Entry |
|
Name |
(RefSeq) dicer-related RNase III protein Dcr2p, putative
|
KO |
K11592 | endoribonuclease Dicer [EC:3.1.26.-] |
|
Organism |
tet Tetrahymena thermophila
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:tet00001]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:tet03036]
TTHERM_00316189
Chromosome and associated proteins [BR:tet03036]
Eukaryotic type
Gene silencing
RISC (RNA-induced silencing complex)
TTHERM_00316189
microRNA pathway
RISC loading complex
TTHERM_00316189
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
AA seq |
1965 aa
MKNLKKALAKKHEEQSLKNSQQDSVIFAKNTENFLKSDSSSSDQDEEFEEKQLPVIKKQY
GFNGIPNSYAFKINDESSDEDDEEIFKDQVSPKINEQGKNTIYEIRNYQKELFKNSYSKN
SIIYLETGAGKTMIATMLINYFFQKQKKAPQKKKIIFLANTVQLVKQQYAEIKNNLQRIS
EMMENDKEISQILKFQEGINYRRIFEKENHIVKCHGSYKQKDNLQIETFTKQKWDYLLEN
YEIFVMIGQVLLNGLRRGYIRIEDIEVIIYDECHHTRQDHPYCLIQYEFYHFHKRRNEQV
QLPKIYGLTASPVLDIEVKSDSNIMKKKISELCTNLDANFVKYNIEESKKYIKEATICVE
EYGEEKNIQERANQFLQEQIIGEKWISDIEDKQNEEMRYTEILNFYIKFQQFKNSYFSNL
SPMNKQILLDIEKIICLYSMQVDAQLGKYSVSLFLKDVNDELQKLGQFQHNNEEMQELKK
LFKAQTEKFIESVDKSEKNISKKFMFLYNKLKQTMIHDKEEFECYKVKNKYYEQEFHQHE
KITKVQKYIKDNQSMILVFVEEKIIIKYLQKLLQIWMDDEDRDKDEDEIIFRYKKIVCLT
GQSNFQDRKKKNLNKNQYQNSEFTQNDNFEFAEEEYRQQQMKQESLISSQINKEEDIDSL
KEKINDHQKSAQRCVLVNLDFEVSKQSENIEAFRKKELQIILSTSVTEEGFDIPSCNLVI
SFNKISNLKSFVQIKGRARKENSKFIIMAKDKYQKQDYETDIESYKDLIQQIKEIAPKVE
KQEIEIRPNYKYKIVKETGAILNTNWSVNLFHTYANQLLYSYDSNIKGPFYYYIEITNVG
FICQIIVPSQSGLKTFCSNPQAQKEDAKKDACFQAVIILYRQYKIFDQYLRNISQKIQNS
QSEKSESLFEDEKDEKLTKILQKYCKSYVDVKQKCKMYYFQSVMGECFKQSFFKSILDIQ
QQKSYTFQLYLIKFNDQGKKLPSSGFIKNQDSELGIIHSTQIPIKDTIKYYLQMHENEVY
ANMIYQQEIQISQQQYDKLMLINRFLNSVALNKDIEFYAEYTGEVVNGKGKLFKDHGKNA
SKNLQYKFDNSEGFSALLTVIRPSNNNTNLYEINFDHIEILEKYINYMSGVYKVRNKTKL
NEEEKAARFQSRKLKQDDPFADYKVKPYYDCVNFFDCTKQLDPNIYQDSRKKLVLQSIMS
GRHLNRFIFYGCKSYEEIQKEYQQVPTGKDPFKQIKQLKAQVELEEVSFTSNENHMVLQV
QLFTKHLRSQTNLYLKRVGVLTENFKGDYKYSPHQFTIFPLNVSLLMKLNILHKTFLYQI
RDTFGVHHFQQIRLPKFFDKAYQRIKNNNKTSCSYNLDQIEQPHFLVENYQGVLDVMSKS
EKYNQFCKKYNNHQLMEGYNQISIRKFDQKYIKHNPIFESYQVYKKNIFELQISELMKSL
TSLEYAVNNKESSLERYEFLGDTVLKCLSSTQIYFEHPKSMEDHLHVHRTIIIQNRNLAQ
IAVKKKIFKYILSSKIETLSPIGIKYEIAVDDDEQNQFQKEKEPDEYDKADQRNKNKKGN
EEDGDAENEEIEEQQQQNDIPNLLRLEPTYRHIKGKTLADTLESIIGVFFQQKKDLNLCQ
YLLFSLQVLNKPDLTFNHSYDRSLQQSQLQNPIYVQLKEIESILGYTFQNINLLFQAFTL
PSIESLCIQIPSLKNTNLNKLHQINNAIQKKENQGTFEKIDQISKENQNKIYQKDSNEWE
NLKNYNLCNQRLEFLGDAVLDLIIVEYLFNKFPNSDPGELTQMKTSLVQNKTLCLINLMK
GFYKFIIGSIQHNKEEIELLLNNVEMFMGDTSLMYDTTYNQSLIKTLGDVIESLVGAIFI
DNNLDYEITKKIVMETLFAEILQYFTGQEHRLKNLQLYIEKVLKKEFGKVSLIEDETDIK
EGKKRFFIQSEDNNKEVSFEVYAYDQIDAIDQIYIEINQKKRQKK |
NT seq |
5898 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaaaaacctaaaaaaagcattagccaaaaagcacgaagaataaagcttgaaaaacagt
caataagattctgttatttttgctaaaaatacagaaaacttcttaaagagtgactcaagc
agtagtgactaagatgaagaatttgaagaaaaacaacttcctgttatcaagaaataatat
ggatttaatggaataccaaatagttatgctttcaaaataaacgatgagtcaagcgatgaa
gatgatgaagaaatttttaaagattaggtatctcctaaaataaatgaacaaggcaaaaat
acgatttacgaaattagaaactattaaaaggagttgtttaaaaattcttatagcaaaaat
agtatcatttatcttgaaacaggtgctggaaagactatgattgccacaatgcttataaat
tactttttctaaaaacaaaaaaaggctccataaaaaaagaaaattatttttttagccaac
actgtatagcttgtaaaacaatagtacgcagaaataaagaataatttacaaagaatttca
gagatgatggaaaacgataaagaaatcagctagatattaaaattttaagaaggcattaat
tacagaagaatatttgaaaaagaaaatcatattgtgaagtgtcatggtagttataagcaa
aaggataatttataaatagaaacttttactaaataaaaatgggactacttacttgaaaat
tatgaaatattcgttatgattggttaggtattgttaaatggtttacgtagaggatacatt
cgcattgaagatattgaggttattatttatgatgaatgtcaccatacgagataagatcat
ccttattgcttaatataatatgagttctatcactttcacaaaagacgtaacgaataggtt
taattgccaaagatttatggattaactgcctctccagttttggatatagaagtaaaatct
gattcaaatatcatgaagaaaaaaatctcagaactctgcacaaatttagatgcaaatttt
gtaaagtataatatcgaggaatctaaaaaatatatcaaagaagctacaatttgtgttgaa
gaatatggtgaagaaaagaatatttaagaaagagcaaattagttcttataagaataaatt
attggagagaagtggatttctgacatagaagataaacagaatgaggaaatgagatacact
gagattttaaatttctatattaaattttaataatttaagaactcatattttagcaattta
agtccaatgaataagtagatattgctagatatagaaaaaattatctgcttatatagcatg
caagttgatgctcagttaggaaaatattctgtcagtttatttttgaaagatgttaatgat
gaactataaaaacttggccaattttagcacaataatgaagaaatgtaggaattaaaaaaa
ctattcaaagcttaaacagaaaaatttatagaatcagtagataaaagtgaaaaaaatatt
tctaaaaaattcatgtttttgtataataaattaaaataaacaatgatacatgataaagaa
gaatttgagtgctataaagtcaaaaataaatactacgaataagaatttcactaacatgag
aaaataactaaagtgtaaaaatacattaaggataattaatcgatgattttagtttttgtt
gaagaaaaaattatcattaaatacttgcagaagcttctttaaatttggatggatgatgaa
gatagagataaagatgaagatgaaattatttttagatataaaaaaattgtttgcttaaca
ggctaatcaaacttctaggatcgaaagaagaaaaatttaaataaaaattaatattaaaac
tctgaattcacataaaatgataattttgaatttgctgaagaagagtataggcagtagcaa
atgaaataggaaagcttaatcagcagttaaataaacaaagaagaggatatagactccttg
aaagaaaaaattaatgatcactaaaaatctgcttaaagatgtgttcttgttaatcttgat
tttgaagtcagcaaataatctgaaaacattgaggcattcagaaaaaaagagttgtaaata
attctctcaactagtgtaactgaagaaggtttcgatataccttcctgtaatttggttatt
tcgtttaataaaatatctaacttgaagtcgttcgttcaaattaaaggaagagcgaggaaa
gaaaattcgaagtttataatcatggcaaaggacaaatatcaaaaataagattatgaaaca
gatattgaatcttacaaagatttaatttaataaattaaggaaatagctccaaaagttgag
aaataagaaattgaaatcagacctaattataaatataagattgtcaaagaaactggggct
attttaaatacaaattggtctgtaaatctgtttcatacttatgctaactagcttctttat
agctatgattcgaatatcaagggacctttttactattatattgagattacaaatgttggc
tttatttgctaaataattgttccctcctaatctggattaaaaacattttgcagcaatcct
taggcttaaaaagaggatgcaaaaaaagatgcatgcttttaggctgttatcattctttac
agataatataaaatttttgactagtatctgagaaacatatcttagaagatacaaaattca
taaagtgaaaaatcagaatctttatttgaagacgaaaaagatgaaaaactcactaaaata
ctataaaaatattgtaaatcttatgtagatgtaaaacaaaaatgtaaaatgtactacttt
tagtctgttatgggagagtgctttaaataaagtttttttaaatctattttagatatttag
taataaaaaagttatacattttaattgtacttgataaagttcaatgattaagggaagaaa
ctcccttcttctggttttataaaaaactaagattctgaattaggtatcatacacagcact
taaattcctataaaagatacaattaaatactatctttaaatgcatgaaaatgaagtttat
gcgaatatgatatattagtaagaaatttagataagtcaataataatatgacaagctaatg
ttgattaatagatttttaaattctgttgccctaaataaagatattgagttctatgcagaa
tatacaggagaagttgtaaatggcaaagggaaattatttaaagatcatggtaaaaatgct
agcaagaacttataatataaatttgataactcagaaggattcagtgcactactcactgtt
attaggccatccaataacaatacaaatctttatgaaatcaattttgatcatattgaaata
ttagaaaagtacattaattacatgagtggagtttataaagttagaaacaagactaaacta
aatgaagaagagaaagcagctaggttttaaagtagaaaattaaaataagatgatccattt
gctgattataaagtcaaaccttattatgactgtgtaaacttttttgattgtactaagtag
ctagatccaaatatttattaagattcaagaaaaaaattggtgttacaaagcatcatgtct
ggaagacatcttaatcgttttatattttatgggtgcaaaagctatgaagaaatctaaaag
gagtattaataggttcccacgggaaaagatccttttaagtaaataaaatagttaaaggct
taagttgagttggaggaagtctcatttacttcaaatgagaatcatatggtattataggtt
tagctttttactaagcatttgagaagttaaaccaacttatatcttaaaagagttggcgtc
ctgacagaaaattttaagggtgattataaatattcccctcactagttcactatatttcct
ttaaatgttagtcttcttatgaaacttaatattttgcataaaacattcctttactaaatc
agagacacatttggagtgcatcacttttaataaatccgtcttcctaaattttttgataag
gcttattagagaatcaaaaataataataaaacgagttgctcctataaccttgattaaatt
gaataacctcactttttagtagaaaattattaaggagttttagatgttatgagcaaaagt
gaaaaatataattaattttgtaagaagtacaataaccaccaactaatggagggatacaat
cagataagcattagaaaatttgattaaaaatatataaaacataatcctatatttgaatca
tattaagtatataagaaaaacatctttgaattgtagattagcgagttaatgaagtctttg
acctctctagaatatgctgttaacaataaggaatcatcactagaaagatatgaatttctt
ggtgatacagttttgaaatgtttatctagtacacaaatctattttgaacaccctaaaagc
atggaagatcatctccatgttcatagaactataattatacagaatagaaacttggcataa
attgctgtaaaaaagaaaatatttaaatatattttatcttctaagattgaaacgctttct
cccataggaataaaatatgaaatagcagtagacgatgatgaataaaattaattctagaaa
gaaaaggagccagatgagtacgataaagctgactaaaggaataaaaataagaaaggcaat
gaagaagatggagatgcagaaaatgaagaaattgaagaataataataataaaatgacatt
cctaatttattgcgtttagaaccaacatatcgccacattaaaggaaaaactttagctgat
actttggaaagtataatcggtgtatttttttaacagaaaaaggatttaaatctttgctaa
tatcttttgttctcattgtaagttctcaataagccagatttaacttttaaccatagctat
gatagaagcctgcagtaaagttagctgtaaaaccctatttatgtccaattgaaggagata
gaaagtattttaggctatacattttaaaatataaacctcctattttaagccttcacactt
ccaagcattgaaagtctttgtatttaaatccccagtttaaaaaatacaaacttaaataaa
ttgcatcaaataaataatgctatttaaaaaaaagaaaattaaggaacatttgaaaaaatt
gattaaattagcaaagaaaatcaaaataaaatttactaaaaagattctaatgaatgggaa
aatttgaaaaattataatctgtgcaatcaaagattagaatttttaggagatgcagtcctt
gatttaattatcgtcgagtatttattcaacaaatttcctaactctgatcctggtgagttg
acataaatgaaaacttcattggtacaaaacaaaaccctctgtttaatcaacttaatgaag
ggattttataaatttatcattggaagcatttaacataataaagaagaaatagaattattg
ctcaataatgttgaaatgtttatgggagatacttctttaatgtacgatacaacttataat
taatcattaattaagacattaggtgacgtaattgaaagtttagttggagcgatatttatt
gataataatttagactatgaaattaccaaaaaaattgtcatggaaacactttttgcagaa
atattgcaatattttactggctaagaacatagacttaaaaatttacaattgtatattgag
aaagttcttaagaaagagtttggcaaagtcagtctaatagaagatgagacagatataaag
gaaggcaaaaagagattttttatttaatctgaagataataataaggaagtttccttcgaa
gtttatgcatatgactaaatagatgctatagactaaatctatattgaaataaactaaaaa
aagcgttagaaaaaatga |