Tetrahymena thermophila: TTHERM_00444880
Help
Entry
TTHERM_00444880 CDS
T01020
Name
(RefSeq) RNA recognition motif 3 in plant Mei2-like protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_2
BRAP2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7823379
NCBI-ProteinID:
XP_001023351
TGD:
TTHERM_00444880
UniProt:
I7M3G5
LinkDB
All DBs
AA seq
1473 aa
AA seq
DB search
MKNQSSNSSVDIEINSQCQKPSQQLLGPSIILKDHQEDRTKSNSSSQNSTFRKVHSTKGK
NEKSKRPSSVTQRPSSIPKFVSSFSNEAQKIGLNGNTRSQDDSYAVNSLISSMNNSYCIQ
QNAHDILAKSKLQNSYHQRGSSLQAIGQVNVFSTQYSSNLKGGSSQSLQNQVAQSQSLAN
SFVSVNQQAVGSSGDEKSGANVCQSFSAVISAQPVSELKIAGPEINNLQVSSQSQPLSDN
LVFKHASSLDLPPQSSLNVSSKLINQQVNAAHKYNNPKQLNEQQILKSQKHKQKNILENE
EDCDQKDKQEDEEQNEQNVCELQQAQGIEAFDVVANNKADSENQMSQVQIQGNNIFGINT
ELEKIDLNNSSSSKHTSNSITSRSHKNQSNISDDFLQDSKQESVNNNSMIVSSSNNSSRV
FKGSSNNSFILNQCTQKAAAQNPLNEFIQSKEEIKESISRSKYCAKPRDAHILQNARLPI
KPILQDESKNQILTLDDKLIAPPSIQVIQKPSQDLNESQLKGKQKLKQLMHRRGNTLSRN
DIEDLQFFEFQDSVFQKVSSEDEKVNSNQLENKQTSQENLSTNPLSFINPSQVYDFQNKN
NEEDNQNEQDYQQEDQDEDIEIKKQVELLNSDDSENEDKVRNIGKPSPHPPVGVYQQQIY
HPIPQQQSQQQMSFHPHLNPFVDIPSQSTPQIQQQNFDSFSKQSSTPNQQLEYISSKRIV
GPRPMSIDQQFSQFFATPNQQQIMNIPEKCGSPLQFTDYSQQQGQSPYILYESPAHQHIQ
SIYNQGMKQPTNNMNNIIQFNQMNTPSPPIQGNQQKNYQIFQQHTQMQQMMCQIPAQHSI
GIQQPQQNQQGNQQQQQQAGQIFNQNQISLGQQGQQQMMAMMKNQKQHLQIQPNSLFSSN
SSSTYHLQKQNCNLSQASTIDSADYINTFRSGSSYGVQDVQQDQVVKMIKQQSQSIQQQL
QVRSQCIQSQVQQQQSQQGPQLNQQLNFFPNHHLANQQEKGFFQQPNTNANQFLLEPFTS
QPQFNQYQMSQFQQNQQIPFTNEFMQTPFPLQYLQVYIPQNHAQVVQQPIGQISPEKFDQ
VPQAPPPHIFANSQLLNNQDISKISKNQFQLKQQMQGYNKPSHSKQLSCQQLGQYDQQNQ
VQQLQQSQIQFSQGNQYQLKNNKFNQDSSNIVNQSQQGNSICNNSMTFHNNSQNKNQINS
SNVNSQPIKGKKKLEIKEEDISYDIDLDKLGEDKRTTVCIKNIPNKYQLNCVLQTIEKNH
KDNFDFFYLPIDFNNKCNVGYAFINFIKPEYIKDFYLEFNGKKWKKFNSDKICSLKYATI
QGIPQLQEHFQNSSVMNQREKKFKPVFLNVISNMIDKQKQQSTQNDCNKSNFNDDNNGIN
QQMGKNNFMEGSTSQNQTEQAFNYNNNKQNNYSYQSNHSQHSNSNNNTSQGGQNSTNYHK
KNNSNSNNNYFNRYHNSNQKNYNNNKHEYVQKQ
NT seq
4422 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaattaaagctctaatagttcagtagatatagagattaattcacagtgctaaaag
ccttcttaacaacttttaggcccaagtataattttgaaagaccatcaggaagatagaact
aaaagcaattcttcctcatagaacagcaccttcagaaaggttcattcaactaaaggcaaa
aatgagaaaagtaaaaggccttctagtgtgacccaaagaccaagttcgattccaaaattt
gtatcatccttttcaaatgaagcgcaaaaaataggtttgaatggaaatacaagaagttaa
gatgatagttatgcagtaaatagtctaattagtagcatgaataatagttattgcattcaa
tagaatgctcatgacattttggctaaatctaaactccaaaattcttatcattaacgagga
agttcattgtaagcaataggttaagtaaatgtatttagcacatagtattcaagcaatctt
aaaggtggatcttctcaatctttatagaattaagttgcttaatcataatccctagctaac
agctttgtatctgttaatcagcaagcagtaggttcatctggagatgaaaaatctggagca
aatgtttgctaatctttctctgccgtcatctcagctcagcctgtatctgaacttaaaatt
gcaggtcctgagattaataacctttaagtatcatcacaaagttagccattatctgataat
ttagtatttaaacacgcttcgtcacttgatctccctccttaatcctctctaaatgtcagt
tcaaaattaattaatcaataagtaaatgccgctcataagtataataatcccaaatagcta
aatgagtagtaaattttaaagtcataaaagcacaagtaaaaaaatatactagaaaatgaa
gaggattgtgatcaaaaagataagtaagaagatgaagaatagaatgagtaaaatgtatgc
gaattatagcaagcatagggtattgaagccttcgatgtagtagctaacaacaaagcagat
tctgaaaattagatgagttaagtttaaatataagggaataatatatttggaataaatact
gagttagaaaaaatagatctcaataatagcagctcatctaagcatacttctaactcaata
acatcaaggtcacataaaaattagtcaaatatctctgatgattttttgtaggattcaaaa
taagaaagtgtaaacaacaacagtatgattgttagcagtagcaataatagcagcagggtt
tttaaaggatcaagcaacaatagctttatcctaaattaatgtacttaaaaagcagctgca
taaaatcctttaaacgaatttattcaatccaaggaagaaatcaaagaaagcataagtaga
tctaaatattgcgcaaagcctagagatgctcatatactttaaaatgcaagattgcctatc
aagcctattttacaagatgaatctaaaaatcaaattctaactctagatgacaagttaatt
gctcctccttcaatttaagtaatataaaaacctagccaagatttaaatgaatcacagttg
aaaggcaaacaaaaattaaaataacttatgcatagaagaggaaatactttaagtagaaat
gatatagaagatttgtagttctttgagttttaagactcagtcttccaaaaggtttcatct
gaagatgaaaaagtaaattctaactaattggaaaacaagcaaacatctcaggaaaattta
agcacaaatcctctttcttttatcaacccttcctaggtctatgacttttagaataagaac
aatgaagaagataatcaaaacgagcaagactactaacaggaagattaagatgaagatatt
gaaatcaaaaaataagtagaactgctaaacagtgacgactctgagaacgaagataaggta
agaaatataggtaagcccagtcctcatcctcctgttggtgtttactaataacaaatttat
catccgattccttagcaataatcccagtaataaatgagttttcatcctcacttaaatcct
tttgttgatatcccaagctagtccactccatagattcaataacaaaattttgattctttt
agcaagcaatcttctactcctaatcaacaattagagtatattagctcaaagagaattgtt
ggccctagaccaatgtctattgattagcaattttcttaattctttgctactcctaattag
taataaattatgaacataccagaaaagtgtggatcacctttataatttactgattactct
caatagtaagggtagtctccttacatcttatacgaatcaccagcacattaacacattcaa
tctatttataactaagggatgaagtaacctacaaataatatgaataatattatttaattt
aattaaatgaatacaccttctcccccaatccaaggcaactaataaaagaactattagatc
ttttagcaacacacttagatgtaataaatgatgtgctaaattccagcataacatagtatt
ggtatctagtagccttaacaaaattaatagggtaatcaatagcaatagtaataggctggt
tagatatttaattagaactaaataagcttgggataatagggctaataataaatgatggct
atgatgaagaactaaaagcagcacttgtaaatatagcctaactctttgttctcttcaaat
tcaagctctacataccacttgtagaaataaaattgcaatctatctcaagcatcaacaata
gactcagcagattatatcaacactttcagatcaggatcttcttatggtgtttaggatgtc
tagtaagatcaagtagttaagatgattaagcaatagagttagtcgatatagtaataactg
caagttagaagctaatgtattcaatctcaagtgcagcaacaataaagctagcaaggacct
taactcaactagcagctaaacttcttcccaaaccatcatctcgcaaattaataagaaaaa
ggtttcttttaataacctaatacaaacgcaaattaatttttgcttgaaccttttacttct
taacctcagtttaattaatattaaatgagccaattctaacaaaattaataaattccgttt
acaaatgagttcatgcaaacgccttttcctcttcaatacctttaagtatacattccttaa
aatcatgcataggttgtttaataaccaattggttagatctctccagaaaaatttgattaa
gtacctcaagctcctcctcctcacatttttgctaattcttaattgctaaataattaagac
atttcaaagatatctaaaaatcaattctagctaaaataataaatgtaaggctataataag
ccttctcactccaaatagctatcatgctaataattaggataatacgattaatagaactaa
gtataacaactttaatagagtcaaatttaattttcataaggaaattaatactagcttaag
aataacaaatttaactaagatagtagcaatattgttaaccaaagctaataaggtaacagc
atctgcaacaacagcatgactttccataataattcatagaataaaaattaaattaatagc
tctaacgttaacagctaacctattaaaggaaaaaagaaattagaaataaaagaggaggat
ataagctatgatattgatttagataagttaggtgaagataagcgtactaccgtttgcatt
aaaaatatcccaaacaaatattagcttaactgtgttttacaaacaatagaaaaaaatcac
aaggataactttgactttttctacttgcctattgattttaataataagtgcaatgttggc
tatgcattcattaattttatcaagccagaatacattaaagatttttatcttgagtttaat
ggcaaaaaatggaagaagtttaattcagacaagatttgcagcttaaaatatgctacaata
taaggtattccttaattacaagagcatttctagaattcgagcgttatgaactaaagagaa
aaaaagtttaaaccagtgtttttaaatgtcataagcaatatgattgacaaacaaaagcaa
caatctacataaaatgattgtaataaatcaaattttaacgatgataataatggcattaat
taataaatgggtaaaaacaattttatggaaggaagcaccagttaaaactagactgaataa
gctttcaactataacaataacaagtaaaacaactattcctatcaaagcaatcacagccaa
catagcaacagcaataataataccagctaaggaggttaaaatagcactaattatcacaaa
aaaaataacagtaatagtaataacaactattttaatagataccataattctaattagaag
aattacaataataacaaacatgaatatgttcaaaagcaatga
DBGET
integrated database retrieval system
