Tetrahymena thermophila: TTHERM_00340170
Help
Entry
TTHERM_00340170 CDS
T01020
Name
(RefSeq) cold-shock DNA-binding domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
CSD
DUF150_C
OB_RNB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7828084
NCBI-ProteinID:
XP_001017681
TGD:
TTHERM_00340170
UniProt:
I7LV89
LinkDB
All DBs
AA seq
801 aa
AA seq
DB search
MQEKRLSVTHNGFLEIFCEAKQHTLTQRIVQTLEDHQLVRKLIPEGPGSLMKAISDQLYF
SSLRYQEIQDKCIQYANNLINQKNIPYKLKGLKTIFEQFKQEPSNIMFDTINLELVSLIY
QVRIVVYSMSKELVLKSLLFNNRCSKTIQVINMSNHYDSIYSEYEINCLTECQNVLYDIL
SDQPLSLGKKLDQDLLNIDYENYLEEISRNSPDDQEDVNLTDTQSSGQAGYNLFDNNIPP
ELFNVILDKERRNSIVEQIRHKKSTICNSVNQSNQSQQSPLPNEQVKAPLEKKKGVGVSL
SAVKNRIIGSTDSEKSSDSEDDEDEKNQTPKQTIITKVDSVISQTSNSNGVQINIIQDDD
DNLIKEAIDLKRPRQESTASYNGANMSNSSLSNQASFQAFSCQNLSIPQQTMKHSSSNPQ
IQYPHSRPLSPSNNSETYSTSNKQGLQYQNQTSQYGQQSATTLSSNQQHHQHGPYSMTDL
QNPNNNTTQLTINPTNLGGSNSSTPPLVGVDQQQLTIQQQQLLHQQQLQQQLNQGNFLNP
VPKRKHQVIESSKEKYKGTLKFFDQDKNYGFIVEDESRTDIFVHFDDLQKAGIHKGILMD
HKHSKSIRFQFSMMDYIGKYQNSRKAVDLQLLSDTPPYLPINPIRVLGPEQYLSTYPPYY
QAPNGPVIHSPTSSGQADYFASPYQQNYLNHATLMPPSTNHLISIQPPLSPTAQTGNQFP
PVIHYGLNVPPQQVVAQQYSNVQVSPPQMAIHHPPSSPQMPQAQYPVQQIGQQPQQQQQQ
LYYTNQQQQQGGQLPYSNLVI
NT seq
2406 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagaaaagagactttctgtcactcacaatggattcttggagatattctgtgaagcc
aaatagcatacattgacttagaggatagtataaaccttagaagaccactaactcgtaaga
aagctgatacctgagggtcctggatccttgatgaaggcaatcagtgattaactttatttt
agctcacttcgctactaagaaatttaggacaaatgcatttaatatgcaaataatttaata
aattagaagaatattccttacaagcttaagggtttaaagacaatatttgagcaatttaag
taagagccttctaacataatgtttgacacaataaatttagagctggtttcattgatctac
taagttagaatagtagtgtattctatgagcaaagaattagtcttaaaatcactacttttt
aataatagatgttctaagactatttaagttattaatatgagcaatcactacgattccatc
tattctgaatacgagataaattgtttaactgaatgttaaaatgttctttatgatatttta
agtgactagcctcttagtcttggaaagaagcttgattaagatctactgaatatagattat
gaaaattatttagaagaaattagtagaaattcacctgacgactaggaagatgtcaattta
acagatacataatcaagcggctaagcaggatataacttgtttgataataatataccacct
gagttatttaatgttatattagataaggagagaagaaatagcattgttgaataaattcgt
cacaaaaagagcacgatttgtaactctgtaaaccaatcaaatcaaagctaataatcacct
ttaccaaacgaataggttaaggctcctcttgaaaagaaaaaaggtgttggagtatcttta
agtgctgtaaaaaatagaataatagggtcaacagatagcgagaaatcaagcgatagtgaa
gatgatgaagatgagaaaaattaaacccctaaataaacaattatcaccaaggtggattct
gttattagctaaacaagcaacagtaatggcgtacaaattaacatcatttaggatgatgat
gacaatttaattaaagaagctatagatttaaagcgtccacgccaagaaagtactgcaagc
tataatggagccaatatgtctaatagttctttaagcaaccaagcttcatttcaagctttt
tcttgccaaaatttaagtatcccatagcaaactatgaagcatagcagtagcaacccttag
atctaatacccacattcaaggcctttatccccaagcaataattctgaaacttattctact
tcaaataaataagggttataatactaaaattagacctcttaatatggctagtagtctgct
acaactttgtcttcaaattaacagcatcattagcacggaccctactcaatgacagacctt
taaaatcctaataataacactacttaattgactattaatcctactaaccttggaggtagt
aattcatctactccacctcttgttggagtcgactagtaacagcttacaatttagtagcag
taattgcttcattaacaataattacaataacaattaaaccaaggcaactttttaaatcct
gtacctaagagaaagcactaagtaattgaaagcagtaaagaaaaatacaaaggaacatta
aagttctttgattaagataagaattatggttttatagttgaagatgaatcacgaacagac
atttttgttcactttgatgatttatagaaagcaggaattcataaaggtattttgatggat
cacaagcatagtaaatctatacgtttctaatttagtatgatggattatattggaaaatac
taaaattcacgtaaagcagtcgacctgtaattactaagcgatacaccaccatacttacct
ataaatccaatacgtgtgttgggtccagagtagtatctttctacatatcctccttattat
caagcacctaatgggccagtgatccattcaccaacttcaagcggttaggctgattacttt
gcttcaccttattagtaaaactacctaaatcatgctactttgatgccaccctcaactaat
catttaatatccatttagcctcctctttctccgactgcataaactggaaattaatttcca
ccagtcattcattatggattaaatgttcctccctagtaggttgtagcacaacaatattct
aatgtgtaagtttctcctccatagatggctattcatcatcctccttcttctccttaaatg
ccttaagcataatatccagtacaacagattggctagtaaccataacaatagcaataacaa
ttatattataccaattaacaacagcaataaggtggttaattaccttattcaaatttggta
atttga
DBGET
integrated database retrieval system
