KEGG   Tetrahymena thermophila: TTHERM_00538800
Entry
TTHERM_00538800   CDS       T01020                                 
Name
(RefSeq) RNA recognition motif protein
Organism
tet  Tetrahymena thermophila
SSDB
Motif
Pfam: IBR RRM_1 RING_XB3-XBAT31 zf-C3HC4_2 zf-C3HC4 YhfH RNA_bind Zn_ribbon_3 RRM_DEAH11 IBR_1
Other DBs
NCBI-GeneID: 7839125
NCBI-ProteinID: XP_001007904
TGD: TTHERM_00538800
UniProt: I7M0I5
LinkDB
AA seq 1704 aa
MQQLQQELSELINQQGQVQDIHSTLTRNSASNSIIREETLQNYLISESKESQENLKHIIQ
KSKIDYLCKLQSTFTSSEQEQELAEYIKDFKNNFGYLGSDQNSHVWQILQSLNELQSVNS
GLSFITDKNPIQNGGLIFSLLKSAFNLYHKINLVNIFESQASEDKNLKLQLDEQMIETIW
DSVIVNGSNNKKTVYFLNLEFLNPSQIIFIAKLQKHLNNLKNEAQIPNIVIYSDDILASQ
LKEQIKPQLEIVLEFKRMPQKIQYVQNAILSQKSKMDLIEQLIIDALKKYKQTLLRFDVL
IFVKNIEESKYLQQHYLNLIKEKLNIIDLTDIEVNEEESKFYLEDFKKNWEKQLVEKKIK
EKELKIQQEKEQQAKKIEEELALERERQRKIEEDKNKIFDEEKKLIKEKINQQQVQQIPD
VHPLQQINQDELNIPPFPAVPEIQQQQLNLQEIQINQNQEQEIQLQKVQREEEMVKEEEE
QKRKEEELMVKEEEERKRIEEEEVRKIREDEENIKLKQLQEEEERKRREEEEIKLKEDEE
IKRKQDEENKLKQEEEERQKDIQQYNEDLNKQINKNKQNLYKANEFNIFIAKSYKQLKHH
NLDNVIIQIDTGEAFKVYFMDTIFDQIPVVSSKITREEAIKRERLIGNTKSCEIHRLYEK
KEFLRLQKRDFLNLINLEQYKAFSEIQNEKCPQKQAIRILLQIMINLSENWFSCSSEVGA
HISILWSRMGDIFSVHNQLLVSQTDDLYLACQNLNLQNILEKNQVNSNQYDKIVYKMLNI
QKVLNIKEDPVKILQKLEATKFSELVQQVAIEKYWKNLCVYSGHRRLGFRHFESAKMLNY
AEISSMNLIQERPFLIIPLQLQINSKNQYEIKQCLAIDHPFLLENAPSQFIEKHQLRLLK
RQSLNLHEIEYFGISDALFQYFEDNNQIIKDMENKFDCYYEPNHHMDTITIHSDASQKEK
LEKHFNNLLQEAQKILSEEVMEISHGNNCILKIQKGGTIKEVTILQNEHIFIVDNLPLNV
KEQDVINLFEEYGDIVQVKFFTDPTLKNVEEKSISAEVLVAETEDSKFFVETFNQIEFQD
RVLQLRLKNHSYQIHQDNNSTRYHNIFRWQTWKSKQTGRIEFLDESSVQSFMKLVQNKLI
VDGKEIKAEQDKNFNKTVILSGLQKCTDEETLKSCLIPELQKNIVRINVDRIADVDRGIS
KTSLIFALNKIYKEQHQISWVRRKDHGIVEAKICFSKNYLYKMNTYYERFNSKPDILGQQ
KLYVQRNYIETFNYDLKMMNVVQMILKGNQELVQMQQKNEIKLKEKIVRPIPSKQEFIVI
LKCNDETHFNKAKGIMQALLQSKLLDLRNVKLDLASLFDEEDQVDYSQLFTEIGQKKLKE
IESKYPVFFKINLIKEEVRVFCTDAIYDLINKDVEYFLRQSVRVKIPISGKNIRNILGID
GRGLEEFKNKTNICKIQLDYISKDIYMEGNSKQVDQAKNALLALLEEKNSQACLNNMPYS
YEDCQVCSDTIVTGYRLQGCGHKFCLSCIMFVIDNSLGDVNSLPIKCPFCSQAIIMKDIK
TLMSEDQIQKMTRMSLNHYIQNNFQEFSFCVNENCKSIHSSKLTKYTCYECKKTYCSKCA
AEYHFGMTCTVYQETEAKNIEFLIKEGARKCPNCGVYIIRIDGCYRVECRRCNQHICWKD
NCMKFFATSSECYNHLDENHGGYW
NT seq 5115 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtagcagctttaataggaactctctgaactcataaactaatagggttaagttcaagat
atacacagtacattaacaagaaactctgcttctaatagtattataagagaagaaacatta
caaaactatttgatttctgaaagtaaagaaagccaagaaaatttaaagcatattatccaa
aaaagcaaaatagattatttgtgcaaattgtaatcaactttcactagctctgaataagaa
caagagttggctgaatatatcaaagatttcaaaaataattttggatatcttggaagcgac
taaaatagccatgtttggtaaattttataaagtttgaacgaactttaatctgtaaatagt
ggattatcatttataacagataaaaaccctatttagaatggaggactcattttttctctt
ttaaagagtgcttttaatctttatcataaaattaacttagttaacatattcgaatcataa
gctagtgaagacaagaacttaaagctataactagacgaatagatgatagagacaatttgg
gactccgttatcgtaaatggatccaataataaaaaaactgtttactttttaaatttagag
tttttgaatccttcttagattatttttatagcaaagttatagaaacatttaaataattta
aaaaatgaagcttagattccaaatatcgtgatttactctgatgacattttagcatcatag
cttaaagagtagataaagccttaattagaaatagttttggagttcaaaagaatgcctcaa
aaaatttagtatgtatagaatgctattttatcacaaaaaagtaaaatggatttaatagag
caactgataattgatgctttgaaaaaatacaagcaaactttgttgagatttgacgtgctt
atatttgttaagaacattgaagagagcaaatacttatagcaacactatttaaatcttatc
aaagaaaaactaaatattatagatttgacagatattgaagtgaatgaagaagaaagtaag
ttttacttagaagatttcaaaaagaattgggaaaaataattggtcgaaaaaaaaataaaa
gaaaaagaattaaaaatttaacaagaaaaagaatagtaggccaagaaaattgaggaggag
ttagcacttgaaagagaaagacaaaggaagattgaagaagataaaaataaaatattcgat
gaagaaaaaaaactaataaaagaaaaaataaatcaataacaagtataataaataccagat
gttcatcctttacaacaaattaattaagatgaacttaacattcctcctttccctgctgtt
ccagaaatatagcaataatagttaaacttataagaaatatagataaattaaaattaagag
taagagatctaattatagaaagtacaaagagaagaagagatggtaaaagaagaagaagag
taaaaaagaaaagaagaagaactaatggtaaaagaagaagaagagagaaaaagaattgaa
gaagaagaagtgagaaaaataagagaagatgaagaaaacattaaattaaaataattataa
gaagaagaagagagaaaaagaagagaagaagaagaaattaaattaaaagaagatgaagag
ataaaaagaaagcaagatgaagaaaataagttgaagcaggaagaagaagaaagataaaaa
gatatacagcaatataatgaagatttaaataaatagattaataaaaataagtaaaatctc
tacaaagcaaatgaatttaatattttcatagctaaaagctataagcaattgaaacatcat
aacttagataatgtaatcatttaaattgatacaggtgaagcattcaaagtatatttcatg
gatactatttttgattagattcctgtagtaagctctaaaattacaagagaagaagctatt
aaaagagaaagactcattggtaatactaaatcatgcgaaattcatagattgtatgaaaaa
aaagaattccttagactacaaaagagggattttttgaatttaataaatttggaatagtat
aaggccttttcagaaatttaaaatgagaaatgcccttaaaagtaagcaattaggattttg
ttatagatcatgataaatcttagtgaaaactggtttagctgctcttcagaagtaggagct
catatctcaattttatggagtagaatgggtgatatcttttctgttcataactagctcttg
gtttcttagactgatgatttatatttagcttgctaaaatctcaatctgcagaatatttta
gaaaaaaatcaagttaattcaaatcaatatgataaaattgtttataaaatgctcaatatt
caaaaagttttaaatatcaaagaagatccagttaaaatcttacagaaattagaagcaacc
aaattttcagaacttgttcagtaagttgctatagaaaaatattggaaaaatttatgcgtt
tattcaggacatagaagacttggtttccgtcactttgaatcagctaaaatgttgaactat
gctgaaataagcagcatgaaccttatttaagaaagacctttccttattattccccttcag
cttcaaattaattctaaaaattaatatgaaataaagcaatgcttagctatagatcatcct
tttttactagaaaatgctccttcttaatttattgaaaagcattaactcagactgcttaaa
agacaaagtttgaatttgcatgagatcgaatattttggtatttcagatgcgttgttctaa
tactttgaagataacaattaaataattaaagatatggaaaataaattcgattgttattat
gagcctaatcatcatatggacactataaccatacattctgatgcaagctaaaaggaaaaa
ctagaaaaacactttaataacttgctttaagaagcataaaaaatactctcagaagaagtt
atggaaatttcacatggaaacaactgcatcctaaagatttaaaaaggaggtactatcaaa
gaagttactattttacagaatgaacacatctttattgttgataatctacccttaaatgtg
aaagagtaagatgttataaatttatttgaagaatatggagatattgttcaagtcaaattt
ttcactgatcccaccctcaaaaatgttgaagaaaaatctatttctgcagaagttttagtg
gctgaaacagaagattccaaattttttgtagaaacatttaattaaatagaattttaagat
agagtcctgcagttgcgtttgaaaaaccacagctactaaatacatcaagataataattct
actagatatcataacatttttagatggcaaacttggaaatcaaaacaaactggaagaatt
gaatttcttgatgaatcatcagtttaatcttttatgaaattagtttaaaataaactaatt
gttgatggtaaggaaattaaagcagaataggataaaaattttaataaaaccgtcatattg
agtgggctataaaaatgcacagatgaagaaactttaaaatcttgtttgataccagaactt
taaaagaatattgtgagaataaatgtagatagaatagctgatgttgacagaggaattagc
aaaactagtttaatattcgctcttaataagatttataaagagtaacactaaataagttgg
gtaagaagaaaagatcatggtattgttgaagctaaaatatgcttttctaaaaattactta
tataagatgaacacttactatgaaagatttaatagtaagccagatattttaggataataa
aaattatatgtttaaagaaattatattgaaacctttaactatgacttgaagatgatgaac
gtagtctaaatgatattaaaaggtaatcaggaattagtttaaatgtaacaaaagaatgaa
ataaaactcaaggaaaaaattgtaagaccaattccctctaaataagaattcattgtaatt
ttgaaatgcaatgatgaaacccactttaataaggcaaaaggaattatgtaagctctgctt
taatcaaaactgcttgatttgagaaatgtaaaattagatttggccagcttattcgatgag
gaagattaagtagattactcttagttgttcactgaaataggataaaagaagctcaaagaa
atagaaagcaaatacccagtatttttcaaaataaatttaatcaaagaagaagttagagtt
ttctgtactgatgccatttatgatttgataaataaagatgttgagtacttcttaagatag
agtgtcagagttaaaattcctattagtggaaaaaatattagaaacatacttggaatagat
ggaagaggtttagaagagtttaaaaataaaactaacatttgcaaaatttagctagactac
atatctaaagacatttatatggaaggtaattctaagtaagttgactaagctaagaatgct
ttacttgctttattggaggaaaaaaatagctaagcatgcttaaataacatgccttattca
tatgaagattgctaagtctgctctgacactattgtcacaggatacagattgcaaggctgt
ggtcataaattttgcctaagctgtattatgtttgtaatagataattctttaggtgatgtg
aattctcttccaattaaatgtcctttttgcagttaagctattattatgaaagatataaaa
actcttatgagtgaggatcaaatataaaaaatgacaagaatgtctttaaatcattacata
caaaacaacttttaagaattcagcttttgtgtgaatgaaaattgtaagtctattcattca
tctaaactaactaaatatacttgttatgaatgcaaaaaaacttactgttcaaagtgtgca
gcagaatatcattttggtatgacttgtacagtttattaggaaactgaagcgaaaaacata
gaattcttaatcaaagaaggtgctcgtaaatgccctaattgtggagtctacatcattcgt
atagatggatgttatagggtagaatgtagaagatgcaaccagcatatttgctggaaagat
aattgcatgaagttctttgcaacttcatccgaatgttataaccatttagacgagaatcat
ggaggttattggtga

DBGET integrated database retrieval system