Tetrahymena thermophila: TTHERM_00419660
Help
Entry
TTHERM_00419660 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7846275
NCBI-ProteinID:
XP_001033226
TGD:
TTHERM_00419660
UniProt:
I7LTN4
LinkDB
All DBs
AA seq
3013 aa
AA seq
DB search
MSQHNQVQKKDVVCIKNETKIQLENTRFDLHDLKQFMRNHKDTLQEIIIKGCSSNYKRFQ
IIHTLFLEADLLLIDFTNLNKLEVKDMQPYEEENNQLYQKDMDSLYDHSIKNLMAEFNIH
QMLRQNLNQDKSKIVIKQICFDSKHAFYYSLNALLKYRVQIKCVSFVNILDMKINPMKAF
CEKIRDLFTLTEVQFINVLFSDQNILQIRYLLNWKQQSLERLVFKRIQMSEYQLELLFSA
NNFTLQDLTNLKKFIFKCDEKLQKCQVYKNLIKKYKAFHQKETKQVEDNYKLQKQVEQQS
NIKNELVKEKDYIKQKLFEPKHIIIHSQNKSSQFSSFQKEFQQPLKMLLFQLSQSNFCEE
LDISAFSLIGAPQEIINYLIKAVCDSLSLHTLKIQNCQELIHLLHEGFRQKNNSQDLEVR
RLDEIKSKSLLAIKQNSEKQPQSNQGQDSQFNQKLKKQLRTLDNDCNINEHIQSEQLRSN
EQLSHRQNQNEHQEQANQPSMNSNSFIKIKKRVKRKALKQFIVEGNDHNIFGQSSLNNII
QMMYYSEALSIDFNDSTLTKDGMKGILDGFEQLKLKNDYLEIKKFTIKNMKESNQIDGQS
WMKFGQNLFLAVGEYLESIALDGIKAKESVFLEIMRGIFSYKVKQLKIKLRSFIINQKTD
TQMQIYLFLNQALQYWPLQELRISSQVDSTQQKNNIVNTNNYNYFNKIQSNQLYSHNIKS
YHMSVSQANLNDMQSQVQIQRQEIILNSCSTLKILQLSHFKQIDWYVLIKNIVNCYPKLE
ELDISDNNLNLDFISFLTLNSNLSNMQNLKKLNLSKNPLKSMPSNPRQNQLQNSQISLQS
GNLENSTIKQINQMKYQQTGNQKHKVNLQQSLDLDQTGLNIIKQHPQNVFKLNKDNEVER
NEYQKQESIEFLNNQVENHKQQCSEASLKSDDNIANLLDASKNNMNQLARKRQSSNFEVR
NLKAKNTMTEDKPVKKYEKVMSDFFAFIFKIQSLEYLDLSSTQITNTEVEMIENQIKLQK
ESNLSFENINLNGNNDIIRQELFKKKIQIFQSYFENPTKNQKNQNQEKTDQLKILVQPKI
NYGSTIKELNFQNCDLGNDFYSKVIEILKLKQCQFRTINLSDNSNITEAKWKDIMKQMLT
SQGRFLENLYLTNCKFKDSHIIEICSAIKEVCEIQKEEILKKYEYGALQLNLLDLSSNSQ
IKEGWSNLIQTLLGSVLISLRSIILRNCSINNIKTQYLLEGLQVANLELRKNSDICLRCL
EQIDLKDNPIPLGLQVDLQRSFLLSNILQSQISQVQECNEDLIKNLQNLEKNKEFFIHQI
QKCPIKKQIKPSATQLIFGIQSSDQLDTILPEVLKSFSYIDSLVIHINYEFLDNLIEGLQ
NLEMRIKNQNQEEFAQYEATSIYEIQQAQLRFRSVTLILNIESLKIKEKIPSFQNLQAIQ
QKKSKFNVDKKKNKSKKIMSFGESKSSDDSHDSQSDDEKYKGHKKKNRQGNIINEEEKIR
DDQNLQEEEAQDLIFNYQKHLKNKQKKQKLENDEYDLNKYQTQENQIEPQKWERIIKCLF
NISNFEELTMQNCKIDGRVLDQICKITSLVSLNISDNHLLYLVPSQKKNMKHSNQNFQKL
TKINPFEGLNILLNFSNLQELNLSNTNINARFVKKFTEILKPIDLESRSKPYCLKKINLS
QNKMLQKQEWQTLIKELLNNTCLETLILSDCNIGKHNVQGLINALLYAVNTDYLHNIDLS
YNKSIYPEDWGIIIVNLFNRYRIQELNVSYCAIYDQKLKNILKNLFLNKIEYLKTLDFSG
NYIENPENLFKFMNLLYQASKIEEIKFENCNLNKKNTEYFNDQVHLLQIRTLKTHSSLQI
VNFSNNPQILESYCHSYTYFQTFLENSTQYFQKIQEIYLENCLIDQAKINSFIQCFISIN
SKGLKINSLLTLNISGNRILGQQFSEMLPLIIQVASSLQNLYIGFNTNKCQQYLEEQYQE
NIIDQQNLEFPNNDEPQNAPLMNGIQGITAAFKKINQLNLNKIQISDDEEVSESDWTEFL
EVLLEKTSKSLQHIMICGQRKMHIKESMFFSSLHKILRQKRHSNQFLKEYSNQKAKGDKI
DLQIQSIGYFQGMNQKIYVLTASIWPSFVKNGFQPELESGNILQLDKQEYDKYFWQTPTQ
FRNVYIKLHNDMSIMKFEGSIQNDSQQNLSLKADLFIALNQLRKYLNCELISQNKVDSRN
QTQTEIQAQLFLNINYKYSKLPIFQIQNVLRAPLQFREVDLTPILKGYDNLTFDYPFYLF
LIQTCNLYPCDSMTEFFVKFIKSLSTYYFSIDQNIFNMIQASPHFFLTEKDRDNIQRSLN
KYKHLDQEEEEQKLKNQESMKNKNVAVRQNNNKSKQNTQIIQQDYLAKKTSNNKQLNNLG
NSFQSFKQDYNGIDSFNRNASNILSNNFVSQLNGNINQSKIINAHAIQNLSSNQLQQDAL
SINNKLNDISQNQLIPNRQLSDKQPTQIIPNLGNNQIQYIGSDLRQSTLKPQQIKKQITK
AHIQKLEQQKKFWTVLCPYYFQSESMDGVEEIQIIHRIQKMPPSELELKGMSISAIKTIY
AFCFQNPYFTACQMDYNHSVFVNTSLAWSLREKIYRHYCNYKRNPIKNKLQSIFFQILRL
MIRENVFYKYDNSAILLDQYYSKKNLTLYLMMFLIIFFHILTILVPFIFSNQEGATWDSH
FIYAGFSIITFVFELYLVKDILNKILHLTPGFYVVGKSSTYMQACFQRFKKALVEQSIIN
YKYLIFLWYLITSQFSRFNTYSDFCFLVLCWRKNSITIFYFSTFILLLNKAICFYRFVNI
ILKDELKRKLPGNNITKFYETSIQLDFIAFSEVLDIVSPYNVTRIPNNWLTKLIIPKISG
QSMNQRIYYQLLRILFEDVPQIIIQIIYLIGQINIYAYISLIMSFISFSLAFYKILSIRP
SIISQLDFDELKIQKQTDQEKVLKEFEEKQNQMLIQLFQLAETQKKSIIQQPQYKLKPSY
QQNSPSKLQQTYF
NT seq
9042 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttaacacaatcaagtataaaaaaaagatgtagtatgtataaaaaacgagacaaaa
atataattagaaaatactcgctttgatttacatgacttaaagtagtttatgagaaatcac
aaagacactttataagaaattataataaaaggctgttcatccaactataaaaggttttag
ataatccacactttatttttagaagcagatcttctattaatagacttcacaaatttgaat
aagcttgaagtaaaagacatgtagccatacgaggaggaaaataattaattgtattaaaaa
gatatggacagcctttacgaccacagcataaaaaatttgatggcagaattcaatattcat
taaatgcttcgctaaaacttgaatcaggataaatcaaagatagtaataaaataaatatgt
tttgattctaaacacgctttttactactctttaaatgcacttctaaagtatagggtataa
attaaatgcgtaagtttcgtaaatattttagatatgaaaatcaatccaatgaaagctttt
tgcgaaaaaattagagatttattcactctaactgaagtacagtttattaatgtactcttc
agtgactaaaacatcttacagataaggtatttactgaattggaaatagcaatctcttgaa
agacttgttttcaaaagaatatagatgagtgagtattaattagaactgctcttctcagca
aataactttacactataggacttaaccaatttaaaaaaattcatatttaagtgcgatgaa
aaactgtaaaaatgctaagtttataaaaacttaataaaaaagtataaagcatttcatcaa
aaagaaactaagcaagttgaagataattataaattataaaaataggttgaatagcaaagt
aatattaaaaacgaattagttaaagaaaaggactacattaaataaaagctatttgagcca
aagcacattatcattcatagctaaaacaagtcatcttagttttcatctttttaaaaggaa
ttttaacaacctcttaaaatgttacttttttagttaagtcagtcaaatttttgcgaggag
ttagatatctcagctttctcgttaataggtgctccataagaaattattaattatttaatc
aaagcagtgtgtgactctctttcacttcatactcttaaaatttagaattgtcaagagtta
attcatcttcttcacgaagggtttagataaaaaaacaattcccaagatttagaagtaagg
agattagatgaaattaagagtaaaagtctattagctattaaacagaattccgaaaaataa
ccataatcaaattaaggttaagacagctaatttaattaaaagttgaaaaaataattaaga
actctagataatgactgcaatataaacgagcacatataatctgaataattaaggtctaat
gaataattatctcatagataaaattaaaatgaacatcaggaataagcaaactaaccatct
atgaattcaaatagctttattaagataaaaaaaagggtaaaaagaaaagctcttaagtag
tttattgtggaaggtaatgatcacaatatttttggttagagcagcttaaataatataatt
taaatgatgtattactctgaggctctatctattgattttaatgactcaacgcttacaaag
gatggaatgaaaggaattttagatggatttgagtagctaaaactaaaaaatgactaccta
gaaattaaaaagtttactataaaaaatatgaaagaatcaaaccaaattgatggctaatcc
tggatgaaatttggttaaaatttatttttagcagttggagagtatttagaatcaatcgct
ctcgatggaataaaagccaaagaatcagtttttttagaaattatgagaggtatcttttct
tacaaagtaaaataattgaaaattaaattgcgttcattcataatcaattaaaaaactgat
actcagatgcaaatttacctatttcttaattaagcgttataatattggccactacaagaa
ctacgtatttcgagttaagtagattctacgcaataaaagaataatattgttaatacaaat
aactataattacttcaataagatctaatcgaattaactttacagtcataacataaaatcg
tatcacatgagtgtcagttaggccaatttaaatgacatgtaatctcaagtttaaatttaa
agacaagaaattatattgaattcttgtagcaccctaaaaatattacagttatcacacttt
aagtaaatagactggtacgttcttataaaaaatattgtaaattgttatcctaagctagaa
gaacttgatatatctgataataacttaaatttagactttatttctttcttgactctgaac
agtaatctttctaatatgtaaaatttaaagaagctaaatttaagtaaaaatccattaaaa
tctatgccttcaaacccaagacaaaactaattacagaactctcaaatttctttgtaaagt
ggtaacttagaaaacagtacaataaaataaataaattaaatgaaatattagtaaactggt
aattaaaagcataaggtaaacttgcaacaatctttagatttagattaaacaggactcaat
ataattaaataacatccttaaaatgtatttaaattaaataaagataacgaagtagaacga
aatgaatattaaaaataagaaagtattgaatttttaaacaattaagttgaaaatcataaa
taatagtgtagtgaagcatcactaaaatcagatgataacatagctaatcttctagatgca
agtaagaacaatatgaattaacttgctcgaaagaggtaaagctcaaattttgaagtcaga
aatcttaaagctaaaaacactatgacggaagataagcctgttaaaaaatatgagaaagtt
atgagtgatttctttgcttttatatttaaaatacagagcttagaatatttagatttgtct
tcaacataaataactaatacagaagttgaaatgatagaaaattaaattaaattgtaaaaa
gaaagcaatttgagctttgaaaatatcaatttgaatggtaataatgacatcataagataa
gaactttttaaaaagaaaatataaatattttaaagttattttgaaaatccaacaaagaat
caaaagaattaaaatcaagaaaaaactgattaattaaaaattttagtttagcctaaaatt
aactatggatcaactatcaaagagttaaatttttaaaactgtgacttaggcaatgatttc
tatagtaaggtgatagaaatattaaaattaaagtaatgttaatttaggactataaatcta
agtgataattccaatataactgaagctaagtggaaggatataatgaagtaaatgcttaca
agctaaggaagattcctagaaaatttatatttaactaattgtaaatttaaggattctcac
ataattgagatttgctcagcaataaaagaagtttgcgaaatccaaaaagaggaaattctc
aaaaaatatgaatatggagctcttcaattaaatttattagatttaagttccaactcctaa
attaaggagggctggtccaacttaatataaacattgctgggatctgttttaattagtttg
agatcaataatcctaagaaattgctcaataaacaatataaaaactcaatatttacttgaa
ggtctttaagtagcaaatttagaattaagaaaaaatagcgacatttgtcttagatgtcta
gaataaatagacttgaaagacaatccaataccactgggcttacaagttgatctataaagg
agttttcttttatcaaatattttgcaatcataaatatcttaagtttaggagtgtaatgag
gatcttattaaaaatctttaaaatcttgaaaaaaataaagaatttttcatacattaaatt
taaaaatgcccaattaaaaaataaatcaaaccatcagccacctaacttatatttggtatt
caaagctctgattaacttgacaccattcttccagaagtcttaaagtctttttcatatata
gacagcttagtcatccatataaattatgaatttttagataatctgattgaagggttacag
aatctagaaatgagaataaaaaattaaaatcaggaagaatttgcttaatatgaggctacc
tcgatttatgaaatctaataagctcaattaagatttagaagcgttactttaatattaaat
attgaatctttaaagatcaaagaaaaaatcccttcgttttaaaatctttaagctatccaa
taaaagaagtcaaagtttaatgtagataaaaaaaaaaataaaagcaaaaaaataatgtcg
tttggtgaaagcaaaagcagtgatgatagccatgatagctaaagcgatgatgaaaaatat
aagggccataagaaaaaaaatagataaggtaatataattaatgaagaagaaaagataaga
gatgactaaaatttacaagaggaggaagcataagacctcatttttaactattagaagcac
ttaaaaaacaagcagaaaaagtagaaattagaaaatgatgaatacgatctaaataaatac
taaacacaagaaaattaaattgagccacaaaaatgggagcgtataattaaatgtctattt
aatatttcaaatttcgaagaactcacaatgcaaaactgtaagatagatggaagagtatta
gattaaatttgtaaaataacaagcttagtttctttaaatataagtgataaccatctttta
tacttagttccttcttaaaaaaaaaatatgaagcactctaaccaaaatttttaaaagcta
acaaaaatcaacccatttgagggattgaatattttattaaatttttcgaatttgtaagaa
ttaaatctttcaaatacaaacataaatgctagatttgttaaaaaatttactgaaatcctt
aaacctatagatcttgaaagcaggtctaagccatactgccttaaaaaaataaatttatct
caaaataaaatgcttcaaaagcaagagtggtaaactttaattaaagagttacttaacaac
acatgcctcgaaactttaattttaagtgactgtaatattggtaagcacaatgtgcaagga
ttaataaatgcacttttgtatgctgtgaatactgattatcttcataatattgatctttct
tacaataaaagcatttatcccgaagattggggaattattatagtaaatttgttcaacaga
tatagaatacaggaattgaatgtaagctactgtgctatttatgactaaaagctcaaaaat
attttaaaaaatctatttctaaataaaattgaatatttgaagactttagattttagcggt
aattacatagaaaatcctgaaaatttgtttaaatttatgaatcttctgtattaggcttct
aagattgaagaaataaaattcgaaaactgcaacttaaataaaaagaacacagagtatttt
aatgatcaagttcatttactttagattagaacattaaaaactcactcctcacttcaaata
gtcaatttttccaataaccctcaaatattagaaagctactgccattcttacacatatttc
cagacatttttagaaaattcgacttaatatttttagaaaatttaagaaatttatcttgaa
aattgcttaatagaccaagcaaagattaattcttttatttaatgctttatctctatcaac
tctaaaggtttgaaaataaacagtctcttaaccctcaatatttctggaaataggattctt
ggataacaattctcagaaatgttacctcttattatttaagtagcaagctctttgcaaaat
ttatacataggatttaatacaaacaagtgttaataatacctagaggaataatatcaagaa
aatataatagattaataaaatttagaatttccaaataatgatgaaccttaaaatgcgcct
ttgatgaatggaatataagggattacagctgcctttaaaaaaataaactagttgaatctt
aataagatttagatatccgatgatgaggaagttagtgaatctgactggactgaatttctg
gaggtcttgctagaaaaaacaagcaagtccctctaacatatcatgatttgtgggcaaagg
aaaatgcatataaaagaatctatgtttttcagtagtttacataaaatcctaagacagaaa
aggcattctaactaatttttaaaggagtattctaattaaaaagcaaaaggcgataaaatt
gatttatagatttagagcattggttatttttaaggaatgaattaaaagatttatgtatta
actgcctctatatggcctagctttgttaaaaatggcttttaaccagaacttgaaagtggt
aatatattataattagacaaataggaatatgacaagtacttttggtaaactccaacttaa
tttagaaatgtctacattaagcttcacaatgatatgagtataatgaagttcgaaggctct
atctaaaatgatagtcagtaaaatttatcactcaaagcagatttatttattgctctgaat
caattgagaaaatatttgaattgtgagctaattagttaaaataaggttgattctagaaat
taaacacaaactgaaatacaagcttagttatttttaaatatcaattacaaatactctaaa
ttgccaatattctaaatctaaaacgttctaagggctcccttacagtttagagaagtagat
ttaactccgattcttaaggggtatgataacctcacatttgactatccattttacttattt
ttaatttaaacctgtaacttatatccatgcgattctatgactgaattctttgtgaagttt
atcaaaagtttatctacttactacttctcaattgatcaaaatatttttaatatgatttaa
gcatctcctcatttcttccttactgaaaaagatagagacaatatacaaagatcactaaat
aagtacaaacacctagattaagaagaagaggagcaaaagctaaaaaattaagagtctatg
aaaaataaaaatgtagctgttagataaaataacaataaaagtaaataaaatacataaatt
atctaataagattatcttgctaaaaagacatcaaataataaacaattaaataacttaggt
aattcattctaatcatttaaataggattataatggaatagattcattcaaccgaaatgcc
tctaatattttaagtaataattttgtatcataactaaatggaaacattaattaaagtaaa
atcattaatgcacatgcaatttaaaacctttcaagcaatcagcttcaataagatgcttta
tcaattaataataagcttaatgatatcagttaaaatcaattaattccaaatagacaacta
tcagataaacaaccaacataaataataccaaacttaggcaacaattaaatctaatatatc
ggcagtgatttgagatagagcaccttaaaaccctaataaattaaaaaacaaattacaaag
gctcatatttaaaaactggaataatagaaaaagttttggacggttttgtgtccttattat
ttttaatcagagagtatggacggagttgaggaaatatagattatacacagaatataaaaa
atgcctcctagtgagttagagttaaaaggaatgtcaattagtgctattaagacaatttat
gccttttgtttctaaaatccttactttactgcttgttaaatggattacaatcactctgta
tttgtaaatacaagtttggcatggagtttaagggaaaaaatataccgtcattactgcaac
tacaaaagaaacccaattaaaaataaattacaaagtatttttttttagattcttagattg
atgatcagagaaaacgtattttataagtatgataactcggctattttgctagattaatat
tactctaaaaagaatttaactctttatttaatgatgtttttaattatcttttttcatata
ctcacaattctagttccttttattttctcgaatcaagaaggtgcaacttgggattcgcat
ttcatatatgcaggattttcaatcataactttcgtttttgagctttacctagtgaaagat
attttaaataaaatccttcacttaacaccaggattttatgttgttggaaaatcttctaca
tatatgtaggcgtgctttcagcgatttaaaaaagctttggttgagcaatcaataattaat
tataagtatttaattttcttgtggtatctcataacaagttagtttagcagatttaacacg
tatagtgatttttgctttttagtgttatgctggagaaagaattctataacaatcttctac
ttttcaacatttatccttttacttaacaaagctatttgcttttacagatttgtaaacata
atactcaaagatgaactaaaaaggaagctgcctggcaacaatataacaaaattctatgaa
acttcaatttaattagattttatagcattttcagaagtattagatatagttagtccatac
aatgtaactcgtattcctaataattggcttacaaagctcattatacccaaaatcagtggc
taatcaatgaattaaagaatctattattagttgctgagaattttgtttgaggacgtacct
taaataattatatagattatttatctcataggacaaatcaacatttatgcatacatttct
ttgattatgagttttataagctttagcttggctttttataaaattttaagcattaggcct
tctatcatatcataattagattttgatgaactgaagatttaaaagcaaacagaccaagaa
aaggtacttaaagaatttgaagaaaaataaaattaaatgctaatataactattttagttg
gctgaaacttaaaaaaaaagcataatctaataaccacagtataaattaaaaccttcatat
taataaaattctccgtcaaagcttcaacaaacttatttttga
DBGET
integrated database retrieval system