Tetrahymena thermophila: TTHERM_00485860
Help
Entry
TTHERM_00485860 CDS
T01020
Name
(RefSeq) PB1 domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PB1
N_BRCA1_IG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7831098
NCBI-ProteinID:
XP_001032799
TGD:
TTHERM_00485860
UniProt:
I7M6G0
LinkDB
All DBs
AA seq
1402 aa
AA seq
DB search
MFPQFQEHQQNRISLKLVFGGDCFRLSKFPQNFQELEDIARNKFDNKLPENFCFKYQDSE
NDSINVESSSDYEAFLEYCNQEKLKAIKLRIDSKSFKQYFNWQEQQQQAMGNQPNFANQG
QSSQTYQANNVIGMLLNPFTPYYQNMQNKNQKTQFQISSQDQNSFYGNFQNMNSPNSNDL
NYNIIQMLMCMLNTQGNQAQKSSSTTNSCLNNHGFNNGNNNVNVNFNNNTNAVNNSLSSA
PQIPSLSRGASEANANDIKRQSANQSYTANVESNISFANERRNVGQSLSQQQNNQQNIMV
SFANVKSSVTKNAIATSNQMNQYNLLMQQPFNSSNINDLNITSKFGNQDLTKFENEKLSN
TRNLISGSDIPNPMIDESDNDIKSKDIKKISSMSCGLDDMQPTLSNHLSFTPGSQNIFNN
SQNINLAAKNSQYLKQAELNSSTISNNVDTRSQTTGGGNMGSNYSANNVNQIQAPQGIRI
NEALLSSQYTNQAIVSREQFDQIGKESIQNQQFDKTIESDFIANNYIKREFSPSPPLSQN
NTLANSTNNLMQSKIRPSQITPPLRSGQSIQVPCEKCMIWDEEQKNNPSRYSDKTDKTPT
SSIGKDIIPFTPCPECDKCGGSGFLKIEDPNTFNVIQTIVRHKLKEAEIVLKSLTVRQQK
VEKIIPKESMDWLQKILQIQCGECASNRPSQKPEDQPLFSPFTPSQSNKDKDLSLQVNNN
TNLIQKNMHLIRCSECQTDVSQLKFIYFCIDCKSKNNRNSEVFSKRWQDDIDFDNIICEN
CEDNHDSNHRVVQFCKDDIMIMHSNLNQQTQQNQQSLTSTPIQRTSQLDRSIKAGNSTQQ
NALQNLNYLNNNMTNPLFQNSLIRKPERNNFTQSTNLFTFPQQNNVQQIQKALQGQLETS
TYIGFQPQSIQLQQQQSIIQTQLSAQARQEFSQRNSVDTELLQQQQQNLHKMRSKSDNKS
VTTIVKNTSHEDQFDYFNDNLAKDDANINVVLPRCSTNQKIIKKPISGNTSLNVLSLNNQ
EISCVTANFNQDDEPPTFCDSSIFKVPKNIADSNGAPSSANIISSPVVSQHPLVSNTTQQ
QTDQINFEIIPPTQKNEIQLISESSSSKKQKVNIFENIQNQESPEQSQNLLNSKLNNTND
FTLEEPKSNVNQTQSASSSSSNISNSICVKSQYTSGKSLTQSVYGLSSSRPSITPSGQKQ
GEDQRQYRAKLVNSYCSSDILIDDSVIVFQEILNNGTENWPENVYLKCISGITDNCQYPV
VQVNKGEVMSIAFPIKINQNQAADGEQIKTAWRLYHQQQNEERKFFGPKITIDFQYKKPK
KIELEQSLEFLIESTVETIKNIFNKDSKSDINEFVKQNQQIAQSFLQDNKEDRMISKLII
KYIELYVTFKNNKSAQEKLQDF
NT seq
4209 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttccttaattttaagagcactaatagaacagaatttctttaaagttagtttttgga
ggtgattgttttagactttcaaaattccctcaaaatttttaagaattagaagatatagct
agaaataaatttgataacaaattgccagaaaatttctgtttcaagtattaagatagcgaa
aatgactctattaatgttgagagttcatcagattatgaggcttttttggaatattgcaac
taagaaaagctcaaggcaataaaattaagaatagattcaaaatcatttaagcaatacttt
aactggtaagagtagcaatagtaagctatgggaaatcagccaaactttgctaatcaggga
taatcatcttaaacttactaagcaaacaacgtaataggaatgcttctaaatccttttact
ccttattatcagaatatgcaaaacaaaaattaaaaaactcaattttagatttcaagctaa
gattagaactcattttatggaaattttcaaaacatgaactctccaaattcaaatgattta
aattataacataatttagatgcttatgtgcatgctgaacacataaggaaatcaagcttaa
aaaagttcgagtacaacaaattcttgcttaaataaccatggatttaataatggtaataat
aatgtaaatgtaaattttaataataacaccaacgctgttaataattcactctcatcagca
ccttaaattccttctctttcaagaggtgcttctgaagctaatgcgaacgacataaaaagg
taatctgccaatcaaagctatactgctaatgtggaatcaaatataagctttgctaatgaa
aggagaaatgtaggctagtcactatcataataatagaataattaataaaacattatggtt
agttttgctaatgtcaaatcttcagttacaaaaaatgctattgcaacttccaatcaaatg
aatcaatacaatttattaatgtagtagccatttaattcctctaatataaacgacctcaat
ataacatctaaatttggtaatcaagatctaactaagtttgaaaacgaaaaattgtctaac
acacgtaatttaattagcggatcagatataccaaatcctatgattgatgaatcagacaat
gatattaaatcaaaagatattaaaaaaattagctctatgagctgcggtttagatgatatg
cagcctacattatctaatcacctatcttttactccaggttcttaaaatatttttaacaat
tctcaaaatataaatcttgctgctaaaaactcataatatctcaaacaagcagaattaaac
tcctctacaatttcaaataatgttgacacaagaagctaaacaactggaggaggaaatatg
ggatctaattattcagcaaataatgtaaactaaatttaagctccttaaggaataagaata
aacgaagctctactttctagctaatatacaaattaagcaattgtttctcgtgaacaattc
gattagattggtaaagagagtatatagaattaatagtttgataaaacaattgaaagtgat
tttattgctaataattatattaaaagagagttttcaccatctccaccactatcccaaaat
aacactttggctaactctacaaacaatctgatgtaaagcaagattcgtccatctcaaatt
actccaccattacgttcaggctagagcatacaagttccttgcgaaaaatgtatgatttgg
gacgaggaataaaaaaataatccttccagatacagtgataaaactgataaaacaccaact
agtagtattggaaaagatataatcccatttactccttgtccagaatgtgataaatgtggt
ggatcaggatttttgaaaatagaagatccgaatacctttaatgtaattcaaacaatagtt
agacataaattaaaagaagcagaaatagttctaaaaagtttaacagtcagataacaaaaa
gttgaaaaaatcatcccaaaagaaagtatggactggttataaaagattctttaaatataa
tgtggtgagtgtgctagcaatagaccatcacaaaagccagaagattagcctttattttct
ccttttacgccaagctaatcaaataaggataaagatctttccctttaggtgaataacaat
actaatttaatataaaagaacatgcacttaatccgctgctctgaatgccaaactgatgtg
tcgcaattaaaatttatatacttttgcattgattgtaaatcaaaaaataatagaaactca
gaggttttcagtaaaagatggcaggatgatattgactttgataatattatttgtgaaaat
tgtgaggacaatcatgattcgaaccatcgtgtagtttaattttgcaaagatgatataatg
atcatgcacagcaacttgaattagtaaacataacaaaatcagtagtcattaacaagtaca
cctatttaacgaacaagctaactcgacaggagcataaaagccggaaactcaacttaacaa
aatgctctttaaaatttgaattatttgaataataatatgacaaatcctttattttagaat
agcctaattagaaaaccagagagaaacaactttacttaaagtacaaatctttttactttc
ccttaataaaataacgtacaacaaatttaaaaagcactttaaggctaattagaaacttca
acatatattggattttagccttaaagcatacaactataatagtaatagtctataatataa
acctaactttctgcataagctagataggagtttagttaaagaaactcagtagatacagaa
ttgctgcaacaacaataatagaatctccataaaatgagatcaaaatcggataataaatca
gttacaactatcgtaaaaaatactagtcacgaggatcaatttgattattttaatgataat
ttagctaaagacgacgcaaatattaatgtagttttaccaagatgctcaacaaattaaaaa
attattaaaaagccaatatcaggtaacactagccttaatgtgctctcattaaacaactag
gaaataagttgtgtaacagctaatttcaactaagatgatgaacctccaactttttgtgat
tcttccatttttaaagtaccaaaaaatatagctgatagtaatggtgctccatctagtgca
aatataattagttccccagttgtttcttagcatcctcttgtttctaatacaactcagtag
tagacagactaaattaatttcgaaataataccaccaacttaaaaaaacgaaatacaacta
ataagcgagtcttcatcatctaaaaaataaaaagtaaacatttttgaaaatatacaaaat
taagaatcaccagaatagtcataaaatttgttaaattctaaattgaataatacaaacgat
tttactttggaagagcctaaatcaaatgtaaatcaaacttaaagtgcttccagtagtagt
agtaacatttcaaattcaatatgtgtaaaatcataatacacatcaggtaaatctttgacc
caatcagtttatggattgtcgtcaagtagacctagtataactccttcaggttaaaaataa
ggagaagattagagacagtatcgagctaagcttgttaatagctattgctccagtgatata
ctgatagatgatagtgtaattgttttctaagaaattttaaataatggtactgagaattgg
cctgaaaacgtataccttaaatgcatatctggtataactgataattgtcaataccctgta
gtttaagtgaataaaggagaagttatgtcaatagctttccccataaaaataaatcaaaat
caagcagctgatggcgaatagataaaaacagcatggagactttatcactaataacaaaat
gaagaaaggaaattttttggtcctaaaatcactattgacttttagtacaaaaagcctaaa
aagatagaattagaataatcattagagtttttaattgaaagcacagtagagacaatcaaa
aatatatttaacaaggacagtaaatctgacattaatgagtttgtaaaatagaattagtaa
atagcttaaagttttttataagacaataaagaagatagaatgatttcgaaattaataata
aagtatattgaattatatgtaacatttaaaaataataagagtgcttaagaaaagcttcaa
gatttttga
DBGET
integrated database retrieval system