Tetrahymena thermophila: TTHERM_00414460
Help
Entry
TTHERM_00414460 CDS
T01020
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7834989
NCBI-ProteinID:
XP_001007211
TGD:
TTHERM_00414460
UniProt:
Q22P45
LinkDB
All DBs
AA seq
1348 aa
AA seq
DB search
MSDSKNSSPGNDYEEVVISDRRSITSDEEDSEYQEHDLQDQQEYQLVNQYQPNMQFSDDN
KDNHINHLANQQVQVCNVGENVVQQRIELEHVKQRLSQFDIRDGNNTPNSPSYLVFAPEQ
LKLNQNHGNEKVEKHLLKSLEEFSPISRMEDSRGDMTVQIFDLSMVQGRDQHIGSNQNNQ
GSYSSRNTKSTFSNLANSHQNKEQSKNGSQGPFSNQQISNAPLPPTLTRLSNNSKQEQKT
QKLRERLEKYSHQMMNNINLQKTSSDAAQQKQNTKNSIVQSKNSVSNLTQNKKGSTKSSK
ISTPIAKKSALNNNEGKQFEVQVEQIREKSSNSYQKPTYSSTKKQEYSKTERTTPNNANK
QNQASSSVKQKQNLQSSIQQQQQISMQIQKKMTQPLNQPDKTTQKKHQNIVQAKFLLTSP
QKNKVQQNNFLGNLPSQRSSQPNISDSKSTNHREAPYQRYSDIISTNQYSKQKSQSPSDR
ARTTVGESYKQNLSKKQMSDKNSQRKLSDNMNNVSLKKSYSQENINQQRRDSYSSHQSAN
VQVPNDKNNINGQSKLDLISLRQLYRDSLDNYFVRQNIDYNQSQEQMDKQQKEDEGDEFE
INIYKNQSDKFSAQKNKNIDDEDEQLEFPQLYHINRSQSQHNQNYIQNENNNLDEDGKNN
SQNLIRRSYTQDNMLNNISAQNSSQKGNEQSLFSQNQPQSCYNKDYVQAQNSSKDNIQYT
KEFTENSFNQSHSNYYKLTNLKEQKNNPKNTPFHNNYNNNNNNQQLTGDSNFTSYTNALS
VVTNQGQKVISSAKYIDQDEDEIIDNSEQQFISQRATESHSKNQDHQQQIDLKSYNVPPK
QRKASTNYIPRESPNRHTQISPKQQKQTQYQQQNNYNHNSSNHIDLRKSNNYFHPLNNEK
PVSQRYSDQIDIRKKTELNNKTNTNCSNNSLNINNPICLYNLSKESSNKNVKNSNSNTYN
QNYYSLKEGQNQSASRKQNNKQQSPFTQEDSPVKLVNKNQILNDLKRQAQNLQKQIIDIS
QKSKRAGNTQSIHSIDKGNQNSYSYQTQRSHPILPNDSQIGSQSQITTQNQYYLKNATNQ
NQSIHNINSNTAHNSNSNTNTKTNTKEQFYSQNSQYQQLFQQKQAGRIYSQRDAANKKQK
FIRNSNDFQNQKQSQGDQQSTNYDLSENIMNKLYPDQKKNASKSKEIQKQNSKTQNSIYD
TNIDYILKLLKESSTIQQQNSIIQQKNNQNASFCTLNNKYQTSQQQKTNQQQQQQQQQTL
QSKSPTQTSPPLVREQFSKYLQIVQKKTQKSPQAKQGPALAQKDQIAQRIQQIEQEIPKI
QLQKNQIALENNMLEQQNQLLKQNLQNI
NT seq
4047 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgatagtaaaaatagtagtcctggaaatgattatgaggaagtagttattagtgac
aggagaagcattacaagcgatgaagaggactcagaatactaagaacatgacttataagat
taataagaatatcaattagttaatcaatatcaaccgaatatgcaatttagtgatgataat
aaagataatcatataaatcacctagctaaccaataagtataagtatgtaatgtaggagaa
aatgtagtatagtaaaggatagaattagagcatgttaagcagagactctctcaatttgat
attagagatggaaacaatactccaaattctccctcatatttagtttttgctccagaacag
ctaaaattgaactaaaatcatgggaatgaaaaagtagaaaagcatttattaaaatcttta
gaagaattttcgccgatttcaaggatggaggattcaagaggagatatgacagtataaata
tttgatttgagtatggtttaaggtagggattagcacataggttcaaattaaaataattaa
ggtagttatagctctagaaatactaaatctacttttagcaatctagctaattcacattaa
aataaagaataaagcaagaatggaagttaaggtcccttttcaaattaataaatttcaaat
gctccactacctcctacattgactcgattgagtaataattcaaagtaagaatagaagact
taaaaacttagagagcgattagagaaatatagtcattaaatgatgaataatataaattta
taaaagacttcaagtgatgcagcttaacaaaaataaaatactaaaaattcaattgtttaa
tcaaaaaactcagttagcaacttgacgtaaaataaaaaaggatctacaaaaagtagtaaa
atttctactccaatagccaaaaaaagtgctttaaacaataatgaaggaaaatagtttgag
gttcaagttgaacaaataagagagaaatcaagcaattcttactaaaaacctacatatagt
tctactaaaaaacaagaatattcaaaaactgaaaggacaactccaaataatgcaaataaa
tagaattaagcaagtagtagtgtaaagcaaaaataaaatttgtagtcatctatttaataa
cagtaataaatttcaatgtaaatccaaaaaaagatgactcagcctttaaattaacctgat
aaaactacacaaaaaaaacatcaaaatatagtttaagcaaagtttttattaacttctcca
cagaaaaataaagtttagtaaaataatttcttaggaaatttaccttcttagagatcatcc
taaccaaatataagtgattctaagagtactaaccatagagaagctccatattaaaggtac
tcagatataataagcactaattaatatagtaagtaaaaaagttaatcaccctctgataga
gctagaacaactgtaggcgaatcatataaataaaatttgagtaagaaataaatgtctgat
aaaaatagtcaaagaaaattatctgataatatgaataatgtttctctaaaaaagagttat
tcctaagaaaacattaatcagtaaagaagagattcttatagtagtcaccaatcagcaaat
gtgtaggtacctaatgataaaaataatataaatggttagagtaaactagatttaataagc
ttaagataattatacagagatagtttagataactattttgtgagatagaacatcgattat
aactagagttaagaataaatggataaataataaaaagaagatgaaggagatgagtttgag
attaatatttataaaaattagtctgataaattctctgcctaaaaaaataaaaatatagat
gatgaagatgaatagcttgagtttccttagctttaccatattaatagatcgtaaagttag
cataaccaaaattatatttagaatgaaaataataatttagatgaagatggaaaaaataat
agccaaaatttaattaggagatcatacacgcaagataatatgctcaacaatatctcagct
tagaattcttcacaaaaaggaaatgaataaagcttattcagttaaaattaaccttagagc
tgttataataaagactatgtgtaagcttaaaatagcagtaaggacaatattcaatatacc
aaggaatttactgaaaatagttttaatcaaagtcattcaaattattataaactaactaac
ttaaaggagtaaaaaaataaccctaaaaatactccttttcacaataattataataacaac
aacaataaccaataattgacaggagattcaaattttaccagctacacaaatgctctctca
gtagttacaaattagggttaaaaagttatttcaagtgcaaaatatattgattaagatgaa
gatgaaattatagataacagtgaataataatttatatctcaaagagctacagaaagtcat
agtaaaaatcaagatcatcaataataaattgatttaaaaagctataacgtacctccaaag
taaagaaaagcaagcacaaattatattccaagagaatctcctaatcgacatacataaata
tcacctaagtaacaaaaataaacataatactaataataaaataattataatcataacagt
agtaatcatattgatttaagaaaaagtaataattattttcatcctttaaacaatgaaaaa
cctgtctctcagcgctacagtgattaaattgatattagaaagaaaacagaattaaataat
aaaaccaatactaattgcagtaataacagcttaaatataaataatccaatttgcttatac
aatttaagtaaagaaagcagtaataaaaatgtgaaaaatagcaatagtaacacgtataat
taaaactattacagcttaaaagaaggataaaattagagtgcatctagaaaataaaataat
aagcaacaatcaccttttacataagaagactcacctgttaaattggtaaataaaaaccag
attttaaatgatttaaaaagataagcttaaaatttacagaaataaattattgatattagc
tagaaatctaaaagagcaggcaatacctaatcaatacattcaattgataaaggaaattaa
aattcatatagctactaaactcaaagatctcaccctatattaccaaacgactcttaaatt
ggctcctaaagttaaataactacttaaaattaatattacttgaagaatgcaacaaattaa
aattaatctatacataatataaattctaacactgctcataatagcaattctaacactaac
actaaaactaatactaaagagcaattctattcttaaaattcctaataccaacaactattt
tagtaaaagtaagcaggtagaatttattctcagagagatgcagccaataagaaatagaaa
tttataagaaattccaatgatttttaaaattagaaatagagttaaggagattagcaatct
acaaactatgatttatcagaaaatattatgaataaactttaccctgatcaaaagaaaaat
gcaagcaagagtaaagaaatttaaaaatagaactctaagacataaaatagcatttacgat
acaaacattgattacattttaaagctcttaaaggaatcgagcactatttaataataaaat
tctataatataataaaagaataattaaaacgctagtttttgcactttaaataataaatat
taaaccagttagcagtaaaaaactaactagtaataacaacaataataataataaacttta
taatcaaaatcgccaacacaaacttctcctcctttggtcagagagtaattttctaaatat
cttcaaatagtgtaaaagaaaacttaaaaaagcccttaagcaaaacaagggccagctcta
gcataaaaagattagatagctcaaagaatttaataaatagaacaagaaatacctaaaata
taattataaaaaaattaaattgctttagaaaacaatatgttggaataacaaaaccaactt
ttaaagtagaatttacaaaatatttga
DBGET
integrated database retrieval system