Tetrahymena thermophila: TTHERM_00326920
Help
Entry
TTHERM_00326920 CDS
T01020
Name
(RefSeq) REJ domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
REJ
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7833165
NCBI-ProteinID:
XP_001026455
TGD:
TTHERM_00326920
UniProt:
I7MJE7
LinkDB
All DBs
AA seq
3432 aa
AA seq
DB search
MKSNKTNFQLFIILAIINLTLSQSQVLIGSYQTSNPFTKEFKNSEWNNNLDFAFYGWLKI
TTFPPPASWSTGFHFTSNSPDVWTDQYNYGDRVLAFFNDNNNIINPTYTTYSANPSTNIW
SQVSFSTPELNQWIFIYLSYGSQQQAQYAYYKFPSHEVRSKLINIVHSTSNYYYLYVGKT
SPYYYFMGQICGFYLIAGPTAYRESGFDQFLTLQTQDAISCSYCLSDFYIPQQTCVQWCP
NNYRANIVQKTCDQCSTYTSDCQTCAPTCKSCQFGNKDICLDCQETMNISNGTCVCKNGI
DNRNIFYQCSNDNIAVLQANLASDSPTLTINFGVPLKNNNFSCSQIFQPNTLGQLGSNPV
CTINQANITIALSQDANITETQQISFLPNVLQYQGNNNFINTFYLFSFNQLKDIPFQMNY
KYDEIQNTCYDITFQLIPQNDAKRGFNSIVWSIQAQPTLDSQIQLQVDNIVKTANDNINP
NLIIPKYLIPSNTNIKATVNYFMRVNVNGTLSFSTLYQKYYQIVIQTIQSAQPPVYRYMD
LTFKFNLYTQVCDQTGSVIVFEPYDIQIISQVLPNLNQSYYQTSQQDFQVNVQKYEIPFN
TAFDLQVSAVLDSNKTISQQTNINITPQLSKLLVQITSGQGGQNGLFNYKKDLNLTGTAR
DLEIQDPNIPQGINLSWQCQSLIQQQNGERECLDYNNNTVTLAQNSLSTVVPAYTFIPYQ
TLQFSLVGSKDTRTSFSNITAIIAEIDIPPLFVQFRDISQLQQVNLNDDIFVTLQYGSDI
SSDDIQYAGAVLYNNAEVGIIKFDFYEVKFRIWDYFNSVTPDNPVVQVRFTAYNPSFYMP
SMTTKKFNINLPPANCVFTVSPTSGKALETIFNIQMSGCTSSDNSLTYQFFYYQNNSDFQ
QEILVPNNILRRQIQDQSLESQLNTVLPSGNLTIMGQVMNSKLSIFNSTLEIKVTPFDQG
EQQINNIIDQMLQQLNSQYPRQSLLNLCFLGEEISKNNPVYQLNSVNYRKSLVISQIISQ
TNSLPKQSNLFTYSNKVISQLQLSLNNQQDSQSLILLNYINQTLENTILLMQDSSNLLLN
NNNNIVLQNLVDSFKMLNSTTKIISYSLLPNQMNLSDQICGLLANITLPNTGGIQLQGNL
IELNCQQITEKNLNQYIDELDYFQTKTTNIYRITYSTYSQNPYSQTTEFLNYTDQLQILQ
PNITISKNPVIIPQIEYVNSNKRFLSINNSSLNQNSTYIYTFSNVNKSQNKLTCLQKQVN
QWSSSNCQELNRTGTSRFYCYCKDKTPTTITDNLEELIKNKNLQTAFSSQGFNNISNFKN
FYKYAAFWILSTATLILIGLYFYGKHLDRKFIFHSIQRIAPATAIDNGQSLINLQNRIKA
NQQNKGGNNTNRNEIFSQNQLIQQENKNLYLQYGIDSQQQIINNIKVESNKQFPFQETPF
QTTINTPDLQLIKKSKQENQEIQNINHQIQIVNLNDQQDYNRDDLQHQQQKQQQKQIQQW
NGQANQQKQNIQQQDSISNQQSQLDNQFELQLQKFQNQIGTLETITKIVAQPFSTLNLQQ
KIQQETKDLQIGDKQLHSNKQKVQNPSESVQNTSEQNFKNEADKQNEMETLLKQLNDQNQ
SQVLIGSYSTGNSYTKEFKNSEWNTNLDFAFYGWFKITSFPTSFWSIGFHFTSNAPNVWN
DKYNYGDRLLTFHNDNNNLINPTYTTYSANPSPNVWNEAPYSTSDFNQWIFIYLSYGSQQ
QAQYVYYKFPSREVGQKLTNIIHNTSNYYYLFVGITKAPYTYFIGQICGLYLIAGPTAYR
ESGFDQFLTLQTQDAVSCSYCLSDFYIPQQTCGQWCPNNYRANLVQKTCDQCSTYTSDCQ
TCATTCRSCKFGNKNICLDCYETMNISNGTCVCKNGIDKRNIFYQCSNDNTAVLQANLAS
DTPTLTVNFEVPLQNNNLSCSQIFQPKTLGQLGSNPVCTISQANITIALSQDANITETQQ
ISFLPNVLQYQGNNKLINTFYLFSFTQLKDIPFQMNYNYDEIQNTCNDITFQLIPQNDAK
RGFNSIVWSIQTQPTLDSQIQLQVDKIVKTANDNVNPNLIIPKYLIPPNTNIKATVNYFM
RVNVNGTLSFSTLYQKYKQIVIQTIQGAQPPIYRYMDLTFKFYLYTQVCDQTGSIIVFEP
YDIQIISKILPNLNQSYNQTTQQDFQVNVKQYEIPFNTAFDLQVSAVLDSNKTISQQTNI
NITPQLSKLLVQITSGQCGQDGLFNYKKDLNLTGTARDLEIQDPNIPQGINLSWQCQSLI
QQQNGERKCLDYRNNIVTLGQNSLSTAVPAYTFTPYQTLQFSLVGSKDTRTSFSNMTAII
AEIDIPPLFVQFQDISQLQQVNLNDDIFATLQYGSDISSDVIEYAGAVLYNNAEVGIIKF
DFYEVKFRIWDYFNSVTPDNPVVQVRFTAYNPSFYMPSMTIKNFNINLPPANCVFTVSPT
SGKALETQFSIQMSGCTSSDNALTYQFFYYQNNSDFKQEILAPNNILRRQIQDQSLANQL
NTILPSGNLTIMGQVMNSKLSIFNSTVEIKVTPFDQGEQQINNIIDQTLQQQNSQYPRQS
LLNLCYLGEEISKNNPVYQLNSVNYRKSLVISQIINQTSSLPKQSYLFTYSNKVISQLQL
SLNSQQDSQSINLLNYINQTLENTMMLMQDSGNLLLNNNNVVLQNLVDSFKMLNSTTQSI
SDSLLPSQMNISDQICGLLANITLPNTGGIQLQGNLIELNCQQITEKNLNQYIYKLDGFQ
TKTTNIYSITYSTYSQNPYSQTSEFQNYTKQLQQLQPNITISKNPVIIPQIEYLNSNRRI
LSISNNNNLNQNSTYIYTFPNVSKSQNKLTCLQKQVNSWSSSKCQILNSTEMSGFQCYCK
DKTPTTITDDLEQLIQNKNLQTAFSSQGFDNISNFKYFYKYAAFWTLSAVTLLLIGLFFY
GKHLDRKFIFHSIQRIAPTPATDNDQSLINPQKRIQTNLDNKNENNTNRDENFSLNQLKQ
QENKYLYLQQGIDSQQQIINNINIQSNKQFPFQETPIYTPINTQDLQLIQQSQQENQEIQ
NIYNQMQIVNLDNQQDYNKDNLQLQQQNQQKNQLKQFQEQGNQQKQNIQQQDSLSNKSSQ
LDKQYEIQLQKFQNQIGTLETITKIVAQPFSTLNIQQNNYYTTQNNLNINNKQIYQQNNF
EDYDNCKFQKEQQIQQQTKELQISDKQLHSNKQKVQNPGKSVQNSSEQNLKSEAEKQNEM
ETLQKQLNDQKQKLANKSLLIRIIVFHDFFNIFYSYDPKLSRAIRFNIFYLRIIHSLCLT
TIFDESYNIDQKIILSIISSIILVTGVTIITLIHKIKIIGQKISAIFLICLLLFYYYIIL
SIISGEEANQANSKTLSFLLIVGIDFFGILTLMSVLKLSLVLYSQQEQSKQTLIKSLFKI
FDLQILLQNLNV
NT seq
10299 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagtaataaaacaaatttttagctttttattattttagcaataataaatctaaca
ttaagccaaagccaagtacttataggctcatattagactagtaatccatttactaaagaa
tttaaaaatagcgaatggaataataatcttgattttgctttttatggttggttgaaaata
actacttttcctcctcctgcttcttggtctactggttttcattttacaagcaattctcct
gatgtttggactgatcaatataattatggcgatagagtcttagctttttttaatgacaat
aataatattataaatcctacgtatacaacttactcagcaaatccctccaccaatatatgg
agtcaagtttctttctctaccccagaattgaactagtggatttttatttatttatcatat
ggttcttaataataagcttaatatgcctactataaatttccatcacatgaagtaagatca
aaattaataaatattgtacattctacatctaattattactatctttatgtgggaaaaaca
agtccctactattatttcatgggtcaaatatgtggtttttatttaatagcagggcctact
gcttatagagaatcaggatttgatcaattcttaactcttcaaacttaagatgctattagc
tgtagttattgcttatctgatttttatataccataatagacatgcgttcaatggtgccct
aataattacagagcaaatattgtataaaaaacttgcgactaatgttctacatatacttct
gattgttaaacatgcgctcctacttgtaaatcttgctaatttggaaataaagatatctgt
ttagattgctaagaaactatgaacatatccaacggaacatgtgtttgcaaaaatggaata
gataatagaaatattttctactaatgtagtaatgataatattgcagtcttataggcaaat
ttagcaagcgatagtcctacccttacaattaatttcggagttcctttgaaaaacaataat
tttagttgcagttaaattttttagccaaatactttgggtcagctgggttctaatcctgtt
tgtactataaactaagcaaatattactatcgctttaagtcaagacgctaatataacagaa
acttaataaatttcatttttacctaatgttctttagtattaaggcaataataattttatt
aatactttctatttattcagctttaattagttaaaagacattcccttttaaatgaactac
aagtatgatgaaatacaaaacacttgttatgatatcacttttcagttgattccataaaat
gatgcaaaaagaggatttaattcaatagtgtggagtatttaagcataaccaactttagat
tcacaaatataattgcaggttgataatatagtaaaaacagcaaatgataatattaatcct
aatttaattattcctaaatatttaataccatctaacactaatattaaagctactgttaac
tatttcatgagagtcaatgttaatggaactttgtcattttctactttatattaaaaatat
tatcaaatagtaattcaaaccatttaaagtgcataaccaccagtttatagatatatggat
ttgacttttaaattcaacctatacacacaagtatgcgattaaacaggaagtgttatagtt
tttgaaccatatgacatttaaataatttcacaggttttacctaacttgaactaaagctat
tattaaacctcatagcaagacttttaagttaatgtttaaaaatatgagattccattcaac
acagcatttgatttgcaagtttctgctgtgttagatagcaataaaacaatatcttagtag
actaatataaatattactccttaattatctaagcttttagtatagattactagtggataa
ggtggatagaatggtttgtttaattacaaaaaggatttgaatttgacaggtactgcgaga
gacttagaaatttaggatccaaatatcccttaaggaataaacttaagttggtaatgctag
tcattaatatagtaataaaatggagagagagaatgccttgactacaacaacaatacagta
actctagcttagaatagccttagtactgttgtaccggcatatacatttattccctattaa
actctatagttctcattagttggaagcaaggatacaagaactagttttagtaatataaca
gctattattgctgaaattgacattccgcctctatttgtttaatttcgagatatatcttaa
ttatagcaagtcaacctcaatgatgatatatttgttacacttcagtatggaagtgatatt
tcatcagatgatattcaatatgctggagcagtgttatataataatgccgaggttggaatt
ataaaatttgatttttatgaagttaaatttaggatttgggattattttaattctgttact
ccagataatcctgtagtataggttaggttcactgcttataatccttcattttatatgcct
agtatgactacaaaaaaatttaatatcaacttacctcctgccaactgtgttttcacagtt
agtccaacttctggaaaagctttagaaactatatttaatatataaatgagtgggtgtaca
agttctgataattcattaacctactaattcttttactatcaaaataatagtgattttcag
caggaaattttggtccctaataacatacttaggagacaaatataagattagtctttagaa
agtcaattaaatacagttttaccctctggaaatttgactataatggggtaagtaatgaat
tctaaactttcaatttttaattcaacattagaaattaaagttactccttttgatcaagga
gagtaataaataaataacatcattgattaaatgctctagtagctaaatagctaataccca
agataatcgcttttgaatctgtgttttcttggtgaagaaatctctaaaaacaatccagta
tattagttaaattctgttaactatagaaaatctttggtgatttcacagataattagctaa
acaaactctctcccaaagtagtcaaatctttttacatactcaaataaagttatttcttag
ctttaactttccttaaataaccaataagatagctaatcgttaatcttactcaactatata
aattaaacattagaaaatacaatactgttaatgtaagactctagcaacttactcttaaat
aataataataatattgtactttaaaacttagttgacagctttaaaatgcttaattcaact
accaaaattatatcttatagcttattacctaattaaatgaacttatcagactaaatatgt
ggactgttagctaatataactcttcctaatactggaggtatttaactacaaggaaatcta
atagaattaaactgctaacaaattacagaaaaaaatcttaattaatatattgatgagtta
gattatttttaaacaaaaacaactaatatttatagaattacatacagcacatattcataa
aatccatacagtcaaacaactgaatttttaaactatacagactaactataaatattgtag
ccaaatataacaatttctaaaaatcctgtcataatacctcaaattgaatatgttaatagt
aataaaagatttcttagtataaacaatagcagtttgaattagaattcaacttatatttac
acattttctaacgttaataaatcataaaataaattaacttgtctctaaaaataagtaaat
taatggtcttcttcaaactgttaggaactaaatagaacaggaacaagtaggttctactgt
tattgcaaagataaaactcctacaacaattactgataatctagaagagttaataaaaaat
aaaaatttataaactgcgtttagttcataaggctttaacaatatatcaaactttaaaaat
ttttataaatatgcagctttttggattctgagtactgcaacattaatattaattggatta
tacttttatggaaagcaccttgatagaaaatttatttttcattctatttaaagaatcgct
cctgctactgctattgataatggccaaagcttaattaatttataaaatagaataaaagct
aactaacaaaataaaggtggaaacaatactaacagaaatgaaattttttcttaaaattaa
ctgattcaataagaaaataaaaatctatatttataatatggtattgattcacaataataa
ataataaataatataaaagtagaatcaaataagtagtttcctttttaagaaacccctttt
taaactactataaatactccagacctttaattaattaaaaaatctaaataggagaattaa
gaaatttaaaacatcaatcattaaatttaaatagtaaatttaaatgactaataagattat
aatagagatgacttgtagcatcaataataaaaataataacaaaaacaaatctaatagtgg
aatgggtaggcaaattaataaaaataaaatatttaataataagatagtataagcaatcag
tagagctaacttgataattagtttgagctttaactataaaaattttaaaactaaatagga
acattagagactattacaaaaattgttgcttagcctttttcaactttaaacttataataa
aaaatttaataagaaacgaaagatttacaaataggtgataaataactgcactcaaacaag
taaaaagtttaaaacccaagtgaaagtgtttaaaatacatctgaataaaattttaaaaat
gaagcagataaataaaatgaaatggaaacactattaaaataactgaatgattaaaaccaa
agccaggtacttataggttcatattcgactggtaattcatacactaaagaatttaaaaat
agcgaatggaatactaatcttgattttgctttttatggttggttcaaaataacttctttt
cctacttctttttggtctattggttttcattttacaagcaatgctcctaatgtttggaat
gataaatataattatggtgatagactcttaacttttcataatgacaataataatttgatc
aatcctacatatacaacttactcagcaaatccctctccaaatgtatggaatgaagctcct
tactctacctcagattttaactagtggatttttatttatttatcgtatggttcataataa
taagcttaatatgtctactataaatttccatcacgtgaagttggataaaaattgacaaat
attatacataacacatcaaattactattatctttttgtgggaattacaaaagctccttac
acttatttcataggtcaaatatgtggtctttatttaatagcagggcctactgcttataga
gaatcaggatttgatcaattcttaactcttcaaacttaagatgctgttagctgtagttat
tgcttatctgatttttatataccataatagacatgcggtcaatggtgccctaataattac
agagcaaatcttgtataaaaaacttgtgactaatgttctacatatacttctgattgttaa
acatgcgctactacttgtagatcttgcaaatttggaaataaaaatatctgtttagattgc
tatgaaacaatgaacatatccaacggaacatgtgtttgcaaaaatggaatagataaaaga
aatattttctactaatgtagtaatgataatactgcagtcttataggccaatttagcaagc
gatactcccacccttacagttaactttgaagttccattgcaaaataataatttgagctgc
agttaaattttttagccaaaaactttgggtcagctgggttctaatcctgtttgtactata
agctaagcaaatattactatcgccttaagtcaagatgctaatataactgaaacttaataa
atttcatttttacctaatgttctttaatattaaggcaataataaattaattaatactttc
tatttattcagctttacttagttaaaagacattcccttttaaatgaactacaactatgat
gaaatacaaaacacttgtaatgatatcacttttcagttgattccataaaatgatgcaaaa
agaggatttaattcaatagtgtggagtatttaaacataaccaactttagattcacaaata
taattgcaggttgataagatagtaaaaacagcaaatgataatgttaatcctaatttaatt
attcctaaatatttaataccacctaacactaatattaaagctactgttaactatttcatg
agagtcaatgttaatggaactttgtcattttctactttatattaaaaatataagcaaata
gtaattcaaaccatttaaggcgcgtaaccaccaatttatagatatatggatttgactttt
aaattctacctatacacataagtatgcgatcaaacaggaagcattatagtttttgaacca
tatgacatttaaataatttcaaagattttacctaatttaaactaaagctataattaaacc
acttaacaagacttttaagttaatgttaaataatatgagattccattcaacacagcattt
gatttgcaagtttctgccgtattagatagtaataaaacaatatctcagtagactaatata
aatattactccttaattatctaagcttttagtttagattactagtggataatgtggatag
gatggcttgttcaattacaaaaaggatttgaatttgacaggtactgcgagagatttagaa
atctaggatccaaatatcccttaaggaataaacttaagttggtaatgctagtcattaata
tagtaataaaacggagaaagaaaatgccttgactacaggaacaatatagtaactctaggt
tagaatagccttagtactgctgtacctgcctatacttttactccatattaaactctatag
ttctcattagttggaagcaaagatacaagaactagttttagtaatatgacagctataatt
gctgaaattgacattccgcctctatttgtttaatttcaagatatatcttaattacagcaa
gtcaacctcaatgatgatatatttgctacacttcagtacggaagtgatatttcatcagat
gttattgaatatgctggagcagttttatataataatgccgaggttggaattataaaattt
gatttttatgaagttaaatttaggatttgggattattttaattctgttactccagataat
cctgtagtataggttaggttcactgcttataatccttcattttatatgcctagtatgact
ataaaaaattttaatatcaacttacctcctgccaactgtgttttcacagttagtccaact
tctggaaaagctctagaaacttagtttagtatataaatgagtggatgtacaagctcagat
aatgcattaacctactaattcttttactattaaaataatagtgattttaagtaggaaatt
ttagctcctaataacatacttaggagataaatataagattagtctttagcaaatcaacta
aatacaattttgccgtcaggaaatttgactattatgggataagttatgaattcaaaactt
tcaatttttaattcaactgtagaaattaaagtgactccttttgaccaaggagagtaataa
ataaataacatcatagattaaacgctttagcagcaaaacagttaatatcctagataatcg
cttttgaatctttgttatcttggtgaagaaatctctaaaaacaatccagtatattagtta
aattctgttaactatagaaaatctttggtgatttcacagataattaactaaacaagctct
ctcccaaagtagtcatatctgtttacatactcgaataaagttatttcctagctttaactt
tctttaaatagccaataagatagctaatcaataaacttactcaactatataaattaaaca
ttagaaaatacaatgatgttaatgtaagattctggtaacttactcttaaataataataat
gttgtactttaaaacttagttgatagctttaaaatgcttaattcgacaacccaaagtatt
tctgatagtttattacctagttaaatgaacatatcagactagatatgtggtttgttagct
aatataactcttcctaatactggaggtatttaactacaaggaaatctaatagaattaaac
tgctaacaaattacagaaaaaaatcttaattaatatatttataaattagatggtttttaa
acaaagacaactaatatttacagcattacatacagcacatattcataaaatccttacagt
caaacatctgaattttaaaattatacaaaataattataataattgtagccaaatataaca
atttctaaaaatcctgtaataataccttaaattgaatatttaaatagtaatagaagaatt
cttagtataagtaataacaacaatttaaattagaattcaacttatatttacacatttcct
aacgttagtaaatcataaaataaattaacgtgtctctaaaaataagtaaattcatggtct
tcttcaaaatgctaaatactaaatagtacagaaatgagtgggttctaatgttattgcaaa
gataaaactcctacaactattactgatgatctagaatagttaatacaaaataaaaattta
taaactgcatttagttcataaggttttgataatatatctaattttaaatatttttataaa
tacgcagctttttggactctgagtgctgtaacattattattaattggcttattcttctat
gggaagcaccttgatagaaaatttatttttcactctatttaaagaatagctcctactcct
gctactgataatgatcaaagcttaattaatccttaaaaaagaatataaactaatttagat
aacaagaatgaaaacaatacaaacagagatgagaatttttcattaaattaactaaaataa
taggaaaataaatatttatatttataataaggtattgattcacaataataaataattaat
aatataaatatataatcaaataagtagtttcctttttaagaaacccctatttatactcct
ataaatactcaagacctttaattaatttaataatcttaataggaaaattaagaaatttaa
aacatttataattaaatgtaaatagtaaatttagacaactaataagattataataaagat
aacttgtagctttaataataaaactaataaaaaaatcaactcaaatagttctaagaatag
ggaaattaataaaaataaaatatttaataataagatagcttaagcaataaatcaagctaa
cttgataagtaatatgagatttagctttaaaaattttaaaactaaataggaacattagag
actataacaaaaatagttgcttaacctttttcaactttaaacatataataaaataattat
tacaccacataaaacaatttaaatataaataataaataaatttattaataaaataatttt
gaagactatgataattgtaaattttaaaaagaataataaatttaataataaacgaaagaa
ttacagataagtgataaataactgcattcaaacaagtaaaaagtttaaaatccaggcaaa
agtgtttaaaattcttctgaataaaatttaaaaagtgaagcagagaaataaaatgaaatg
gaaacactataaaaatagttgaatgatcaaaagtagaagcttgcaaataaatcgttatta
attagaattattgtgttccatgatttttttaacatattttacagctatgatcctaaacta
tccagagcaattagatttaacatattttaccttagaataattcactctttatgcttaaca
accatttttgatgagagctataatatagattagaaaataattttatctataattagctca
atcattttagtcacaggagtaacaattataactctgatacataaaatcaaaataataggt
taaaagatatcagctatatttttaatttgccttcttttgttttattactatataatttta
tctatcattagcggagaggaagccaattaagcgaattctaaaactttatcatttttgtta
atagtagggattgattttttcggaattctaactcttatgtctgttttaaaattaagttta
gttttatactcatagcaagaacaaagtaaatagacattaataaagtctctttttaagata
ttcgatttatagatcttactataaaatttaaatgtttga
DBGET
integrated database retrieval system