Tetrahymena thermophila: TTHERM_00437260
Help
Entry
TTHERM_00437260 CDS
T01020
Name
(RefSeq) BRCA2, oligonucleotide/oligosaccharide-binding domain 1 protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
BRCA-2_OB1
BRCA-2_helical
BRCA2DBD_OB2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7822950
NCBI-ProteinID:
XP_001017722
TGD:
TTHERM_00437260
UniProt:
I7MK26
LinkDB
All DBs
AA seq
2228 aa
AA seq
DB search
MFLASTPPKQTQKATVNDYFDSESDCSNHKNNDNALIEKNLIQSYSVESQSNLIGNRYNN
INQIEIEKLRGQNSVSQQVIAEKLQQKDFFKFQYFSSEKKQLSPDDQDQSDEEDLQQSKK
NSHIFTNKSVLAEKKQEFNNQTDIIRNDFNIDRNISIQGEKELKQQNNNQQSAQNNHLAY
QLNSSLIPFAAESEKIRQNQANSQENNQSIKINNIFNQQKQQSIDNNQINSINHLQININ
NIPLKQQSEEKGIVNITQEGQMIKTQSLLNLVENQKMLIEVKPHLKDFDHQNFDDNILAE
EIEIEIDNSNYDRQSISDDEFSQHNQKSNTNVQFQESKSIFKDEEQNGMQISLSEKCRII
DQSSNQSRIGFLNLNNSENSNQQLTYFNNLQESSSESENSRNSFIKRAQQIFNQNNNTKQ
QPSQVNKSTIDTNNNNYDNGLPDPFQNEKFFQKKKNDLQFQDQAQFSFAKVKKNEGKIAQ
TNGAILIDQNKRKNLFQNEQINFSVPQKQNQNFQKFTIQFEEFDESSQENSSIQQNQTEK
GQKIIEDPSFKNFSIKQELQSNKGTFEKPQLPKKNNQISEHQLKIEQERKKNQPNILQDN
FVNGFKISQKVQKNDKFSKFVGLFEDINDEDEYDEQFNNQQSIPDIQIVKQNSFDEGSIA
LNKTKQQCVVQNDQIGFNFTKPTFSNGFTNSFQSSRVGLDVVNTENQQVNKQQETKNKTN
VLHDTFVSGFNISSKIQKDEKFSKFVGLFEDMNDEEDEQDEFLNNKSELEGQVAQINSQN
NFNQQIQQNEDIGFTFKKQNSNSNVNFKNTFQSAKVNFEKPSIKNKEDSENLYVKQQQET
KNKSNILQDQFVNGFKISSKVQKDEKFSKFVGLFEDMNDEEAEQDSFQEEFNNKKSELEG
QAVVQKSSEDSKVEFQSFKSAKVTTNVEFGFTKPKSVQNDQKMLNGFNKANQNIIPTLKE
KSNLKNLLEELNQEDGDAQDQYSTNNYDEFFNKQKNENQEEFIGFKTAKNNRKLEVDEKV
IEQLTKIFDKNDKNVQQPPQQNQIKEDNKKKEQKSQDYNDFFNTAGDNNNGFFGFKTAKS
NKKLEVDEKILKQLTKIYEEDDKKHEKKISPKQNKIDTEEQTNYDDFFSNKTSSDAGGFF
GFKTANNKKNLEVNEKLLEQISKHFDSDDTKEQKNANSKIEKQYSDNDEFDDSKKYEDFF
SNKSDASFGGFKIAKGNKEIKVDPSKLMQFEQSFSLKDNDSNFSKSSVQGSRVPKRKMNI
DDDEEHQQQQLQKEFGNKMLKVDQQNKIKPISGSGMKDSYSFSNGFKNTPQTKSDNKDRF
NSNSRFQNSESSFNSGFQKSSKSDVIQEDDGDDDDAFSRFIRQIKKPEPKRSHPKPFRQV
KVVDSSKTTPIAKETPNIKSTKIERKANYKRGLLNSEESANSFLFAKDSVEKSGQKSGKS
STLSKKFKPQSIERINESISKDQAKKSKDTLKQGNRYSFIDEEDEDGNTSYKRQLFNSSS
KKSNLSSSMKQIQIALNHQYLNNPLIQMKYNYDSQIANSNFIRYDELKPKKNQMEIENDN
QTGIIQNMAKDINQCLYYSTMCNCLRNNLDNLLNFQENSFTQRIECFCSLPIPSTEPVEE
ENAPKKTKEADDVLEYNKNKLQKGFLNYLNFFAKLQQKEKTLEEKWVRNHFRQVVWKLSC
YENNLDYCPVNKKLTVENIYYELEYRLYSEVYACKRSILKQIQEQDAVKSLNMVLIVANI
TKVNQYGCYVLELSDGWYSFFVVVLDHKHVISNDLYQQNNKILQLDLIKRNKIYIGMKMY
VNNLAKPSVGNLENMINPKQNILYQNVYEIFYNNIIKAPANSKLGICSNALQKYFPRSLK
SIKPCGGDTIQSVDVFIVKKYPLCYEAGNVKVSFCNPKQMEDEGMDGGKQLGFTVLVVDS
LSYYDETFKIDEQPWVYINIHSVTHDLYDSLKEGTRIRLYNLKINNRGQQKMKFNYKYQK
IVKEILYLETNKKTKIEEMSTFIKAKEDQQSMKKFGLELTENFKFLLEDVQESIFNLQYD
KALQESFLQQYKVEMDVIMYIVKIEDGSYFGINQNYSAICISPTNEIRQSTNSVFKKQKP
DDEYSLEDAHLYDKLSKNREIKTANQISEKSNQIKPKLQNPEEGKIGVFLNVQLNTIKQS
TLSTSNLEKYHFNFTFNTYKKTYSVDNLNAQTLPYSDKYKKQINELNEFLGISSDKFLEV
SNYLRNYI
NT seq
6687 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttttagcgagtactcctccaaaataaacataaaaagctactgtcaatgattatttt
gattcagagtcagattgttcaaatcacaaaaacaatgataatgctttaatcgaaaagaat
ttgatataatcttattcagttgaaagttaatctaatttaataggcaatagatataataat
attaatcaaatagagatagaaaagctaagaggataaaactctgtttcttaataggttatt
gctgaaaagcttcagtagaaagatttttttaaattttaatattttagttctgaaaaaaag
cagctctctcctgatgattaagattaaagtgacgaggaagatttatagtaatccaaaaaa
aactctcacatttttactaataagtctgttttggcggaaaaaaaataagaatttaataat
taaacagatataattaggaatgattttaacatagacagaaacatctcaatttagggcgag
aaagaattaaaataataaaacaataattaataatctgcttaaaacaaccatttggcttat
taattaaatagttctttaataccttttgcagctgaatctgaaaaaattagataaaatcaa
gcaaattcacaagaaaataattaaagtattaaaattaataacatttttaattagcagaaa
tagtaatcaattgataataattaaataaactcaatcaatcacttacaaattaatatcaac
aatattcctttaaaataataatcagaagaaaaggggatagttaatatcactcaagaaggc
caaatgataaaaacttaatctctacttaacttagtagagaactaaaaaatgttaattgaa
gttaaacctcatcttaaagattttgaccattaaaattttgatgataatattctagctgaa
gaaatagaaatagaaatcgataattctaattacgaccgctaatctatttcagatgacgaa
tttagttaacataatcaaaaaagtaatacaaatgttcaattttaagaatctaaaagcata
ttcaaagatgaggaataaaatggtatgtaaataagtttatctgaaaaatgcaggattatc
gattaaagtagtaattaatctagaataggttttttgaatttgaataattctgaaaattca
aattaacaactcacatatttcaacaatttataagaatcaagtagtgaatctgaaaattca
aggaattctttcattaagagagcatagcaaatatttaattaaaacaataatactaagtaa
tagccaagctaggtaaataaaagcacaattgatacaaataataataattatgataatggt
ctaccagatccattttaaaatgagaaatttttttaaaagaaaaaaaatgatttataattt
taagattaagcttagttttcctttgctaaggtaaaaaaaaatgagggaaagattgcataa
actaatggtgctattttgattgatcaaaataaaaggaaaaatctattctaaaacgaacaa
attaatttctctgttccttaaaaataaaattaaaatttttagaaatttactatttaattt
gaagaatttgatgaaagttcataagaaaactcatcaatttaatagaaccaaaccgaaaaa
ggctaaaaaattattgaagacccctcttttaaaaattttagtatcaaataagaattgtaa
agtaataaaggaacttttgagaaacctcaattacctaaaaaaaacaattaaatctcagaa
cattaacttaaaattgagtaagaaagaaaaaaaaattaacctaatattttacaagataat
tttgttaatggatttaaaatatcttagaaagtctaaaaaaatgataaattttccaaattt
gttggtttgtttgaagatattaatgacgaagatgaatatgatgaataatttaataattaa
taatctatacctgatatataaattgttaaatagaattcctttgatgaaggtagcattgct
ttgaataaaactaaacaataatgtgtagtttaaaatgattaaattggatttaattttaca
aaaccaacatttagtaatggtttcactaattcattttagagttctagggttggacttgat
gtagttaatactgagaactaataagttaataaataacaagaaacaaaaaataaaactaat
gttttacatgatacattcgtaagtggatttaatatatcttctaaaatataaaaagatgaa
aagttttcaaaatttgttggattatttgaagacatgaatgatgaagaagatgagtaagat
gaatttttaaataataaatcagaattagaaggataagttgcttaaataaacagctaaaat
aatttcaattaataaatacaataaaatgaagatattggattcacctttaaaaagcaaaat
tctaattctaatgttaactttaaaaacacattttaaagtgcaaaagtaaattttgagaag
ccttcaataaaaaataaagaagattctgaaaatttgtatgtaaaataataataagaaact
aaaaataaatctaatattttataagattaatttgttaatggatttaaaatatcttcgaag
gtataaaaagatgaaaaattttctaaatttgtaggtttatttgaggatatgaatgatgaa
gaagctgaataagattcgttttaagaagaattcaacaataaaaaatctgagttagaagga
taggcagttgtttaaaaatcatctgaagacagcaaagttgaattccaatcattcaaatca
gcaaaagtgacaacaaatgtagaatttggatttactaagcctaaatctgtttaaaatgac
taaaaaatgttaaacggatttaacaaagcaaattaaaatattattcctacattaaaagaa
aaatcaaatttaaaaaatttactagaagagctgaattaagaagatggagatgcataagat
taatactctacaaataactatgatgaattttttaataaataaaagaatgaaaattaagaa
gaatttattggattcaaaacagctaaaaataatagaaagttagaagtagatgaaaaagtc
attgagtaattaacaaagatatttgataagaatgacaaaaatgttcaataaccaccttag
taaaatcaaattaaagaagataacaagaaaaaagaatagaaatcataagattacaatgac
ttttttaacaccgctggggataacaacaatggattctttggatttaaaactgctaaaagc
aataaaaaacttgaggtagatgaaaaaatacttaaataactaactaaaatatatgaagaa
gatgataaaaagcatgaaaaaaaaatatcaccaaaataaaataaaattgatactgaagaa
taaactaattatgatgattttttctcaaataaaacaagtagtgatgctggtggattcttt
ggatttaaaactgctaataataagaagaatttagaggtaaatgagaaattattggaacag
atctcaaagcattttgattcagatgatacaaaagaatagaaaaatgccaattctaaaata
gaaaaataatattcagataacgatgaatttgacgattcaaaaaaatatgaagactttttt
tcaaataaatcggatgcatcctttggtggatttaaaatagctaaaggaaataaagaaatt
aaagttgatccatctaaactaatgcaatttgaataatctttttcattaaaagacaacgat
tctaattttagcaaatcatcagtctaaggtagcagagttcctaaaagaaagatgaatata
gatgatgacgaagaacatcaataataatagctataaaaagaatttggaaataaaatgctt
aaagtagactaataaaataaaataaaacctatctcagggtcaggtatgaaggattcttat
tctttttcaaatggatttaaaaataccccttaaaccaaatcagacaataaagatagattt
aattctaatagtagattctaaaacagcgagtcttcctttaattcaggctttcaaaaatca
tcaaagtcagatgtaatttaagaggatgatggggatgacgatgatgcattttctcgcttt
ataagataaattaaaaagcctgaaccaaaaagaagtcatccaaagccattcaggtaagta
aaagtcgtagattcttcaaagacaacacctattgctaaagaaacgcctaatattaaatct
actaagatagagagaaaggcaaattataaaagaggattgcttaattctgaggagtcagct
aactcatttctttttgctaaagactctgtagaaaaatcaggacagaaaagtggtaaatcc
tctaccttaagcaaaaagtttaagccacaaagtatagaaagaattaatgagagcatcagt
aaagattaggctaaaaaaagtaaagacacattgaagcaaggcaacaggtactcatttata
gatgaagaagatgaggatggtaacacctcatataaaagatagctctttaatagctcatct
aaaaaatctaacttaagtagttccatgaagcaaatacaaattgctttaaatcactaatac
ctcaacaatcctttaatttaaatgaagtacaactatgattcatagatagcgaattctaac
tttattagatatgatgaacttaaaccaaaaaaaaattagatggaaattgaaaatgataat
tagacaggaatcattcagaatatggctaaagatataaattaatgcttgtattattcgact
atgtgcaattgtcttagaaacaacttagacaatctgttaaatttttaagaaaattcattt
acttagcgtattgagtgcttttgctctctgcctattccttcaacagagcctgttgaagaa
gaaaatgctccaaaaaagacaaaagaagctgatgatgtacttgaatacaataaaaataaa
ctttaaaaaggattcttaaactacttaaacttttttgccaaattgcagcaaaaagaaaaa
actttggaagaaaaatgggtcagaaatcactttagataagttgtttggaaattatcttgc
tatgaaaataatttggattactgtccagttaataaaaagctaacagttgaaaatatttat
tatgagttagagtacagattatattcagaagtgtatgcatgcaaaagatctatcttaaaa
taaatttaagaacaagatgcagtaaaatctcttaatatggtattaatagtagctaacatt
acaaaagtaaatcagtacggatgctatgttcttgaactatcagatggttggtatagtttt
ttcgtagtggtcttagatcataagcatgttatttccaatgatctttatcaacaaaataat
aaaattctttagcttgacttaattaaaagaaataagatatatattggtatgaagatgtat
gtcaataacctagcaaaacctagtgtcggcaacttagaaaatatgatcaatccgaaataa
aatatactctattaaaatgtatatgaaatattttataataacataatcaaggctccagca
aactctaaattaggaatctgcagcaatgctttgtaaaaatatttccctcgttctttgaaa
tccattaaaccttgtggaggtgacacaatataatcagtagatgtttttattgtcaaaaaa
tatcctctttgctatgaggcaggaaatgtcaaggtctccttctgcaatcctaaataaatg
gaagatgagggtatggatggtggaaagtaattaggttttacagttttggtagtagattcg
ttaagctattatgacgaaacatttaagatagatgagcaaccttgggtttatatcaatatt
cattcagtcactcatgatctttatgactctttgaaagaaggcactcgaatcaggctttat
aatctcaaaataaataacagaggatagcaaaaaatgaagtttaattataagtatcagaaa
attgttaaggaaatattgtatttggaaacaaacaaaaagactaaaattgaagaaatgagc
acttttataaaagcaaaagaagattagtaaagtatgaaaaaattcgggttggagctaact
gaaaactttaaatttttgttagaagatgtacaagagagtattttcaatttataatatgat
aaagctttataagagagctttctataataatacaaagtagaaatggatgttataatgtat
atagttaaaatagaagatggatcttactttggaattaatcaaaattattctgcaatatgc
atttctcctacaaatgaaattagatagagcactaacagtgtttttaaaaaataaaaacca
gatgatgagtattctttagaagatgctcatctctatgataaactgagtaaaaatagagaa
atcaaaacagcaaattagatttctgaaaaatcaaattagataaaacctaaattacaaaat
cctgaagaaggtaagataggtgttttccttaatgtttagctgaatactattaaataatca
actttaagcacatctaatttagaaaaatatcatttcaatttcactttcaacacttacaaa
aaaacatattcagtggataatttaaatgctcagactcttccctactctgataaatataaa
aaataaattaatgaattaaacgagtttttgggaatcagctcagataaatttttagaagta
tccaattatcttagaaattatatttga
DBGET
integrated database retrieval system