Tetrahymena thermophila: TTHERM_00438910
Help
Entry
TTHERM_00438910 CDS
T01020
Name
(RefSeq) RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3
KO
K15216
RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tet00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
tet03021
]
TTHERM_00438910
Transcription machinery [BR:
tet03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
Other transcription-related factors
Transcription initiation factors
TTHERM_00438910
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRN3
DUF3223
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7832477
NCBI-ProteinID:
XP_001017788
TGD:
TTHERM_00438910
UniProt:
I7M8B2
LinkDB
All DBs
AA seq
963 aa
AA seq
DB search
MSKSNTHPAPQMRKPVNIQQNVGSQVKKAPQGEQISQKNDSANHAQMQEDEEKIYRVLSS
CYDDYLKGNKVLMNKIVNEMSNRHKEKEHIKMWLRASTKKLIDLFKNKQDVNFLIEVILY
QMPWFEAGNEYEIQLQEQEQKKILQQQQTHANQQQQHGIGSSTSLFSNASSSKRNIQQQH
GQQLTIKKPSPHFDLFSELSKFIMTLLSFSNAFAPQIIKFLISNIVPMEVKEMEKNKKSE
IELEVEGKVFENQKKLLMYIRDIMNKYILNSINDVKELNKEDTNFLLGVLKYHPNSKEKM
QRYVKLIIGQAQFDDKISKCLYIQNKEGQKIDISYVKSVFNLVDEQFQKIGLKQGSPNQK
KMMLQVVDLLAKIIKIYPLYQNDLCRILQESYPHRVQGEQFHKIYLTNILQLAIKCPQLM
PKILIIAVQKLIEIDSEIKLDHDAQENEKNSQIMAEKLDWLMLIIFEFIDYQLKDKVSSD
SCFGQKEELKQNSQDKKDKSQMEDKFFKIFLNVFSEQILITHQSKYVQFIIFYLCSLRNS
FQNAFLNHLVKNITEKNPLIYKSTQINSIYYLGSYIARAKYIENETIRKIFEYLITHLNR
YIQKFDERQKEENYNEGLHKIHLNLYHLLQAMLYILCYRFKAVLESKENLLQKFYEIMDK
ACSNFNALFFISPHIQNVFSDVCVSYGEDQLVELFEKTSQTSQATESISAALQQRAQLLD
NYFPFDPYCLQYSDKFICEIYQNWQDTNSLSSQSFVEQQLEKQQPQTNNNKKSKKMSKGN
NANNASSNLNINNPPIIQNSPHFNNSLNNSFICSQSHNNPNNITGTLLNTSRSNYGFTID
KLNNINDLEYDRDNMIYDDEDVKANNNNHILDFINESDPEFQIQQAKYHKDKKSLNGKRK
NPSTTDNSVNNTPITNNDEDSNNQPIVDSKKISKKSKKSSDIEDDFNNASFGNKKLCIQE
MQF
NT seq
2892 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcaaatcaaatactcatccagcacctcaaatgaggaaaccagtaaatatttaataa
aatgtggggtcccaagttaagaaggccccttagggtgaacaaatcagttaaaaaaatgat
tcagctaatcatgcttaaatgcaagaagatgaagaaaaaatttatagagttcttagtagc
tgttacgacgattatctaaagggtaataaggttttaatgaataagatcgtgaatgaaatg
tcgaataggcacaaggaaaaggaacatataaaaatgtggttaagggcatccactaaaaag
ctgattgatctatttaagaataagcaagatgtcaactttttgatagaggtaatattgtac
taaatgccttggtttgaagcaggtaacgaatatgagatttagttgcaagagcaagagtag
aaaaagatactgtagcaatagcaaactcatgcaaactagcaatagcagcatggaatcgga
agtagtacctcgcttttcagcaatgcatcaagttcaaagagaaacatttagtagtagcat
ggacaataattaacaataaaaaaaccatctcctcacttcgatttgttttcagagctttct
aaatttataatgactctgctgtctttcagtaatgcctttgcaccatagattattaagttc
ctcatttccaatattgtgcctatggaagtgaaggaaatggaaaaaaataagaaatccgaa
atagaattagaagttgaaggaaaggtttttgaaaaccaaaaaaagctattaatgtatatc
agagacataatgaataagtatattcttaacagtataaatgacgtcaaagaattaaacaaa
gaagatactaattttttattaggagtcctcaaataccatcctaattcaaaagaaaaaatg
taaagatacgtcaagctaattattggttaagcataattcgatgacaaaatctcgaaatgc
ttatacattcaaaacaaagaaggttagaagatagatatttcttatgtaaaaagtgtgttt
aatttagttgatgaataattctaaaaaattggattaaagcaaggctccccaaattaaaaa
aagatgatgttacaagttgttgatttgctagcaaaaataattaaaatatatcctctttac
taaaatgacctatgtcgcattttacaagaatcttatcctcatagagtgcaaggagaataa
ttccataaaatatatcttactaacattttataactcgctattaaatgcccatagcttatg
cctaaaatactgataattgctgtttaaaaattgattgaaatagactcagaaatcaagctt
gatcatgacgcctaagaaaatgagaagaatagttaaattatggctgaaaaacttgattgg
ctgatgctaataatttttgaattcatagattattaattaaaagataaagttagtagcgat
tcttgttttggacaaaaagaagaattaaaataaaatagctaagataaaaaagataaatct
taaatggaagacaaattttttaaaatatttttaaatgtatttagtgaataaatattaatc
acccattaaagcaaatatgtttagtttataatattttatctttgctcacttcgtaactca
ttttaaaacgcttttttaaatcaccttgtaaaaaatataactgagaaaaatcctttgatt
tacaaatcaacctaaatcaattctatttattatcttggcagctacattgctcgtgcaaaa
tacatcgaaaatgaaactattagaaaaatatttgaataccttattactcatttaaataga
tatattcaaaaatttgatgagagacaaaaagaagaaaactataatgaaggtctccataaa
attcacttaaatttataccatcttttacaagcaatgctttatatcttatgctatcgtttc
aaagcagtcttagaaagcaaagaaaatcttttgtagaaattctacgagattatggacaag
gcctgttctaattttaatgcattattttttatttctcctcatatttaaaatgtttttagt
gatgtttgcgttagctacggcgaagattaattagtagaactttttgaaaaaactagctaa
acaagttaagcaacagaatcaatatcagctgctctgcaacaaagagcttagctcttagat
aactactttccatttgatccctattgcttacaatatagtgataagtttatttgcgaaata
tattaaaattggtaagacacaaattctttatcatctcaatcttttgttgaataataatta
gaaaagcaacaaccttaaaccaataataataaaaaatccaaaaaaatgtcaaaaggtaat
aatgctaataatgctagctctaacttaaatatcaacaatcctccaataatttaaaatagt
cctcactttaataatagcctaaataatagttttatatgcagccaatctcataataatcct
aacaatataacaggaactttattaaatacaagtagaagcaactatggtttcactattgat
aagctgaacaatattaatgacttagaatacgacagggataacatgatttatgatgacgaa
gatgtaaaagctaataataataatcatattttagatttcataaatgaaagtgatcctgaa
ttctaaatataataagccaaatatcataaagacaaaaaatctttaaatggaaaacgtaaa
aacccaagtacgactgataattctgtgaataacactccaattacaaataatgatgaagac
agcaacaattaacctattgttgactcaaaaaaaattagtaaaaaatctaaaaaatcttct
gatattgaagatgattttaacaatgcctcttttggtaataaaaagttgtgcatataagaa
atgtaattctga
DBGET
integrated database retrieval system
