Tetrahymena thermophila: TTHERM_00378930
Help
Entry
TTHERM_00378930 CDS
T01020
Name
(RefSeq) Spc97/Spc98 family protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
GCP_C_terminal
GCP5-Mod21_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7828290
NCBI-ProteinID:
XP_001015474
TGD:
TTHERM_00378930
UniProt:
Q23FC4
LinkDB
All DBs
AA seq
1701 aa
AA seq
DB search
MSVKMMSSNSDIIQNLVIVVERLYKDQPFANYQIKKKCLDRLIDTLFSYILSKSMRLKIS
NARLDRESLTPYLNNMKGINLQLNILHTNITEITFKMRQNSQFNKALALEVLIQSLIEKG
DDFKCFENYDSKKVKRISMSTIISFIRLMADVYVENSRSDCEYDTFDNNKFCIANRLISK
LLAERNINQSNKDQVVSLNNLKVFKFTNSMQQNNCIVQNNEKENDGFGFQSKLNISQKPC
VQSLTPILGRKIKGIYLTTPKEKQTEKIVKSQCNKNSESMMDNEDEDDYEEQEDEEEEDN
FANEEKQKNHKQNIQIGEFKIENNNNNNKLNNHGLQEQKHIKNDESESIQTVHDSEVFTP
IKDFFNLRKGLIIPSQTEYSSQMNTGLQTTDRQFTNYSDLSCQIEKEMFDSSLDTLVKKE
QTGFPKNVFELNKNTDDNIQSFMGAFQRKQEEPQNMPFSISLNIPSINSNFGLNSNFNPM
SSFAQINSKPQNKINSNQSQIGISNFFSINNNLFQSPQNVVTTNQIKPDTSLNQTNQNVS
MIQNSISHRQNPLSVSQLNNNESQLSIKNSFFNPSAAAFHKSQNQNQDLISNKFVLNPVQ
AQNVSMNQTILSENISLYHQKNKDNLQDQILEDKLSGNFNNNNNNVLGLNFLSSRGSNNL
VSQFLKDKSDRSQQRKIVFQQGFQYDNKDFDQFLKHENEIVSSSLWEDYDIRKSKIQNKN
LQISQTAIFTKQSCEELTQQSNKHYSNLLTTDPEIVSENFILHSVISMLQGIHSDLFQLN
LQNYEFYLKKLNITLPHITHESLLIYLEQYVGTATKIIRLQAILNYFKNARNEQLEQREV
FDLIGECLQCLDSQLLDLRLNNCSILELPLQLRQSFREIDLMYFLIFSNYQQNTQFNFDL
KIAISSLPTNTDLLNIIYNKLEKESISQIDQEILFTFFSHILQPLISNLTQFVITGKSNE
VIYKNLPVFLRESFPRIQEVSQNLSLLKQCDLDHFNACCQINQEQKGDLCQIQISQDIFE
IRQIEKQFNYLIQSRRDAIGKLLQQIKYKKEVKKAQELEQKLNYVKTIKENFLRKVEMIQ
QQKKEQHELKLKKAQEELNQLEIKRIQAKYKKLFEQQEEKAIILQNQLKENERIKQEQLE
IIKNKIQQDFSSLTNQEKKAAEQQLQPGNKEIFETENELKILYEKAQQLKENQMVEEVDI
TPKHQAEINLQKMYEEKTKLLEEEQRKGEEEQNEQTEFLKSIYEQKQQELTQSLVNLKKQ
SPQKLKKNDLESSDDESIINDEEILANQIKMFSSYKQKQIVNKMSEEIMVEEEEKGQMQN
EKLMQKDNLQKMEIEDLQIQYVNEENQNGEKSPSQGLNDCQKYPNTPISVIIQACIQNII
KSQALITNEAIMNIIFEKYNIMNIFSFLKKYMFCERGDKIDDFLEVIVKENCQIELISLY
EASSLFDEEDFLEPLNQYQPFIEFKKDEAPFYAYNFLATNLQDLIKLKMKNCPQIIEVIF
SEEMLAGYVGIFSHLIKFRYANKVLQQKWKQINRNIITWNSNKMETSHTKKQLARLSQSL
RHKIQNFIGNFQNYLYFDIIENAWKMLNKALKKCKNFQELLLIHTNYLKYIQQKTFMKTP
NQIIEQYLNEILQIQIQFVNILENIISYQEEIDYNEEGDQYIQKIHQLNQKFQNYEDFLS
KLIDRIREKETLQTQKLINFS
NT seq
5106 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgtaaaaatgatgagttctaacagtgatataatttaaaacttagttattgttgtt
gagagattatataaagaccaacctttcgctaattattaaataaaaaagaaatgtcttgat
agattgattgatacattattttcatatattttatctaagtctatgcgactaaaaataagt
aatgcaaggcttgatagagagagtcttactccttacttaaataatatgaaaggaataaat
ctacagctcaatattcttcatacaaatattactgaaattacatttaaaatgagataaaat
agctagttcaataaggctcttgctttggaagtattgatttaaagcttaattgaaaaagga
gatgattttaaatgttttgaaaattatgattcgaagaaagtaaaaagaatatctatgagc
acgattatatcttttataaggcttatggctgatgtttatgtagagaatagcagaagtgat
tgcgagtatgacacatttgataataataaattttgtattgctaatagattaataagtaaa
ctgttagcagagagaaatatcaattagtctaataaagactaagttgtatcactcaataac
ctaaaagtttttaaatttacaaattctatgcaatagaataattgcatagtctaaaataat
gaaaaagagaatgatggatttggtttctagagtaagctaaatatttcttaaaaaccttgc
gtacaatcattaactcccatattaggcagaaaaataaaaggtatttacttgacgactcca
aaagaaaagcaaactgaaaagatagttaaaagccaatgtaataaaaatagcgaatctatg
atggataatgaagatgaagacgattatgaagaataagaagatgaagaagaagaagataat
tttgcaaatgaagaaaaataaaaaaatcataaataaaatattcaaattggagaatttaag
attgaaaacaacaacaacaataataaattaaataatcacggattacaagaataaaagcat
atcaaaaatgatgaaagcgaaagcattcaaacagttcatgattcagaagtttttactcct
atcaaagattttttcaatttaagaaagggattaattattccatcttaaacagaatattct
tcttaaatgaacactggattacaaaccacagacagataatttactaattattctgactta
tcttgctaaattgagaaagaaatgtttgactcttctctagatacattagtgaaaaaagag
taaacgggatttccaaaaaatgtatttgaactaaataaaaacacagatgataatatataa
agttttatgggcgctttccaaaggaagcaagaagaaccttaaaatatgcctttttctatt
tctttaaatattccttcgataaactcaaactttgggttaaactcgaatttcaatccaatg
tctagcttcgcttaaataaactctaaaccacaaaataagataaatagcaatcagtcttaa
ataggaataagcaacttttttagtatcaacaataatttattttagagcccatagaatgtt
gttactacaaaccaaattaaaccagacacaagtttaaatcaaactaattaaaatgtatct
atgatataaaattcaatttcacatcgacaaaatccccttagtgtatcataacttaacaac
aatgaaagttagctttctataaagaattccttttttaatccatctgcagcagctttccat
aaaagctaaaactaaaactaagacctaattagcaataaatttgttcttaatccagtttag
gctcaaaatgtttcaatgaattaaacaattctaagtgaaaatatttctctttaccattag
aaaaataaagacaacttgtaagattagattctcgaagacaaattaagtggtaatttcaac
aacaataacaataatgttttgggcttgaattttctttcaagcagaggatcaaataatttg
gttagttagtttttaaaagataagtctgataggagctaataaagaaaaatagttttctag
caaggatttcaatatgataacaaagattttgattaatttttaaaacatgaaaatgaaatt
gtttcttcaagtctttgggaagattatgatattagaaaaagcaaaattcaaaataaaaac
ttacaaatatcataaacagcaatatttactaagcaatcatgtgaagaattaacttaataa
tccaataaacactactcaaatttactcactacagaccctgaaattgtttctgaaaatttc
atactacattctgtaattagcatgcttcaaggaatccactctgaccttttttaattaaat
ttataaaactatgaattttacctgaagaaattaaacatcactctcccccacataacacat
gaaagtcttctgatatatctggaataatatgttggaacagctacaaaaataattagacta
caagccatattaaattactttaaaaatgctcgaaatgagtaattagagcaaagagaggtg
tttgacttgataggggaatgccttcaatgcttagatagttaattattagatttaagatta
aataattgcagtatactggaattgcctttatagttaagatagtcatttagagaaatcgat
ctgatgtattttttaatattttcaaactattagtaaaatacatagttcaattttgatcta
aaaattgctatttcttctttacctactaatactgatctcttgaatatcatttataataaa
ttggaaaaggagtctatttcttagatagattaagaaattcttttcacattttttagtcac
atcctctagcctcttatttctaatcttacctaatttgttattactggtaaatcaaatgaa
gttatttataaaaacttacctgtgtttttaagagaatctttccctagaatccaagaagtc
tcacaaaatttatctttgcttaaatagtgtgacttagaccatttcaatgcatgctgttaa
atcaattaagaataaaaaggagatttatgttaaattcaaatatctcaagatatttttgag
attagataaatagaaaaacaatttaactatctaatttaaagcagaagagatgccatcgga
aagctattacagcaaattaaatataaaaaagaagttaaaaaagctcaagagctcgaacaa
aaactcaactatgtcaagacaatcaaagaaaatttcttgagaaaagtagaaatgatttag
tagcagaagaaagaacagcatgaactgaagctcaaaaaagctcaagaagaattaaaccaa
cttgaaataaagagaatataagccaaatacaaaaagctttttgaataacaagaagaaaaa
gccattattttacaaaatcaactcaaagaaaatgaaagaattaaataagaacaattagaa
attataaagaacaagatccaataagatttctcgagtcttactaatcaagaaaaaaaagca
gcggagtaataattgcaaccaggaaataaagaaatatttgagacagaaaatgagttaaaa
atattgtatgaaaaagcttagtaacttaaagaaaatcaaatggttgaagaagtggatatc
acacctaagcactaagcagaaattaacctttagaaaatgtatgaagaaaaaactaaattg
ttagaagaagagcaaaggaagggcgaagaggaataaaatgaatagactgaatttttgaaa
tcaatttacgaatagaaatagtaagaattaacacaaagtttggtaaacttgaaaaaacaa
tcaccttaaaaattgaaaaaaaatgacttagaatcaagcgatgatgaaagcattattaat
gatgaagaaatattagctaattaaataaagatgttttcctcttataaacagaagcaaatt
gttaataaaatgagtgaagaaataatggtagaagaagaagaaaaaggataaatgcaaaat
gaaaaacttatgcaaaaggacaatttgtaaaaaatggaaatagaagatcttcaaatatag
tatgtaaatgaagaaaattaaaatggtgaaaagagtccttcacagggattaaatgattgc
caaaagtatcccaacactcctattagcgttattatataagcttgcattcagaatatcatt
aaatcctaagctttaattacgaatgaggcgattatgaatataattttcgaaaaatataac
ataatgaatatattttcctttttaaagaaatacatgttttgtgagcgaggagataaaatt
gatgattttttagaagtcattgtaaaggaaaattgttaaatagaattgatttcgttgtat
gaagcatcatctttgtttgacgaagaggactttttagaacctctcaattagtatcagcct
tttatcgaattcaaaaaagacgaagctcctttctacgcttacaatttcttagctacaaat
ctttaagatctcattaagctaaaaatgaaaaactgcccataaataattgaagtcatcttt
agtgaggaaatgcttgcaggatacgtaggaatattttctcatttaatcaagttcagatac
gcaaataaagttttgcaacaaaaatggaaacaaattaacagaaatattattacatggaat
tctaataaaatggaaacatctcacactaaaaagcaacttgcaaggttatctcagagctta
agacataaaatataaaatttcataggaaacttttaaaattatttatattttgatataatt
gaaaatgcttggaaaatgttgaacaaagctttaaaaaaatgcaaaaacttccaagagctg
ctattgatccatacaaattatcttaaatacattcaataaaaaacatttatgaaaacacct
aactagataattgaacaatacttaaatgaaatactctaaatataaatctaattcgtcaat
atacttgaaaacatcatttcctactaagaagaaattgattataatgaagaaggagactaa
tatatctaaaaaatacaccaactcaatcagaaattttaaaattatgaagatttcctaagc
aaattaatagacagaataagagagaaagaaacattataaacataaaaattaataaatttt
agttga
DBGET
integrated database retrieval system