Entry |
|
Name |
(RefSeq) transmembrane protein, putative
|
Organism |
tet Tetrahymena thermophila
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
AA seq |
1769 aa
MSVKHPSLNVIYVAALNGGLFVLDSASQVQFQYFNMTCKKVFLRNGQLYASMGKEGYSIF
QMNPQNGFLTLVINNQIGSSVDSIYVDQTAQFIYIGSEGYIYLIQVSGQGQKQTDYAVSM
HVGIYSGESNYIYSTQDEQYLMVANLGNGVSVINISQKNQPYLVSQKLPEWQVVDLKMVS
KGQIVYAIEEWYGLFIGDFSSLYVNENIFKAKDQVWVNHLSFQATSRAIEVSSDEKFLFV
GLRQIGVYIFDISSSQNKLNPILIQKVQISGLANHIFMYNSDNSFLYSNGCCVSITNKVE
ANFNTDIPNVFNTHISRSFQVLDVDTIPWDYKYSSNSQQLYLAAAFNGLQVFQLQNSTFL
PPIKLFSSNSYPSTSTDTVTLIEEKNLLVQGSSEKGIILWDIKNLTSIKKVGEFNHPLQN
SDSDGIVYNSKLGCLAIANGYQGAYLLDINDLNNLKMISEINVIDYDMQVTAESILMTQD
ANYLAISLRYYGVLIFNMKILKSPNLISNFITYGGEKCILSYDENYIFVSDGYKGITIIN
FVDKENAYIQSSLNLGAQALYAYQSKINQNIIYVSLIENGQLAVIDVSNKSNPYKMAQIQ
YGFEKSFALREAPNQQFITYLTSNGLRFQSISFPIKIHTQIRKIIQIQQNLQKTFIIVSS
NEQFKVGETVELIFSSILFNQSIKLEKIFYYKEFQVTQIEQWMQFNQDKNKLRMTIDKNA
IQNNNGLNIVLLQILIQLNQTSFISQTYSINQTQSSQIYQKLKQRAILNDNDYLNLNNFQ
LNSNFYIDLDNTPQYSNITATQDYIKQILLQSIYYQPIKFNVVSSLVLNLIYSENNQPIS
TISQTVKIIIQIFDAQSYFIENTVALQAQISMSQDFKSVVIEGQTIDVNQILLDGVEAVF
YQQIDQILVQVTLIDNINFDVVQTYKVSQLQFLKNAKQINNYNSLKQQFEDQISEQLTVD
KVYTFTFSSNTFQYLLPQQEGLQFQAFIKKDSNTYVNIQDIDWIDFDSSNRQFKWQGSLS
QLSKRYTIVINATLTNSNKYWAEDSFEIHFERIPVELIVMICLISFFFALVILILYCYRA
KIQYFRYFERYSYSSEPAIVNKNFYKIIMLIPNYLGEFHKLWQQFIKNEKKENKSVKLNF
KKYLTPQSKEIDVQLLIDKLKSIYELNKHFYSKLKDQEFKVTNFRLSNLVRGAFSRQMLQ
EDLATLEVYQQLKAIAQKKGFRKDWYKYYTKIVYPEKINEKVPVLTIEESNSHTNVDSYN
MSQLEQNFPIIIIDESKIIFTLEEANSNQMEKNNSYNHQLLFENIKSEGYGYVNKAIKRQ
EPSYGEAIHILHSNIKKIVAFKKRAEESRCICFPKIRQKFFLDFQEIQNVKNSNLPEWLK
CEVTQSSIILSGKPSSQDVGDILIRVYDKNNYILNQFFINVRKMRKQTYVNPELEAYQIS
NRQQMPPLSQQLLVPQHSKLSNQFQGLVPNKVVSSVGGSGILNTNTYYQQSPHTVNTNSP
LQLNQSSNQVIQAQGQKRILRNHSKKSSQRYSIKQYKQLLNGNGDLNMIRLKSDNQIKDN
SIVTENHKKNSDDYIYRKNMQSPTYQDSPTLENIQIKQCNNQDKNGITNYSSSSQMLHLQ
AQENNDIRAIKEENLLKLKGDNNYDSLDPEQIFSKPMKHFMNNYNHHHPIDNETIQEELQ
TNQKDQNKSHSSFNFNQNSRYKFSTSNAQHQEDQSSISQYKSYQESYDFEKSLGLMSCEQ
IDVNSPKLTQFKPISIKQLNQIPSNENIA |
NT seq |
5310 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgagtgtaaaacacccgtctctaaatgtaatttatgttgcagcgctaaacggaggacta
tttgtattagactcagcttctcaggtataattttagtacttcaatatgacttgcaagaaa
gtcttcctcagaaatggccaactttatgcatcaatgggtaaagaagggtattcaatattt
taaatgaacccacaaaatggcttcttaaccttggttatcaataactaaataggaagttcg
gttgatagcatctatgtagactaaacagcttaattcatttacataggaagcgaagggtat
atatatttaatttaagtatcaggttaaggctaaaagcaaaccgattatgctgtctctatg
catgtaggaatctactcaggagagtctaactatatttatagtacttaagatgagtaatat
ttgatggttgccaatttgggaaatggtgttagtgtgataaacatctcttagaagaactaa
ccttatttagtatctcaaaagcttccagaatggcaagttgtggatctcaaaatggttagt
aaagggtagattgtttatgccatcgaagaatggtatgggttatttatcggggatttctct
tcactctacgtaaatgaaaatatcttcaaagcaaaagattaagtatgggttaatcacctt
agtttttaagctacttcaagagcaatagaagtatcttcagatgaaaaattcttatttgta
ggactaagacaaataggggtttatatatttgatatttcaagtagctaaaacaaactgaac
ccaattttaatataaaaagtctaaattagtggcttggctaaccatatttttatgtataat
tcagataactctttcctctattccaatggatgttgtgtttcaattactaataaagtagaa
gcaaatttcaacactgatattcctaatgtatttaacactcacatatctcgcagcttctaa
gtattagatgtagatacaattccttgggattacaaatattcttcaaatagctaataactt
tatctggcggcagccttcaatggattacaggtcttctaactgcaaaatagcacttttctt
cctccaattaagcttttctcatctaattcttatccctctactagtacagatacagttact
ttaatagaggaaaaaaatctgctcgtataaggcagttcagaaaaaggaatcatattatgg
gacattaaaaatttaacctcaattaaaaaagtaggagaatttaatcaccctcttcaaaac
agtgatagtgatggaatagtctataattcaaaactaggttgtttggctattgcaaatgga
tactaaggagcttatttattagacattaatgatttaaataatttaaaaatgattagtgaa
ataaatgttatagactatgatatgtaagttacagctgagagtattttaatgacttaagat
gcaaattacttagccatatctctaagatattatggagtattaatatttaatatgaaaatt
cttaagagtcctaaccttataagtaatttcataacttatggaggggaaaaatgtatatta
agctatgatgaaaattacattttcgttagtgatggctataaaggaattacaataataaac
tttgttgataaggaaaatgcttatatttaatcaagcttaaacctaggggcacaggcttta
tatgcttattagagcaaaataaatcagaatataatttatgtatctttaatagaaaatgga
tagctagcagttatagatgtttcaaataaaagtaatccttacaaaatggcttaaatataa
tatggatttgaaaaatctttcgccctgcgtgaagcaccaaaccaacaatttataacttat
ttaactagcaatgggttacgcttctaatcgataagcttcccaataaaaatacatacatag
atcagaaagataatataaatttaatagaatctctaaaaaacttttatcattgtctcttca
aatgaataatttaaagttggggaaactgttgaactaatattctcatcaatattatttaat
cagtctattaaattagaaaaaattttttattacaaagaattttaagtcacttaaattgaa
taatggatgtagtttaattaagacaagaataagcttagaatgacaatagataaaaatgcc
atataaaataacaatggtttgaatatcgttctattacaaatactaatacaactgaatcaa
acttcattcatttcataaacctactcaattaatcaaacttagtcctcttaaatctaccaa
aagctcaaacaaagagctatattgaacgataatgactatctaaatttaaataacttctaa
ctaaattcaaacttttatatagatttagacaacactccttagtacagcaatattacagca
acttaagattatattaaacaaatcttattataatcaatttattaccaacctataaaattt
aacgttgtttctagtctagttttaaatttaatttactcagaaaataattaacctatttct
acaatttcataaactgtgaaaattattatctaaatatttgatgcctaatcttatttcata
gagaatacggttgctctttaagcacagataagcatgtcctaggattttaaatcagttgtt
attgaaggccaaacaatagatgtgaatcagattcttttagatggagttgaagctgtattt
tattaataaattgattaaattttagtgtaagttaccctcatagataacatcaattttgat
gtagttcaaacttataaagtttcctaattataatttctcaaaaatgcaaaacagattaac
aactataactctctgaaatagtaatttgaagattaaatcagcgaacaactgacagttgat
aaagtatacacatttacattctcaagcaacactttttagtatctgctaccttagcaagaa
ggtttacaattttaggcatttataaaaaaagactcaaatacttatgtcaatatataagac
attgactggattgattttgattctagtaatagatagtttaaatggtaaggaagtttatca
tagctttcaaagagatatacaatagttatcaacgccactcttaccaactcaaataaatat
tgggctgaagattcttttgaaattcattttgagaggatacctgtcgaattaattgtcatg
atatgcttaataagctttttctttgctttagttattcttatattatattgttatagagct
aaaatttaatattttagatattttgaaagatacagctattcaagtgaacctgcaatagtc
aataaaaatttctataaaattattatgcttattcctaactatctaggggaatttcataag
ctttggtagtaatttataaaaaacgaaaaaaaagagaataaaagtgtgaaattaaacttt
aaaaaatatttaacaccttaatctaaagaaattgatgtgcagcttttaatagacaagctt
aagagcatatatgaattaaataaacatttttattccaaactaaaagattaagaattcaaa
gttaccaattttaggctttcgaatttagtgagaggtgccttttcaaggtaaatgctataa
gaagatttagctacattagaagtttatcaatagttaaaagctattgcatagaaaaaagga
tttcgcaaagattggtataaatattacactaagattgtttaccctgaaaagattaatgaa
aaagtacctgtgcttacaatagaagagagtaacagccatactaatgttgattcgtacaat
atgtcttaattggagtaaaactttccaattattattattgacgaaagcaaaataatattt
accttagaagaggcgaattcaaattaaatggaaaaaaataattcttataaccactaatta
ctattcgaaaatataaaatcagaaggatatggttacgtgaataaagcaattaagagataa
gaacccagttatggagaggcaatacacattttacattctaacattaaaaaaattgttgct
ttcaaaaaaagagcagaagaatctagatgtatttgctttccaaagattcgttaaaagttt
ttcttggacttttaagaaatttagaatgtaaaaaactcaaatctgcctgaatggctaaag
tgtgaagttacatagagttctataattttgagtggaaaacctagctcgtaagatgttgga
gatatcctgatcagagtttatgataaaaacaattacatactcaattaattctttataaat
gtacgtaaaatgcgcaaacaaacttatgttaaccctgaattagaggcatattaaattagt
aaccgtcagcaaatgcctcctctttcccaacaattattagttccataacatagtaagtta
tcaaattagttttaggggttagttccaaataaagttgtaagttcagttggaggatctgga
attttaaatactaatacctactattaataatctccccacacagttaacacaaattctcct
ctgcaactaaactaatcttcaaatcaagtcattcaggcttaaggacagaaaagaatttta
agaaatcattctaaaaaaagctcttaaagatattcaataaagtaatataaatagttatta
aacggaaatggagatttgaatatgatcagattaaaatcagataattaaattaaagataat
tcaattgttactgaaaaccacaaaaagaactccgatgattatatttataggaaaaatatg
tagtctccaacatatcaagattctccaactttagagaacattcaaataaaatagtgtaat
aaccaagataaaaatggcataactaattatagtagtagtagttaaatgcttcatttatag
gcctaagaaaacaatgatattagagccataaaggaagaaaatctattaaaactaaaagga
gacaataactatgatagtttagacccagaataaatcttcagtaaacccatgaaacacttt
atgaataattacaaccatcaccatcctattgataatgaaactatttaagaagagcttcaa
acaaactaaaaagattaaaacaagtctcactcttcattcaatttcaatcaaaatagtagg
tacaaattttcgacttctaatgcttaacattaagaagattaaagttcaatttctcaatac
aaaagctaccaagaaagctatgattttgaaaaatctttaggtttaatgtcatgcgagcaa
attgatgtcaatagcccaaaactcactcaatttaaaccaatatctataaaacagttaaat
taaattccatcaaatgaaaatatagcttga |