Tetrahymena thermophila: TTHERM_00540160
Help
Entry
TTHERM_00540160 CDS
T01020
Name
(RefSeq) LRR and IQ domain protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_9
LRR_8
LRR_4
IQ
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7832533
NCBI-ProteinID:
XP_001007941
TGD:
TTHERM_00540160
UniProt:
I7LU12
LinkDB
All DBs
AA seq
1427 aa
AA seq
DB search
MSLNKNIDSLQEGNVTIQKTNVLASRIQEPLKLKILILQGTEIMVKELENIKQCSNLIKL
DISSNKIQSFPKNVSFKNLTSLKLLYLHNNLIDDAESLYKVFEIPNLMYLTIFNNPLSTK
WSLRHFVVNSMPKLFALDFNAISDEERMEMISKTDRFYALSPSTKINWPLISIPSETVLQ
DDDYLLLMREEIKIIIKKYSENSPVVIIQRIWRGYVCRKQLKSKLKTAEDRLQMSLRVSQ
HWKKHTMRKLTLKTLLQERGKEYLLYEKKSYQFHRSLDMLKKLFRDYLHRFRIKKQMQMA
ARIILKAFKKMKQFLNSYQQVLFPQPALPQSSTKSNQMTPANKFQSSQYKQNQKNSNLNM
QIQNSDNNNNNLQPNQIIIYFHRDQVREFSKIFNDCYKYIQNQDQAQSIYEDIKKNLFSK
YVKKAEKVLGFRVIESQESKNHIYYSKYPFNALMRPSLRSKVLFTKTDQKYYEMQYHPFF
NRFHSYISLPNMDRELKKQIMTEKDWEKFNYLCNKLRRFQQKEYECLMEFQCPDPSIATA
FTKQVISYNYIAFHGSEEESQNQVRDLYKEQEDQLRNKNRSNELEETNFLTSVADQAEQI
LPKNQESLQQKKNQKKPLFLVFFKNYLIQVSAAVKIQKIWRYHKSKPQQIQVFAIIQQKR
ACSKLQHWFRNIKWYHKRSFYSQLSYYVHQQINTNTLFLHYSTYEELPKIYQKTLQKKTL
TFKEQDNMIQYSPLKGTARLTWNFDNQEQQKFIELQKRIFPKWLKLTADSNTKEMSDEEY
CGDIMHLIHVSTKIGLLQIGGMKYLKIEFASLQEAKYRAAALALITYRFRNNGYFIKLFT
YSQISNYTFILSEETELKATYDINLKYDQNRCLAKEEKSINNPNSLFLSSQNKIEFNSKA
SKICQMSQVESLVTYKETMIPLLQKKSTQKLSNTKKQKPLQKLEQEFNLFYNDQIYIYKP
QNNQVLLSGKNLNEQIKVQIEAQNIELPNKRGLPQLQNENFDFSKRGLPVTTNDTSTKYA
KSEFDSTVISFYKGNQVNPLSTSHSRYRSKPLLDNSLNNIVTDVTLLKDQQRCLSRDFQV
LLKEREEQSIIAKQKGIQDSKKRSYLIKEIKNMDKLIHQNEQKEITNIEKKNREFTKEVN
MKIDIEQKLQRVEILKQIGMQTKSEEMWVQNFNRSQNYLVRQMTQMNKKKAQDDLIKRNV
EKANKVREKKLLGTSQQNRTQSSHHRNRTESSFCSSSSNQNNFMLASFQDFENQQRGKIA
SRGGDRTTSLQPAQNQQQQNPSLVQLGVYQNAKPPSNNKKNVKRLNTSSDVMYRTTTNAS
NPLDTITGLNTEPNEIQNIISLESTFYGMNQVYNKNQKLFTEGDEKSLGIHTSNSKNSKK
ITLKRSLDKGLKTQTQFNNKIVHAVFPEEFYPISTGSNQIKLNIQNF
NT seq
4284 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtttgaataaaaatattgacagcttgtaagaaggaaatgtaactatttaaaaaaca
aatgttttagctagcagaatttaagaaccactcaagctaaaaattcttattctttaaggg
acagaaataatggttaaagaattagaaaatattaaataatgctcaaacttgataaagctc
gatataagtagcaataaaatatagtcttttcctaagaatgtttcattcaaaaatttaaca
tctcttaagttactttatcttcataataatttaattgatgatgctgagagtttgtataag
gtctttgaaatacctaatttaatgtatcttactattttcaacaatcctctatcaactaag
tggtcacttcgtcactttgttgttaattctatgcctaagctattcgccttggattttaat
gcaatttctgatgaagaaaggatggagatgatatcaaaaactgatagattttatgctctt
tctccttctacaaaaataaattggcctcttattagcatcccctctgaaactgttctctaa
gatgatgactatctcctcttaatgagagaagaaattaagattattattaaaaaatattca
gaaaattccccagttgtgataatataaaggatatggagaggctacgtttgcagaaagtag
ctcaaaagtaaacttaaaacagctgaagatcgcttacagatgtcgttaagggtatctcag
cattggaagaaacatactatgaggaagctaactctcaaaacgttattataagaaagggga
aaggaatatttattatatgaaaaaaagtcatactaatttcacagaagtcttgatatgctt
aaaaaattgtttagggattacttgcacagatttcgtattaaaaagtaaatgtaaatggca
gctagaattatattaaaggctttcaaaaaaatgaaatagtttttaaattcatattagcag
gtactctttccttaacctgctcttccataatcttccacaaagtcaaattaaatgacgcct
gctaataaattctaatcatctcagtacaaataaaaccaaaagaactctaatttaaatatg
caaattcaaaactcagacaataacaataataatttataacctaactaaataattatttat
tttcatcgtgattaagtgagggagtttagtaaaatatttaatgattgctacaaatatata
taaaattaagattaagcttaaagtatttatgaagatattaaaaaaaatctattttcaaag
tatgtaaaaaaagctgaaaaagttttgggatttcgtgtaatagagagttaggaatctaaa
aatcatatttattacagtaagtatccgtttaacgctttaatgcgtccttcattaagatca
aaggttttgttcacaaaaacagatcaaaaatattacgaaatgcaatatcatcccttcttc
aatagatttcatagctacattagtttgcctaatatggatagagaattgaaaaaataaata
atgactgaaaaagattgggagaagtttaattatctatgtaataaactaagaagattttaa
taaaaagaatatgagtgccttatggaatttcaatgcccagatccgagtatagctacagct
ttcacaaagcaagttatatcatacaactatatagctttccatggttcagaagaggaaagc
taaaattaagttagagatttatataaagaataagaggatcaattaagaaataagaataga
tcaaatgaattggaagaaaccaattttcttactagtgtagctgactaagctgaataaatt
ttacctaagaatcaagaaagtttatagcaaaaaaaaaattaaaaaaagcctcttttttta
gtgttttttaagaattatttaatttaagtatctgcagctgtaaagatacaaaaaatatgg
agataccataaaagcaagccacagcaaatttaagtttttgctataatacaacaaaaaaga
gcttgcagtaagcttcagcattggtttcgaaatataaaatggtatcacaaaagatccttt
tacagttagctttcatactacgtacattaacaaattaatacaaacacacttttcctgcat
tactctacttatgaagaacttcctaaaatttattaaaaaactctccaaaagaaaactcta
acgtttaaggaataagacaatatgatttagtactctcccttaaaaggaacagcgagatta
acttggaattttgataattaagagcaataaaaattcatagaattataaaaaagaattttc
ccaaagtggttaaaattgactgcagattcaaatactaaagaaatgtctgatgaagaatat
tgtggtgatattatgcatttgattcatgtttctacaaaaataggattattgtagattgga
ggaatgaagtatcttaaaattgaatttgcttccctccaagaagctaaatatagagcagca
gcccttgctctaataacatatagatttagaaataacggatactttattaagctctttact
tattcataaatatcaaactatacatttatactttccgaagagactgagctcaaagcaacc
tatgacataaatttgaagtatgactaaaatagatgtcttgcaaaggaagaaaaatctatc
aacaatcctaatagtttattcttaagcagccaaaataaaatagaatttaattcgaaggct
agcaagatttgctaaatgagctaagttgaaagccttgtcacatacaaagaaactatgatt
cccttgctctaaaagaaatccacttaaaaactgagtaacacaaaaaaatagaaaccactt
taaaaactagaataagaattcaatttattctataatgattaaatttatatttacaagcct
caaaataattaagttttacttagtggtaaaaatttaaatgaatagataaaagtttaaatt
gaagcttagaatattgaattgcctaataaaaggggacttccttagctttaaaatgagaat
tttgatttctcaaaaagaggtttaccagtaactactaacgatacttctaccaaatacgct
aagtctgaatttgattcaacagttataagtttttataaaggaaattaggttaatccttta
tcaacttctcatagtagatatcgcagtaaacctctcttagacaactctttaaataacata
gtcactgatgttacacttttaaaagaccagtaaaggtgtctaagcagagatttccaagtt
ttactgaaggaaagagaagaacaaagtataatagcaaaataaaaaggaatttaagatagt
aaaaagagatcttatttaataaaagagataaagaatatggataaactcattcactaaaac
gaataaaaagaaattaccaatattgagaagaagaacagagaatttacaaaagaagttaat
atgaaaatagatattgaataaaaactgcaaagagtcgaaattctaaagcaaattgggatg
caaacaaaaagtgaagaaatgtgggtgcagaattttaacagatctcagaactatctagtt
cgctaaatgacttaaatgaataaaaaaaaggcttaagatgatcttattaagcgaaatgtg
gagaaggctaataaggttagagagaaaaaattgcttggaacatcttaacaaaacagaact
taatcatcacatcatagaaatagaacagaatcatcattttgttcaagttcaagcaatcaa
aataattttatgttggcaagcttttaagattttgaaaatcaataaagagggaaaattgct
agcagaggaggtgatagaactacatccctttaacctgcataaaatcaataataataaaat
ccgtctttggtttaacttggagtatactaaaatgctaagcctccttcaaataacaaaaaa
aatgttaaaagattaaatacctcaagcgatgttatgtatagaacaactacaaatgcatca
aatcctttagatacaattactggtttaaatacagaaccaaacgaaatatagaatattatt
agcttagaatctactttctatggaatgaaccaagtttataataaaaactaaaaacttttt
acagaaggagatgaaaaatcactaggtatccatactagcaatagtaaaaacagtaagaag
ataacgctaaaaagaagtttggataaaggtttaaagacataaactcaatttaataataaa
atagtgcatgcagtatttccagaggaattctatccaatttctacaggatctaattaaata
aaattaaatattcaaaatttttga
DBGET
integrated database retrieval system
