Tetrahymena thermophila: TTHERM_00439120
Help
Entry
TTHERM_00439120 CDS
T01020
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7838257
NCBI-ProteinID:
XP_001017809
TGD:
TTHERM_00439120
UniProt:
I7LVA7
LinkDB
All DBs
AA seq
1311 aa
AA seq
DB search
MICYVRVVKILKTQSINIAVFQLKIGKSNKLVKVISQPCQSSLFIIVIILFGLWLWQLSS
QNKLLIKLENVSDNQKLVKVIIKKSIKQSREEQKKQQVIIKNIRNNYKNKNQEILIELIN
QFKQLENFTYLLSEGMDKPKDTLGLLQDEHQKENINSNYKFGNRSGFMSQQDNPRSILSQ
SSVNAPNILQPNQQSQNQYKSNTQARENIYRQSIDLKNSQVLPQLKDRAISQKERKSASQ
EKESQLKQHQVRNIMINKDLNQFQNEQRRQSSIQQMQAKHMESGQQFNNNNLQTPRSREE
NSATTKDSLVNYLSSQKKLQKIQTSPSDKAVNQLNSQFQSLNDFKDNIEEGRNQTQIFNQ
SNKKLSQPNSFNIKKDLINEDKFVNIDVSLNTLTQQQKTKNIYSRAQTAQENQFTDKGIK
RDSQTIDVESLETAPNINVGLIQDQKLILNHLKKQNQNSNQTEKPLQHNQNQNKDYDGAN
ITFYPKQSSKKNVNKISTNDQNEIQQEAQYQMQQQLIKKKSSSDNNNESQNDAKIRLNDC
VGQYNISQSNQKNTITSQKVEDISRRASCQNQQINLKNPQSQYQQKNQMIYTNQVEVYQQ
QTEPNAIQTQPDFSFSNQYNNSKQYILSEGQQFEQIEQIPKNQMKFHNLYQKNISHSKNN
SLSQGLPNTGVNNLGTGIHFLEQSSNNQQSQKNYNRQNQLKNSQLSQQRASNYVGQIKRQ
LNQQCQQQIDVPYPIPQGHHRSNSHHLDTRIAKPNSFLMTNQFEGQFKDCLQKELKSIKG
NNDRCNLSFDQRNDDFISNQYYSDNKQRNLSTNQNDLLVLKQKGKRNESLDILETSTQNN
GVNNADRFRFTQIKNNQNSKNIASIQCTTALKSDKQMLNQQINQIQQTFAASLTQNNNQL
SSINQVKKLSDICLPSLDQQNKSRNESLNNNQSKKITLSSLKIQPNSQLNQNSQPIQLCI
DKFTFNTQKNVIKPSNKNYQNQNLNFTENKAGQFGYTLNANQIRQTILENNIQQNEPSSQ
ILKKSLLSKNNETNAQEKPSNNESDQADQANNQILEETGRFGQEQITENQKKNNQKQLMI
SLNDNINNINVCTQLKYQKNDLMSQFPNKNNNQRPLRNSLEGVQIDQNQQKQINNIQLYN
NSGLLSTDGPDMLSSQNPNSIINIPVITTNFGLNNSQGITKPNADTLNQGTLLIHYNFPL
AEVMQYRSKYQKHQQKQISDIQNNYINYAQKKVSSAISCKRNEDFYSQFDGTGNDILDKQ
QRARSSNNRFPREIFTPNVQKAKRLNSQNKQNLNFNNCINNQEQQNEFIQQ
NT seq
3936 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatttgctatgtgagagtagttaaaatactaaaaacacaatcaatcaatatagctgta
ttttaattaaaaataggaaaaagcaataagttagtcaaggtgattagttagccttgttaa
tcgagtttatttattattgtaattatactttttggtctgtggctttggtagctttcatca
taaaataaattattgataaaattagaaaatgtatcagataattaaaaattagtgaaagtg
atcattaagaaatcaattaaacaaagcagagaagaacaaaaaaaataataagtaatcatt
aaaaatattagaaacaattataaaaacaaaaactaagagatactgatagaattaattaat
taatttaaatagttagagaattttacttacttactttcagaaggtatggacaaacccaag
gacacattgggattgctgtaggacgaacatcaaaaggaaaatattaattctaattataaa
tttggaaatcgaagcggtttcatgagtcagtaggataatcccagatctatcctttcttaa
tcatctgtgaatgctcccaatattttatagccaaattaacaatctcagaattagtataaa
tcaaacacctaagcaagggaaaatatttatagataaagcattgacttaaagaatagctaa
gttttaccttaacttaaagatagagcaataagttaaaaagaaagaaaatctgctagttag
gaaaaagaaagttagttaaaatagcaccaagttagaaatatcatgataaacaaagactta
aattagttttaaaatgaataaagaagataatcatctatttaacaaatgcaagcaaagcat
atggagagtggccaataatttaacaacaacaatttgtaaacacctagaagtagagaagag
aacagtgctaccacaaaggatagtcttgtcaactacctatcaagttaaaaaaaactttaa
aaaatacaaactagtccttctgataaagcagtaaatcagttaaatagtcaattccagagc
ctaaacgatttcaaagataatattgaagaaggaagaaattagactcaaattttcaaccaa
tctaacaaaaagttgagctagccaaattcttttaatataaaaaaagacttaattaatgaa
gataagttcgttaatattgatgtttctctaaacacacttacttagtagtagaaaacaaaa
aatatttacagtagagcacaaacagcataggaaaattaatttactgataagggaataaaa
agagactcctaaactattgatgtagaaagtctagaaactgcaccaaatataaatgttgga
ttaatacaggattaaaaattaatccttaaccatttaaaaaaataaaattaaaattctaat
caaactgagaagcccttgcaacacaactagaattagaataaagattatgatggagcaaat
atcacattttatccaaaataatcctctaaaaaaaatgttaataaaatatccacaaatgac
caaaacgaaatctaataagaagcacaatattaaatgcagcaacaattaataaagaaaaag
agctcttctgacaataataatgaaagttagaatgatgctaagattagattaaacgactgt
gtaggttaatacaatattagctaatctaatcaaaaaaatacaataacctcctaaaaggta
gaggatatatctagaagagctagctgctaaaatcagtaaataaatctaaaaaatccacaa
tcctaatattaataaaaaaatcaaatgatttatactaattaagtagaagtttaccaatag
caaacagaaccaaatgctattcaaacttaacctgatttttcttttagcaatcaatacaat
aatagcaagtagtatattctaagtgaaggatagtaatttgaataaattgaacaaattcct
aaaaactaaatgaaatttcataacttataccaaaagaatatatctcactctaagaataac
tccttatcttaaggtttacccaatactggagttaataatttaggtacaggaatacacttt
ctagagtaatcaagtaataattaataaagttaaaagaattataatcgccaaaatcaactt
aaaaactcataattatcataataaagagcttcgaactatgtaggctaaattaaaagatag
ctaaactagcagtgttagtaacaaatcgatgttccttatcctataccttaaggtcatcat
agaagtaatagccatcacttagatactagaattgctaaacctaattcttttttgatgaca
aattaatttgaaggttaatttaaagattgcttgtaaaaggaattaaagagcatcaaagga
aataatgatagatgcaatttaagctttgattagagaaatgatgattttatctctaattaa
tattactctgataataaacagagaaatttaagcacaaattagaatgacttattagtatta
aagtaaaaaggcaagagaaatgaatctcttgatattttagagactagtacataaaataat
ggtgttaataatgcagataggtttcgctttacttaaattaaaaataactaaaactctaaa
aatattgcatcaattcaatgcacaactgctcttaaaagtgataaataaatgttaaattaa
tagattaattagatataataaacattcgcagctagtttaacttagaataataactagctt
tctagtataaactaagtaaaaaaacttagtgacatttgtcttccttctcttgattaacaa
aataaatcaagaaacgaaagcttgaataataattaatctaaaaaaataacattaagttca
ttaaaaatacaacccaacagctaattaaatcagaattcacaacctatttaactatgtatc
gataaattcacttttaatacctaaaagaatgtcataaaaccaagcaataaaaattattaa
aactaaaatctcaactttactgaaaacaaagctggttagtttggatacactttaaatgca
aattaaataagacaaacaatcttagaaaataacatctaacaaaatgagccatcctcacaa
attcttaaaaagagtcttttaagcaaaaacaatgaaacaaacgctcaagaaaagccttca
aacaatgaatcagattaagctgattaagcaaataactaaattcttgaagagacaggtaga
tttggttaagaacaaataactgaaaattaaaagaaaaataattaaaagcaattgatgata
agtttaaatgacaatattaacaatattaatgtatgtacctaattaaaatattaaaagaac
gacttaatgtcacaatttccaaataaaaataataatcaacgtccattaagaaattctttg
gaaggcgtttaaattgactaaaattaataaaaataaataaataatatacaattatacaac
aactcaggattactatcaactgatgggcctgatatgttatcaagttaaaaccctaattct
ataattaacataccagttataactacgaacttcggattgaataattcttaaggaataact
aaacctaatgcagatactttgaactaaggaacattgttaattcattataactttccttta
gctgaggttatgcagtatagatctaaatattaaaaacactaataaaaataaatatctgat
atttaaaataattacattaactatgcttaaaagaaagtctcttctgctatttcatgtaag
agaaatgaagatttctacagctaatttgatggaactggaaatgatatattagataaatag
caaagagcaagatcaagcaacaacaggtttcctagagaaatattcactccaaatgtataa
aaagcaaaaaggcttaatagttagaacaaataaaatttaaatttcaacaactgtattaat
aattaagaacaacaaaatgaattcatttaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
