Tetrahymena thermophila: TTHERM_00313169
Help
Entry
TTHERM_00313169 CDS
T01020
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MMR_HSR1
VPR
COQ7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7825300
NCBI-ProteinID:
XP_002348338
TGD:
TTHERM_00313169
UniProt:
C0NA17
LinkDB
All DBs
AA seq
2121 aa
AA seq
DB search
MTYIRKLKSEITFSFLYDQFIFIKNSKDIQNSSFLQCLTDQKKAQSKILYLTQINSSRLY
GLTQQECSKQFNDELKTKIALKELSERDILNFFLDFYFDLILDLLYRRIPLTSLLKSVQQ
QVQIECLQNLNVSNVLVLVFERLNLIDKINLGQILSCSYQSIPIFYKIEETDENQIYKNN
LISAFYSFMDQFQNHIILNVCSSSIQKKQREEFFNYLANNKDIIADLNEGFNQRGTVHLY
SQFPNSKLSQFTLLDICQLDLLNVQFLRIFTNLMNCSSIILIHLNFEKDFILCTNKYVVS
VETQKIINTLNDKYSVIFIIHKAQKHKAQVEKYFKVYLEYHKFEYKLLLISENDPEPEYD
NLFFQLKNQTLQQTKKQEIIQSFEEFLEAYISNSDFENLNTHIAQYKNLIQQTIKKQLIL
NKISDVESYKLIQHMFSYSNVFSELFYKEKIFDNLSRSYFRETENFVKKGEKLQQLKKKF
ESCNQLSEITIFFFNEITQNNYIKQSVISKILSDWKQPLVEENNKKIDQINQDIRNLEKV
AFKQLSQKDQEYLEQLYKQKNQLIILQDNYDISIESFIREISLFTQNTSKNSFYKIEHAQ
LKVQIQSYYKYAFEKGIPIQFIDKTRKFGSNLLEEFFKQIDQKFRLSDYKIVSVVGPQSS
AKSTLMNYLFRCSFETSSARCTKGMYFTKINFQGMNLIVIDTEGLLSNVFRDQSFDNSVM
TLLFLISNVIIFNIKDESNSKMKEMMSITEEVIKLFNNIQDNYTVPEIFIALRDYFDRNN
IELKKKQIINEMIQVNGIFESQSSKQQNKNQIKLKPENVFIFPSAFSELNYFESRFKHIN
TGFGEDVLQLRKSITNVLKQSKGYLSIQDFYFKAEGIWNRLKEHGHDLLKCITLEEYKSK
KLLEEIALGYQKKIEEKKVNQIEEKEAILKNSLTDNYMDIHSFNRIKQEYSQFITTLNIQ
MNEELEDSLQQDYNDNKLINQLNPRDFYFILNKTQHRNKVNLQVRQNIFEQRIQSLFFGL
QIDVLEKDFNKQIQQEVNQAQFEQNEQSLKKLLDQIQEEYSDKIKQLQKKFETTDELMRQ
QLEQLKNEYVKHYDQNLQNLIQEFSISQIAKQNFDDVKNIIQENQVDQIAKKFLVNSSRL
SSSEYELLINKIQEFFQNLKLVKPNKVYQEQEIVKNIFQQMVDCCKVFFDSIQPDLQQYI
NDTNMYKYTFYILYQIIRDQVKKWQQQVLRKKMEKFQIIIDQKIQHIKKMSETSTDWVEL
GVQAMRSIQNQIVTTFIKKSLSNMEPVLNKTVDDLTSDYTKAIDNAFMSVYDSTEQKINI
DNFLKYTVNINKYIDEMKRDQIKIKAEELVENKTTEFNLGLQNIIDELNQIILHFVNTEI
FDFDQLIEKLNTIYFEGVSLQLGQEIIIENLKNKPQFIEEEEEVQDDDLNCDVEEEKEEE
EQKQENNEVQEIHQDKDKSCYRDNEKVDGLTENEQEINSNKQSQKENGLEKQALDFSEII
MKSCGNNNKEQEDKQKNQIIIFNSSQSQIDMLNDKQKQDSEDSFAMDLNESVINGELSKN
NNDKQIEEVQSNIQGESKNQQSNCMEGQDENQDKILQYGDQNNSQSNIETQEQEKKISNQ
EGDILQENEQDLCNEEKKEDSKHIEKINNQTSIDQEDNNKTKQDNEIQNEVDTIQVDKNN
NSTKHFAENQEEQINHNSAQAEQSQIIENDNIQTSLDKVQSSQDQEDNDKTKQDTEIQNE
VDTNSYSSKNFTNNQEEQKNNDSTQVEQAKLNEKGNTQTSLNSVQSGCEQEDDNKKKQDT
QIQNETGTIQVDSNNNSSKNVQDKQEDDREQCLKINQNDIEDLQKNQNDKQKRASEQQLS
DSDSGKNGSKKEKTRIKKIKIVKKYIPVQSLYIQGMRKIYNEINPTNGNKIILQFKEELN
NEMEQMLKLHYQKMIGCQERCPFCGQKCHLELGHSGDHSVNDRHLIIGIHGYGKQEFYVN
KFCYDTIDEPFRINYQRFENMYEASQKLFPNWSSCFSLDKKNNQDQNFSQILKQGYALTA
KWFANHNNKSRLEDLKENVPQEFKDLAQNQEEIDETYKIQWKYIDDQSSDQSQDDSQDQD
ISQLKQRLLRLFTFIHIILSD
NT seq
6366 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacttacataaggaagttaaaatcagagattactttctcttttctctatgattagttt
atttttattaaaaatagtaaagatatttaaaatagctcatttctctaatgcttaactgat
taaaagaaggctcaaagtaaaattctttacttgacttaaataaattcctcaaggttatat
ggtctgacttaacaagaatgctcgaaataatttaatgatgaactcaaaactaaaatagca
ctgaaagagttaagtgaaagagatattttaaacttctttttggacttttattttgattta
atactcgacttgttatacaggagaattcctttaacttctttgttgaaatcagtttagtaa
caagtttagattgaatgcctacaaaatttaaatgtgagcaacgttcttgttctcgtcttt
gaaagactgaatttgattgacaaaataaatcttggttagatattaagttgctcctattaa
tctatcccaattttttacaaaatagaagaaaccgatgaaaactaaatttataagaacaat
ctgatttctgctttttattcttttatggattaattttaaaaccatatcatactaaatgtt
tgcagcagcagtattcaaaagaagtaaagagaagaattttttaattacttagcaaataat
aaagatataattgctgatcttaatgagggctttaactaaagaggaactgttcacttatat
tcttaattccctaattcaaagcttagtcaatttacgcttttagacatttgttaacttgat
ctgctaaatgtttaatttttaagaatatttactaacttgatgaactgtagtagcataatt
ttgatccatctaaatttcgaaaaggattttattttatgcacaaataagtatgttgtttct
gtagagacataaaaaataattaacacattgaatgataaatactctgtcatttttatcata
cataaagcctagaaacataaagcttaagtagagaaatactttaaagtctaccttgaatat
cataaatttgaatataagttgctgttaatttcagaaaacgatcctgagcctgaatatgat
aatctttttttttagttgaagaattaaactttataataaacaaaaaaataagaaataatt
taatcttttgaagagtttttagaagcttacatctcaaatagtgattttgaaaacttaaat
actcacatcgcttaatataagaacttgatttagtaaacgataaaaaagcaactaatttta
aataaaataagcgatgttgaatcttataagcttattcagcatatgttctcttattcaaat
gtgttttcagaattgttctacaaagaaaaaatatttgataacttatcaagatcatatttc
agagaaacagaaaactttgtaaaaaagggagaaaaattgtaataacttaaaaaaaaattt
gagtcatgtaatcagctgagtgaaataaccatattcttttttaatgaaataacttaaaac
aactatattaaatagtctgtgatttctaaaatactctctgactggaagtagcctttggtt
gaagaaaataataaaaaaatagattaaataaattaagatattagaaatttagaaaaagtt
gctttcaaataactttcataaaaagatcaggagtatttagaataattgtacaaataaaaa
aattaattaattattctttaagataactatgatatttctattgaaagtttcataagagaa
attagcttatttacttaaaatacctcaaaaaattcattctacaaaatagagcatgcttaa
ctcaaagtataaattcaaagctactataaatatgcctttgagaagggaataccaatctag
tttattgataaaactagaaaatttggtagcaatttattagaagagttttttaaataaatt
gactagaaattcagattatctgattacaagattgtttctgttgtaggtccttagtcttca
gcaaaaagtactctaatgaattatctttttagatgtagtttcgaaacctcaagtgccaga
tgcaccaaaggaatgtattttacaaaaataaacttttaaggaatgaatttgatagttata
gacacagaagggttattatccaacgttttcagggactaatcttttgataactcagtgatg
actttactatttttaatctctaatgtgataatttttaacattaaagacgagtctaattca
aaaatgaaagagatgatgagcataacagaggaagttatcaaattatttaataatatttaa
gataattacacagtaccggaaatcttcattgccttaagagactattttgataggaataat
attgaattaaaaaaaaaataaattatcaatgaaatgatataagtgaacggaatctttgaa
agttagagctcaaaatagcaaaataaaaatcaaataaaattaaagccagaaaatgttttt
atattcccaagtgctttttctgaattgaattattttgaatctaggtttaaacatataaat
acagggtttggtgaagatgtgttgcaacttagaaagtctataacaaatgttctgaaataa
tctaaaggctatctatcaatctaagatttttattttaaagcagagggaatatggaataga
ttaaaggagcatggccatgatttgctaaaatgtattacacttgaagagtataagtctaaa
aagttattagaagaaattgcgcttggttactaaaaaaaaattgaagaaaaaaaagtcaat
taaatagaagaaaaagaagcaatattaaaaaatagcttgacagataattatatggatatt
cattcatttaatagaataaaacaagaatatagctagttcataactactttgaatatataa
atgaatgaagagcttgaagatagtctataataagactacaatgataataaattgattaat
taactcaatccaagagacttttacttcatattaaataagacttagcataggaacaaagtc
aatttataagtaagataaaatatctttgagtaaagaatttaaagtttattctttggcttg
caaattgatgtccttgaaaaagattttaataaataaatttaataagaagtcaatcaagca
caatttgaataaaacgaataatcattgaaaaaattacttgactaaattcaagaggagtat
tctgacaagataaaataattataaaaaaaatttgaaacaacagatgaattgatgagacag
tagctagaatagcttaaaaacgagtatgttaagcattatgattaaaatctctaaaattta
atctaagaattttcaattagttaaattgctaagcagaacttcgatgatgtaaaaaatatc
attcaagaaaactaagtagattaaattgctaaaaaatttttagtaaatagtagtagatta
agttcaagcgaatatgagctattaattaataaaatacaagagtttttccaaaacttaaaa
ttagttaaacctaataaagtttatcaagaataggaaatcgtaaaaaacatattttaataa
atggttgattgttgcaaagtattttttgactcaatataacctgatttgcaataatacata
aatgatactaatatgtataaatatacattttatattctttactaaatcattagagattaa
gtaaagaaatggcaatagcaagttcttcgcaaaaaaatggaaaaattttagataataatt
gaccaaaagatctaacatatcaagaaaatgtcagagacttcaactgactgggtagagtta
ggagtttaggctatgcgcagtatataaaattaaatagttacaacatttataaagaaatct
ttgtctaacatggagcctgtactcaataaaactgtggatgatttaacttcagattacacc
aaagcgattgataatgcctttatgtctgtttatgattctacagagcaaaaaatcaacata
gacaactttcttaagtatactgtgaatatcaataaatatattgatgaaatgaaaagagat
taaattaaaatcaaagctgaagaattggtagaaaataaaacaacagaatttaatctagga
ttataaaatataattgatgaattaaattaaattattttacattttgttaacactgaaata
tttgacttcgatcaacttattgaaaaattaaatactatttattttgaaggagtttcttta
taattaggttaagaaattattatagaaaatttaaaaaataaaccttaatttatagaagag
gaagaagaagtctaagatgatgatttgaactgtgatgttgaagaagaaaaagaagaggaa
gagtaaaaataagaaaataatgaagtccaagaaattcactaagataaggataaaagctgt
tacagagacaacgaaaaagtagatggcttaacagaaaatgagcaagaaatcaatagtaat
aaataaagttaaaaggaaaatggtttagaaaaataagctctagattttagtgaaataata
atgaaaagctgtggaaataataataaagaataggaagataagtaaaagaattaaattata
atatttaattcgtcttaatcctaaattgatatgttaaacgataaataaaagcaagatagt
gaggattcttttgctatggatctaaatgaatctgtaattaatggtgaattaagcaaaaat
aataatgataaatagattgaagaagtttaaagtaatatttaaggtgaaagcaaaaattag
caaagtaattgtatggaaggttaagatgaaaattaagataaaatattataatatggtgat
taaaataattcttaatcaaatatagaaacttaagaataagaaaagaaaatttcaaattag
gagggagatatattgcaagagaatgaataagatttatgcaatgaggaaaaaaaagaagac
tctaaacatattgaaaaaataaataatcaaactagcatagattaagaagataataataaa
actaaataagataatgaaatttaaaacgaagtagatacaatttaagtagataaaaacaat
aattccactaaacattttgcagaaaactaagaagaataaataaatcataactccgctcaa
gccgagtaatcataaataattgaaaacgataatattcaaacatcattagataaggtgtaa
agtagttaagattaagaagataatgataaaactaaataagatactgaaatttaaaacgaa
gtagatacaaacagttattcctctaaaaattttacaaataactaagaagaataaaaaaat
aatgattctactcaagtcgagtaagcaaaactaaatgaaaaaggtaatactcaaacctca
ttaaatagtgtataaagcggttgtgaataagaagatgataataaaaagaaataagatact
caaatttaaaatgaaacaggtactatttaagtagattcaaataataactcttctaaaaat
gttcaggataagtaagaagatgatagagagtagtgcttaaagattaattaaaatgatata
gaagatttataaaaaaattaaaatgacaaataaaaaagagcatctgaataatagcttagt
gattctgactcaggaaaaaatggctctaaaaaagagaaaactagaattaaaaaaattaaa
atagttaaaaagtatataccagtttagtcgttatatatataaggaatgaggaaaatttat
aatgaaataaatcctacaaatggcaataagataatactttagtttaaagaagaactcaat
aatgagatggaataaatgctgaaattacattatcaaaaaatgataggatgtcaagagaga
tgcccattttgtggttaaaaatgtcatttagagctaggacattctggtgaccatagtgtt
aatgatcgtcatttaattatcggaattcatgggtatggtaaacaagaattttatgttaat
aaattttgctatgatacaatagatgaaccattcagaattaattactaaagatttgaaaat
atgtatgaagcttcataaaaattgttcccaaattggtcatcttgcttctctttagataaa
aaaaataattaagattagaatttcagttagattctaaaataaggatatgcattgactgct
aaatggtttgctaaccacaataacaaaagcaggctagaagatttaaaagaaaatgtgcca
taagaatttaaagatcttgcttaaaattaagaagaaatagatgaaacatataaaatctaa
tggaaatatatagacgatcaaagcagtgattagtcacaagatgattctcaagattaggat
ataagttaattaaagtaaaggttgcttaggctatttacttttatacatataatattaagt
gattga
DBGET
integrated database retrieval system
