Tetrahymena thermophila: TTHERM_00402000
Help
Entry
TTHERM_00402000 CDS
T01020
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Adeno_E1B_19K
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7839642
NCBI-ProteinID:
XP_001014074
TGD:
TTHERM_00402000
UniProt:
I7LUI3
LinkDB
All DBs
AA seq
889 aa
AA seq
DB search
MSKFDNDYQNIKNDILREINQSQFQQRQEILKLQQMIIDREDKSKEMELKVNSFDNKMVS
LKNLLMSELSHTKENLLQEPKKIMRDFEINVKHIYDMKFKSLEAQFIGIMDEQSKLNRLT
QLDQTKRQEEIQDYYSKLERFVQQNQDKLDHKLGTTIQDILAKFNKMEDTFLELFKQKEK
LFERMNLGYEHLFSNQEIIESTIKKIIYTLDRKADNLSVRTYLKNIKIDLDTKFEDFQNS
LAFPRGIITNGTYLQDKTNQSAVLENLNTINISELKPSESDNQLNKIIYKINQQNLTIKN
IKENYHEHEKRIDHLEEITMNLKLMDQNSQVNQLLNLKQRVPVLHSDEYHINQTPNNQKG
KFQSFNHSPQIDNSYYQNIPTDSKSIHQKSDIKDRDQFSQNKQGNSILNEIFGKKNGDNR
DSKSNQINKSDHSRNLIYEAFDQTVSPQQNKLDHQKNKNEQIQNNLRQNNFMQAPSSETI
EKNEKLPQQLEQDEGEQIDFAKSKLNNQNESLEKLKLVKSVAQDRMTSTNVQNRMRLNFD
QKQKLKSKEESQNKTKKEDSDILKEAQPLDQGFIDVGEDFLTNSLKKSLGNKDNDTQKSN
NQNKRPQLQIEEVEQMSYKNKNNNQNIKQTVSPPPEEDQEELITGGGIRNLLNKSKNRNE
SKDDSPIKNSQYNKKNVSNFSNLNEIDLLNQEYKNQFNQSNIGSKSSSLDNKFNQNKVNY
QTMQNNSNLYRQGEYYDQPNSQIFENPLDKRNPLLKKQGEMSNSSIMRGNKSNLSNKQND
LPPLNIKSTKEINKSKVLPQRNQLNKGLNQQGNLNNKFGNQYQNRGPVDQNNQYYEEDEE
VVYQIDEDGFLMDEAGEYLRDEQGNFIRLTPDQLDNLRDQNLVVEEEYY
NT seq
2670 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaaatttgacaatgattattaaaatattaaaaatgatatactaagagaaattaac
taatcacagttttaataaagataagagatattgaaattatagtagatgattatagataga
gaagataaatcaaaggaaatggagttaaaagtaaattcatttgataataaaatggtcagt
ctaaagaatttgctaatgtcagaattaagtcatacaaaagaaaatttattataagaacct
aagaaaattatgagagactttgagataaacgttaagcatatttatgatatgaaatttaag
tcattagaagcttagtttattggaattatggatgagcaatccaaattaaatagactgact
caactagattaaactaagaggtaggaagaaatataagattattacagtaaattggaaagg
tttgtataataaaactaagataaattggatcataaacttggcactactatttaagatatc
ttagcaaaattcaataaaatggaggatacattccttgagcttttcaagtagaaagaaaag
ttgtttgaaagaatgaatctaggatatgagcacctattttcaaattaagaaataatagaa
tcaactatcaaaaaaataatctatactttagatagaaaagcagataatctatcagttagg
acatatctaaaaaatattaaaattgatcttgatactaaattcgaagattttcaaaatagc
ttagcttttcctagaggaataattacgaatggaacttatttacaagataaaacaaattaa
tcagctgttttagagaatttaaatacaattaatattagtgaattaaaaccatctgaatct
gataattaattgaataaaataatttataaaattaaccaataaaatttaactataaaaaat
atcaaagaaaattatcatgaacatgaaaaaaggattgatcatttagaggaaataactatg
aatttaaaactaatggattaaaattcttaagttaattaattactaaatttaaaataaaga
gttcctgttttacatagtgatgaataccacattaatcaaactcctaataattaaaaaggc
aaattctaatcttttaaccatagtccttagattgataatagctactattagaacattcca
acagattcaaaaagcattcattaaaaatcagatataaaagacagagattaattttcttaa
aataaataaggaaattcgatactaaatgaaatctttggtaaaaaaaatggtgataacaga
gattcaaaatctaaccaaataaataaaagtgaccattctagaaatttaatatatgaagcc
tttgatcaaactgtatctccttaataaaataagctggatcattaaaaaaataaaaatgaa
taaatttaaaataatttacgtcaaaataatttcatgtaagcaccttctagcgaaacaata
gaaaaaaatgaaaagctaccataataacttgaataagatgaaggagagtaaattgatttt
gcaaaaagcaagttgaacaatcaaaatgagagtttagaaaaattaaagctagttaaatct
gtggcataagatagaatgacatctacaaacgtccaaaatagaatgagattaaacttcgat
taaaaatagaagcttaaatcaaaagaagaaagctaaaacaaaactaagaaagaagatagt
gacattcttaaagaagcttaacctcttgattaaggttttattgatgtaggagaagatttc
ttaactaactcattgaaaaaatctttaggcaataaagataatgatacataaaaatcaaat
aactaaaacaaaagaccttaactgtagatagaagaagtagaataaatgtcttataaaaat
aaaaataacaatcaaaatataaaacaaactgtttcccctccgccagaggaagaccaagag
gaactaattacaggtggaggaattagaaacttacttaataaatctaaaaatagaaatgaa
agtaaagatgattctccaataaaaaattcataatataacaaaaaaaatgtaagcaacttt
agcaacttaaatgaaatagacctattaaattaagaatataaaaactaatttaattagtca
aacataggttctaagagttcatctcttgataataaattcaattaaaacaaagtcaattac
taaaccatgcaaaataatagcaatttatatagacaaggagaatattatgattagcctaac
tcttaaatatttgaaaatcctttagacaaaagaaatccacttttaaagaagcaaggagag
atgagcaatagcagtattatgagaggaaataagtctaacttatccaataaataaaatgat
ctaccaccattaaacataaaaagtacaaaggaaatcaataaatcaaaagttcttccttag
agaaactaactgaataaaggattaaattaacaaggtaatttgaacaacaaatttggaaac
taatactaaaatagagggcctgtagattaaaataactaatattatgaagaagatgaagaa
gtagtatattaaatagatgaagatggcttcttaatggatgaagcaggtgagtatttaagg
gatgaataaggtaattttattagattaactcctgattaattagataatttaagagactaa
aaccttgttgtagaggaagagtattactga
DBGET
integrated database retrieval system
