KEGG   Tetrahymena thermophila: TTHERM_00420480
Entry
TTHERM_00420480   CDS       T01020                                 
Name
(RefSeq) SNF2 family amine-terminal domain protein
  KO
K15505  DNA repair protein RAD5 [EC:5.6.2.-]
Organism
tet  Tetrahymena thermophila
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tet00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:tet03400]
    TTHERM_00420480
DNA repair and recombination proteins [BR:tet03400]
 Eukaryotic type
  TLS (translesion DNA synthesis) factors
   Rad6 epistasis group
    TTHERM_00420480
SSDB
Motif
Pfam: SNF2-rel_dom Helicase_C ResIII DEAD zf-C3HC4_2 zf-C3HC4 zf-RING_2 zf-C3HC4_3 Prok-RING_4 zf-RING_UBOX zf-RING_5 zf-rbx1 RING_XB3-XBAT31 zf-RING_10 zf-RING_4
Other DBs
NCBI-GeneID: 7831442
NCBI-ProteinID: XP_001033303
TGD: TTHERM_00420480
UniProt: I7MD77
LinkDB
AA seq 1183 aa
MNLKASSVNLIKNVIILFIFGIYLKISLKVKSNNQSENNHLHSDQYQEDETYQILTNPFQ
YQIQMSSQNYQNYNNNPSYQPLQIEYANQNYDYQLESFQQDCNMTNYFQTEQDNRNQHSQ
DQFRNDFKNQNYFEPNQCDVDNQEFKFQVDRLQSSGEFFKCLDFLAIKNYDKFQDQYQYL
GALQTTLSTDLKKFDFINPNQVYQGKIQPGKILKISWQNYSSKKYLDFYELHEEMNTLVL
HNNQYIGYIDHTYSFIWGYLLNNKIVNIYPYFFSKEGNKIHILLEVYINPKFLKAPFDQN
NNQQYSFNKCIKYIDQVALKILLNILRLQITSPSLIERDLQKYFQKFNILRNQVFPKVLI
SCKKTFNYYKTQLQNFPNHFVDFYSQVNKEIEMLKSQKHFKQIHFTEPIQANINYPSKMQ
NIYYCKKQNQKDFIKNINNVVIISAEKSSQEDSIDNENSYRFYQQAQQPSDVVSNLHPYQ
LQGLQWLLYRERRVDNLYIPTMRNQLQDQKTKIDIDYEEIELVGGQKIYRNIINNKFQYE
FPEQQDIFGGILADEMGLGKTLTIISLIHETKKERTSKYGTLIITPSNLVNQWENQFKNH
SKADSISILNLQQKNNRSKSFEDYDVVICSYNIICMLFESYDLSDKIFNQQWERIILDEA
QKIKNKQSKVSEACFEIQSKYKWCLTGTPLENSIDDIYSLIRFLNIPKYSDWNWWRQNVK
NTKNQEQKSNSFKIINQIIENLTLRRTKKSQYANGESITSIPEKQIQNIYIDLFDNEKNI
YDKIFQKTQQVYKFFKQNSNKKDKNYMHVFEVLTKLRRFCVHPSLTFKIEEEAIQVSENS
TNDIISKINSFLNEIQSKIQQQNKNNKESNQNNDEKNQEPQNNISQYQKEVIQQIKDGQF
QVCSVCLEDIKYHSISSCLHVFCSSCLEQSIQTNHKCPLCRKHLSMSDMLDFVDEGAVIH
QQLSHYLNDEIISGSKIQKTVEIIEEIHKKGEKVIVFSQWIDTLNLLEKHLQKKQISFMR
FEGKLTKSQKQKSLYHFENQTTNADLLQASTLKEDSSQQEQTMGQEEQYDNSNQNQENTS
QTPTVLLASLMSGYVGLNLTGANNLILCDSWWNPAVEDQAINRIHRLGQQKQTYIYKMIC
KDTIEEKIQQINDQKRDIFQTIFNSSEQNKNKKAKEFLQQILN
NT seq 3552 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatttgaaagccagttcagttaaccttataaaaaatgtaattattttatttatcttt
ggtatttacttaaaaatttcattaaaagttaaaagcaataatcaaagtgaaaataaccat
ttgcattctgaccaatactaggaagatgaaacttattaaattctcaccaacccattctaa
tattaaatataaatgagcagctaaaattattaaaattataacaataacccttcttatcag
cctctctaaatagaatatgctaattagaattatgattactaactagaatcattctaacag
gattgtaatatgacaaattatttttaaactgagtaagataacaggaattaacattctcaa
gatcaattcagaaatgattttaaaaattaaaattattttgaaccaaactaatgcgatgtt
gataattaagaatttaaattttaagtagatcgtctttaatcctctggtgaattttttaaa
tgcttagatttccttgccataaaaaattatgataaattctaagattaatatcaatattta
ggcgccttgtaaacgacattatctactgatttgaaaaaattcgattttattaaccctaat
taagtctactaaggaaagatataacctggaaagattttaaaaatttcttggtagaattac
tcatcaaaaaaatatcttgatttttatgaactccacgaagaaatgaacacacttgtttta
cataataactaatacattgggtatattgatcatacatattctttcatttggggttacttg
ctaaataataaaattgttaacatttatccttattttttctcgaaagaaggcaacaagatt
cacatacttttggaagtttacattaatccaaaatttttaaaggctccttttgactaaaat
aataactaataatacagttttaataaatgtattaaatatattgatcaagtcgctcttaaa
atcttattaaatattttgagactataaataacatctccctctttaattgaaagagattta
taaaaatatttttaaaaattcaatatattaagaaatcaagtatttccaaaagtattgatt
tcttgcaaaaaaacatttaactattataaaacctaattacaaaattttccaaatcatttt
gttgatttttattcacaagtcaataaagaaattgagatgctcaaatcttaaaagcatttt
aaataaatacatttcacagagccaatataagctaatattaactatcctagtaaaatgcaa
aatatatactattgtaagaaataaaaccaaaaagatttcataaaaaatatcaataatgta
gtaattatttcagcagaaaaaagtagttaagaagattccatagataatgaaaattcttat
aggttttattagtaagcttaataaccttcagatgtcgtttcgaatcttcatccctatcaa
ctttaaggtctttaatggcttctttacagagaaaggagagttgataatttatatattcct
actatgagaaattaattataagattagaaaaccaaaatcgatatagattatgaagagatt
gaattagttggtggttaaaagatttacagaaatattataaataacaaattctaatatgaa
tttcctgaataataagatatatttggaggtattttggcagatgaaatgggattaggaaaa
acccttacaattatttctttaattcacgaaacaaaaaaagaaagaacttctaaatacgga
accttaattattacaccatcaaatctagtgaattaatgggaaaattaatttaaaaatcat
tctaaagcagattcaatttctattctgaacttgcaataaaaaaataacagatctaaaagt
tttgaagattatgatgtagttatttgttcatataacattatttgtatgttatttgagagc
tatgatttaagtgataaaatattcaattaataatgggagagaattatcctagacgaagcc
caaaaaattaaaaataaacaatctaaagtttctgaagcatgtttcgaaatttaatcaaaa
tacaaatggtgcttaacaggtactcctctagaaaacagcatagatgatatttatagcttg
atccgttttttaaacatacctaaatacagtgactggaattggtggcgctaaaatgtaaaa
aatactaaaaattaagagtaaaagagcaactctttcaaaattattaaccaaataattgaa
aatttaactttgagaaggactaaaaaaagttagtatgctaacggtgaaagtataacttca
atacctgaaaagcaaatttaaaatatttatattgatctttttgacaatgagaaaaacatc
tacgataaaatcttctaaaaaacttagcaagtctataaattctttaaataaaattcaaac
aaaaaagataaaaattatatgcatgtctttgaagttctaactaagttgagaaggttctgt
gttcaccctagtcttacttttaaaatagaagaagaggccatttaagtaagcgaaaatagc
actaatgatattatttctaaaatcaactcattcttgaatgaaatttaatcaaaaatttaa
taataaaataaaaataataaagaatctaattaaaataatgatgaaaaaaactaagaacca
taaaataatatatcttaatattaaaaagaagtcattcagcaaataaaagatggataattt
taagtttgtagtgtttgccttgaagatataaaatatcactctataagttcttgtcttcac
gtattttgctcatcatgcttagaataaagtatccaaactaatcataagtgccctctttgc
cgtaaacatttaagtatgagcgatatgctggattttgttgatgaaggagcagtaattcat
taataattgagtcattatttaaatgatgaaattatcagtggatctaagatttaaaagact
gttgaaatcatagaagaaatccataaaaagggagaaaaagttatagtattttcataatgg
atagacactttgaatttattagagaagcatctctaaaaaaagcaaatttcttttatgaga
ttcgaaggtaaattaactaaatctcaaaagtaaaagtctctatatcattttgaaaatcaa
acaactaatgctgacttgttacaagcatctactttaaaagaagatagtagctaacaagaa
taaaccatgggataagaagaataatatgataattctaattaaaattaagagaatacatca
taaactcctactgtacttttagcttcgcttatgagtggatatgttggacttaacttgaca
ggagctaacaatttaatattatgtgatagctggtggaatcctgctgttgaagactaagca
ataaatagaattcataggttaggctaatagaagcaaacttatatctataaaatgatttgt
aaagatacaatagaagaaaagatttaacaaatcaatgattaaaaaagagatattttccaa
acaattttcaattcttctgaacaaaataaaaataaaaaagcaaaagaattcttataacag
atattgaattga

DBGET integrated database retrieval system