Tetrahymena thermophila: TTHERM_00300100
Help
Entry
TTHERM_00300100 CDS
T01020
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7838347
NCBI-ProteinID:
XP_001024537
TGD:
TTHERM_00300100
UniProt:
I7M3U0
LinkDB
All DBs
AA seq
1602 aa
AA seq
DB search
MISVHISNKEKSKRRSGSSCGNNRLLGNQGVSSERNQDDINEECLYLNYLSIFKIDKIPT
NYSYISELYLSHNMLRSLKGIEQFKSLRILHLKFNFIAEFEEIDRVVNKFYLKNLNLKGN
PIMKIEKNRLTLNYLKQNLFENLVLFNSDEPDPQNNENHQQYIKDHYELQRQALKKGSET
GRNDQQMEKQRLLSGFQNGSNNCLSSRSISNQLQNDQFQIVKCLPQKLKHTRHQSSCSTI
SLNSKQNIDNYLRQANQNEARIPLNCTNLSNQGVGQFEPGQLNIYKITPLKRGASIHSIN
SLNKTNQNLIDQSINNRSSSRLTNQDFSNNTLRGNNSQTKFQIQIQQNESSQFEDQQDCD
QMQQNQDSEINQNEESEDQNILIQDVRSCDESNNAKSILCEQYVELSEVIQKEREKSLEN
IRQLKQDVKQVQKNLQCLQKNIEQQKNIEQIVLNISQIQPQLQNSHKLPSSALKSARNSN
YQQQISLNQFLNSSINGNSTSRTHRYQNSAQFLQQQQPQIPILQSSNYNNMISIDLKGAN
KSQSSQQNNLKLLISNQQNNLAPSSNSKFIQKVIHQQQKQFIDENISYPNEENYQELSQQ
KVKLNNYANHEFQVQSTNQKQIHQNYQHDQQQPSSQNLINGDFQMDQNQNSNRCKLQYDG
NFNQINNFQKVQNHNIIDVIHQAQQEQPKIQNVQIQNYLMNYNQDNQDCSKNKRLTQNNK
ILKDQMHLQKINQQTNNQPSRCKNLQNQLSQDIKSIQANIVLDNQTQRERNFYNNQRQNC
IQDKENLLNLQSQSPRIVSSPLNAIQHSNNTPLQSSQNINLNYLQSRQNELNKSPNNIQK
NYQNQQINQQQQSQQNLQTNNFSDYYKQQLNRIDAGSNQRTGQSTNKMSSSKSQYIQSKR
NIGENNTYKDQSSSLVNIKYSNQKKQFHQKSLTNVQDLLHSSNFYQQMSQFQNQQAINDS
QSFITPRGVISNTSLTNQYNLNVKGSDDNILVNSQQALSTPLKHSYSNILLNQDLNSSTY
KNSQLMSNQNLINPQQNFIQNPPSAFSTPLIDSNKKQSNSYQIQLQQQQQQQKQGQHFSQ
QYINLKLNKALSQDLQSQNLQSFGSIQPEIFVENFPLNFQDQNNKQLARNDALKIASSTQ
ASNYGDQTQILTDRQSQAQNNFSLLSKNMLNSGNNNFTMTSGAKTYGETFNTEMQSPSSA
QYQNQVIQVNQLLSSTASQSCNSQYFNAAISNKQALNKIDNQNKEKLPQIQYNLNNPAIS
TLSSPLKQPSQVNGSPLLLTLNGFSNTMQSSGKISFQNSQRGFSNIQEPIHVQDTFTFED
SLRNYAQQRTEAEEESLQNTQNNLQEKTLACDKNKLIVNDESTEYDKEEEEDIYSSKFLI
NQRTNVQTTQRNPLSYSRLNTFSQNEQESEQTAQSNNNLQYFTKNSNYDVYQSYAAQQNQ
LQTYSQTSTPLKSSYVIQTPQQQSNQKQAIQSSRIHAEEPIEQTSQKNQQFLSGSSQTLV
EKHIDDIDCDITNLAIKYYNRNLQAKIFKNFKIQIKSSLIEKRDNENIQKSLMFYYRALK
AKAFYSWRSFQTTKLNYKKAIQKINYVKELHQDHKEQSNILE
NT seq
4809 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataagtgtccatatctcaaataaagaaaaaagtaaaagaaggagtggtagtagttgt
ggaaataatagattacttggcaattaaggggtttcatcagagaggaattaggatgatatt
aatgaagaatgcttatacttaaactatttatccatatttaagattgataaaattccaact
aactattcttatatctctgagttatacctctctcacaacatgcttcgctctttgaaaggc
atagagcaatttaaaagtttgcggattttgcacttgaaatttaattttattgctgaattt
gaagaaattgatcgtgttgtaaataagttctaccttaaaaacttgaacctaaaagggaac
ccaatcatgaaaattgaaaaaaacagattaactttaaattatttaaaacaaaacttattt
gaaaacttagttttatttaattcagatgagccagatcctcaaaacaatgaaaatcattag
cagtatatcaaagatcattatgagcttcagagataagctttgaaaaaaggtagcgaaaca
ggaagaaacgactaataaatggaaaaataaaggctattaagtggcttttaaaatgggtca
aacaactgcttgtcatcaagaagtatttctaattagttgtaaaatgattaattttaaatt
gtcaaatgtcttccataaaagctcaagcacactcgccattaatcatcctgttctactatt
tctttgaattctaaataaaatattgataactatttgaggtaagctaattaaaatgaagcc
cgaattcccttaaattgcacaaatttatcaaattaaggtgtaggatagttcgaacctgga
tagctgaatatttataaaataactcctttaaaaagaggtgcaagcattcacagtattaac
agcctaaataaaactaattaaaatttgattgactaatcaattaataataggagttcttca
agattaactaattaagattttagtaataatactttaagaggtaataacagttaaactaaa
ttttaaattcaaatccaataaaatgaaagctcataatttgaagatcaataggattgtgac
taaatgcaataaaaccaagattctgaaattaatcaaaacgaagaatctgaagattaaaat
attttaatataagatgtaagaagttgtgacgaatcaaacaacgcgaaatcaatactatgt
gagcaatatgtagaactgtctgaagttatttaaaaggaaagagagaaatcactggaaaat
attagataacttaaataagatgttaaataagtctaaaaaaatctttaatgcctctaaaaa
aatattgagtagcaaaaaaatatagaataaattgttttgaatataagccaaattcaacct
caattataaaatagccataaattgccaagtagcgcattaaaatctgccaggaattcaaac
tattaacaataaatttccttaaattaatttttaaattctagtatcaatggcaattcaaca
agcaggactcacaggtattaaaattctgctcaattcttacaacagcaacaaccttaaata
ccaatactttaatcttcaaattataataatatgataagtattgatctaaaaggagcaaac
aagagctaaagcagtcaataaaacaatttgaagctattaataagtaactaacaaaataac
ttagcacctagtagcaatagtaaatttatttaaaaagttattcattagtagcaaaaataa
ttcattgatgaaaatatctcttacccaaatgaagaaaattatcaagaattaagttaataa
aaggtcaaactcaataattatgctaaccatgaattttaagtttaaagtacaaattaaaaa
taaatacattaaaattactaacatgattaataataaccaagttcatagaatttgataaat
ggagatttttaaatggattagaatcaaaatagtaatagatgtaagttataatatgatggt
aatttcaatcaaattaacaatttttaaaaagtataaaatcataatataattgatgtaatt
cactaagcatagtaagaatagcctaaaatatagaacgtctaaatacaaaactatctaatg
aattataaccaagataattaggattgctcaaagaataaaagactcacttaaaataacaaa
atcctcaaagaccaaatgcatctttaaaagataaattaacaaaccaataactagccttcc
agatgtaaaaatttacaaaattagttatcttaagatatcaaaagtatttaagcaaatata
gttttggataattaaacataacgtgagcgtaatttctataacaattaaagataaaattgt
atttaagacaaagaaaatttattaaatcttcaatcataatctccgagaatagtgtcttca
cctttgaatgccatttaacatagtaacaatactcctttgtaatcttcttaaaatataaat
ttgaattatttacaaagcagacaaaatgagctaaataaaagtccaaataatattcagaaa
aattattaaaattaacaaataaattaataacaataaagctagcaaaacctttaaacaaat
aattttagcgattattataagcaacagttaaataggatagatgcaggtagtaattaaaga
acaggctaatctaccaataagatgagcagctcaaaatcataatatattcaaagtaagagg
aatataggtgaaaataatacttataaagattaaagctcatctcttgtaaatattaaatat
agcaactaaaaaaaataatttcattaaaagtctttaacgaacgtctaggatcttttgcat
tcatctaatttttattagtaaatgagttaattccagaattagcaagcaattaatgactca
taatcttttataactcctagaggagttatttctaacacatcactaacaaactaatacaat
ttaaatgtaaagggatctgatgataatatactcgttaattcccagtaagctttatctact
cctttaaaacattcttattcaaatatcttattgaattaagaccttaattcttcaacttat
aaaaattcttaacttatgagtaactaaaatttgataaatcctcaataaaattttatttaa
aatcctccctctgctttttccactcctctcattgattcaaataaaaaataatccaatagc
tattagatccaattacagtaatagcaataataataaaagtaaggttaacacttttcttaa
caatatatcaatcttaagcttaataaagctcttagccaagatttgcaaagtcagaattta
caatcttttggttctatttaaccagagatatttgtagaaaattttccattaaattttcaa
gattagaataacaaatagctagcaaggaatgatgctttaaaaatagcaagtagtacataa
gcatctaattatggagatcagacttaaattttgactgacagataaagccaagcacaaaat
aacttctccctgttatcgaaaaacatgctaaattctggtaacaataatttcactatgact
tctggggctaagacatacggagagacttttaacactgaaatgtaaagcccttcttctgca
taatatcagaattaagttatttaagtaaattaacttcttagcagtactgctagtcaaagc
tgcaatagctagtattttaatgcagctatctcaaataagtaagctttaaataaaattgac
aattaaaataaagaaaaactcccccaaatttaatataacttaaataatcctgcaatttca
acgctatcttcccccttaaaataaccatcttaagtaaatggctctcctcttttactcact
ttaaatggtttttcaaacacaatgtagtcatctggaaaaatttcattctaaaattcttaa
agaggttttagtaatatccaagaacctattcatgtataagacacttttacattcgaagat
agtttaagaaattatgcttaacaaaggactgaagcagaagaagaaagtttgtaaaacact
taaaacaatttgcaagagaaaactttagcttgtgataaaaataaacttattgtaaatgat
gaaagcaccgaatatgataaagaagaagaggaagacatatacagttcaaaatttttaata
aattaaagaactaatgtataaactacctaaagaaatcctctgtcttactcccgcttaaat
acattcagttagaacgaataagaatctgaatagactgcttaatcaaacaataacttacaa
tatttcacaaaaaactctaattatgatgtctattagagttatgctgcataatagaactag
ttgcaaacctactcttaaacatctacacctttgaaatctagctatgtgatataaactcca
tagtaataaagtaattaaaagtaagcgatttagagtagcaggatacatgcagaggaacct
attgaataaacaagctagaaaaattaatagtttttaagtgggtcttcataaacattagtt
gagaaacatattgatgatattgactgtgatataacaaatctagcaatcaaatattacaat
agaaacctttaagctaaaatatttaaaaattttaaaatctaaattaaatcttcattaata
gaaaagagagataatgaaaacatttaaaaatcacttatgttctactacagagcacttaaa
gctaaagccttctattcatggaggtcgttctaaactactaaactaaactataaaaaagca
atttaaaaaataaactatgttaaggagttacaccaagatcacaaagagtagtcaaatatc
ttagaatga
DBGET
integrated database retrieval system
