaagagaattcatcttcttttttgact
gacaaggtaatatactcatacagaaattaaagtaaattttaaagctcagaaaatcaccaa
acaacttctgagccaaaaatacctacaatagtgaacagcacaaaactgttaaaaaatgcc
taatacccataaaaaggtaatcttaaccaagttgataaaatattagaataatcttaaata
gaaaagagtattacaaactcaaataactcaaatatgactgagaaaatattgtaaactaat
ctaattctaaatactccaataaagaaagattaatttgataaacatttgaagactgataat
aacctaacaaattcaatcaaactaactagcacagagtttgattaataagatatatacgag
tcattgagctataaattaaataataacatttccaagaatagctaaggagtgataagatcg
aaatcatattctaagcctagtacttatctttagaattcataaacctctactaatattaat
taagagaattctacatttagaataattcatagtaagaatgctactcctgacataaaagaa
aaaagcttaagtacgtttgaaagtatttaaaagccaattctataaaataacacatcaatt
atcaatcaaactgcaaatacataaatttcaccaattaaatcttaattttcacctatgtct
aaaacaaatggttaaatagtaattaaaatacctcagccaactcaagtttgtacttaaagt
agagaggatttaattaaaattgttaatgatcctcagccaccatctctatagtaaatactt
taaacagcttcagatatagaaaatatgaattcaaaatagccttttgaaacaaataaaaat
atctaattttaatccaattaaaatattcttgatacttaactatctaaagagaattatgaa
actattttttcatacatttctaaggaaaactaataaagtaagaaataattaaattagatc
caaagctttgaaagtaattagcaaataataaacaaacaacttccgaagtaagaaaaatta
aaccaattttcagattaaatatcagaaaaagtaatagcaagtaaggtaggaaatataact
attcaaagcaggatagtacgtagtacaagccaaaagcctcatcaaatataacaatga
DBGET
integrated database retrieval system