Tetrahymena thermophila: TTHERM_00538820
Help
Entry
TTHERM_00538820 CDS
T01020
Name
(RefSeq) helicase carboxy-terminal domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
SecA_DEAD
DEAD
Helicase_C
VWA_2
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7839127
NCBI-ProteinID:
XP_001007906
TGD:
TTHERM_00538820
UniProt:
I7LU06
LinkDB
All DBs
AA seq
3178 aa
AA seq
DB search
MDFNFIDENNNELNHQRQQNAQQQNQEEIKKSQLEDRLLKYLEELELRNVSSIQGEIEEV
QKEIEKYKLKDNQARVSEKEQTLEKLNEIQQMIKQLCEIRNQQLEYQLNEILSELNMRDA
NLLAEEIGDVKSELENYEMKKRPKKVAEKRKTLEKLINAQQIYFEIQYSNGDPQTILDQL
FKQHLEEKLRIGLQELKLEDVDSIEIVIQEVKSEIKQLLSKKKQNQASEKKCNLEKLENL
QNIAKELHQLDQQLQIDQKSKKKQQLEQQLDQFMKELELEDVQQIEEEIQQILEKIEKYS
QRKENSKVSQEEQTLSKLKNCQLIYLDLQKLNDEANLNNSNLKEIINQNSEMELDFTNQI
YQQEDPNQRDNQILDLNTKFNVKYLKQDASQIPYSSEKLLTEMLIFCIELLTSNGIKIAD
EYYSQVLNFLLEIENRLKIEDQLGPEILQSIQCLKLSIDHDNLKQFIVDTEKLLKKIRPL
NVNEMNRLINEANKASNIMKGQDIILFLGNTGAGKSTTVHFLSGSRMVKLKSEFIDYIGP
DPNKILNKSLQKVKIGVQAQSETRYITPVQVHYQDVQMNQKGHFILCDVPGFGDTAGPEV
DIANGIGIVEAIKQCKSVRPVILLSFKSTGDKGQGIKDLAHLLLGLIQNPDDNLSLFTYL
FTKFPQDVDINKELKNIKKSIEESSDKAFISLFEDMIYQTEKGCCRVEPLTNQPQVLLKQ
ILKKQGVDDPSQIFKFSITQNSQSVIQDQALKTQQMIISAVSRCEYELINYQLNKLKFLV
DTLNQNSIKQTYEKCKKLIIDNFNTYYNNAISQLDQSIQNQNKLDIQYLYQFQDLVNKSK
NLEQLRSQHLGNEVMQYDSLIQQLKLSVQKMANVFNQDDNITKFASNNIDNIKLISEIFP
EIKQQYGNSCQLIMKKIESLLILCKQTIKNKNYDQLSMQLSQIKSYQIEFKNHLNEQSIN
EELNNVKKQFYDIFVNIIEQSNHTLEKKELQIQDIDNLNRHFQDFGDVEKNLKLIQHFST
DQISKYKKNFINNLVKHFEKIIKQIEDTLKLEPEQAFQKLEILVYQMKQFRQINTIDHLT
SDKYYKSIQDVEGLMQSIKRQIDQYLNDFQHDKKKVDFQKVYRCLIQLKSAEWMDGVQKG
IYEQKIKGITDELFKYSQFQIITKLVDLDLSCKNYQNISVASELLIEMERMQVFEEFNIK
LKELRETAEKKFSNSIESVFNQIKELISKYNKFLNLRMEGSFLIQPQNTETSEEQEEEKE
NIQNKINSSKYCLANDNQIQQKKSIKCSKQIIKNNIVKIKRESKRFIQIEHQSKLKNKQN
FFPIKIDMNQIEDYLVYIENCCTSKWIRLDANTLKDKLKQLLVQYGNSLKVQIQQYFQII
TEANEQNDNEKSLASQKLATQAQELMELQNYKMTCQLVQGGQILKDLKNLMQQHYLELYD
QLNQTSLEKQFQAQIIRIIKQLIHTENILGDNKFYNLYKNQQIEINNEYKGIYQKIIEQI
ELNQYQNASFELLSIDDKSANEKAMKQIRLTLVTSVELLLDKAQDKQSYLENQIQKDLIN
QIVQIIEQIKKAKQCLQDYFEKEFLDNVDRQVDQIIIDIQNKIEQYLESMSAHVKQLDFF
QVEEKREHIMQIILLLSRYNSQTKEEINKKLNQLQKELEEKVKQITQIDYNDQNNLIHKP
PKFILEKLSKVSSRNIKYAECYDKLNKILIDRVSNSILDYQNSIQQEQNQKELKIQTLIN
SLPDDLKLQSQDQFNSVKQFIKQKNDVFEKDFKQAEKSKDLDKKLKFMEQCSQEKMFSFQ
DKMSKQIQQECQKYSSQLTDYLGKNEIKESIQQAIKLLENKNKFLDYKKKFGEEKDRIEE
FEKMYSELEKAISSNYESARRAIQSDISMSFESLKAIKTIEDQDSYQKEYDKLQSFIINL
KDYEKYFLINDFNTKIKSLGFEIYNFFEKIFKSFNDNLKDMKIKKIKQDLLLISKWENFI
QKIVMDVKKQNIFTEQFLNDYQITQFKEKYHSYKDCIEKFINQIQEVKQNVINFKFQDDY
QMHSQHQELKKDVNILIQLKEEKIDFQSTQLDYECYEKECLPKLISKIEEFQKEIEIILE
SQEKQFSENEFKMFNKYYDNLNQFNENVKNLNIDIEYYKRRISQKLEQKIENLFQSIDVT
QIDSVAKSLILIKTYSENIPSFKKNFDCRLDIWIKNIYFNEFKGMKLAQLVTHLQREKTG
IGIIIIEEHDIFKQQSISIFNKQVKEQGIKYVLENIKGEDLNKEKLDNVYNKFLKQYEDI
VQNNIICIENKSQSEKIVIESLAYKVKSFAKKIELKNKQIKWDNSVRQNIPSLMAHIFAL
WTFLNMEYFKELTHMAKEEKETYLFSPHAGQIISIFRLLGLGYQTDGLQNNFIQIGTGEG
KSIVLAVTAIIFALHEVDVYCACYSQYLSERDYESFLKLFNILGVIQNIKYGAFTKICEH
FINQQGDIRQLTADYICNGFSENKKKTKKTTKNPSILIIDEVDVFFTKDFYGSMYNPVAR
LQDENIVKLAEFIWQSRKQHLFLEKIQQTNFYKQCINKFKNLRTIIDECLKDMISDSKNF
SHDYLVLNDRICYKEQDRVSFDINYGYKTLFAYFYEQEKGQISLKSLQENTFILLRCGSF
SYSEIPFQFENIIGVTGTLETLNDFEKNIVQKIFKITKSTFIPSVFGKNKRKFAQKDDTY
VESEDDYFKILREKIEKSLYRNEQKRAVLLFFETEQQLLKFYNSPELNDLKYNINIITEQ
ISNYNYVEKIKQLIKKSTIQGQITLLTSSFGRGTDFKCSDQQVLDNGGVHVIQTFFSSKK
SEEIQIMGRCARQGAEGSYSLVLLDSDLEKILGADYRKAIEQIRQNNNFYEVLDKKRNEI
ECLEYTNYHKYIDQIKQKHIEGQQYINSLVSQNENQVQEFLLKNNKGSNDIQNLIRILCL
VDGTSSMGLVLNKVKTEISVMLERSCQIIINSEKNIPEDCFQIQFAVYRDYDQMNEGILQ
VSPWESKAENLKQFLEQITPKGGEDYEEAIEIGLQHANQENSKYPLSAIILIADAPAKSL
SQIKNYRKKYGGEDYWKKTKFSQITDFQAEIEKIKKVKIPVHCFYLNYGAKENFTQISSQ
TGGKCESLDINSSQASQKLIQFVVEPILVNVGKQNGVGDSLYQKYLKIYSKSYIRVSE
NT seq
9537 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattttaattttattgacgaaaataataatgagcttaatcattagcgataatagaat
gcctagtaataaaattaagaggaaattaagaaatcttaattagaagatagactattaaaa
tatttagaagagctcgaattgagaaatgtcagctcaatttaaggagaaattgaagaagta
taaaaagaaattgaaaagtataaattgaaagataattaggctagagtatctgaaaaagaa
taaactcttgaaaaactgaatgagattcagtaaatgataaaacaattatgtgaaataaga
aattaataattagaatattaattaaatgaaatactttctgaattaaatatgagagatgcg
aatctattagcagaagaaataggagacgttaaatctgaattagaaaattatgaaatgaaa
aaaagaccaaaaaaagttgcagagaaaagaaaaactctagaaaagctaataaatgctcaa
taaatatattttgaaatataatactcaaatggagatccataaactattttagattagctt
tttaagtaacatttagaagaaaaattaagaataggtttgcaagagctaaaattagaagat
gttgattctatagaaatagtgatataagaagtaaaatcagaaatcaaatagctgttatct
aaaaaaaaataaaattaggcttctgaaaaaaagtgtaaccttgaaaagcttgagaatctt
taaaacattgcaaaagaattacattaattagattaatagttataaatcgattaaaagtca
aaaaagaaacaataactagaacaatagctggattaatttatgaaagaacttgagttagaa
gacgtttaataaatagaagaagaaatttaataaatattggaaaaaatagaaaaatattca
taaagaaaagaaaattccaaagtttcataagaagaataaactttatcaaagcttaaaaat
tgccaattaatatacttagacttatagaaactaaatgatgaggcaaatttaaataatagt
aatttaaaagaaattattaattaaaattcagaaatggaattagattttaccaattaaatt
tattaataggaggatcctaattaaagagataactaaattttggatttgaatacaaaattt
aatgttaaatatttaaaataagatgcttcgcaaataccttattctagcgaaaaactacta
actgaaatgctaatattttgtatagaattgttaacttctaatggtattaagattgctgat
gaatattattcttaagtcttaaattttctattagaaatagaaaatagattaaagatagaa
gattagctcggtccagaaatattatagtcaatatagtgtttaaaattaagcatagatcat
gataatttaaaataatttattgttgatacagaaaagctgcttaaaaaaattagaccttta
aatgtaaatgaaatgaatagactaattaatgaagctaataaggcatcaaatattatgaaa
ggataagacattatattatttttaggtaatactggggcaggtaaatcaacaacagttcat
tttttatctggatcaaggatggttaaattaaaaagcgaatttatagattacattggccca
gaccctaataaaatattaaacaagtctctttaaaaagttaaaattggagtttaagcttaa
tcagaaacacgttacattactcctgtttaagtgcattattaagatgtttaaatgaattaa
aaaggacattttatactttgcgatgtaccaggatttggagatactgctggacctgaagta
gatatcgcaaacggaatcggaatagtcgaggctattaaacagtgcaaaagtgttagacct
gtcattttattaagtttcaaaagcactggagacaaaggataagggataaaagatttagct
cacttgcttctagggcttatttaaaatccagatgataatttaagtctatttacttactta
tttacaaaatttcctcaagatgttgacataaacaaggaactgaaaaatatcaaaaaaagt
atagaagaatcctcagataaagcatttataagtctctttgaagatatgatttattaaact
gaaaaaggttgctgcagagtagaaccattaacaaatcagccttaagttttattaaagtaa
atacttaaaaaataaggagttgatgatccaagttagatcttcaaattttcaattacttaa
aactcgtaatctgtaatttaggattaagctttaaaaacacaataaatgattatttcagct
gtaagtagatgtgaatatgaattaataaattattaattaaataaattaaaatttttagtg
gatactttaaattaaaattctattaaataaacttatgaaaaatgcaaaaagctaatcata
gataattttaatacttattacaacaatgctatatcgtagcttgattaatctatttagaat
caaaataaattggatatttaatatctttattagttttaagatctagtaaataaatctaaa
aatttagaatagttaagaagctagcatttaggtaatgaagttatgtaatacgattctcta
atataacaattaaaactatcagtttaaaagatggcaaatgtttttaattaagatgataat
ataaccaaatttgcttcaaataatattgataacataaaacttatttctgaaatctttcct
gaaataaagtagtaatatggtaactcttgttaattaataatgaaaaaaattgaaagcctt
cttatactttgcaaacagacaataaaaaataagaattacgattaactttcaatgtagctt
tcataaataaaatcttaccaaattgaatttaaaaaccatctgaatgaataaagtataaat
gaagaattaaataatgtgaaaaaacaattttatgatatttttgttaatattattgaataa
tcaaaccacacgttagaaaaaaaagaattataaatataagatattgataacttaaataga
catttttaagattttggagatgttgaaaaaaatttgaaactgattcagcatttttcaact
gactaaatctcaaagtataaaaaaaatttcattaataatttggtaaaacattttgaaaaa
ataatcaaataaattgaagatacgcttaaattagaacctgagcaagcattctaaaaatta
gaaattttggtttattaaatgaaataatttagataaattaatacaatagatcatttgact
tctgataagtattataaatcaatctaagatgtggaaggtttaatgtaatcaataaagagg
tagatagattaatacttaaatgatttctaacatgataaaaaaaaagtagatttttaaaaa
gtttatagatgcttaatttagttaaaatctgctgagtggatggatggtgttcaaaaagga
atttatgaataaaagattaaaggtattactgatgaacttttcaaatattcacagttttaa
ataattacaaaattggtagatttagatttaagctgtaaaaactattaaaatatttctgtg
gcatctgagttgcttatagaaatggaaagaatgtaggtctttgaagaatttaatattaaa
ttaaaggaattaagagaaacagctgaaaaaaaattttcaaattccatcgaaagtgtgttt
aattagatcaaggaattaataagcaaatataataaatttttaaatttaagaatggaaggt
tccttcttaatttagccttaaaatactgaaacttcagaagaataagaagaagagaaggag
aatatataaaacaaaataaattcttcaaaatattgtttggcaaatgataattaaatacaa
taaaaaaagagtattaaatgctcaaaataaattatcaaaaataatattgtaaaaataaaa
agagaatcaaaaaggtttatacaaattgagcatcaaagtaaacttaagaataaataaaat
tttttccctattaaaattgatatgaactagattgaagactatttagtttatatcgaaaat
tgttgcacaagtaaatggataagattagatgcaaacactctaaaagataaactaaaataa
ttgttggtctaatatggaaattctttaaaagttcaaatataataatatttttaaataatc
acagaagcaaatgaataaaatgataatgagaagtctttggcatcttaaaagctagctaca
taagctcaagagctgatggagctataaaattataaaatgacttgctagctagtctaagga
ggataaatacttaaagatttaaaaaatttaatgcaataacattatttagaactgtatgat
taactgaactagacttcattagaaaaataattttaagcgcaaataataaggattataaag
taactaattcacactgaaaatatccttggcgataataagttttataacctttataagaat
cagtaaattgaaataaataatgaatataaaggaatttattaaaaaataatagagtaaata
gaactaaattaatattaaaatgcatcttttgaattgttgtcaatagatgataaatctgct
aatgaaaaagctatgaaataaataagattaacgcttgtaacctcagtagagctgttactt
gataaagcttaagataaacaatcgtatcttgaaaatcaaattcaaaaagatttgataaat
caaattgtttaaattattgaataaataaaaaaggcaaagtaatgcttgtaagactatttt
gaaaaagaatttttagataacgtagatagataagttgattaaatcattattgatatttaa
aataaaatagagcaatatttagagagtatgtctgctcatgtaaagcaattagattttttt
taagtagaggaaaagagagagcacataatgtagattatattacttctgtctcgctataat
agctaaacaaaagaagagataaacaaaaagctaaattaattgcaaaaagagctcgaagaa
aaagtaaaacaaattacttaaatcgattataatgattaaaataatttaatacataaacct
ccaaaatttatcttagaaaagctcagtaaagtctcatcaagaaatattaaatatgctgaa
tgttatgataaattaaataaaattttgatagatagagtaagcaatagtattctggattat
caaaattcaatataataagaacaaaattagaaagaacttaaaatttaaactctcataaat
tctctaccagatgatttaaaactataatcataagattaatttaatagtgtgaagcaattt
attaaataaaagaatgatgtttttgaaaaagattttaaataagcagaaaaaagcaaagac
ttagataaaaaattaaagtttatggaataatgtagctaagaaaaaatgttttcattttaa
gataaaatgagcaaataaatacaataagagtgctaaaagtattcttcttaactaacagat
tatctaggtaaaaatgaaattaaagaaagtatttaataagcaattaagttgttagagaat
aaaaataaatttttagattataaaaagaaatttggagaagaaaaagatagaattgaagag
ttcgaaaaaatgtattcagaacttgaaaaagctatttcatccaattacgaaagcgctcgt
agggctatctaatcggatatatcaatgagctttgaaagtttaaaggctattaaaacaata
gaagactaggattcctaccaaaaagaatatgataagctttaaagtttcattataaatctt
aaagattatgaaaaatatttccttatcaatgatttcaataccaaaataaaaagtttaggc
tttgaaatttataatttttttgaaaaaatctttaaaagttttaatgataacttaaaggac
atgaagatcaagaaaattaaataagatcttttacttataagtaaatgggagaatttcata
taaaaaatagttatggatgtaaaaaaataaaatattttcactgaataattcttaaatgac
tattaaataacataatttaaagaaaaatatcatagttataaagattgcatagaaaaattt
ataaattagatataagaagtaaaataaaatgtaataaattttaagttctaagatgattat
taaatgcattcttaacattaagaactgaaaaaagatgttaatattctaatacaattaaaa
gaggaaaaaatagatttttaaagtactcaacttgactatgaatgctatgaaaaagagtgt
ctcccaaaattaataagtaaaattgaagaattttaaaaagaaatagagataattttggaa
agctaagagaaataattttcagaaaatgaattcaaaatgtttaataagtattatgataat
ttgaattaatttaatgaaaatgttaaaaatttaaatattgatattgaatattacaaaagg
agaatcagttaaaaattagaataaaaaatagaaaatttattttagagcatagatgttacc
taaattgatagtgttgccaaaagtttgattttgataaagacttactctgaaaatatacct
tcatttaaaaagaattttgattgtcgattagatatttggatcaaaaatatctattttaat
gaatttaaaggaatgaaattagcttagctcgtaacacatttataaagagaaaaaactggt
ataggaataattataattgaagaacacgatatatttaaacaataatccatatctatcttt
aataagtaagtaaaagagtaaggaattaaatatgttttagaaaacattaaaggtgaagat
ctgaataaagaaaaattagataatgtttacaataaattcttaaaataatatgaagatatc
gtttaaaataatatcatttgcatagaaaataagagtcaatctgaaaagatagttattgaa
tctttagcttacaaagttaaaagctttgccaaaaaaatagaattaaaaaataaatagata
aaatgggacaattctgtaagacaaaatattccatcacttatggctcatatatttgcttta
tggacatttttgaatatggaatatttcaaagagttaactcatatggcaaaggaagagaaa
gaaacttacttattttcacctcatgcaggataaattatatcaatattccgtttattagga
ttggggtattaaactgatggcttataaaataattttatttaaataggaactggagaagga
aaatctattgtattagcagttactgcaataatatttgcactgcatgaagttgatgtatat
tgtgcttgctatagctagtaccttagtgaaagagattatgaaagttttctaaaattattt
aatattttaggggttatacaaaatataaagtatggagcctttactaaaatatgtgaacat
ttcataaatcaatagggagatattcgttagttaacagcggattacatatgtaatggcttt
tctgaaaataagaaaaagactaaaaaaacaacgaaaaatccaagcatattaattattgat
gaggtagatgtattctttactaaggatttttatggaagcatgtataatcctgtagctcgt
ttgcaagatgaaaatattgtaaagttagctgaatttatatggtaatcaagaaaatagcat
ttgtttttggaaaaaatttaataaacaaatttttacaaataatgcataaataaatttaaa
aatttgagaactattatcgacgaatgtctaaaagacatgatttcagattctaaaaatttt
tctcatgattatttggttctaaatgatagaatttgttacaaggaataagatagagtgtct
tttgatattaattatggctataaaactttatttgcttacttttatgaacaagaaaaggga
taaataagtttaaaaagtttgcaagaaaatacttttattttattacgatgtggtagtttt
tcctactctgaaatacctttttaatttgaaaatattattggagtaacaggtactttagag
actttgaatgattttgaaaaaaatattgtctaaaagatttttaaaataacaaaaagcaca
tttattcctagtgtttttggtaaaaataaacgtaagtttgcatagaaagatgatacatat
gttgagagcgaagatgattactttaagattctgagagaaaaaattgaaaaaagtttatat
agaaatgaataaaaaagagctgttttattattctttgaaacagagtaatagcttttaaaa
ttttataattctccagaattaaatgatttaaaatataatatcaatattattactgaataa
atttcaaattataattatgtagaaaaaattaaataactaattaaaaagtccactatctaa
ggttaaataactcttttaacttcttcatttggtcgtggtactgatttcaaatgttctgat
taacaagttctagataatggcggagttcatgttatctaaactttcttctcaagtaaaaaa
tctgaggaaatctaaattatgggaaggtgtgctaggtaaggagcagaaggatcctatagc
ttagtacttttagattcagatttagaaaaaatattaggagctgactatagaaaagcaata
gaatagataagataaaataataatttttatgaagttttagataaaaaacgaaatgaaatt
gagtgtttagagtatactaactaccataaatatattgattaaattaaataaaagcacatt
gaaggttaacaatatattaattcccttgtttcttaaaatgaaaattaagtttaagaattc
ttattaaaaaataataaaggctctaatgatatacaaaatttaatcagaatactatgctta
gtagatggaacaagttcaatgggacttgtgttaaacaaagttaaaactgaaataagcgtt
atgcttgaaaggtcttgtcagataataataaatagcgaaaaaaacattcctgaggattgt
ttttagatataatttgcagtttatagggattatgactaaatgaatgaaggtattttataa
gtatctccatgggaatcaaaagcagagaatttgaagcaatttttagaataaataacgcct
aaaggaggagaggattatgaagaagctattgaaataggattataacatgcaaattaggaa
aattcaaaatatccattatcagctattattttaattgcagatgctcctgcaaaaagctta
tcttaaattaagaattacagaaaaaaatatggtggagaagattattggaaaaaaactaaa
ttttcatagataactgatttttaagcggaaattgaaaaaatcaaaaaagttaaaatacct
gtgcattgtttctacttgaattatggagctaaggaaaattttacttaaatttcgagctag
actggaggaaaatgtgagagcttagatattaattcttcctaagcttcttagaaattgata
tagtttgttgttgaacccattcttgttaatgtaggaaaataaaatggagtaggagattct
ctctatcaaaaatatttaaaaatatacagcaaaagttatatcagagtgagtgagtga
DBGET
integrated database retrieval system
