Tetrahymena thermophila: TTHERM_00310340
Help
Entry
TTHERM_00310340 CDS
T01020
Name
(RefSeq) PHD zinc finger protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
zf-HC5HC2H_2
zf-HC5HC2H
PHD_2
PHD-1st_NSD
PHD
PHD_NSD
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7842771
NCBI-ProteinID:
XP_001021109
TGD:
TTHERM_00310340
UniProt:
I7M2N2
LinkDB
All DBs
AA seq
2090 aa
AA seq
DB search
MNSSSSLSSKKKSCEGQIILPFLPEWYCYLCRQNKVEKPIVKGYLGNKREKQPDKILNLH
LTCTLFIPELHLYFSSYDGFEVFNVSKVQTEDYQCLICQDSGNPKKGYSIKCREETCCNK
THLACINKTRIYKQENEQKLLKCFTLCRQHARSNPQPYETTYDKLYTEIQNEWIVVYKQL
EEQEKIRQFQEKSMLQQQQKGKGGIMKKQNAQSSNIMNSKLNQQVKIQSEISHKPRANSG
GSNIHNTSDQLLENSQGNLLSENSGLGNISTINTTGGDNFQDSNQQNQHYESSQSNNNKK
KRGRPSKKIDFISSFQQKNQYSVDGTSQSEEKGDIYDSTTKKVFTETREDKSYSREIFPF
DSSAGAMNSKNDANLRPEGFSSPSNTEKKSTNEDINNIQKENEYQRNAYTMLFGFPAVKE
ESQSSQDKNMIVNQNKSATASQQDELKKKNILSEEETEKNQSQSCRRSQRQEIYLQNKKN
EKQQVNLKSAPFRRGSSFDASSCFQNSSGILSQSIYDNPFTKILNSSHNTESQGKLDPIR
SSRSASVPCNNSSNQKANEVIEIDEEEEQYLECGYPNYNDDKRQQNMEQWWFKIDSEYFT
SPQNPSQIISEVLYELNVENDYLKQDVQQINQNAKSSHKNSKSEKQTQFYLFYPKQIKQE
QIEHFCSTPVANLYLQQIQLLQKSKEEDNQSQSFGYQMNISDFEEIESEDHLEIFEESES
ILKKEKSKEIVQSSQKKEQQNGKKKQSAKKQKDDSVKTAKKNRNKQDQNRSQTFDQEALN
KNLRDSTSCKENVEENMLIIDCNDDCQNNDNEEEEDQFENYTKNKADKEMNKQQQNNSQA
YNPQISLTAKEGQDQLNPQQRVQSDQNMDIENDAQKDCFHQQNNKQLENIQPEIIEKKEE
EIDLEISQNVSEEQQNKQNEVKIEELDSCIKESTLQDEESSIKKEEFSENQIKIEEIEKL
PSQLPSQFRQKSSSIKYNQEDKQKYINYYQQEYVSEPLPIKIGKKISALFHSVNGDGYLV
VYDVNENADIKRSYTRNNKSEYQLYGVSKDTDKLKEFIDAHKINTAPGIDENNRRRAVPT
SDTTPQLMFSKIMHLDYDALQIAVKEQIDLNNNLINQQDKGEIDLMLLRNIFFEKQWCMN
QKIFMDWQKSVNQLIQEDKDISCLKKQSTAIWDFLKLSQIQKNIIIGYSDKEEYNTEIYF
MVSSEDDNEQEKHSYPTKRPINSSKQVKDINQQQSIVQKDEIKENESIQNSNQENVKEAN
ENQDQPSSKNQQLESQKEDSQALTAQENQVPINQNSVDVIQVGVEENIQNNTEAVITEKY
LSTLVQNQTLDQKQMEIENCSVSKESIAQSESRKCSENQESLLNEIFNVERNQVGMQGEQ
PENSQQLKDNKQKRKNSSSKMNVQPISKKSEDLSKTEESNKPKDQQNQQTSEQKSKLRAR
KPQNTMQQQTQKLSAYMRKKNAALLQGDASKQQTKASTIFETVRKGKANPNKRLKKNSQF
KSQLETDCMICFSQKNTDNNPVVYCSDCQQSFHKICYGIYEVPEGKFFCDKCKMIRSLKH
KERYQKDILIERFSCPLCVETDLPIKLIYLKNNHEAQHNFRQLDEEGLENESDELKQYID
QSISQLQIENKLNNHGELWMHPFCMFTFNLAKFQDDNIVLTSTDFPNSQANKDSIHSDSS
ISSEDIFSNPSCQICQKSHGITVKCKESECNEYFHPLCAFFQGLQSKVAEKAVEKQNQII
SKKSKKNKQDQNLIELSEQGQLEFEINCKKHCTLLRKQVVADEQSKLEQEGNKTNLSLEI
RQIQENLKQDIDFYLKQIFYRRFGVNYEKICTYFYYYEDFHEEVYLKNNLKIKFYNPHDN
EYQSIQQIKSFLQFGPLPKNQLNNQLHWQNQNNTEEITNSKNQDEEEDIEEIDYGEEEEY
DDDDVRNSYNDEEIDLEDKYYEDDQQKKAQTRKIGYKQNSGANKKGESGLKPKQTTYKKQ
LKQKDQKQNSLPADIDQSEQIQKQNQQDEKDQMKMEIEENLPLQTSLNNEQVKTQENQSN
QKKQKVHEEENIFDQYELEDDFGSQDDYDYENNLQSSKSSQKESDSANKN
NT seq
6273 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagtagttcgagcttaagctccaaaaagaagagttgcgaaggttaaataatatta
ccatttcttcctgaatggtattgttacctttgtagatagaataaagtggaaaagccaata
gttaagggttatttaggaaataaaagagaaaaatagcctgataaaattctaaatttgcat
ttaacctgtactcttttcataccagagctgcatctatacttctcctcatatgacggcttc
gaggtttttaatgtttctaaagtataaactgaggattattagtgtttaatctgttaagat
agtggcaatcctaagaaaggatattcaatcaaatgtcgtgaagaaacttgctgcaacaaa
acccatttggcatgcattaataaaactcgtatatataagtaagaaaatgagtagaaactc
ttaaaatgctttactttatgtcgccaacatgctagatctaatccatagccttacgaaact
acatatgataaattatatacggaaatttaaaatgaatggattgttgtttataagtagtta
gaagaataggaaaaaattcgttagttttaggaaaaaagtatgttgtaatagcagcaaaaa
ggaaagggtggtattatgaaaaagtaaaatgcataaagcagtaatatcatgaattcaaaa
ttgaattaataggtaaagatataatcagaaatatctcacaaacctagggcgaacagtgga
gggtctaatattcataatacctcagatcaactactagagaatagttaaggaaatttattg
tctgaaaattcaggattgggaaatattagcacaataaatacaacaggaggcgataacttc
taagattctaattagcagaattagcattatgaaagcagccaatcaaataataacaaaaaa
aagaggggaagaccttcaaagaaaatagactttattagttcgttttaataaaagaattag
tattctgtagacggcacatctcaaagtgaagaaaaaggtgatatttatgattcaactaca
aaaaaagtatttacggagacaagggaagataaatcttatagcagagagatatttccattt
gatagttcagctggagctatgaattccaaaaatgatgccaatcttagaccagagggcttt
agctcaccttccaatacagaaaagaaatctacaaatgaagatattaataacatttaaaaa
gagaatgaatattaacgaaatgcatacactatgttatttgggtttcctgctgtaaaagaa
gaaagctaatcaagctaagataaaaatatgattgtaaactaaaataaaagtgcaactgct
agtcaacaagatgaattaaaaaagaaaaatatactaagtgaagaagaaactgaaaaaaat
tagtcataatcatgccgtagaagctaaagataagaaatttatttacagaataaaaaaaat
gaaaaataacaagtcaatttaaaaagtgctccatttagacgaggaagcagctttgatgca
agtagttgcttttaaaatagctcaggaatactttcttagagcatttatgataatccattt
acaaaaattttgaatagttcacataatacagaaagctaaggaaaactagatcctatcagg
agcagcagaagtgcttctgtcccctgtaataatagcagcaactaaaaagcaaatgaagtt
atcgagatagatgaagaagaagaacaatatttagaatgtggataccccaattataatgat
gacaaaagatagcaaaatatggaatagtggtggtttaaaattgattctgagtattttact
tctccctaaaacccttcataaattatatctgaggttttatatgagctaaatgtggaaaat
gattatctgaaataagatgtttaacaaattaattaaaatgctaaatctagtcataaaaat
agcaaatctgagaaataaacttaattttatttattttatcctaagcaaataaaataagaa
taaattgaacacttttgctcaactccagttgctaatttatatttataataaatttaactt
ctttaaaaaagtaaagaagaagataattaaagttaatcctttggctattaaatgaatata
agtgattttgaagaaatagaaagcgaagatcatcttgaaatttttgaagaaagtgagagt
attttaaaaaaagaaaaaagcaaagagatagtttagtcgtcttaaaaaaaagaataacaa
aatggaaaaaagaagtaatctgcaaagaagcaaaaagatgattctgtaaaaacagcaaag
aaaaatcgtaacaaataagattaaaataggtcataaacattcgattaagaggctttaaat
aaaaatcttagagactcaaccagttgcaaggaaaatgttgaagagaatatgttaattata
gattgtaatgatgactgtcaaaataatgataatgaagaagaggaggaccaatttgaaaac
tacactaaaaacaaagcagataaagaaatgaataaataataataaaataattcacaagca
tataacccataaatctcattaactgctaaagagggataagattaattaaacccatagtaa
agagtctaaagtgatcaaaatatggatattgaaaatgatgcttaaaaagattgcttccat
tagtaaaataataagcaattagaaaatatacagccagaaataatagagaaaaaagaagaa
gaaatagatttagaaataagctaaaatgtaagtgaagagtaataaaataaataaaatgaa
gttaagatagaagaacttgatagctgcatcaaagaatcaacattataagatgaagaaagc
agcattaaaaaggaagaatttagtgaaaattaaattaaaatcgaagagatagaaaaactt
ccaagctagttaccttcacaattcagataaaaaagctcttctataaaatataactaagaa
gataaacaaaaatacataaactactattaataagaatatgtatctgaacctctacctatt
aagattggaaagaaaattagtgctttgtttcactctgttaatggagacggatatttagtt
gtatatgatgtaaatgaaaatgcagacattaaaagatcctacactagaaacaataagagt
gaatattaattgtatggagtttcaaaggatactgataaattaaaagaatttattgatgca
cacaaaataaatacagcgccagggatagatgaaaataatagaagaagagctgttccaact
tcagatactactccatagctcatgttttctaagattatgcatctagattatgatgcctta
caaatagctgtaaaagagtagatagatttaaataataatttgattaattaataagataaa
ggtgaaattgatttaatgcttttgaggaatatattttttgaaaaataatggtgtatgaac
taaaaaatatttatggactggtaaaaatcagtaaatcaattaatataggaggataaagat
atcagctgcttaaaaaaatagtctactgctatttgggacttccttaaattatcacagatt
caaaaaaatataattattgggtattctgataaagaagaatataatacagaaatttatttt
atggttagtagtgaagatgataatgaataagaaaagcacagttatcctactaaaaggcct
ataaatagttcaaagcaagttaaagatattaattaataataatctattgtttaaaaagat
gaaataaaagaaaatgaatctatttaaaattctaatcaagaaaatgtaaaagaggcaaat
gaaaattaagattaaccttcatcaaaaaattaacaattagaatcccaaaaagaagattcc
taagcgctaactgcataagaaaattaagtaccaataaattaaaatagtgttgatgttatt
taagtaggagtagaagaaaatatacaaaataatacagaagcagtaataacagaaaaatat
ttgtcaacattagtgtaaaactaaacacttgattaaaaataaatggaaatagaaaattgc
tctgtcagcaaagagtcaatagcttaatcagaatcaagaaaatgctcagaaaatcaagaa
tcgcttcttaatgaaatctttaatgttgaaagaaattaagtaggaatgtagggtgaataa
cctgaaaatagttaatagttaaaggataacaaataaaaaagaaaaaattcttcttccaaa
atgaatgtctagccgattagcaaaaagtcagaagatttgtctaaaacagaagaaagcaac
aaaccaaaagattagtaaaattagtaaacttcagagcaaaaatcaaagctgcgtgctaga
aaaccataaaatacaatgtagcagtaaacttaaaaattgtcagcttacatgaggaaaaag
aatgcagctttgctttaaggtgatgcatcaaagtaacaaacaaaagcaagcaccattttt
gaaacagtaaggaaaggaaaggcaaatcctaataaaagactgaaaaagaactcttaattt
aaatcctagttagaaacagattgcatgatttgctttagtcaaaaaaatactgataataac
ccagtagtttattgctctgattgctagcagtctttccataaaatatgctatggcatttat
gaagtacccgaagggaaattcttttgtgacaaatgcaaaatgataagatcattgaagcat
aaagaaagatattaaaaggatattctaatagaaagatttagttgtcccttgtgtgtggag
acagatttaccaataaaattgatctatctcaaaaataatcatgaagcctagcataatttc
agatagttagacgaagaaggacttgaaaatgaaagtgatgagcttaagtaatatatagat
taatcaattagttagttataaattgaaaataaacttaataatcatggagagctgtggatg
catcctttttgtatgttcacctttaatctagctaaattctaagacgacaacattgttttg
actagtacagattttccaaactcataagcaaataaagattctattcactctgattcttcc
atttcatctgaagatatatttagcaatccttcttgctaaatttgttaaaagagtcatggc
atcactgtaaaatgcaaagaaagcgaatgtaatgaatactttcaccctttatgtgctttc
ttttagggacttcaatcgaaagttgcagagaaagctgttgagaaataaaatcaaattatt
agcaaaaaatctaaaaaaaataaataagatcaaaacttaattgagctttcagaataagga
taacttgaatttgagataaattgtaagaaacattgtacacttttaagaaaataagtagta
gctgatgagtaaagtaaattagaataggaaggaaacaagactaatttatctctcgaaatt
agataaatttaagagaatttaaagcaagacatagatttttatttgaaacaaatcttttac
agaagatttggtgtcaattatgaaaaaatttgcacatatttttattattatgaagatttc
catgaggaagtatacttaaagaataacttaaaaattaaattttacaatcctcatgacaat
gaatatcaatcaatataacaaataaaatcatttttatagtttggtccattgcctaaaaat
taattaaataactagcttcattggcaaaattaaaacaatactgaagaaataacaaattca
aaaaatcaagatgaagaagaagatatagaggaaatagattatggggaagaggaggaatat
gacgatgatgacgttagaaatagttataacgatgaagaaattgatcttgaggataaatat
tatgaggatgatcaataaaagaaagcacaaactagaaaaataggatataaataaaactct
ggtgcaaataaaaaaggagagtctgggcttaaaccaaagcaaacaacttataaaaaataa
cttaaataaaaagattaaaaataaaactctttaccagccgatatagattaaagtgaataa
atataaaaatagaactaataagatgaaaaagattaaatgaaaatggaaattgaagagaat
ttaccattataaactagcttgaataatgagtaggttaaaacttaagagaatcaaagcaat
taaaaaaaatagaaagtacatgaagaggaaaacatatttgactaatatgagttggaagat
gatttcggatcataggatgactacgattatgaaaataacttataaagtagcaaatcctca
caaaaagagagtgattctgcaaataaaaattga
DBGET
integrated database retrieval system