Tetrahymena thermophila: TTHERM_00427610
Help
Entry
TTHERM_00427610 CDS
T01020
Name
(RefSeq) helicase carboxy-terminal domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
SecA_DEAD
VWA_2
RsgA_GTPase
ABC_tran
AAA_29
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7830264
NCBI-ProteinID:
XP_001013840
TGD:
TTHERM_00427610
UniProt:
Q23A97
LinkDB
All DBs
AA seq
2551 aa
AA seq
DB search
MDLDFSGISSNSEDIQSQDSIQQEIQNIENIDFEQQERLANFCFDENILLLLKYVNQNVP
QEQCLILFNLLNEQMMLESEAIIKQIQPLLQSSLQEFKNGNGNKAEIRLYDLFKIINTLD
FQKISDQISQSDDSSKDIKDKDIVMVLGNSGAGKSTFIHYVAGSKIQKVIGQNGLYHWEI
SKPLYQSLDRVISNSNAKSETKFVIPIQIKVQDQEQSDSSSDDEDEDEGNEEVTICDTPG
FKDSEGKESEIANLTGITKCISVCQSIKPVVIISEKQISDRGQGIKEIANVIKKMLKPSK
DSHKIIKNFLFVFSKFEKDEDKKQFHKKLKNIKEHLNTEEKKDKEFVYVLKTMIKQTKIY
QDIAFFDFSMKGSQFIKRYITEMEAIQMPKDFFTCFFTSEAEISISEQLKQDQGRIENAL
KKRNYLLVFKKLGLLNLLKQNISDLSSINNQYEQNVTLIDEYINSEIQKVEDFISQIINI
KKIDEQQIKSFLINKEQLSKVSILQQLLPQAENLVIKLDSALQSAITAILENAKLEINSC
QQINVNEYYLKLKSLSDTIKEEKHIQQFITYVKGYIQKQVEKAKSYLQQDCFLDFFDEMQ
LIINYIESCSFLTVQNANIQIQQTFDSIISIMKSQRLIILEKIKLLGTNEENKNEIIIAQ
QKTKNILQDFKKSKLNVKEFKEKMNNFWKSLEEQVENEYNIIEQKVIAVINQESDDFSDL
KSKVFQLQLLSKIFHNLEQKFNNLKNLLNDRVTKTSQQVIQMTKQILSFNNNTDFEMELE
NLMETFQLIQKCQWIKELDQEFEQSSQKILNQLRKFANNILGKVDQIDITLEQTVQTEDL
SKIANYNQKMKILNSFQNEDKELQNIVKEYDDKVREKFKIYFDEIQIIMDSQDFTYWKLE
NCYHFLLKCNQNKIFKQETQKLLENLKKKILSSYLEKEKSLQDSLNQLKILLENISLTEQ
EKQQIQQCTKNIYQKFEEMQKIQYFDCLKSILEQSKSSFSLGQLQTSLKILWIKIKDTFD
ESEYIQQKWIFVLQQLNMFDELCYPSKSQFSFGNLLSDCYKKNKTNTQNLKGEIDKQLDN
GNLLKILETLKSASQNKENKDHQSIFDDLKLQLENKMRQIIQKAQQTIDQLRQNLTCSSI
KSQTKELIDNTNQIIILYNKFNDFELNFKDYLDIENFKCLKDQVKSSIQQIANQGLNKIK
QAFKIYNFKEFYDQINFMQNIFVILQQSFTMNEQICQLSQIQGNCQEELKLLVENLKLEC
TNREIFNLKSVCSKLEQVEDDNIQAFSKTLKGIYQKKLEDMLGKTKEKPLNQQEKIISEV
QQFFEYIPQEMENSLKQQIDAIKNTDKIKQEIDTCIRQKNIEGLKKLKASLADSSFYKQF
NIDLEDFITKENENLFKQINQYSQNKNYINFEKSLLNLIKFGLSIPQDFQFISIDKLNSV
LEQIFNDLFKMADCLYQQILKNSFSYEKDCLDFFSNYCELSNSLIKVYNDKLQECEQKFF
NGIESFYIFNSVQKLKSDVINEIKQKVNKIQLSKQDFSNCIDQFCIVYYLQSFDLEQYRE
LLIALNSKQEKLKQYIESIIKQDITAFKIENEYEKYYESFQNSLSNAQGILTLEEKCNLN
CFNKTLIEQLMKKLNQINSLIDQEMKQCFQCDFLEEDVVKRINNVYLNSKYIDEYLSQWN
QGKNHIDKKYVELQFIKQIKEQFQEPLRVENQDINLITEYLSNMNRISQTYIYMQQVKKE
CDKNINKVLLNYKNSNGSLEKLQILLSKTKYGDQIMQSNPFFKGFQISNTNLRIQRFGID
EVIEQIKGYSGKSKTNDLNKTQLNDYYQRFLIKYNSYQEKYLTKFDKIDFINLLRDIQTS
VGQINVKYFQETGQIQQKCLGIVSDLLAGIFCCWTCINSKYYFESIQQSYEKQQSFLLKP
HAAQVIAIFRLLSIGYSIDYSKIQKNSLAQVLTGEGKSVILAALACFYSLCGFQVMCACY
SNQLSNRDYEEFLPLFEKLKIKDYILYNTFNRVCEEILNERANIREQVSNYIQTGEIKNI
KTQKPKKQVLLIDEVDVFFSKDFFGNNYEIVAPIQDVTVENLLDKIWSDKSDLNFSFENI
SQSEEYKQCIEKFEQQAELIQEQTKIVIHDFKNFNNIIVENYKIQNDKINYKNQDQYLDN
ISYGYRTLYTYYLENQKSRISNFSLKQQKVFKINCGSFSYSELPKKFFIIKGVTGTLETL
SGKQLELIQQNYNMNQYTLIPSVYGKSKFSFNEQKDIKAVPLEEFYNTITDEINKNLVGK
NXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXKRNSKTLIALDVTGSMSNLITQTKN
TIQTTFEQARDILKQKGYDPQCFQIMICCFRSYNSKFEEILEASSWENNPDKLRSYLQKI
TASGGTYPGESVEVGLWWANKQSDENPIGQVIVLGDQPAHLQNEAQSHREKHGQLYWDST
PLKGLTYYVPECDKLQSKNVPVNTFYLNQSAKQTYEEIASLTKGISQFLDINSAQSSKEL
TNAFVEQILKDIGKEDGRSNELIQAYKEKYS
NT seq
7656 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatttggattttagtggaatttcaagtaattcggaagatatttaatcgcaagattca
atttagtaagaaatataaaatatcgaaaatattgactttgaatagtaagaaaggctcgca
aacttttgctttgatgaaaatatattattactattaaaatatgtgaatcaaaatgttcca
taagagtaatgcttgatcctttttaatctcttaaacgagtaaatgatgctagaaagtgaa
gctattattaaataaatataaccattattataatcaagcctttaagagtttaaaaatggc
aatggtaataaggcagaaataagattatatgacctgtttaaaataataaatactttagat
tttcaaaagatatctgattagataagttaatctgatgattctagcaaagatatcaaggat
aaagatattgtgatggttttagggaattcaggtgcaggaaagagtacattcattcattat
gttgctggatcaaaaatataaaaagttattggctaaaatgggctatatcactgggaaatt
tctaaacctctttactaatctttagaccgagttatttcaaattctaacgcaaaatcagaa
acaaagtttgtaatacctatacaaattaaggtttaggactaagagcaaagtgatagcagt
agtgatgatgaagatgaagatgaaggtaatgaggaagttacaatatgtgatactcctggt
tttaaagattctgaaggaaaagaatcagagatagctaatttaactggaattacaaaatgt
atttctgtttgctagagcataaaacctgtagttataattagtgaaaagtaaatttctgat
agaggataaggaattaaagagattgcaaatgtaattaaaaaaatgttgaaaccttctaaa
gattctcataaaattattaagaattttttatttgttttttctaagttcgaaaaagatgag
gataagaaataatttcacaaaaaacttaaaaatataaaagaacatttgaatacagaagaa
aaaaaagataaagagtttgtttatgttcttaaaactatgataaaataaacaaaaatttat
taagacatagctttcttcgattttagcatgaaaggatcttaatttataaagaggtacatt
acagaaatggaagcaatttaaatgccaaaagatttttttacttgtttttttacatctgaa
gcagaaatatccatatcagaatagttaaaataagattaaggtagaatagaaaacgctttg
aaaaaaagaaattatttgctagtttttaaaaaactaggtttgttgaatttgttaaaataa
aatatttcagatttatcttctataaataattaatatgagcaaaatgttactttaattgat
gagtacataaatagtgaaatttaaaaagttgaagattttatttcatagataataaatatc
aagaagatagatgaataataaattaaaagttttttaattaataaagaataattatctaaa
gtaagtattttataataattattacctcaagccgagaatttagtgataaaattagattct
gctttgtaaagtgccattacagcgatactcgaaaatgcgaaactagaaattaattcatgt
taataaattaatgtaaatgaatattacttgaagttaaaatctttatctgatactattaaa
gaagagaaacatatttaataattcataacttatgtaaagggatacatataaaaataagtg
gaaaaggctaaaagttacttgcagtaagactgttttcttgatttttttgatgagatgcaa
ctaatcatcaactatattgagagctgctcctttttaactgtacaaaatgcaaacattcaa
atttaatagacttttgattcaatcataagtatcatgaaaagttaaaggctgataatctta
gaaaaaataaaactacttggaacaaatgaagaaaataagaatgaaataattatagctcaa
taaaaaacaaaaaatattctttaggattttaagaaatctaaattaaatgttaaagaattt
aaagaaaaaatgaataatttttggaaatcattagaagaataagtagagaacgaatacaat
attattgagtaaaaagtcattgccgttatcaattaagaatcggatgatttttcagatctg
aaatcaaaagtattttaactataacttttatctaagatatttcataatttagagtaaaaa
tttaataatttgaaaaacctcttaaatgatagagtaacaaaaacatcttagcaagtaatt
taaatgacaaaataaatattatctttcaacaataacaccgatttcgaaatggaattagaa
aatttaatggagacattttaattaatttaaaaatgttaatggattaaagagcttgattaa
gaatttgagtaatcttcttaaaagatattgaattaattaagaaaatttgcaaataatatt
ttaggaaaagttgattaaatagatatcacattagaataaactgtataaactgaagattta
agcaaaatagcaaactacaactaaaagatgaagatattaaatagtttttaaaatgaagat
aaggaactataaaatattgtaaaggaatatgatgataaggttagagaaaaatttaagatt
tattttgatgagatttagataattatggattcataagattttacttattggaaactcgaa
aactgttatcatttcttattaaagtgcaattaaaataaaatatttaagtaagaaactcaa
aaactcttagaaaatttaaaaaaaaaaattttaagcagctatttggaaaaagaaaaatct
ctttaagactctcttaattaactaaaaattctattagaaaatatttctttgacagagtaa
gaaaaacaataaattcaataatgcacaaaaaacatttattaaaagtttgaagaaatgtaa
aagattcaatattttgattgcttaaagagtatcttggaataaagtaaaagttccttttcg
cttggatagctatagacttcccttaagatactttggataaaaataaaggatacctttgat
gaaagtgaatacattcagcaaaagtggatcttcgttttacaatagctaaacatgtttgat
gaattatgttatccctctaaaagctaatttagtttcggtaacttactctctgattgctac
aaaaagaataaaacgaatacataaaatttaaagggtgaaatagataaataattagataat
ggtaatcttcttaaaatccttgaaactttaaaatctgctagccaaaacaaagaaaataaa
gatcattagtcaatttttgatgatttaaagttatagttagaaaataaaatgagataaata
atttaaaaagcttaacaaactattgatcaacttagataaaatttaacatgctcatcgata
aagagctaaaccaaagagttgatagataataccaactaaattattattctatataataaa
ttcaatgattttgaattaaattttaaggattacttagacatagaaaactttaaatgttta
aaagattaagtcaaaagtagcatttaataaattgcaaattagggactaaacaaaataaaa
taagcttttaaaatctataacttcaaagaattttatgattaaattaattttatgcaaaat
atttttgtaatcctttaataatcattcacaatgaacgaataaatctgttagttaagttaa
atataaggaaattgttaagaagaattgaaattactagttgagaatttaaagttggaatgt
acaaatcgagagatatttaatttaaaatctgtatgtagcaagttagaataggtagaagat
gataatatttaagccttttctaagactcttaaaggcatttattaaaaaaaactggaagat
atgctgggaaaaactaaagagaagcctcttaattagcaagaaaaaattattagtgaggtt
cagtagttttttgaatatatcccctaagagatggaaaatagtctcaagtaataaatagat
gccataaaaaatactgataaaataaagtaagaaatagatacttgcattagacaaaaaaat
attgaaggattaaagaaacttaaagcaagtttggcagattcaagtttttataaataattt
aacatcgatcttgaagattttataacaaaagaaaacgagaatttattcaaacaaattaat
taatatagtcagaataaaaattacattaactttgagaaaagccttttaaatttgataaag
tttggcttaagtattccctaagatttctaattcatttctatagataagttaaatagcgtt
ttagaatagatatttaatgatttatttaaaatggctgattgtttatattaataaatattg
aaaaatagttttagctatgaaaaagattgtttagactttttttctaattattgtgaatta
agtaattctttaataaaagtttataatgacaaattgcaagaatgtgagtaaaaatttttt
aatggaattgaaagtttctatatctttaattctgtttagaaattgaaatcagatgtcata
aatgaaattaaataaaaagtcaacaaaatttaattatctaagcaagatttttcaaattgc
atagatcaattttgtattgtatattacctttaaagctttgatctagaatagtatcgtgaa
ttgttgatagctttgaattctaagcaagaaaaactgaagtaatatattgaatcaataatc
aaataggatattactgcatttaaaattgagaatgaatatgaaaagtactatgagtctttc
taaaatagtttaagtaatgcttaaggaatattaactttagaagaaaagtgtaatttaaat
tgttttaacaaaacactaattgaatagctaatgaagaagttaaattaaattaattcatta
atagattaagagatgaaataatgcttttaatgtgattttttggaagaagatgttgttaaa
agaattaacaatgtatatttgaactcaaaatatattgatgaatatttgtcttaatggaat
taaggtaaaaatcacattgacaagaaatatgtagaattacagtttataaaataaattaaa
gaatagttttaagagcccttaagagttgaaaatcaagacattaacttaattacagagtat
ttatctaatatgaataggatatcttaaacttacatctatatgcaataagttaaaaaggaa
tgtgataaaaatataaataaagtcttattaaattataaaaattctaatggttctttagaa
aagctataaatcttattaagtaaaactaagtatggtgatcaaataatgtaatccaaccct
tttttcaaaggattttagattagcaatacaaatttaaggatataaagatttggtattgat
gaggtcattgaataaataaaaggctactctggtaaaagtaaaacaaatgatttaaataaa
acttagttaaatgactattactaaagatttttgataaagtacaatagctattaagagaaa
tacttaaccaaatttgataaaatagactttattaatttactgagagatatttaaacctca
gttggttaaataaatgtgaaatacttttaggaaactggataaatacaataaaaatgtttg
ggtattgtttctgatcttttagctgggatattctgctgttggacttgtattaattcaaag
tattattttgaatccatttaataatcctatgaaaaataataaagctttttactaaaacct
catgcagcataagtaattgcaatttttagacttttatcaataggttattccatagattat
tcaaaaatctagaaaaacagcttagcctaagttttgacaggagaaggtaagtcagttatt
ttagctgctctagcttgcttttatagtctttgtggattttaagtgatgtgtgcttgctat
agtaattaacttagtaatagagattatgaagagttcttacctttattcgaaaaattaaaa
ataaaggattatattttatataatacattcaacagagtatgtgaagaaatactaaatgaa
agagcaaatatcagagaataagtttctaactacatttaaacaggtgaaataaaaaacatc
aaaacttagaaaccaaagaaataagttcttttaatagatgaagttgatgttttctttagt
aaagatttttttggaaacaactatgaaattgtagcaccaatctaagatgtaacagttgaa
aacctgctagataaaatttggagcgataaatctgatttgaattttagctttgaaaatatt
tctcaatctgaggagtataaatagtgcatagaaaaattcgaataataggctgaattaata
taagaataaacaaaaatagttattcatgattttaaaaatttcaacaacataattgttgaa
aattataaaattcaaaatgacaaaataaactataaaaactaagattagtatttagataat
atatcatatggatatagaactttatacacctactatcttgaaaattagaaatcaagaatt
tcaaattttagcctaaagcaataaaaagtatttaaaattaactgcggtagctttagctat
tcagagttacctaaaaagtttttcataatcaaaggtgtaactggaacattagaaacttta
agtggaaaacaattagaattaattcaataaaattataatatgaattaatatactttgatc
ccttcagtgtatggaaaaagtaagttttcatttaatgaacaaaaagatattaaagcagtt
cctttagaagagttttataatactattacagatgagataaataaaaacttagttggaaaa
aatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagaaattcaaaa
actcttattgcattagatgtaacaggctcaatgagtaatctcataacttaaactaaaaat
actatctaaacaacctttgaataagcaagggatatcttaaaataaaaaggttatgatcct
taatgtttttaaataatgatatgctgctttagaagttataatagtaaatttgaggagata
ttagaagcttcaagttgggaaaataaccctgataaattaagatcttacttataaaaaatt
acagcttctggtggtacgtatcctggagagtctgtagaagtaggtttgtggtgggctaac
aaataaagtgatgaaaatccaataggttaagttattgttttaggtgattagcctgcacat
ctgtagaatgaagcttagtcacatagagaaaaacatggataactttattgggattctact
cctttaaaaggtttaacttattatgttccagaatgtgataaactttaaagtaaaaatgtt
ccagtcaatacattttatctaaattaatctgcaaaataaacttatgaagagattgcaagt
ctaacaaaaggtataagtcagtttcttgatataaattcagcttaaagttccaaagagtta
acaaatgcttttgttgaataaattttaaaagatattggaaaagaagatggtcgcagtaat
gaattaatttaagcttacaaagaaaaatactcttga
DBGET
integrated database retrieval system
