Tetrahymena thermophila: TTHERM_00300010
Help
Entry
TTHERM_00300010 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF7630
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7833041
NCBI-ProteinID:
XP_001024528
TGD:
TTHERM_00300010
UniProt:
I7MID4
LinkDB
All DBs
AA seq
2404 aa
AA seq
DB search
MYLKRYSIQTISFQHQLQIYDYFNGNLLVQSDLNFGKTFNILYYDPDAHVLALYESDKKM
SENNQFSLVFIYNYFEFKLIPPKGQSKNNKADTILEDIDNMHHFTIFNQPLICRIDFINS
FFICDEYYKVNLSKQIITLDYPLTSEINQYQDQVLNIFQKATNQTQKSSEEFFVSSKDFL
LLHNGIKGRKFYMEIDCMIRESNNFIINRIESFFICISIDNQIINIYSFLPKPKLNQDNQ
LLSYKLLRSFQVQEYIQDYKFFFFKNSVLVSINHTINVYNTDAIVSSKQDTKIKPIIQQV
DGEIIFIDSDQQTILTYNKNIYQRIWLNGYIEVWNLDKFDDMEIVEYVSSFKDELDNSII
FVGKIQINIDNYFKQLKQRYHKEENKKQYQDQDSISQDSKIVDDEIEEDIQQLKQKIKIQ
QERGYQLFQTFTIGIDRNTLEKKFYLRSDYRCFDAQNLIEVQHFDAANQQYFLITSCSHL
IVQYKKQISEEVYHNFQDHQKLIVKTISQKNLILFYYTQGKGDIFTHSHSSIKLVINNQV
LTNQISPPHSNFLNNQLINQLIEICTQIEDFIILFYQQDILVYSYRQDNDNIQQQQTLSL
KSSHKIPYNLCKSKKIDFKNDKYGNFWAIALTFSKNENILSVIDLSDIQQGIIDFPLEIQ
IKKSMGCISDQNDEQNYFIDFYTRYIIAYGRYKLCIFNNLGNIKKEIAINQKISIEFNYQ
QHVLLFIVQKGEINDLKNFGIIYDYVHEKSTEMKIEKLNPGIIRSVRMIIIGYTMSDNLI
SFICTDLENQYVYSYTHILNKQYLPKYNQASFLERIKYTNECSQKTQSYERYFIKSFIFE
EKNYIVNIYYDSIQIYQISKYLKIVLRLLYCILPENQEESTVKPYRNFLDLKIFETSIES
YYWSDIQDNKDLQEDDTLLVMAIVFTNRITLYQLDQDNHPELIAYATFDQHINEIIELSE
IGKQIIVLVARSQNNLYTYKFHVRKRQQICSVDWSSSKQGQYLKNKNDIVERSRINYLFN
HLKFPQYFYLNHGLQNTNQILDLSYISTLKNIYLYYQSLQKYQMTYIDFEKINNQEIFAI
HFESFELSINQYQIQFNDYKSVVLDNFEIKLDNNMVYYGFITIKNVNYVQISNFRLKGTT
DQSNQNQEQYNQGIGYIFKFINCKKVKIFNFQMKNFKWSSISSFFILESIRDVQIEKFDV
ENNKFRGYLIRLNFIISAQINHLIFKQNKQISILDVDNAEEQSTETTYVYLYNFFFSNSF
IESNEFSLTNVNFKYGGNIIHKNIQINNNTFQNPYLFSFNPDKIKIIDTIFDGNVLIQTN
LIDIQNGKILLEKLKLFKNLQNAVQNHHYTLQYEQNAPQFPIILFKSSAITIYQSQFQDN
VIFFMLILAENSQIQVDQCKFVSNFCRNSNMGCCLSTQESSLNLIHSIFIENLSVSGSAG
KFYKCIGDIKINGCLFQMNKAQFYGGALLLEQCSQIQIKKSTFIQNEAMIGGAIRYLQTY
PYNFLNNYDIYDNKIYNNEAYFYGQNIGSYIRLIQVKEVFEQYVDFDDQMSIIKKDFLVQ
DQNIIKIFNFTSGRHLQINWDMADEERRRLIQSEIIDLNLKIIEEQDINEKEYEIIKKYD
LKISNKAAKILSYQKAIEDNILQIDINLVGEEQGQILVKIKFPDVLIPKNEVKRSKIISQ
EEITSNQGGENIFMFPLEVYLILEIRPCQQGETQIILQSRETKYFICQECLRGTFSKTVN
PNQDTVCKKCDPQNSECFKNYLFTKKGYWRYKESIFTCPYSESCIGGNGQGDDLCQEGYK
GALCQSCDSNFTRSSKQFVRYGFDRCIECDSVVDKILNLSLLSILFLLLLIGIAYSSYQK
GIKKIQIQYLIKMGLLSAGNSANFFQSVYFAKLLLGYLPMIQLYRKYGSYLDTHVFNVWN
KISMIFSQLSYSLECIIAKVFFKIGAFYPSRIVVTSVGPMIVLLTVILITCILHKKKLIK
DQLKDSINTQLILIIGLFYSCIAINNLLECLHYIQIEDKNFSLADTSIDANNESYQMFLS
YYISIFIIFWTLLVPSLLALKLFSMRNSLDMIKMNWQYGFLFQEYKIKYYFWDFVKLLVR
NFIFFFVNLSGQEQLTEDGILIIVTLILYIWSLIAFMPYKKRSHNSIDIALSCSSIVTAF
LTTFGYDIEEKEKSLFKICEILTDLLNIVLIIFIVQSMEIMNIKRMRQKFHNNLSWKTLK
LWNELRKKVLRYKSQQKQMKSASFDYLPIFDNLGKLNKIYGNFQIKFISKKMSQTMYHVL
NLQVQTQMQFKKMNNLFKMIPQISHSCVVLMASYDFIIPWFYQKSLQKVKAKLAMQIKKR
PAQQIKRFIIGCLLDRDINKNRASQLSSYLNLQKIIIEITFTQKQNEMLKKNISIQNLFQ
TNYL
NT seq
7215 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatcttaagagatattcaattcaaaccattagcttttagcattaactataaatatac
gattattttaatgggaaccttttagtttaaagcgatttaaattttggaaaaactttcaat
attctatattatgatccagatgctcatgtcttagcactctatgaatcagataaaaaaatg
tctgaaaataatcaattttcattagttttcatttataattattttgaatttaagctcatt
ccacctaaaggctaaagtaaaaataataaagcagatactatattagaagacatagacaat
atgcatcattttactatcttcaatcaacctttaatatgcaggattgatttcattaacagc
ttttttatttgcgatgaatattacaaagtaaacttgtctaaataaataataactcttgac
tatcctctcacaagtgaaataaattagtattaagattaggtactcaatattttttagaaa
gcaacaaattaaacataaaaatcttctgaggaattctttgtatcatcaaaagatttttta
ttattacacaatggtataaaaggaaggaaattttatatggaaattgattgcatgattaga
gaaagcaataattttataataaataggattgaatctttctttatttgtattagcattgat
aattaaataataaatatctattcttttctacctaagccaaaactaaattaggataatcaa
cttctatcttacaagcttttgagatccttttaagtataagagtacatctaggactacaaa
tttttcttctttaaaaacagtgtacttgtgtcaattaatcatactatcaatgtttataac
acagatgcaattgtttcaagcaaataagatacaaaaataaaacctataattcaataagta
gatggagagattatatttatagactcagaccaataaactattcttacatataacaaaaat
atttatcaaaggatatggcttaatggatatattgaggtgtggaatttagataaatttgat
gatatggaaattgttgaatatgtcagttcatttaaagacgaattagataattctattatt
tttgtagggaagatataaataaatattgacaattattttaaataacttaaataacgctat
cataaagaagagaataagaaataatattaagattaagattcaatcagctaagatagtaaa
atagttgatgatgaaatagaggaagatatttaataattaaagcaaaagataaagatttaa
taagaacgaggatactaattgttttaaactttcactataggtattgacagaaatactcta
gaaaaaaaattttatttaagaagcgactatagatgttttgatgcataaaatttgatagaa
gtttagcattttgatgctgctaatcaataatatttccttataacttcttgttcacattta
attgtttaatacaaaaaataaataagcgaagaagtatatcataacttttaagatcattaa
aaactaatagttaaaactatttcttaaaaaaacctaattttattttactatacctaagga
aaaggagatatatttactcatagtcattcttcaataaaattagttataaataactaagtt
ctaacaaattaaatatctcctccacatagcaactttttaaacaattaattgataaattaa
ttgatcgaaatatgtactcaaatagaagacttcattattctattctattagcaggatatt
ttagtttatagttatagataggataatgataacatataataatagtaaactttgagtttg
aaatcctcgcataagatcccttacaacttatgtaaatcaaaaaaaattgactttaaaaac
gataaatatggaaatttttgggcaatagctttgactttttccaaaaatgaaaatatttta
agtgtgattgatttatcagatatttaacaaggtattatagactttcctttagaaatataa
ataaaaaaaagcatgggctgcatatctgactaaaatgatgagtaaaattattttatagat
ttctatactagatatataattgcctatggaagatacaaactatgcatttttaacaatttg
ggaaacataaaaaaagaaattgctatcaattagaaaattagcattgaatttaattattaa
tagcatgtgcttctttttatagtttaaaaaggagaaataaatgatttaaaaaattttgga
ataatttatgattacgtgcatgagaaatctactgaaatgaagattgaaaaactaaatcca
ggaattataagatctgtacgaatgataattattggatacacaatgagtgataatcttatt
agcttcatttgcacggatttagaaaactagtatgtctatagctatacccatatacttaac
aaacagtacctacctaaatacaattaagcaagtttcttagaacgaattaaatacacaaac
gagtgctcacaaaaaacctaatcttatgaaagatattttataaagagttttatatttgaa
gaaaaaaactatattgtaaatatctattatgattcaattcaaatttattaaatatctaag
tatcttaaaatcgttcttaggcttttatattgtatcctacctgaaaaccaagaagagagc
actgttaaaccttatagaaattttttagatttaaaaatatttgaaacgtccattgagagt
tactattggtctgatatataagacaataaagaccttcaagaagatgatactcttttagta
atggcaatagtttttacaaatcgaattactttatactagttggatcaagataatcaccca
gaattaattgcctatgcaacctttgactagcatataaatgaaattattgaattatcagaa
attggaaaacagataattgttttagttgctcgcagttaaaataatctatacacgtataag
tttcatgttagaaaaagacagtaaatttgttctgttgattggtcaagctctaaacaagga
tagtatttaaaaaataaaaatgatattgtagaaagatcaagaattaattacttgttcaac
catttaaaatttccataatatttctatctaaatcatggcttacaaaatactaactaaatt
ttagatttatcttatattagcactttaaaaaatatatatctctactatcaatcactttaa
aaatattaaatgacttatatagactttgaaaaaataaacaactaagagatatttgcaatc
cattttgaatcttttgagcttagtataaatcaatattaaatacagtttaatgattataaa
tctgtagtactagataattttgaaataaaattagataataatatggtttattatggtttt
attacaattaaaaatgttaactatgtttaaatatcgaatttccgtctaaaaggaacaaca
gattaaagcaattaaaattaagaataatacaaccaaggtataggctatatttttaagttc
attaattgcaagaaagttaagatatttaatttttagatgaaaaattttaaatggagttca
attagcagcttttttattctagaaagtataagggatgtttaaatagagaaatttgatgta
gaaaataataagtttagaggttatttaataagattgaattttatcatatcagcttaaata
aatcacttaattttcaaataaaataaataaatttccattctagatgtagataatgctgaa
gaacaaagtactgaaacaacttatgtctacttatataatttttttttttctaattcattt
atagagagcaacgagtttagccttacaaatgtaaactttaaatatggaggaaacattatc
cataagaatatttaaataaacaacaacaccttttaaaatccatatttgttttcttttaac
ccagataaaataaaaataatagatactatttttgatggaaatgtgcttatttaaactaat
ttaattgatatttaaaatggtaaaattcttttagagaagctgaagttgtttaaaaattta
taaaatgctgtttagaaccatcattacactcttcaatatgagcaaaatgctcctcagttc
cctattatattatttaaatcatctgcaatcacgatctattaatcataattctaagataat
gttatattttttatgttaattcttgctgaaaattcataaatttaagtagattaatgtaaa
tttgtaagtaatttttgcagaaattcaaatatgggttgttgcttaagcacttaagagtct
tcactaaatttgattcattctatttttatagagaatttatcagtaagtgggtccgctgga
aagttttataagtgtattggagatattaaaattaatggctgtttgtttcagatgaataag
gctcaattttatggaggagcgcttttattagagtagtgttcttaaatacagattaaaaaa
agcacatttatataaaacgaggcaatgataggtggagctattcgatatttatagacctac
ccttataattttttaaataactatgatatttatgataataagatatataacaacgaagct
tatttttatggataaaatattggatcatatataaggttaatttaagtgaaagaagttttt
gaataatatgttgattttgatgatcaaatgagcataattaaaaaagattttttagttcaa
gattaaaatatcatcaaaatatttaattttacaagtggaagacacttgtagattaattgg
gacatggctgatgaggaaagaagacgtcttatataatcagaaataatcgatttaaattta
aaaattattgaagaataagacattaacgaaaaggaatatgaaattataaaaaaatatgat
ttaaaaatcagcaataaagctgctaagatattgagttattaaaaagccatcgaagataat
atactccagatagatattaacttagttggggaagagtaaggctaaatattagttaaaata
aaatttcctgatgtccttattcctaaaaatgaagttaaaagatcaaagataattagctaa
gaagaaataacctctaattaaggaggagagaatatttttatgtttcctcttgaagtttat
ttaattttagaaattcgtccctgttagcaaggagaaacacaaattatcttgcaatcgaga
gaaactaaatattttatttgctaggagtgcttgagaggaactttttcaaaaactgtaaat
ccaaattaagatacagtttgtaagaaatgtgatccctaaaattcagaatgcttcaaaaac
tacttatttactaaaaaggggtattggagatataaggagtccatttttacttgcccatat
tcagaaagttgtattggtggaaatggttaaggagatgacctttgctaagaaggctacaaa
ggagctttatgctagtcttgtgattctaatttcacaagatcctctaaacaatttgttaga
tacgggtttgatagatgcatagaatgtgactctgttgttgataaaatattaaatctttcc
cttttgtcaattctatttttacttttattaattggtattgcttattccagctatcaaaaa
gggattaagaaaattcagatttaatatttgattaaaatgggcttgctctcagcaggaaac
tcagctaattttttttaatctgtgtactttgccaaacttctattgggatatttacctatg
atttagttataccgcaaatacggctcttatttagacactcatgtatttaatgtctggaac
aagatatctatgatattctcatagctttcatattctcttgaatgtatcatagcaaaagta
ttttttaaaataggtgccttctacccctctaggatagtagtaacttcagtagggcctatg
attgttttgctaactgttattttaatcacttgcattttacataaaaaaaaattgattaaa
gatcaattaaaagactctatcaatacgcaattgattcttataataggacttttctattct
tgcatagcaataaataatttacttgaatgccttcactatatatagattgaagataagaac
ttttcactagccgatacttctatagatgcaaataacgaaagttattaaatgtttctttca
tactacatctcaatattcataattttctggacactgcttgtacctagtttattggcgtta
aagcttttcagtatgagaaattctctagatatgataaaaatgaactggtagtatgggttt
ctcttttaagaatataagattaaatattatttctgggattttgtaaagcttttggtaaga
aatttcatcttcttttttgtcaacctgagtggataagaatagcttacagaagatggaatt
ctaatcatagtaacgcttattctatatatttggagtctgattgcattcatgccttacaag
aagagaagccataattcaatcgatatagccctttcatgctcatccatagttactgcattc
ttgactacttttggatatgacatagaagaaaaagaaaaaagtcttttcaaaatctgcgaa
atattaacagacttactaaatatagtcctaatcatatttattgttcaaagcatggaaata
atgaatataaaaaggatgaggcaaaaatttcataataatttgtcatggaaaacactaaaa
ttatggaatgaattacgaaaaaaagtacttcgatataaatcttagtaaaaataaatgaaa
agcgcttcatttgactaccttccaatatttgataatttaggtaaattaaataaaatttat
ggcaactttcaaattaaatttatttcgaaaaagatgagttagacaatgtaccatgtgctt
aacctataagtttaaacataaatgcaatttaagaaaatgaataacctcttcaaaatgatt
ccttaaattagccattcttgtgtagttttgatggctagctatgattttatcatcccttgg
ttctatcaaaaatctctttaaaaagtaaaagcaaagctagcaatgtaaattaaaaagaga
ccagcgtaataaataaagaggtttattataggatgtcttttagatagagatataaataaa
aatagagctagctagctttcaagctaccttaatttgtaaaaaattataattgagattact
tttacataaaaataaaatgaaatgcttaagaaaaatatatctatttaaaatttattttag
acaaattatttatga
DBGET
integrated database retrieval system