Tetrahymena thermophila: TTHERM_00538930
Help
Entry
TTHERM_00538930 CDS
T01020
Name
(RefSeq) cyclic nucleotide-binding domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
cNMP_binding
Ion_trans
Ion_trans_2
zf-CCHC
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7839137
NCBI-ProteinID:
XP_001007917
TGD:
TTHERM_00538930
UniProt:
I7LU08
LinkDB
All DBs
AA seq
1335 aa
AA seq
DB search
MEDINRITIYQSSQNQTSFQTNQLLKQGGQRDEQEQNELRLKMQTMHDKLKGQTKIGRSL
NGDHGNDPPSFKSIEDFEFINQLGQSEHQPKNRFQLGKQSINAKEMNSNSDFDDISIQKG
IFQQKQEDDEKQQLGQDLKLAFSEDSPQNMLSYDFNRNDLVVSPQSEKLQQSLNKYNESS
EDSSKYKTHQNIEMNNFSMLSGKNLMRQDNGNEQKKKFNFQQEINSLFFKNIKSKSKSKQ
GVLNKLICCIKPKKKFKNYKRSLTFFENLQLNQTQKQNRIQFKIFKFASAIKQRHLKKSL
NDVDTGNLQLISDLSYYQQNYNQVSFKAYKNSFLRAFIIKYQQIKSLIIDSFKEEVIPIK
IFMPTSSAIVLWDLLQITMTYLFLFLYSIEVFFAQNETTNLFMVTFFEIILSITLIDILK
KFNTSYFEKDQIIQIRSKIIFKYITSSIFITDVISLSTILFKLKYRNKEISYNPNNSLYL
YLENFLIFLLLNRALKQKKLLQSIITLEQSQKHLFWLFSQVLNVVTVTHIVSIAFYMLGI
YEDSNNFQVSWLQKYGITNLEYYDRYIYSIYWAVTTMTTVGYGDITATNSSEALFISIAL
IVFSCVYAYSINNIGFILQEIERSSKKLNENISIIQRYLNRKNVDIQLKTRVRFYLSFLE
QESKNRDKQAEDKIIGTLSNQLREEITQQINSKILQDQNIFKNNFSHKINKSIVFIMEEV
LVTPNEIIFQENDTNDQSIYFIQNGIVEIYSDCYRQDKETSCKVYQTITQNQFFGEISFF
SGLARSASARSVNLTTLYRIKRDRFIDLVKTSEYDFERFKMIQEKIAIHGNLSCLYLKCY
SCKKIGHLASNCPVTHPFFDKQFIFLKNNFSEIQERQPNYLRAEKTKQLKPIIQAKKNIQ
ICKKLKDLCRNLNSRTQFLYNITSDEDEGLTFDTDSLLSQDAQSSKFGQEIKSFAKQTTD
LSQKIENKQIQKLIKSNQDEISIIEKQIGLIKQNSALNDQVSNNCANNYDLQQINNNFNI
SPDTQYFSKVEQIVSVLKKQNQLYNSLANENAKENNQKQGQFIKSRSDFKNYLNSKQVNF
NKQNTQNSNQDPKNQIFFQKKISKELLDDQDVFFLSPQIIKVQSNIQQNNKKEQPSLSAT
SFKIFEQQIQQQEKGEENPSKNQLNRIKSSEYKGNRSLTKLSSSKQTNLQFKNQTNQLTQ
EFASEKMRNSQKTSNNLIRSHDYSQYSKFYSQQDFFEQIQMYDFERVKIYKKFFPHNNID
RVITTLKKIQTQQKKERFKKNLERRRQIIFALDHIQNRLICETPSKNNVRQKKKELTSLS
YGVTLKQKEQLKQVV
NT seq
4008 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagatattaatagaattacaatttattaatcttctcaaaactagacatcttttcaa
acaaatcagcttttaaagtaaggaggctaaagagatgaataagaataaaacgaactcaga
cttaaaatgtaaacaatgcatgacaaattaaagggttaaactaaaattgggagatcactc
aatggagatcatggaaatgatcctccttcttttaaaagtatagaagattttgaatttata
aattagcttggttaaagtgaacattaacctaaaaatagattttagcttggcaaataatct
ataaatgctaaagaaatgaattctaattctgattttgatgatattagcatttaaaaggga
atattctagtagaagtaggaagatgatgaaaaataataactaggtcaagatttaaaatta
gcttttagtgaggattcgccataaaatatgctttcctatgattttaatcgaaatgatctt
gttgtttctccataaagcgaaaaattacaataatctcttaacaaatataatgaatcttct
gaagattctagtaaatacaagacccattaaaatattgaaatgaataattttagtatgttg
agtggaaaaaatctaatgagataagataatggtaatgagtaaaagaaaaaatttaatttc
taacaagaaattaattctctgttctttaaaaatataaaatcaaaatcaaaaagcaaacaa
ggtgtgttgaataaacttatttgttgcataaaacctaaaaaaaagtttaaaaactacaaa
aggagtttaacattttttgaaaatctttagttaaactaaacataaaaatagaatagaatt
taatttaaaatatttaaatttgcttcagcaattaagcaaaggcacttaaagaaaagtcta
aatgatgtagacactggtaatttatagctaattagtgatttaagttactattaacaaaat
tataattaagtatcatttaaggcttataaaaattcttttctaagggcttttattataaaa
tatcaacagattaaatcattaataattgatagttttaaagaagaagttattcctatcaaa
atttttatgccaacaagctcagcaattgttttatgggatttgctttagattacaatgaca
tatttatttttgttcctttactcgattgaagtgttttttgcttaaaatgagacaacaaac
ttgtttatggttaccttttttgaaataatattatcaataactttaattgatattttaaaa
aaatttaatacttcatactttgagaaagattaaattatttaaataaggtcaaagattata
tttaaatatattacctcaagtatctttataaccgatgtaataagtctttccaccatcctt
tttaagttaaaatatagaaataaagaaatttcatataatccaaacaatagcctctatttg
tatctagaaaattttttaatctttttactccttaacagggctttaaaatagaaaaaatta
ttgcaaagcattattacattagaacaaagtcaaaagcatttattttggcttttttcgtaa
gtcttaaatgtagtcacagttactcacatagtaagtatagcattctacatgttaggaatc
tatgaagattcaaacaacttttaagtctcttggttataaaaatatggaattacgaattta
gaatattatgatagatatatttattctatttactgggcagtaacaacaatgacaacagtt
ggttatggtgatattacagcaacaaactcttcagaagcattgtttatttctatagccctg
attgttttcagctgtgtatatgcttattctataaataatattggttttatcctttaagaa
atagaaagatcatcaaaaaagttgaatgagaatatttctattatataaagatatttaaat
agaaagaatgtggatatttagctgaaaactagagtaagattctatctcagttttttagaa
taagaatcaaaaaatagagataagtaggctgaggataagattataggtacattatctaac
tagcttagagaagaaatcacctaatagataaattcaaaaattctgcaagattaaaatatt
tttaaaaataatttttcccataaaattaataagagtatcgtttttattatggaagaagtg
ctagttactccaaatgaaataatatttcaagaaaacgatacgaatgattaatcaatttat
tttatctaaaacggaatagttgaaatatactcagattgctatagataagacaaagaaact
tcttgtaaagtatattagacaattacataaaactagttttttggtgaaatttccttcttt
tctggtttagcaagaagtgcttctgcaagaagtgtgaatctcactactttatatagaata
aaaagagatagatttattgatttagtaaaaactagtgaatatgattttgagagatttaaa
atgatataagaaaaaatagctatccatggaaatttaagctgcctatatttaaagtgttac
tcatgtaaaaaaataggtcatttagcttctaattgccctgtaactcatccattttttgac
aagtaattcatattcttgaaaaataatttttctgagatttaagaaagacaaccaaactat
ttaagagcagaaaaaacaaaataactgaaacccataatttaagctaaaaagaatatccaa
atttgtaaaaaattaaaagatttatgtagaaatctcaatagtagaacataatttctctac
aatattacttctgatgaagatgaaggattaacttttgatactgacagcttactatcttag
gatgcttaatctagtaaatttgggtaagaaataaaaagttttgcaaaataaacaacagat
ttatcttaaaagatagaaaataaacaaatacaaaaactcattaaatctaattaagatgaa
ataagtataatagaaaaacaaataggcttaattaaatagaattcggctttgaatgattaa
gtttctaacaattgtgctaataattatgatttataataaattaataataactttaacata
tctcctgatacacagtatttttctaaggttgaataaatagtttctgttttaaaaaagcaa
aattagctgtataatagtctagctaatgaaaatgctaaggagaataactaaaaataaggt
taatttattaaatcaagaagtgattttaaaaattatttgaattcaaaataagtcaatttt
aataaataaaatacttaaaattcaaattaagatccaaaaaattaaattttcttttagaag
aaaatatcgaaagagttactagatgattaggatgttttttttctatctccataaatcata
aaggtttaatccaatatataataaaataataaaaaagaataaccttctttgtctgcaaca
agcttcaaaatatttgagtagcaaatataatagcaagaaaaaggagaagaaaacccatct
aaaaattaattaaacagaattaaatcaagcgaatacaagggtaatagatctttaactaaa
ttaagctcaagtaagtaaacaaatttgtaatttaaaaattagacaaattagttaacgtaa
gaatttgcttccgaaaaaatgagaaacagttaaaaaaccagtaataacttgattagatct
catgactattcttaatattcaaagttttattcttaataagatttttttgagtagatttaa
atgtatgattttgagagagtaaaaatatacaaaaaattttttcctcataataatattgat
agagtaataacaactttgaaaaaaatttagacttaataaaaaaaagaaagatttaaaaaa
aacttagaaagaagaagataaattatatttgctttagaccatatttaaaacaggttaatt
tgtgaaacgccttctaaaaacaatgtacgctaaaaaaaaaaggagcttacttcgttatca
tatggagttactttaaagtaaaaagaatagctaaaataagtagtctga
DBGET
integrated database retrieval system