Tetrahymena thermophila: TTHERM_00313190
Help
Entry
TTHERM_00313190 CDS
T01020
Name
(RefSeq) DENN (AEX-3) domain protein
KO
K20163
DENN domain-containing protein 4
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tet00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
tet04131
]
TTHERM_00313190
Membrane trafficking [BR:
tet04131
]
Protein recycling
Rab GTPases and associated proteins
Other Rab GTPase associated proteins
TTHERM_00313190
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DENN
uDENN
dDENN
PPR_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7824659
NCBI-ProteinID:
XP_001033500
TGD:
TTHERM_00313190
UniProt:
Q22KG2
LinkDB
All DBs
AA seq
1161 aa
AA seq
DB search
MIATTNRVFDYFTTIGIDDKLIETHRSEEDLPLIGLEVIQLSSGSFKDTQTEKYVDILGD
KSLWLRCYYGKDKPAITEIGVYYFKIIDGGIAIKAKHNYIPVSIVKSIEDRHPQTTQQTV
EGFDYWKGNFDLTQLIQADYKPGYAFAMSYKVQSKNNFNTQILRVKVITAKISNSNKLKS
GSLHVVVPIQHEVINFSFGLQEQNRVFCLQRDYEIQNKRYKPAVLDRYPLADHMHTPFPD
AVSQFCFPEGVKFKRDNSTQPECFNFVLTLQDGCRIYCTCLIFNEVPDQKVIEQLGHIKI
DDQTPLFVQKAICLISHYNYFDEYKQILKHLYRLSLSKNEIPIERFICNIVDDIRLPLEI
TDWGKLGIQYEIGPETVIFGTSHKYPPFSAKSLLTLFRLLDIDKIIFLFECILLEKKLFI
ISKYKSVITQVAEALISLIFPFQWNHVYIPILPDMFKTYMEAPLPLIIGLEQKLKNFDIS
SGIQSESIQAYLDSNDLINIEWMPALPEKFLKQLKKRLQPYSNLHLPIQDVKNFLDMQDL
AFENPFAEDEIPPVNFDAFDIRDSFLEFVSSFMMKYKKFLIPPDKKKSNKEMSEIFDTRE
FLNFHKSSKQGTFLQKFTETTMFSYFIETRTQISPFEPYYQFFDICLEKKRSKKDPILFV
KEQLTKTIFVQQPSEQDLDKSQYYSYERFPKLKPELFTKCQKLEEVIKAEFNLMEIEQQQ
EDTSQFDEYRWAKYLYEQIYYIWFQIFIVKLKQDFFSPYYTKLTDYAIFLLGQLRKKNHA
LTEIMYRFVIEACGYYGKDDRVIELVQQMKEQKIETSPITHGIFFQAVTQSKEYFAAQEE
IRKKVFENQMTIIEEDSKDNENQEQKIAKGLNNIKLNVGTQIQQQNFKSKFDNILFTIIE
TCPNCNRNLFPEEIISNWKKGNTDYRTKCPIPSCSHEFVSKFQVVTLEEKQGIDITNVSV
YNNLRKQVEFLSPLIVRKEIENIMKQKGQSSIMSNKFEEEHPIIYWNIILYFKLIRAPTF
FLEFNQPEQYYNYHAMLCEKKIQDSIKNQEKGILSKMSEYFFQNKKEEDDKTSHSSFTHL
SPPQDNASMGSVGARKDQKDSAIINFGTKSIKKIFTQLLIKLRKDGENKLHDLELKKQSQ
NLIAEEQGKNSEKMDIPSERQ
NT seq
3486 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagctacaacaaatagggtcttcgattatttcactaccataggcattgatgataaa
ttaatagagactcatagatctgaggaagatcttccattgattgggctagaggttatataa
ttaagttctggtagctttaaggatacatagactgaaaaatatgtagatattttgggagat
aaaagtttatggcttaggtgctactatggtaaagataaaccagcaattacagagatagga
gtgtattattttaagattatagatgggggaatagctattaaagcaaagcataattatatt
cctgtttcaattgtaaaaagtatagaagataggcatcctcagactacataataaacggta
gaaggatttgattactggaaaggaaatttcgatctaacttaattgatttaagctgactat
aaaccaggatatgcttttgctatgtcatataaggtttaaagcaaaaacaatttcaataca
taaattttaagagtaaaagttatcacagctaaaatttcaaacagtaataaacttaaaagt
ggaagtttgcatgtagttgtgcctatttagcatgaagttattaatttttcatttggcctt
taggaataaaatagagtgttttgccttcaaagagattacgagatataaaacaaaagatat
aagccagcagtacttgataggtaccctttagctgatcatatgcatactccttttccagat
gctgtttcatagttctgttttccagaaggtgtgaaattcaaaagggataattcaacttaa
ccagagtgttttaattttgtgctaactctataagatggatgcagaatttactgcacttgt
ttaatttttaatgaagttcctgatcaaaaagtgatagaataactaggacatataaaaatt
gatgactaaactcctctttttgtgtaaaaggcaatttgcttgatttctcactataactat
tttgatgagtataaacaaatattaaagcatctatatagactatccttatcaaagaatgaa
atacctattgaaagatttatatgcaatatagttgacgatattagattgcctttagaaata
actgattggggaaagctaggaattcaatatgaaatagggccagaaactgttatttttggg
acttctcataaatacccaccatttagtgcaaaaagtctgctaactttatttagacttttg
gatatagataaaattattttcctttttgagtgtatcttattagaaaaaaaactattcatc
ataagcaagtataagtccgttattacttaagtggcagaagctttaattagtcttatattt
ccattttaatggaatcatgtatacattcctattcttcctgatatgtttaaaacttatatg
gaagctcctcttcctttaatcatagggctagagcaaaaattaaaaaattttgatatatct
tctggtatctaatcagaaagtatttaagcctatttagatagtaacgacttgataaatatt
gagtggatgcctgcccttccagaaaaatttttgaaacaactcaaaaaaagattgcaacct
tattctaatttgcatttgcctatttaagatgtaaaaaatttcttagatatgcaagatttg
gcatttgaaaatccttttgctgaagatgaaataccacctgttaacttcgatgcttttgac
ataagagattctttcttagagtttgtctcttcattcatgatgaaatataaaaagttttta
attcctccagataaaaagaaatcaaacaaagaaatgagtgaaatatttgacacaagagaa
ttcttaaatttccataaatcttcaaaacaaggaacttttctttaaaaattcacagaaact
acaatgttttcttactttatcgagacaagaacctaaatttctcccttcgaaccttattac
taattttttgatatatgcttagaaaaaaagagaagtaaaaaggatcccatattatttgta
aaggaatagctcaccaaaactatatttgtacaacaaccaagcgaataagacttagataag
tcctagtattattcttatgaacgattccccaagttgaaacctgagttatttactaaatgc
caaaagttagaagaagtcataaaagctgaatttaatttgatggaaatagaacagtaacaa
gaagatacaagttaattcgatgaatatagatgggctaaatatttatatgagtagatatat
tatatctggttctaaatatttatagtgaagttaaaataagactttttttcaccttactac
accaagctaactgattatgcaatattcttattaggttagttgagaaaaaaaaaccatgct
ttaacagaaattatgtacagatttgttattgaggcttgtggatattatggtaaagatgat
agagttattgaattagtttaataaatgaaagaataaaaaatcgaaacatctcctattact
catggaatcttcttttaagcagtcacttaatctaaagaatattttgccgctcaggaggaa
ataagaaaaaaagtatttgaaaaccaaatgacaataatcgaagaagattctaaagataat
gaaaattaagaacaaaaaattgcaaaaggactgaataacataaaattaaatgtaggaact
taaatttaatagcaaaattttaaaagcaaatttgataatattctatttacaattatcgag
acatgtcctaattgtaacagaaatctcttcccagaagaaattataagtaattggaaaaaa
gggaatactgattatagaacgaaatgtccaataccctcttgttctcatgagtttgtatca
aagttttaagttgttactttagaggaaaagtaagggatagatattactaatgttagtgtt
tataataacttaagaaagtaagtggagtttttatctcctttgattgtaagaaaagaaatt
gaaaatataatgaagtagaagggctagagctcaattatgagtaataagtttgaagaagaa
caccctataatttactggaatatcatactttattttaagttaataagggcaccaacattt
ttcttggaatttaactaacctgaacaatattataattaccatgctatgctttgtgaaaaa
aaaatacaggattcaataaaaaattaagaaaaaggtattctttctaaaatgagtgaatat
ttcttttaaaataaaaaagaggaagatgataaaacaagccattcttcttttactcattta
agtcctcctcaagacaacgcttctatgggatcagttggtgcaagaaaagattaaaaagat
tcagcaattattaattttggaacaaagtcaattaaaaaaatatttactcagttgctgata
aagctgagaaaagatggagaaaataagttacatgatctagaattgaaaaagtaaagttaa
aatttaatagctgaggagtaaggaaagaattctgagaagatggacattccatcagaaaga
taatga
DBGET
integrated database retrieval system