Tetrahymena thermophila: TTHERM_00471780
Help
Entry
TTHERM_00471780 CDS
T01020
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7832258
NCBI-ProteinID:
XP_001033062
TGD:
TTHERM_00471780
UniProt:
I7M6K9
LinkDB
All DBs
AA seq
1643 aa
AA seq
DB search
MQSKEYYFWKYDISLMNIISAIFWFYLNDFKLFEKSIEVNAILIIHLIQSVVHFIPYIQN
KGNSIQHWTIVLFLIITTVLAFQLKQSVNHYDDDIDQTQFNNQNILYTWQIQSLIQLFIV
LKLKYRMLLDMQRVIDIPFYTVILIILIQQILIAVLYTSAMLITIALVVYIGICYQQISY
KIERKILLKEFNFYYINKLEKNACIQYNYSSKKVQTQKQKILQNLNDITQSTSEKQEEFG
SSNISSQQKKSGSIVHKSDIEVNLNINKDNGDLGSKLKNKYQTNSKRFNAESFKFKDEDI
RFLQNEFEQAKNKFSIEYKKQKSFLNIIKEQFCYGRQVINRDLYKKYQSLQINSGIHRLK
GSLHIIKLPDNQEYGIILFKQSEQRIVDLYIQRIEQVQNHITLISKELSYMTANSSMPIP
HSLDKSDIVINQTRTHQCIVDLNQDNGIANSKSIQPTKNQIESPGTLASHSNIEMTPYIQ
KRQTVNHYQSQSYFNIYHNNHSFTNINCLNDINPCISKTIQTQMQGNSFYAKHFSLNKNS
TNTKNLTQIQQVQQQTQDLCQNCASNQQFSLLQQLIKCRFQIQILLNDLREYQLSCLELQ
YPRYKKYKTKWISHETKQRENYENEHQINQTVVYQQFQKDVYQQQQLIYFSNFAFLDIQV
LDYIFSNDIQLQANNKKCKGVYDSVVNRIEDIYQQRTSITNLKILLDFFIKILSVGEKNF
NMSLEQFSYIDSGLLQEQEKQQFRQVYGDQLIEENSDKVAANYQKTQTTGVFHQAQQGIS
NQTSPLISKTERTNFLFQEEDLETYKDMILSIIQQIFYLYKDNSSAISMQVHRFYSKEGI
FNPQLMFRKRYLKEVIKSYLILEQNRQNQKNNQNQIGNQQLSQQFYGAKNLNIQNVNQKS
PQYIAQKRNSFQMQHDKKQNEIQLPSISNIQHASSRIQPYKQINFQNPSQYNEQTYNNQG
ALDTPLKNQLNQQDSQDIIDNISYQKQQQTLNGANKNLLINQMSVQVSQAMSNSYQNNTH
QEKNNGNYNQNSIQPFFAQMQQQITGKHAFQVTSMNDINQQSIIQSGIQNQEIKNNNTNN
TQQIANDQSINFNAIGSSREAQQIDNQYIEEIIEQEKYRKLKLVRVSIKIDQSIPNDELT
SQISKETNCLTQIEEYVQYLSPLPLFYSKEKKDATIIHTYSFYIQNYLYLNNLMSENDNQ
NQRSLMNLDQKMDQNNNQDIVSLDGQPFEQNQISQPAFEKKQTQNLREDNNLPITITQAV
KEGQIKLNQQTLFQSSRQNFNDELFQNANNRASNTISFQQSHDNIESATDRKFLQSHNNL
QIRDQQISFNGKYGGVQTPFQEINQDYTQIEIYPKDYENKMYSNININGHNDISNIGFTD
RQVEEPSAERKLSKNMEKLSAKQEYNASQNLLLLGDRQKYHKNIQNFDNLNKNVLYQLHD
ENDTCIQENIREREKSSDNFVNQVRDSKSLIKNNQVQENQSQCSDLEYNKDVMDERDEKE
LSVIIERSEQNYSNINHYRNQLSKQTSSKINDFPFLNQNPVYSFLNQKSQFQSQLLPEDH
KQTFSNNFSKNNYGIESENRSIIHPNIIGSVSQQYIQQLNSNISKEGNLINFTSQYYDSK
LNKDGNQINYFSQNCESKLKQSN
NT seq
4932 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtaaagtaaagaatattatttttggaaatatgacatcagcttaatgaacattatttct
gcgatattttggttttatctgaatgattttaaattgtttgaaaaatcgattgaagtgaat
gcaatcttaattatccatttaatttaatctgtagttcattttatcccttatatataaaat
aaaggaaactcgatatagcattggactattgttttatttttaattattacaactgtttta
gctttttagttaaaataatctgtaaatcattatgatgatgatattgattagacataattt
aataattaaaatattttgtatacttggtaaatacaaagcttgatatagttattcatagta
ttaaaacttaaatatagaatgcttctagatatgtagagggttattgatatcccattttat
actgttatattgataatattaatttagtaaattcttatagcagttctttacacaagtgcg
atgctaataacaattgctttagtagtttatataggtatttgctattagtaaattagctat
aaaattgagcgaaagatattattaaaggaattcaacttctactatataaataaattagaa
aaaaatgcatgtattcaatataattattctagtaaaaaagtctaaacttagaagtaaaaa
attttataaaatttgaatgatattacttaatccaccagtgaaaaataagaagagtttggt
tcttcaaacataagcagttagtagaagaaatcaggaagcatagtccataaaagcgatata
gaagttaatttaaacataaataaagataatggagatttaggttctaaattaaaaaataag
tattaaacaaatagtaaaagattcaatgctgaatcatttaaatttaaggatgaggatatt
agattcttgcaaaatgaatttgaacaggccaaaaataaatttagcatagaatataagaaa
tagaaatcatttttaaatataattaaagaatagttttgctatggtagataagttataaat
agggatctatacaagaagtaccagagcctttaaataaatagtggtattcacagattgaaa
gggagtttacacataattaaattgccagataactaggagtatgggattattttgtttaag
caatcagaatagagaatagtcgatttatatatttagcgcatagaataggtttagaatcat
attacattgataagtaaagaacttagctatatgactgctaattctagtatgcctatacct
cattcattagataaaagtgatattgttattaattaaactagaactcattaatgtatagtt
gatcttaatcaagataacgggatagctaattctaaatccatttaaccaactaaaaattaa
attgaatctccaggtaccctagcctcgcattcaaacatagaaatgacaccttacatacaa
aaaagatagacagtaaatcattaccaaagttagagctatttcaatatttatcataacaat
cactcgtttactaacatcaactgcctaaacgatattaatccatgtattagcaaaaccatt
taaacttaaatgcaaggaaattccttctatgcaaagcatttttcccttaataaaaattca
acaaacacaaaaaatttaacataaatataacaagtgtagcaataaactcaagatttatgc
taaaattgtgcaagcaattagcagttttctttgctttaatagttaattaaatgtcgcttt
taaatttaaattttattaaatgacttaagagaatactaactcagctgcttagagctttaa
taccctagatataaaaagtataaaacaaagtggatttcacatgaaacaaagtagagagaa
aattatgaaaatgaacattaaattaaccaaacagttgtttatcaataattccaaaaagat
gtctactaacaacaataattaatttacttttcaaatttcgcttttttagatattcaagtc
ttagactacatctttagtaatgatatttaattgtaagcaaataacaaaaagtgtaaagga
gtatatgactccgtcgtaaatagaattgaagatatttattaataaagaacttcaattaca
aaccttaaaatattgttagattttttcattaaaattttatcagtcggtgaaaaaaacttc
aacatgtctcttgaataattttcatacatagactctggcttattataagagcaagagaag
tagcaatttagataagtatatggggattaactaattgaagaaaacagtgataaagtcgcc
gctaattactagaaaacacaaactactggggtatttcattaagcctaataaggaatttct
aattaaacatctccactaatcagtaaaactgaaagaactaattttttattttaagaagaa
gacttagaaacttacaaagatatgatattgtcaattatttagcaaatattttatctctac
aaagataattcaagtgctatttcaatgcaagtgcatagattttattcaaaggaaggtatt
tttaatccttaattaatgttcagaaagcgctacctaaaagaggtgataaagtcatattta
attttagaataaaatagataaaattaaaagaataattagaattaaataggaaattagtaa
ctcagttagcaattttatggagctaagaatttaaatatctaaaatgtcaactaaaagtct
ccttaatatatagcgtaaaaaagaaactcatttcaaatgtagcatgataaaaaataaaat
gaaatttaactcccaagtatatctaatatttagcacgctagtagtagaatctagccttat
aaacaaataaactttcaaaatcctagttaatataatgaataaacttataataattaaggt
gcattagatactcctttaaaaaactagttaaattaacaagatagccaagatataattgac
aatatctcatattagaaacaacaataaactttaaatggtgcaaataaaaatttattaata
aattaaatgtctgtttaagtttcataagcaatgagtaattcttactagaacaatactcac
taagaaaaaaataatggaaactacaatcagaatagtatccaacctttttttgcccaaatg
taatagtaaataactggaaaacacgcgttttaagtgacgagcatgaatgacataaattaa
tagtcaataatacaaagtggtatttagaattaagaaataaaaaacaacaacactaataat
acctagcaaatagcaaatgactaaagcataaattttaatgcaataggaagctcaagggag
gcttaataaattgataactaatatattgaagaaattatagaataagaaaaatatagaaaa
ttgaaacttgttagagtgagtatcaaaatagactagagtataccaaatgatgaattgaca
tcgtagatatcaaaagaaacgaattgcttaactcaaatagaagaatatgtttaatattta
tctcctttgccattattttatagcaaagaaaagaaagatgcaacaattatacatacttat
agcttttacatttaaaattatttgtatttaaataacttaatgagtgaaaacgataattaa
aatcaaagatctttgatgaatttagattaaaagatggattaaaataataatcaagatatt
gtcagcttagatggttagccttttgagtaaaatcaaataagctaacctgcttttgaaaaa
aaataaacttaaaatttaagggaagataacaatttacccattaccataacctaagctgtt
aaagaaggctaaattaaattaaattaataaactcttttttagagctctagacaaaatttt
aatgatgaactatttcaaaatgctaataatcgtgcttcaaatactataagtttctagtaa
agtcatgacaacattgaatcagcaactgatagaaaattcttgtagagccataataattta
taaatccgagattaataaatatcattcaatggtaaatatggtggagtataaacgccattc
taagaaattaattaagattacacataaattgaaatttatccaaaagattatgaaaataaa
atgtattctaacatcaatattaatgggcataatgatataagcaatataggattcactgat
agataagtggaagagccctcagctgaaagaaaactttccaaaaatatggaaaaactttca
gccaaataagaatataatgcaagctaaaaccttttgttgttgggagatagataaaaatat
cacaaaaatatttagaattttgataatttaaataaaaatgttttgtattaactgcatgat
gagaacgacacatgcatttaagaaaatataagagaaagagaaaaatcatccgataacttt
gttaactaagtgagagattcgaaaagcttaattaaaaataatcaagtttaagaaaattag
agctaatgctcagatttagagtacaataaagatgttatggatgaaagagatgaaaaagaa
ctctcagtcatcatagagagaagtgaataaaattattcaaatataaatcattatagaaat
tagctgagcaagcaaacatcttctaaaattaatgattttccttttctaaatcaaaatcct
gtatatagtttcttaaattagaagtcttaattttaaagttagctacttccagaagatcat
aaatagactttttcaaataacttttctaaaaacaattatggcattgaaagtgagaacagg
agcataattcaccctaatattatagggagtgtatctcaataatatatttaataattaaat
agcaacatatcaaaagagggtaatttgataaattttacatcacaatattatgatagtaag
ctaaataaagacggcaaccaaataaattatttttctcaaaactgcgaaagtaaattaaaa
caatcaaattga
DBGET
integrated database retrieval system
