Tetrahymena thermophila: TTHERM_00376200
Help
Entry
TTHERM_00376200 CDS
T01020
Name
(RefSeq) helicase carboxy-terminal domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Helicase_C
P-loop_SecA
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7824631
NCBI-ProteinID:
XP_001015399
TGD:
TTHERM_00376200
UniProt:
Q23FJ9
LinkDB
All DBs
AA seq
1872 aa
AA seq
DB search
MKKLKNFSNLDEELKIIVNEYEVEVRKKFEPYFNKIKTLSQPQDIPYWEYQKCYQFLQKC
ISNRIYRQEAQKMLEDLNQNLINHCLEKEKSLQQSFEQLKNIFQNASLTNEERKQIEDCS
KNIYNKFEEMSKIENFSELKYKLEQSRSAFLISQQQTLLKRLWRQIKEIVDENEHVQQKW
IFILQQLKILDELECTPQNQFSFASLLSDTYAKNKLNVQNLKSGLEQQLSNLHLPKILET
YKQLYEQTMQNKENKEHQMILNDLKFQLENEMKKIITQIQQYADKLKQIVTYSPISNQLK
EQMDNANQIINLYKHFKDYEYHFKGYLDVDKLKPQIEQVNNSVNQIAHEGPKKIKQTFNN
NNFKESNDQYKFMLEIFKILQQQFPIDEEFNKLRQIQENCFQELQQKVENLKLENSKTER
FNLNFICERLEKVEDDDIYQNFSKLLQDIFQKKLEDKLTNVRDKPLNQQEEAIRQVQSFF
DNIPKEMIKSLNQQIKNIKNTDKIQEEIESCFKQKSYIGLNKIQKTLADSSLYKQFKIKL
EEFMEKEIEQTHIQIISNCKEYNNFEKNLQNLIRVGISTTQEYQSLVKEKLNNVFEQLFC
DQIKEAEKLIQNILNQKISSNQKSIEFFSHYCLLCNSLLKVYGKLQEQELKLLKGLDCFY
VFEQIQEQKSKVINNIKQRVKQIKNTEDDFTCFKEQFNIIYQLQNFDGESYHELIENLNS
KQQKLQKQMEQIILKNVNTFKIQKEYEDYYQSFQKGLQNAKEMQNIAQQFNLGTQYKTLF
QDLLSKLNQTVESINQDLKQCFQGDIFDDNVVKSINNIYLNSKFIDQYFSSMDYVKTRID
QRFVQSEFLQQIKRQFKEPKEIDKLEQVTEYIFNMHKISSTFIYMEKIKTECNENINQVL
KNYKDSKGSLEKLQIQLRKSKYGDQVAQNHPFFKGFQISDTNQRIQRFSIDQVIEQIKGY
SGISKKDDLNKAQLNEFYKIFFDKYNQYLQKYLTSFEKINFIDLLKEIQSSVNKINKDEF
NKTGKIEQTSLNIATELLAGIFCCWTCINSKYYFESIDQSYENKQSFLLKPHPAQIVAIF
RLLGIGYSKNYDEIQCNSLAQVLTGEGKSVVLAALACFYSLCGFYVKCACYSNQLSVRDY
EEFSLLFEKLMIKDLIMYGTFNKVCEEILNQKGDIREQVSSYIQTDNIKCSNTSDIKKQV
LLIDEVDVFFSKDFFGNNYDIVAPIQGPAVEKLLDKIWSAKFDPNFSFKYIFGSLEYKSC
IAQFPKWAELIKEQTKIVVSDFKNFNNVMIENYKIQNDKIYYKNQDQYLDNISYGYRTLY
TYYQENQNSKISNVGLQKQKLFKINSGSFSYQELPKKFFIINGVTGTLETLSQSQLELIQ
NTYNMKQYTFIPSVYGKSKFQFNPQKDVKVVLQQEYYNTITNEINRNIVGKTDQKRAVLV
FFNTKDILLDYYNSQQFKTLKQNSQTQIMTEENSIEERKKIIKDATYSGAITLLTKIFGR
GIDFQVNDSIIFQNYGIHVIQTFFSEDKSEETQTKGRTARQGEEGSFSMVLQLDTLQAFL
KTEEDKKKIEKLDEIYEVLDRNRQVNFENDFKSNIEYNQKTSMTSHKQSVDFLNFLKDRN
LQEVKKYLLQLNQGPKENTFKTLIAMDVTGSMGSLITQTKNTIQTTFEQTREILKEKGYD
PQCFLIMISCFRSYNSKWEEIFQTSTWENNPDKLRSFLQKITASGGTWPGESVEVGLWWA
NKQNDEDPISQVIILGDQPAHLQNEAQKFRNEFKQTYWESTPLKGLTYYVPECQKLNSKN
VPVNTFYLQQRAKSTFEDIAKLTNGVSEYLDINSAQSSKKLTNLFVEQILKDIGKQDGRS
NELIAAYKAKYS
NT seq
5619 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaagctaaaaaatttttcaaatttagatgaagaattaaaaataatagtaaatgag
tatgaagttgaggttaggaaaaagttcgagccatactttaataaaataaagacactttca
tagccataagatattccttattgggagtactaaaagtgttactaattcttatagaaatgc
atttcaaataggatttatagataggaagctcaaaaaatgcttgaagatttgaatcaaaat
ttaataaaccactgcttagaaaaagagaagtctctttaatagtcttttgaacagctaaag
aacatcttccaaaatgcttctttaacaaatgaagagagaaaataaattgaagactgctca
aaaaacatctacaataagtttgaagaaatgtcaaagattgaaaatttcagcgaattaaaa
tataaattggagtaaagtagaagtgcctttttaatttcttagtaataaactcttcttaag
agactatggagataaataaaagagattgtagatgaaaatgaacatgtttaataaaagtgg
attttcattttacagcaactaaaaatattagatgaattagaatgtactccttaaaattaa
ttttcttttgctagtttactctctgatacctatgctaagaataaacttaatgttcaaaat
cttaaaagtggattagagcaatagttaagtaaccttcatcttccaaaaatactagagact
tataaatagctttatgaatagaccatgcaaaataaagaaaacaaagaacatcaaatgatt
ttgaatgatttaaagttttagcttgaaaatgaaatgaaaaaaatcataacataaatttag
taatacgctgataagctcaaataaattgtaacttattcacctattagcaaccaactcaaa
gaataaatggataatgcaaattaaattattaatctatataagcatttcaaggattatgaa
tatcattttaagggttatttggatgtagataagcttaagccttagattgaataggttaat
aacagtgttaactaaattgctcacgaaggacccaaaaaaataaaataaacgttcaataac
aacaatttcaaagaatctaatgattaatataaatttatgttagaaatttttaaaatacta
taacaataatttcctatagatgaagaattcaataaattaagatagatataagaaaactgc
ttccaagaactttaataaaaagtagagaatttaaagttagaaaactcaaaaacagagaga
tttaatttgaatttcatatgtgaaagattagaaaaggtagaagatgatgatatttattaa
aacttttctaaattactttaagatattttctagaaaaaactggaagataagctcactaat
gtaagagacaagcctttaaattaacaagaagaagctatcagataagtttaatcttttttt
gataatattcctaaggaaatgataaaatctctgaactaataaataaaaaacattaaaaat
actgataaaatataagaagaaattgaaagctgctttaaacaaaaaagttatatagggcta
aataagatataaaaaactctagctgattcaagcttatataaacaatttaaaatcaagctt
gaagaattcatggaaaaagaaatagaatagacccatatacaaattatatctaattgcaaa
gaatacaataactttgagaaaaatcttcagaatttaattagggttggcattagcaccacc
taggaatattaatctttggtaaaagaaaaattaaataacgtttttgagcaactattttgt
gatcaaattaaagaagctgaaaagttaatataaaatatattgaatcaaaaaattagcagc
aattaaaaatccatagaatttttttctcattattgcttattatgcaattctttactaaag
gtttatggcaaattgtaagaataagagttgaagcttttaaaaggacttgattgtttctat
gtgtttgaataaatttaagaataaaaatcaaaagttattaacaatataaaacaaagagta
aagtaaattaaaaatactgaggacgattttacttgtttcaaggaataatttaatattatt
tactaactttaaaattttgatggtgaatcatatcatgaattaatagaaaatttgaattct
aagcaataaaaattgtaaaaatagatggaataaattatcttaaagaatgttaatacattt
aaaatttagaaagagtatgaagattactaccaatctttttaaaaaggcttataaaatgct
aaagaaatgcaaaatatagcgcagcaattcaatttaggaactcaatataaaactctattt
caggacttgctatcaaaattaaattaaacagttgaatcaataaattaagatctcaaatag
tgcttttaaggtgatatttttgatgataatgttgttaaaagtattaataacatttatttg
aattcgaaatttattgattaatatttttcatctatggattatgtaaaaactcgtattgat
tagaggtttgtgtaatcagaatttttacagtaaattaaaagataatttaaagaaccaaaa
gaaattgataaactagaataagttactgagtacatatttaatatgcataaaatatcctca
actttcatctacatggaaaaaataaaaacagaatgcaatgaaaacattaactaagtatta
aaaaattacaaagattctaaaggatctctagaaaaattataaattcaattaagaaaatct
aaatatggtgattaagtagcacaaaatcacccttttttcaaaggattttagattagtgat
acaaatcaaagaatataaaggtttagcattgatcaagtcatagaataaattaagggctat
tctggtatttctaaaaaagatgacttaaacaaggcttaactaaacgaattttataaaata
ttttttgataaatacaatcaatatttataaaaatatttaacttcttttgagaaaattaat
tttattgacctcttgaaagaaatataaagttcagtcaataaaatcaacaaagatgaattt
aataaaacaggaaaaatagaataaacatctttgaatatagctactgaacttttagcaggt
attttctgttgctggacttgtataaactcaaaatattattttgaatcaatagattagtca
tacgaaaacaagtaaagctttttattaaaacctcatcctgcttaaatagttgcaattttt
aggcttttaggaattggctactccaaaaattatgatgaaatatagtgtaacagtttagct
taagtcttgactggtgagggaaaatctgttgttttggcggctctggcatgcttttattct
ctttgtggattttatgttaagtgcgcttgctacagtaattaacttagtgtaagagattat
gaagaattctcgcttttgtttgaaaagttaatgattaaagatttgattatgtatggaaca
ttcaacaaagtctgtgaagaaatattaaaccaaaaaggagacattagagaataagtttca
agttatatctaaacagataatattaaatgctcaaacacttcagatatcaagaaataggtt
ctcttgatagatgaagtagatgtcttttttagtaaagacttttttggaaataattatgac
atagtggcaccaatctaaggtccagcagttgaaaaattacttgataaaatatggagtgcc
aaatttgatccaaattttagttttaaatatatttttgggtctctagagtataaaagctgc
attgctcaatttcctaaatgggctgaattaattaaagaataaacaaaaattgttgtttct
gattttaaaaatttcaataatgttatgattgaaaattataaaatttaaaatgataaaatt
tattacaaaaattaagattaatatcttgataacatatcatatggatatagaactttgtat
acatactattaagaaaattagaactcaaaaatttcaaatgtaggtctttaaaaataaaaa
ctcttcaaaattaacagtggaagctttagctattaagagctacctaaaaagtttttcata
attaatggtgtgactggaactttagaaactttaagttaaagtcagctcgaattaatataa
aacacatataatatgaaataatacacttttataccatcagtatatggtaagagtaagttt
taatttaacccccaaaaagatgtgaaagtagttttgtaataagagtattacaatactata
acaaatgaaataaataggaatatagttggaaaaactgattaaaaaagagcagtactagtt
ttctttaataccaaagacatcttgcttgactactacaatagttaatagttcaaaacctta
aaataaaattcctagacttaaattatgacagaagaaaactcaattgaagaaagaaagaaa
attataaaagatgcaacatactctggtgcaattactttactgaccaaaatttttggtaga
ggtatagatttctaagttaatgattctatcatattttaaaattatggaattcatgttatt
cagactttcttttctgaggataagtctgaggaaacctagacaaaaggaaggacagcaaga
taaggtgaagaaggttctttcagcatggttcttcaactagatactctttaggctttcctt
aaaacagaagaagataaaaagaaaattgagaaacttgatgaaatatatgaagtccttgat
agaaatcgtcaggttaatttcgaaaatgactttaaaagtaatatagaatataatcaaaag
acatcaatgactagccataaataatcagtggacttcttaaattttttaaaagatcgtaat
ttataagaagttaaaaaatacttattgtaattgaattaaggaccaaaagaaaatactttt
aaaactctaattgctatggatgttactggatcaatgggcagtctcatcacttaaactaaa
aatactatttagacaacttttgaataaaccagggaaatcttaaaagaaaaaggatatgat
ccataatgctttttaatcatgataagctgttttagaagttataatagcaaatgggaagag
atattctaaacttcaacttgggaaaataatccagataagttaaggtctttcttataaaaa
ataacagcctctggtggtacatggccaggagaatctgtggaagtaggattatggtgggct
aacaaataaaatgatgaagacccaataagtcaagtaataattttaggggattaacctgct
catctacagaatgaagcttaaaaatttagaaatgaatttaaatagacttattgggaaagt
actccactaaaaggattaacttattatgttccagagtgttaaaaacttaatagtaaaaat
gttcctgttaatacattttacctccaacaaagagcaaaaagtacgtttgaagatattgca
aaattaactaatggggttagtgaatatcttgatataaattctgcttaaagctccaaaaaa
ttaacaaatctatttgttgaataaattttaaaagacattggaaaacaagatggtcgtagt
aacgaattaattgcagcatacaaagccaagtattcttga
DBGET
integrated database retrieval system
