Tetrahymena thermophila: TTHERM_00535910
Help
Entry
TTHERM_00535910 CDS
T01020
Name
(RefSeq) hect domain and RCC1-like domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RCC1
RCC1_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7826596
NCBI-ProteinID:
XP_001023500
TGD:
TTHERM_00535910
UniProt:
I7LX15
LinkDB
All DBs
AA seq
1584 aa
AA seq
DB search
MIRKANLLNILFFYQFNNQILSVKHLKLKQLIQINFQFLFKQNTLQITNILFMTQVFYFG
KERIRPNVFSDHTPIIKKISFLGKDIINFDSKEEKKMFEDYIEMIKFVQEKDLCFKQVVC
SQNTAYILDAKDELWVFGEGGDGQLGISKLKSVLRQPINMSRFQNRYFTNLSCYSTHVLA
ISSTFKLYTWGNTEYGCQGTIMQNKYIVEPEKVKKNKFEEYIPQQEYSQLKVTHVATGPN
FSLVGVNKSHLFSFGKEDKSRLGLGQFNIDYTDKIYKVDLPFSNLTIRGIACGTNHCLLW
DTEGQIFSWGDGSHGKLGHSSVKGGYNYMIVNPQKIKALEDQKIIQASCGFNHSCAINFK
GEIYTWGKTIYSKENKEGQKIDYLRPKKLSCYIKSEQNIQIGTHAIKISTYGNQNAVVDD
KGYVYTWGQNIDNCLGHEDSKDYNYPVCIEELTGTKCIDVGCGENFTVVIASEKINKQTY
YNIKEFYSGILENAKEKVTKIKDFYQKKITKTMSNNSVLDKNTLQALNRMGSIVGSPSVF
TRGDSPVFKPTEKQIKQNFIANFPISQKSQQKQFNIPNSEQQMSQKVSTNTLNKVTSEKR
QASFESFSINRKIRQANIEIKKTKGEFNGYKHAASLSQNKFRPLIKESVDISVQDLQKEI
VLDEVTQNLHFDDDEFIFHEEAKKQEERKNVKNDPREFIKNKPKGVLVNSIFKEQIELIY
KEYSTTEKKENLQEKYLKNVRPKQDDFFKARMKTDQSIRQKFKDAKKDLSISSVFVADNQ
STMENQMQDTFSNSNSAHQQKYQVNQNFIKCSRPQTTSSQILQTTISQRSIQHNKLFNPT
SGEQLLELPQGDFLKRQKFLLNQQLIDQKKEKLTSIAVLRDFRTELAKKKKQDIEQEKQK
LRDQKRIEIFIKSKEYQQRLLQEQQFQQNSDSIRNNWAVYLNVEMICAAFKKLAELGLQN
LRREFELKVKLRKMQFYIRDYMMRKKIKKLSTKQIIIMRRMISCWVKRKQLQKLQQATKL
VVLHCIQEKIKKKLRVKISVKRNQIIYVQHFMRWARKSLHQQRKILSQIWDTHILHIFRQ
QIISRNLDGKQLDFYRNKFSNMLTSYTAVKQTNQHQNSIQEKPFLNSLIQTQINLELNTS
QSQKTSQFQNLQNLQTLNIQDFQTVNGQIEDFETYLRGRSNQTSQKNAKQNMLQMNNVQN
VGFTIKDQLDDESIHEIIKRKAQQNTLFGGLLEQLKFKTNVRDSQVINYEEEELLNLDTK
TDSKSRNVIFKDQNQISQDGEFKQNRTTKLELKGNLSKQNDQSLKSASQINELSDSKSDS
SEDQIDEEEQELTKKVPKSKQMQRRKQVFKRDEFSFADTLLPFSVHYFDLLLPSNYSIRI
DSLKNQNQQALQVAKMAEITVKKKIIESILILTRSKYEQQIKQYNQKRKDFIEANKHLIN
LERAKIMLLTPAETLRGIHKREDVQYALKKKQYYSQQQLFDHLPFEELKQIIADRLPNAP
KRPAYKVTINQELFRASFHKYVESVRKLIQEIEIRGIFKGKKKRDVSIMKKNNDTENDED
QDAQQINMEKLYQIFRNFERNFKI
NT seq
4755 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataagaaaagcaaatcttttaaatatattatttttttattaatttaataactaaatt
ttaagtgtaaagcatttaaaactaaagcaacttatataaattaattttcaatttctcttc
aagtagaatactttataaataacaaacatcctcttcatgacataagtattttattttggt
aaagagaggattagacctaatgttttttctgatcatactcctataataaagaaaatttct
tttctaggaaaggatataatcaactttgactctaaggaggagaaaaaaatgtttgaagat
tacattgaaatgattaaatttgttcaagaaaaagacctttgttttaaataagttgtgtgc
tcataaaatactgcttacatcttagatgcgaaagacgagctatgggtatttggtgaagga
ggcgacggttaattagggattagtaaactaaaatccgttttaagacaaccaattaatatg
agtagattttaaaacagatattttactaatctctcttgctactcaactcatgtattagct
atttcatccacttttaaactttatacttggggaaatacagaatatggatgttaaggaact
atcatgcaaaataaatacattgttgaacctgaaaaagttaaaaaaaataaatttgaggag
tacattccacaataagaatatagttaattgaaagtaactcatgttgctacaggacctaac
ttttctctggttggagttaataaaagtcatcttttctcattcggaaaagaagataaatct
cgtcttggattgggataatttaatattgattatacagataaaatatacaaagttgatcta
cctttttcaaatttaacaataagaggtattgcttgtggaactaatcattgccttttatgg
gatacagaaggataaattttttcttggggagatggttcacatggtaaattaggacattca
agtgtaaaaggaggatacaattacatgattgtgaatcctcaaaaaataaaagctttagaa
gattagaaaattatataagcaagctgtggatttaatcacagctgtgcaattaattttaaa
ggagaaatatatacttgggggaaaacgatatactctaaggaaaataaagagggtcaaaaa
atagattacttgagaccaaaaaaactaagctgctatataaaatcagaataaaacatttaa
atagggacacatgctataaaaatatctacttacggtaactaaaatgcagttgtagatgat
aaaggatatgtttatacttggggataaaacatagataattgtttaggacatgaagattca
aaagattacaactatccagtgtgtattgaggaattaactgggacaaaatgtatagatgtt
ggctgtggtgaaaatttcactgtggttatagcttctgaaaagataaataaataaacgtat
tacaatattaaagaattttattctggaattttagaaaatgcaaaagaaaaagtaaccaaa
ataaaagatttttaccaaaaaaagattactaaaactatgagtaacaattctgttttagat
aaaaatactttgtaagctcttaacagaatgggtagcatagtagggtctccaagtgttttt
actagaggtgattcacctgtttttaaaccaacagaaaaataaattaaataaaatttcatc
gcaaactttcctataagttagaagtcttaacaaaaataattcaatatacctaattctgaa
tagtagatgagctagaaagtttccacaaatactctcaacaaagtaacttcagaaaaaaga
taagcttcttttgaatccttctctataaatagaaaaataagataggcaaatatagaaatt
aaaaaaacaaaaggagaatttaatggttacaaacatgcagcaagcttatctcaaaataaa
tttagacctttaatcaaagagagtgtagatattagcgtataagacttacaaaaggaaata
gttttagatgaagtgacttaaaatttgcattttgatgacgatgaatttatttttcatgaa
gaagcaaaaaagtaagaagaaaggaaaaatgttaagaatgatcctagagaattcattaaa
aataaacctaaaggtgtgctagtaaatagtatttttaaggaatagatagaacttatttac
aaagaatatagcacaactgaaaaaaaagagaatttataagaaaaatatctaaaaaatgtt
agaccaaagtaagatgatttctttaaagcgagaatgaaaacagactaatcaatcagataa
aaattcaaagatgctaagaaagatttgtcaataagtagtgtttttgttgctgataattaa
agtaccatggagaattaaatgtaggatacattctcaaacagtaattcagcccactaacaa
aaatattaggttaattaaaattttattaaatgttctcgtccccaaactactagttctcag
atattgcaaactactattagctaaagatcgatttagcataacaaattgtttaatccaaca
agtggagaataacttttggagcttcctcaaggtgatttcctaaaaagataaaaatttttg
ttgaatcagtaattaatagactagaaaaaagaaaagttaacttcaattgctgtcttgaga
gattttagaacagaacttgcaaaaaagaagaaacaagacatcgaacaagaaaaataaaag
ctaagagactaaaaaagaattgaaatattcataaaaagtaaagaatactaataaagactg
ctttaagagcagtaattttagcaaaattctgactccattcgaaataattgggctgtttat
ttaaatgtggagatgatttgtgcagcatttaaaaaattggcagaattaggtttataaaat
cttagaagagagtttgagctaaaagttaagctcagaaaaatgcaattttatattagagat
tatatgatgagaaaaaaaataaaaaaactatctacaaaataaataattatcatgagaaga
atgatttcatgctgggtaaaaaggaagtaattgtaaaaactataataggcaactaaactg
gttgtcttgcattgtatataagaaaaaattaaaaagaagctaagagtcaaaatttctgtc
aaaagaaattagattatttacgttcagcattttatgagatgggctagaaagtcattacat
taatagagaaagattttaagttaaatatgggatacacacattttgcatatatttagataa
taaattatcagcagaaacttagatggcaaataactcgatttctacaggaacaaattttct
aatatgcttactagttacactgctgttaaataaacaaattaacattaaaattcgatataa
gaaaagccttttttgaatagtttaatttaaacttaaattaatcttgagctcaacacaagt
tagtcttaaaaaactagttaatttcaaaatttataaaatttacagactttgaacatataa
gatttccaaaccgtaaatggctagatcgaagatttcgaaacatatctcagaggtagatcc
aactagacaagctaaaaaaatgctaaatagaatatgctataaatgaataacgtacagaat
gtaggtttcacaatcaaggattagcttgatgatgaatctattcatgaaattattaagaga
aaagcttaataaaatacattatttggaggtctactagaataattaaaattcaaaacaaat
gtaagagactcttaagtaattaattatgaagaagaggaacttttaaatttggatactaag
acagattctaaatctagaaatgtgatatttaaagatcaaaatcaaattagttaagatgga
gaatttaaatagaatagaaccactaaattagaactcaaaggaaatctctctaaataaaat
gattaatctttgaagagtgcttcttaaataaatgaattatctgattctaagagtgatagt
tcagaagattaaatagatgaagaagagtaagaacttactaaaaaagtacctaagtctaaa
caaatgcagagaagaaaataagtttttaaaagggatgaattttcttttgcagatactctt
ctaccgttttctgtgcactattttgatttactgctaccctcaaattactctataaggata
gattctttaaagaatcaaaactagtaagctctacaagttgctaaaatggcagaaattact
gtgaaaaagaaaatcatagaaagtattttgatattgactcgctcaaagtatgaataataa
atcaaataatataatcaaaaaagaaaagatttcattgaggctaacaagcatttaattaat
ttggagagagcaaaaattatgttgctcacacctgctgaaactttgagaggaattcataaa
agagaagatgtttaatatgctttaaaaaagaaataatattattcataataatagttattt
gaccatcttccatttgaagaattgaaatagataattgctgatagattaccaaatgctcct
aaaaggcctgcttacaaagtcacaataaattaagagttattcagggcaagttttcataaa
tatgttgaatcagttagaaaattaatttaagaaatagaaattagaggtatatttaaagga
aaaaaaaagagagatgtttcaataatgaaaaagaataatgatacagaaaatgatgaagat
caagatgcttaataaattaatatggagaaattgtattagatttttagaaacttcgaaaga
aatttcaaaatttga
DBGET
integrated database retrieval system