Tetrahymena thermophila: TTHERM_00378550
Help
Entry
TTHERM_00378550 CDS
T01020
Name
(RefSeq) ubiquitin carboxy-terminal hydrolase
KO
K11840
ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 9/24 [EC:
3.4.19.12
]
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tet00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
tet01002
]
TTHERM_00378550
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
tet04121
]
TTHERM_00378550
Enzymes [BR:
tet01000
]
3. Hydrolases
3.4 Acting on peptide bonds (peptidases)
3.4.19 Omega peptidases
3.4.19.12 ubiquitinyl hydrolase 1
TTHERM_00378550
Peptidases and inhibitors [BR:
tet01002
]
Cysteine peptidases
Family C19: ubiquitin-specific protease family
TTHERM_00378550
Ubiquitin system [BR:
tet04121
]
Deubiquitinating enzyme (DUB)
Ubiquitin-specific proteases (UBPs)
UBP/USP
TTHERM_00378550
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UCH
UCH_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7830290
NCBI-ProteinID:
XP_001015436
TGD:
TTHERM_00378550
UniProt:
Q23FG2
LinkDB
All DBs
AA seq
2896 aa
AA seq
DB search
MSINNSDQASQQHSEMIIEESNTMAAGAISQNQSEQQRLLNGEAAQTQPAAQPQQQNSQQ
QPSTSNNLNMEQNYNQNSSALNTSEDMQQNENEFREILISDYFQKGFYMDVREHLGDWRV
GIVQQIYEKQQRLFIQFDGSKSDEHVLMSSNKLAHFRKFTKGYTGEKNNASRVKRNIEDI
KLMIQPFKQMIKANYQGVSAFDFTQEFRGKYFFAMDQALQNISYEDESREQVIKLIKNHI
NYTIKYIKEFPNYFTDYYKEYTNQLSYMYDLPVAIAHGSYEMFEMLLSIFGTTDRLVTNQ
NCFYAKNWFFIRENQDQILEQFPEKIIKIHHTNLLENEDNDGMQEEIIGQQQSLIHQQKA
QLRSKIKSEIIPIFTNYFWLNGGFEAMNQLFNDQNKMIPLLSLYQISKIIYYSINNMKDK
YIVIIIDQLCNYIIQRMSLITEREIKEYDPRLVKSIRDYLQNTVKYHPDQDKQDMYLKRI
DEMDLNLALKLLSSQYLNKKIQGLNDISEIIAEIKQNDSFQNGSNNDDIGFRNNSEYYSD
QMNDRRFNPKEFTEWVIKNQIIDHLLGDSMHVEIVRRCHEIIRFMCFCKQFPVELIDTIW
NSCGSDKHEVIVSAIFEMIISITDQLSKEALFKFHEKINSIPLNEINEQTLMLIKGFSQK
AIDILIPSSKFAYFSQDQDGSDTEELEDGQEQQNQEEQKESKSKLSKEAKEQQYEKNFFC
LELLLKLINEDNNQNLSYLVVDNALQIAKELLCLQQGSFIAKKYANLFLEQIISGKSSYQ
AYYLIYALVDSQMPPDILISLQKREIDLPKIIVDDICNYLKQIPEQINKLNPAVLENLKN
APNQNYVFKTTVFKGKYSHENNIHVRFQLLEIILTQNFSDNKRIFQLSPQEFDKLWNQFI
QIPNHPCESQIFLNWILNKTIQRQNQNYLNTIDITNLFTFDLIKHIFVNIFCNPAMMKYQ
NFTPELFNIFFYLFKKINLKLRNIELIANLNKFKVQNEDLAGMKTMWDIFGEAENKQVVN
SCCDQLSEIYINHDKNYDPQFRDHYMRQLTEKCMQFLQQGYIKQSSQLIERSVQLLLLFF
SKIEGQSYKKQYELNQQNQYSQYSIQNQQTYTIIFQKENLSKNIKLNQNIPFGILRKKIS
QEFKIPTTSFRLYCRNYKTFIEPFQDEEIIHASRNVFYVHLIEGADMQNAFHPKNFIIQN
NEYFDLLFNLLSLNFPTDECNNNLWELIMKLPTNDHVKQRIIKIQEPWEEILKGSFHKKL
YCLNIMEELFQHPNGNNLWIQKFYGSGGFKYLYEYFITLDMNIIQNALSKRFIEKLLKIM
CYYDSKAKIDMYQDDPEKGQLVFKQRFQRLIECIHRICEYCILREEKDLENCSQEKLNYS
HQCQHYQRMMNQNQNCNNQAEPKQPDFYTVEYEIVLQCIKLIAQDYNDTMHEFFCHPLME
KIIRKGLAQIDNCIIQINLTHFLNVLYGRCKDKHKILKHLLPTMLHNILPDIVRYSKVNG
ILVQQNNLMIPENTPIEVFRAEQTRSFFELAQQIITYSKDIQQLVSEFDFDQTAINITEM
IINRPILETSQNNKDEILCGLFNLLKVIININPNLRLTLSRNYNLIKQILDFSFDFPQIR
KKSESIFNQNQIAIRGPKIKSSDTRSYSFDLLKQISINVPENVYQIIQYLKPLILSGDWR
TKSQKDWDIVPKKNEKSSTGYVGIKNLGCICYMNALLQQLFMIPSFRQTILKCKDPQFES
TAQEDNILYQLKCMFTSLCYSEKEAYNPKSFCHAFKDYDGNPTNVYEQMDIDEFFNSLMD
KLENQMKGTKHSEAIKKHFGGVFSNEIISKGCQHYSEREEEYLSISLQVKNKKDIKQSLE
ALTQGEMLEGDNSYHCEKCDKKVVALKRTCLKKLPNHLILVLKRFEFNYDNMQKVKINQF
CSFPFEIDFQEFSQQGLRKAEQAQNKQQNHGNHAEYPDNYFKYRLYGIGIHMGIADSGHY
YSYIRDREAQNGENKWMEFNDNVVKFFDPKDIPNEAFGGEEKWKQFYMMENMNMMNQFRQ
KIRNAYLLFYDRIEKFDEDQFQQASASPKEKDLSSEQNVKILEFDDEQEDNISVKEEDKK
QNLKMEAEEDEEIIQERTLSNALNGADAASGEQKSKEQQNQQKIEEEEENSEYEEKYCGE
FKQELLKQNTSFHLHKILFSQEFCIFMNNLIHQYNQTLGENRQPLEYPFDLNSNTITKEF
YDLHFIKFSLTYFFTTAIRQRVVRNENNVNLDQFYSLITQQLYKNIPAIQWLIKCFTDPR
LIKEIIMSPSSDAKEIVIIILEQSCKVLFSLEKAHLHDVEEETDLPKTLLGQFINALIYC
LNIAENYQEYFELIFRLIQIDEEIAQYLLQRMFIGRAMEFIFSSEGKKKKNNQQMGVNQQ
LDFPKTPFRTSDTPMMGLPSQEKQKKQYDSFYKKDRSGFADSTSITYLFRILEYLILRSN
FVTNNPSKIPSKINYNLQKDEIYWLYRDLDSLFYFLNKAKDKLAIKSVNNILAYLSYEDP
VIIDYIYSIAAKIVQEYQSQEFVRSFTLLKKFFSVKDSFQIKKIEVALQKLQQACESNLS
YQRESDVIQQFLIKLCADNHLVASYIYKNQQMHLNNQLKNLHEYNPNKKDADENLQKRDR
YDLQYFDIRIPSRTTQLTCLKNWKIKQLEKLKSGDFNFDVPRFDTDDIMPETEIVKGRYY
DFFDDKEGKWKIIRCYEIHQKKRIAYFFEINIQQMNNYSLNDERELYEKANSFIIIVLHL
STYKLFPFKSMHDHFAIQLQSEEEEENEEAELKKQEDNDDKKTEEENNSTIIQQNNFNEP
NNQNEASNCMMYNEQNHSGSDSDIQNNHAPNSQEREVGEDQESEDEEEEEEEEEEEEELE
EEEEEENEEIHGTSSQ
NT seq
8691 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtataaataatagtgattaagcgtcgcaatagcattcagaaatgatcatagaggag
tcaaacacaatggctgctggtgccataagtcaaaattaaagtgagtagtaaagattatta
aatggagaggctgcccaaacctaacctgctgcctagccatagcaataaaacagttaatag
tagccatctacttcaaataatctaaatatggaacaaaattacaattaaaattctagtgct
ctaaatacttctgaagacatgcaataaaacgaaaatgagtttagagagattttgatctct
gactatttttaaaaagggttctacatggatgtgagagagcatttgggtgattggagagta
ggaattgtttagtaaatctatgaaaaatagcaacgactctttattcaattcgatgggagc
aaatcagacgaacatgtgttaatgagttcaaataagctcgctcatttcagaaaattcact
aaaggatacacaggagaaaagaataatgcctctagagtcaaaagaaatatagaagatata
aaattgatgatataaccttttaagcaaatgattaaagcaaattattaaggagtatctgca
tttgattttactcaagaattcagaggaaaatatttttttgcaatggattaagctttgtaa
aatatttcttatgaagatgaatcgcgtgaataagtgataaaattgattaaaaaccatatt
aattatacgataaaatacattaaggaatttccaaactattttacagattattataaagaa
tataccaattagttatcatacatgtacgatctacctgtcgcaatagctcatggttcatat
gaaatgtttgaaatgctgctctctatatttggtacaacagatcgtttagttactaattag
aattgcttttacgcaaaaaattggtttttcatcagagaaaattaggatcaaattttagag
caatttcctgagaaaattataaaaatacatcacactaatttgctggaaaatgaagataat
gatggaatgtaggaagaaattattgggtaacagtaaagtcttattcattaacaaaaagct
taattaagaagtaagataaaaagtgaaataattccaatttttactaattacttttggctg
aatggaggctttgaagctatgaattagctgttcaatgaccaaaataagatgataccttta
ctatcactttactagattagcaaaattatttactacagtataaataacatgaaagataaa
tatatagttataattatagactagctttgtaattatattatttaaagaatgagtctcatt
acagaaagggaaatcaaagaatatgatccacgtcttgttaaaagtattagagattattta
tagaatactgtaaaataccaccctgactaagataaacaagatatgtatttaaagagaata
gatgaaatggatttaaaccttgctcttaaattgttatcaagctagtatttaaacaaaaaa
atttaaggattaaatgatataagcgaaattatagctgaaattaagtaaaatgatagcttt
tagaatggcagtaacaacgatgatattggatttagaaataatagcgaatactacagtgac
caaatgaatgacagaagatttaaccctaaagaattcactgaatgggttatcaagaatcaa
attatcgatcatctgttaggagattcgatgcatgttgagattgttagaagatgtcacgaa
attattcgttttatgtgcttttgcaagcagttcccagttgagttgattgatactatttgg
aattcctgtggttctgataaacatgaagttattgtttctgctatttttgaaatgattatt
tcaatcactgattagctctctaaagaagctttatttaaatttcacgaaaagattaattct
atccctctcaacgaaattaatgagcagacactcatgctaattaaaggattttcttaaaaa
gctattgatatactcatcccttcttctaaatttgcatatttctctcaagatcaagatggc
tcagacactgaagagctagaagatgggcaagaataataaaattaagaagaacaaaaagaa
agtaaaagtaaattatctaaagaggctaaagaataacaatatgaaaaaaactttttctgt
ttggaacttttgctaaaattaataaatgaagataataattaaaatttgagctatttggtg
gttgataatgctttataaatagctaaggagcttctttgtctgtagcagggaagctttatt
gctaaaaaatatgcaaatttgtttttagaataaataatttctggaaaatcatcctactaa
gcttattacttaatatatgcattggttgatagtcagatgcctcctgatatcttgatttcc
ttgcaaaaaagagaaatagatttaccaaaaattatagtagacgacatttgtaattatcta
aagcagattccagaatagataaataaactcaatcctgctgttttagagaatttaaagaat
gctccaaaccaaaattatgtcttcaagacaactgtttttaaaggaaaatattctcatgaa
aataatattcatgtaagattctagctacttgagattattttaactcaaaacttcagtgat
aacaagcgtatattccagttaagtcctcaggaatttgataagctctggaaccaatttatc
taaattccgaatcacccatgcgagtcttaaatcttcttgaattggatacttaacaaaaca
attcagagataaaattaaaactatttgaatacgatagacataactaatttgttcacattt
gacttaataaaacacatttttgttaatatattctgtaatccagctatgatgaagtactaa
aacttcacaccagagctctttaacatattcttttacttgtttaaaaaaatcaatctaaaa
cttcgtaacatcgaactcattgcgaatcttaacaaatttaaggtataaaatgaagatctt
gctggtatgaaaacgatgtgggatatctttggagaggcagaaaataagtaggttgttaat
tcttgctgtgattagttaagtgaaatttatataaatcatgataaaaattatgatccttag
tttagagatcattatatgagatagctaactgagaaatgcatgcaatttttatagtaggga
tatattaaatagtcatctcaactgatagagaggtcagtttaattgctgttgctgttcttt
tctaagatagaaggacaaagttataaaaaatagtatgaattaaatcaataaaactaatat
tctcaatactctatttaaaatcaataaacttacacaatcattttctaaaaagaaaatttg
agtaaaaatattaagttgaattaaaatattccatttggaattctcagaaaaaaaatatca
caagaatttaaaattccaactaccagctttaggctctattgcaggaactacaaaacattc
atagaaccattctaggatgaagagatcattcatgcttcaagaaatgttttttatgtccat
cttatagaaggagctgatatgcaaaatgcgttccaccctaaaaattttatcatttaaaat
aatgaatatttcgacttgctttttaatctcttatcattgaattttccaacagacgaatgt
aataataatctctgggagctaattatgaaactaccaacaaatgatcatgttaagcaaaga
atcataaaaattcaagagccttgggaagaaattttaaagggatctttccacaagaagctt
tactgccttaatattatggaggaattattctagcatcccaatggaaataatttatggatt
caaaagttttatggtagtggaggttttaaatatctttatgagtactttatcacacttgat
atgaatattatttaaaatgcactctctaaaagatttatcgagaaactacttaaaataatg
tgctattatgattctaaggcaaaaatagacatgtatcaagatgatccagaaaagggttaa
cttgtttttaaacaacgtttttagagacttatagaatgcattcatcgcatttgcgagtat
tgcattctgagggaggagaaagacttagaaaattgcagttaagaaaagctgaattatagt
cattagtgttagcattatcagagaatgatgaatcaaaattaaaactgtaataattaagca
gaaccaaaacaacctgatttctatactgttgaatatgaaattgtcttacaatgcattaag
ttaatagcataagattataatgatactatgcatgagtttttttgccatcccttgatggag
aagataataaggaagggtttagcttaaattgataattgtattatacaaataaatcttaca
cattttctaaatgttttgtatggaagatgcaaagataagcataaaattttaaagcacctt
ttacccactatgcttcataatatcctaccagacatagttagatattctaaggtaaatggt
atattggtataatagaataatctgatgataccagagaatactcctatagaagtgtttaga
gcagaataaacaagatcctttttcgaattagctcaacaaataattacttactctaaagat
atacaacaattagtttccgaatttgacttcgattagactgcaattaatataactgaaatg
ataattaatagaccgatacttgagacatcataaaataacaaagatgaaattctctgcgga
ttatttaatcttctaaaagtaattataaatattaatccaaatttaagactgactctctct
aggaactataatttaattaaacaaattctagattttagtttcgatttccctcagataaga
aaaaaatctgaaagcatttttaatcaaaattaaatagctattcgtggacctaaaataaaa
tcatctgatacaaggagttattcttttgatttgctcaagcaaatttcaattaatgttcct
gaaaatgtttattaaattattcaataccttaaacctcttatactaagtggagactggagg
acaaagagttaaaaggattgggatattgtaccaaagaaaaatgagaaatcttcaacaggc
tatgtcggaatcaagaaccttggttgcatctgttatatgaatgcactactttagtagcta
tttatgattccctcttttaggtaaactattctgaaatgcaaggacccatagttcgagtct
acagcacaagaagataatattctttattagttaaagtgcatgtttacttctctttgctac
agtgagaaagaagcatacaatcctaaatctttctgtcatgcctttaaggattatgatgga
aatcctactaatgtgtatgagtagatggacattgatgaattctttaactctttgatggat
aaattagagaattaaatgaaaggaacaaagcattctgaggcaattaaaaaacatttcgga
ggtgtcttttctaatgaaattatttccaaaggctgctagcattactcagaaagagaagag
gaatacttgtccatatcacttcaagtaaaaaataaaaaagacatcaaatagagcttagaa
gccctcacacaaggtgaaatgttagaaggagacaactcttaccattgtgaaaaatgtgat
aaaaaagttgtagctcttaaaagaacctgcctgaaaaaattacctaatcatctgatttta
gttctaaaaagatttgagttcaattatgacaacatgtaaaaagttaaaatcaatcaattc
tgctcattcccatttgaaattgatttctaagaattctcctagcaaggcttgagaaaagca
gaataagctcaaaataaacaataaaatcatggaaaccatgctgaatacccagataactat
tttaagtatagactttatggtataggaatacatatgggtatagcagattctggtcattat
tattcttatatcagagacagagaagcttaaaatggagaaaataagtggatggaattcaat
gataatgtagtcaagttttttgaccccaaagatatcccaaatgaagcttttggaggtgaa
gaaaagtggaaataattctacatgatggagaacatgaacatgatgaatcaattcaggtaa
aagataagaaatgcatatcttttgttctatgacagaatagaaaaatttgatgaagattag
ttctaataagcatctgctagtccaaaagaaaaagacttgagttctgagtagaatgttaaa
attttagagttcgacgacgagcaagaagataatatatctgttaaagaggaagataaaaaa
tagaatttaaaaatggaagcagaagaggacgaggaaataatttaagaaagaacgttaagt
aatgcgttgaatggagcagatgctgcatcaggagaacaaaaaagtaaggaataatagaat
tagtagaaaatagaggaggaagaagaaaattctgaatatgaagaaaagtattgtggagaa
tttaaacaagagcttttgaaataaaatacaagcttccatttgcataaaattttgtttagc
taggaattttgcatttttatgaataatctaatacattaatacaatcaaactttgggagaa
aacaggcagccacttgaatatcccttcgatttaaattctaataccatcacaaaagaattt
tacgacttgcacttcatcaaatttagtttgacttatttctttacaactgcaatcagataa
agagtagtcagaaatgaaaacaatgttaatttagaccaattctattcacttataacctaa
taactctataagaatataccagcaatttaatggttaattaaatgttttactgatcctaga
ttgataaaagaaatcataatgtctccatcttctgatgctaaggaaatagttattataatc
ttagagtaatcttgtaaggttttgtttagcttagaaaaggctcatcttcatgatgttgaa
gaagagacagatttgcctaaaactttacttggataattcataaatgctcttatttattgt
ttgaatattgctgaaaactattaagaatactttgaacttatatttaggctaatataaata
gatgaagaaattgcttaatatcttctatagagaatgtttattggtagagcaatggagttc
atcttttcatctgaaggtaaaaagaaaaaaaataactagcagatgggagtaaatcagcaa
ttagatttccctaaaacacctttcagaacttcagacactccaatgatgggattaccatct
taagagaagcaaaaaaagcagtatgatagcttttacaagaaggacagatctgggtttgca
gattctacatcaattacatacttatttaggatacttgaatatcttattcttcgctcaaat
ttcgtcacaaataatccttctaagattccatcaaaaatcaattacaacctgtaaaaggat
gagatatactggctgtatagagatttggactcattgttttacttcctaaataaagcaaaa
gataaattagctattaaaagtgttaataatattttagcttatttatcatatgaagatcct
gttataattgactacatatattcaatagctgctaaaattgtataagaatattagagctaa
gaatttgtccgcagtttcactcttctaaaaaaattcttctctgtcaaagattcattttaa
ataaagaaaattgaagtggctttataaaaattgtaacaagcttgtgaatccaatttgagt
tattaaagagaatcagatgtgatataacaattcctcattaagttatgtgctgataaccat
ttagttgcttcctatatttacaaaaatcaataaatgcacttaaataattaattaaagaac
ttgcatgaatataatcccaacaaaaaagatgctgatgagaatctacaaaaaagagaccgc
tatgatttatagtattttgacatcagaattccttcaagaaccacttaacttacctgcctt
aagaattggaaaattaaataacttgaaaagctcaaatctggagattttaattttgatgta
cctcgctttgacactgatgatattatgcctgaaactgagattgttaaaggcagatactac
gatttctttgatgacaaagaaggtaaatggaaaataattagatgctacgaaatacactaa
aagaaaagaattgcttatttctttgaaattaatatttaataaatgaataattatagctta
aacgatgaaagagaattatatgaaaaggctaactcattcattatcatagttctccatcta
tctacatataaattattcccttttaaatcaatgcacgaccactttgcaatatagctataa
agtgaggaagaagaagaaaacgaagaagctgaactcaaaaagtaagaagataacgatgac
aagaaaacagaagaagaaaataactcaacaataatttaatagaataattttaatgaaccc
aacaatcaaaacgaagcttctaactgcatgatgtacaatgaataaaaccattcaggctca
gacagtgacatctaaaataaccatgcacctaactcctaagaaagagaagtaggcgaagat
taagaatctgaagatgaggaagaggaggaggaagaagaagaggaagaagaggaattagag
gaagaggaagaagaagaaaatgaagaaatacatggaacttcttcttaatga
DBGET
integrated database retrieval system
