Tetrahymena thermophila: TTHERM_00349050
Help
Entry
TTHERM_00349050 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Nup54_57_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7835445
NCBI-ProteinID:
XP_001023060
TGD:
TTHERM_00349050
UniProt:
I7M3B3
LinkDB
All DBs
AA seq
1673 aa
AA seq
DB search
MEEAEAVEFSPSYRILEVTEESDEESNHNHLKNEFSNSQHESHQDTAQSAKNQYQTQKQP
QEIIEIDENLDDGEEQSFQYSKKKVDSSGKEIEEFYQNMSFQNSPNQPQVLQINNTSNIQ
PSQKINQNVQNAYGYINQQQQLQQQQQQQQQFQNGVPSFNIQIQRNGEKYELKSASKNLM
QTFSNTQNQQNNQPIAQNAPIQVFKPQPNFNNKLQQNQNLPPQEEETRERKLSVQPVRLI
DQEAFLMKASPQNQNNGNNANVNYSSSNNNINTNTSVNTSQNSRNNQRAQTNSSDKKRHE
KNPQQNDQQFSNQVQYLINKRTQAQLKKEQALSSQKKQMLNQQLLNASDDEMENIVPMSS
NPNKLPLTLVQQENLERQYKEVLLELESTQKQLDEVEKSLRIETLNFEESKRHVLILKMA
LQQKVEEETLKQILAEVIHDARINKVDLYTYLARQMNQQQLEGDKNKHRVVDLERQVKKL
KQINEEQSKQMKQLQEFNESINVELKNAIYALQMAEDEKERMLAEQRQQILDQNSHEKDQ
LLDYLTDCKNQINVLQQEIINLKHQVNSKALNYSIASDHSNPNKNSQVQQQITAGDVNNI
SNGFSNNKQQLSANQHQSPEQLFNNLSNNKLHNQDNSFSHQNNQNSLNFSKNINNDSAEG
KNSLLDHHQEGNLGTNMQQYIHHPDDSQRDDQSHTQNYNLIHQHEEQQNYHENSQNSIHQ
PQNLQKKFQDEELEELLKEIEEINIDDMQPEVVVEKLKKLGGEAKRLKQEIEQNNLVIQD
YKMRQENERSRYSDQIKELFEQLSQTRQELRSKKDQFEQLESNQIGLEEQIESYDQILQQ
KQEEYEKVNEELRQLRQIAGDRLQEMNEIKLKYEIENNALQQEVEQLNVIVQEYESSINQ
DKNSSEERSSSMQFNSQRSGQQTAIRQSNSPKNYSTFQTGNLAKQGNEQNQLQSRQTQEQ
ESNQHYNVSTLNNQVERLQSEIYSKEQQIQQLIEDIKQKDLHILHITDDFQKQIQHLNQQ
IEDIQNEKETIIHENEYCKKEVQKLMEKDLINTNKLKDKKEVKQLQQQLDTKQLEVEKLI
LEKENLNYFVEAYRKFIFNENIKRAIQEYIGVIENISSLEYKRRENVHKINSLEMQQTLE
EYQNDIIKIKEEIISLKESQFTLDDQKKVLLTRKIQLDKELESITISQSDRYESWQTLEE
DYQEIKKKVERQVREFTLKEITYNNVQTAYNDLLKEYGRLLSQSITQQKKPLMRNQSAQG
GQTFILNKSLQSNLSQNQFSPNKKSTIQEVSAEENSQITNNVNQKLLIQIINQYYQTSIL
LKYLLMRFRVKNQDTTAAIIIMTQLLLIITTICQQQIMKKMFTINKLVKILIILYKIKKF
NKISNEILFMCKKTFSILYQNKSLFSLILLKQFLSFHQFGINICLIQNINNFVLLILFIH
LLIQIFNEVRNRKLIRQYNKIIIIVFYIKIISFKTFNNQKQKLLKTMHRQILKQLIGLLQ
PNKSEKQINKQKYLYKIYINSNRKIYIKYNKKMDQQIIIYWFINVFIRQRYKYKIKMTGL
INDIQLFIRLCFYVCMYFQRLQNQSMTILSIYKQFSKQILLINKFIDYIFTLLISDQQFK
LTKFYFFIYFLSHRVLSSAIRNSRKINIWRLQCLFFLWSSFLNALNVWILVIC
NT seq
5022 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagaagctgaggctgtagaattttctccctcttacagaattttagaggtaactgaa
gaatctgatgaagaatcaaatcataatcacttgaaaaatgaattttctaattcttagcat
gaaagtcattaagatactgcttaatcagccaaaaattaatatcaaacccagaaatagcca
taagaaataatagagatagatgaaaatttagatgatggtgaagaatagtccttccagtat
agtaaaaaaaaagtggatagcagtggaaaggaaatcgaagaattttattaaaatatgtcc
ttttaaaactctccaaattagccttaagttttataaataaataacactagcaatattcag
ccttcttaaaagataaatcaaaatgtatagaatgcttatggatacataaactaataataa
taattataatagtaataataataacaataataattttagaatggagttccttcttttaat
atttaaattcaaagaaatggagaaaaatatgaattaaaaagcgcaagcaaaaatttaatg
taaactttttcaaatacacaaaatcaatagaataactaaccaattgcttaaaacgctccg
atccaagtctttaaaccttaacctaatttcaataataaattacaataaaatcaaaattta
ccaccttaagaggaagaaactagagagagaaagcttagtgtttagcctgtaaggctgata
gattaagaagcttttttaatgaaagcctctccttagaattaaaataatggtaataatgca
aatgttaattatagtagtagcaataataatataaatactaatacaagtgtaaatactagt
taaaattctcgcaacaattagagagcttagacaaattcttctgataagaaaagacacgaa
aaaaatccttagcagaacgactagcaattttcaaactaagtgtaatatttaataaataaa
agaacacaggcctagctaaaaaaagagtaagctctttcatcctaaaaaaagtagatgcta
aactaataacttcttaatgcaagtgatgacgaaatggaaaatattgttcctatgagctct
aatccaaataaactccctttaactctagtgcaataagaaaacttagaaagataatacaaa
gaagtgctacttgagcttgagtctacttaaaagcaactagatgaggttgaaaaatctcta
agaatagaaacattaaatttcgaggaatcgaagagacatgtattgatattaaagatggct
ctttaataaaaagttgaagaggaaactcttaaacaaattttagcagaagttattcatgat
gcaagaataaataaagtagatttgtatacttatttagcaaggtaaatgaatcaatagtag
ttagaaggagataaaaataagcatagagtagtagatttagaaaggtaagttaaaaagcta
aagtaaattaatgaggaacaatcgaagcagatgaagcagctctaggaatttaatgaaagc
ataaatgtagagttaaaaaatgcaatttatgctttataaatggcagaagatgaaaaagaa
agaatgctggctgagtaaagacaataaattttagattaaaactctcatgaaaaggattag
cttttggattacttgactgattgcaaaaactaaataaatgttttatagcaagagataatt
aatcttaaacatcaagtaaattctaaagcattaaattattctatagcttctgatcattca
aatccaaacaaaaatagctaagtacaacaacaaattactgctggagatgtaaataatatc
tcaaatggcttttctaataataaatagcaattatctgcaaactaacattaatctcctgaa
caattatttaataatttaagcaataacaaattgcataactaagataattcttttagccat
taaaataattaaaatagtttaaattttagtaagaacataaacaatgattctgctgaagga
aaaaatagtttacttgatcatcactaagaaggaaatctaggaacaaatatgtaataatat
attcatcatcctgatgattcatagagagacgattagtctcatacataaaactataactta
atacatcagcatgaagaacaataaaattatcatgagaactcataaaactctatacattaa
ccttaaaatctgtaaaaaaaattctaagatgaagaactagaagaattgctaaaagaaata
gaagaaattaatatagatgatatgcaaccagaagtagttgtagaaaagcttaaaaaatta
ggtggagaagccaagagattaaaataggaaatagaataaaataatttagttatctaagat
tataaaatgcgttaagaaaatgaaagatcaagatattctgattaaataaaagaattgttt
gagtagttatcttaaacaagataagaacttcgttccaaaaaagattaatttgaataacta
gaatctaactaaatagggttagaagagcaaatagaatcttatgattaaattctatagtag
aaacaagaggaatatgaaaaggtgaatgaagaattaagatagcttcgttaaattgcaggt
gatagactctaagaaatgaatgaaataaagttaaagtatgaaatagaaaacaatgctctt
taataagaggtagagcagctgaatgtcatagtttaagaatatgaaagttctatcaactaa
gataaaaattcaagtgaagaaagatcttcttctatgtaatttaactcttaaagaagtgga
taacaaacagcaatcagataaagtaactctcctaagaattatagcaccttctaaacagga
aacttagccaaataaggcaacgaataaaattaattacaatccagataaacttaagaacaa
gaatctaactaacattacaacgtttctacacttaataactaggttgaaagactgtagagc
gaaatatactccaaagaataacaaatctaacaattaattgaggatataaaataaaaagac
ttgcatattctccacattacagatgatttttaaaaatagatttaacacctaaatcaatag
attgaagacattcaaaacgagaaagaaacaataattcatgaaaatgaatattgtaaaaaa
gaggtttagaagctaatggagaaagacctaattaacacaaataagcttaaagataaaaaa
gaagtcaaacagctttaataataacttgacacaaagcaattagaagttgaaaaattaatt
ttagaaaaagaaaacttaaactattttgttgaagcatacagaaagtttatttttaatgaa
aatattaaaagagcaatttaagagtatataggagtaatagagaatatatcttctttagag
tataaaagaagagaaaatgttcataaaataaattctcttgaaatgcaacaaacattagaa
gaatactaaaatgacattatcaaaattaaagaagaaattatctctttgaaagaaagttaa
tttacactagatgaccaaaaaaaggttcttctaacacgtaaaatttagctagacaaagag
cttgaaagtataacaatatcacaatcagacagatatgaaagttggtaaaccctcgaagaa
gattatcaagaaataaagaaaaaagttgaaagacaagttagagaatttactttaaaagaa
attacatataataatgtataaactgcatataatgatttattgaaggaatatgggcgtctc
ttaagctaaagcattacttagcagaagaaaccattaatgagaaattagtctgcttaaggt
ggataaacattcatactgaataaaagcttacaatctaatttatcttaaaatcaatttagt
ccaaataaaaaatcaaccatttaagaagtatcagcagaagaaaactcttaaataacaaat
aatgtaaatcaaaaattattaatataaataataaatcaatattattaaactagtatacta
ttaaaatatcttctgatgaggtttagggtaaaaaatcaagatacgacagcagccatcata
ataatgacataacttcttctaattattacgacaatatgctaataatagataatgaagaag
atgtttacaattaataagctagttaaaatattaataattttatataaaataaagaaattc
aataaaatctcgaatgaaattctctttatgtgtaaaaaaacattttccattttatattaa
aataaaagtttatttagcttaatattactaaaataatttctatcttttcattaatttggt
attaatatttgtttaatttaaaatatcaataattttgttttattaattttattcattcat
ctcttaatttaaatttttaatgaagtcaggaatagaaaattgataagacaatataataaa
attattataattgtgttttatataaaaattatttcatttaaaacatttaacaatcaaaaa
taaaaattattaaaaactatgcatagatagatactaaaataattaattggtttactttaa
ccaaataaaagtgagaaataaataaataaataaaaatatttatataaaatatatataaat
tctaatagaaagatatatataaaatataataaaaaaatggactaataaataattatttat
tggtttataaatgtatttataagataaagatataaatataaaataaaaatgactggactg
ataaatgatatataattatttattcgtttatgcttttatgtatgcatgtatttttaaaga
cttcaaaattaatctatgaccattctatctatatacaaataattcagcaaataaatttta
ttaataaataaatttattgattatatttttactcttcttattagtgattaatagtttaaa
ttaacaaaattctatttctttatttactttctttctcatagagtactatcatcagcgata
agaaacagtagaaaaattaatatatggcgactataatgcttattttttctatggagcagc
ttcttaaacgcccttaatgtatggattttagtgatatgttga
DBGET
integrated database retrieval system