Tetrahymena thermophila: TTHERM_00558490
Help
Entry
TTHERM_00558490 CDS
T01020
Name
(RefSeq) pumilio-family RNA-binding repeatprotein
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PUF
PUF_NOP9
MA3
ParE_toxin
UTP15_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7838130
NCBI-ProteinID:
XP_001022411
TGD:
TTHERM_00558490
UniProt:
I7LWM5
LinkDB
All DBs
AA seq
906 aa
AA seq
DB search
MDDKDKQSFLLKQPQFKVYQHAELFNGIQKKPEEGELLMGGILDGDGEDDILALRNSAKS
APPDLYLQQKASLQQQENDYLYTKDYFDYYKQSNNPRLQKPLYRHDQLDIKSLNKQMNKL
SIDDSTQYKQSITNAELIQSIGNSTPPPYQQVPQMIYPQQQQIIMGQANEIPPIQGSGSP
APMIMMPPNQMIQPPINLQQPPPTVAQNFKNPPNHQFLQQPRPQNQYNKYNQGNMQHQQG
IKKTKSYQQQGFQGSSQQNMHHNNGQPFQQPPQFLNQSFPMMFQAPPPNLGAPNQMQQFI
PLGMQQPIQQFPYQQNMMFQQQGYGPNYPNMNYQNQMSMSYPQNQNIGNNGMQNNIINPQ
NPNINNNSNNNNNLSNSPGNNNNNQINGGGINNNQNNQNNINVGNNNIMSQNMGNKNNSQ
NYNMQNNNRNQQGMNLGGKKKQLNQPNGHIIQNQFMQSNQNVSNNNPNQVQNLGKSSSTD
SSNQNFNQLFPDLIESCKDQNSSRTIQKQFENSTIEEKNKIFERIQPEALNLMKDQFGNY
VIQKLFEKGTIEHKEKLYYIIKGNVEQLSLHTYGCRVIQKALEELKERPQMQEGLIQELN
NKIMTCIQDQNGNHVIQKCFETLSSSKLTTIINEVIQNIEELAFHPYGCRVIQRILEFCS
NPETKKIYEKLMTNLIRLCECQYGNYIIQYIIEKGQKLEKDEILQVVKVHFVDLSLNKFA
SNVTEKSIVYSDEEFKAGVLDVLLRPNNQNHLDTGIVRLTKNAFGNYVVQRLYEKAQHET
KLRVCQYLLQNNDVYNEVISNSFGKHVLSYIEKHRVDIPMNQIQQNVGNIQNQNMNNNNN
SGPMNNNSNNNNNNNYNNNSNNNNGYNHHNNNNNNHHSQHHNNQNNNNNHINHNNYKKNY
NSNNHY
NT seq
2721 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacgataaagataagcaaagcttcttattaaagtagccgcaatttaaagtctactag
catgccgaactcttcaatgggattcagaaaaaacccgaagagggtgagcttttgatggga
ggaatattagatggagatggagaggatgatatattagctcttaggaatagtgcaaaatca
gccccacctgatttgtatttgcagtagaaagcttctctataatagtaagagaatgattat
ttatacacaaaggattactttgactattacaaacaatcaaataatccgcgtcttcaaaaa
ccactttatagacatgatcagttggatataaaaagcttaaataagtagatgaacaaatta
agtatagacgattcaactcaatacaaacaatctataaccaacgcggaattgatttaaagc
ataggaaattcaacccctccaccttattaacaagtaccataaatgatatacccttaacaa
tagtaaattattatgggataagcaaatgaaataccaccaatctaaggatcaggaagccct
gcaccaatgattatgatgcctcccaaccaaatgatacaacctcctattaacctttaatag
cctcctcctactgtagcttaaaattttaagaacccaccaaatcatcagtttttatagcag
ccgcgtccccaaaactaatacaataaatataatcaaggaaacatgcaacattaacaagga
ataaagaagactaaatcttatcaataataaggattttaaggatcaagctagtaaaatatg
catcataataatggttaacccttttagtaacctccttaattcttaaattaaagcttccct
atgatgttttaagctcctcctcctaatttaggagctccaaatcaaatgcaacaatttatt
cctctaggaatgtagcaacctattcagtaattcccataccaataaaacatgatgttttag
caataaggatatggacctaattatcccaacatgaactattaaaattaaatgagcatgagc
tacccatagaattaaaatataggaaataacggtatgcaaaacaacattataaacccctag
aatccaaatatcaacaataatagtaacaacaacaataatttaagcaatagccctggaaat
aacaataataactagattaatggtggtggaattaacaataattaaaacaattaaaataac
ataaatgtgggtaacaataatattatgagctaaaacatgggaaataaaaacaattcataa
aattacaacatgtaaaataataacagaaattagcaaggtatgaatttgggtggtaaaaag
aaacagttaaattaaccaaatgggcatattatttaaaaccaattcatgtaaagcaatcaa
aatgtcagcaataacaatccaaattaagtttagaatttgggaaagagttcctcaacagat
agttcaaattagaattttaattagctatttccagatttaattgagtcttgtaaagattaa
aatagctcaaggacaatacaaaagcagtttgaaaattctacaattgaagaaaaaaataaa
atatttgaaagaatctaaccagaagcattgaatttaatgaaggattaatttggaaattat
gtcatttaaaagctatttgaaaaaggaactattgaacataaagagaagctctactatatt
ataaaaggaaatgtagagtaactatcccttcatacttatggttgcagagttatataaaag
gctttagaggaacttaaagaaagaccataaatgcaagaaggattgatttaagagctaaat
aacaagattatgacttgcattcaagattaaaatggaaaccatgttatttaaaaatgcttt
gaaaccttaagttcttcaaaattgacaacaattattaatgaagtcattcaaaatatagaa
gagttagcattccatccatatggatgtagagtcattcaaagaattttagaattctgtagc
aatcctgagactaagaaaatatacgaaaaacttatgaccaacttaattagattatgcgaa
tgccaatatggaaattatatcattcagtacatcattgaaaaaggataaaaactcgaaaaa
gacgaaattctttaggtagtaaaagtccatttcgtagatctttctctcaataaatttgcc
tcaaacgtaacagaaaaatctattgtttattctgatgaagaattcaaagctggagtattg
gatgttttattaaggccaaacaatcaaaaccatttagatacaggtatagttaggttgaca
aaaaatgcctttggtaactatgttgtgcaaaggctgtatgaaaaagcataacatgagaca
aaactaagggtttgctaatatttgttataaaataatgatgtttacaacgaagtaatctca
aatagttttggaaaacatgttcttagctatattgaaaagcacagagtagatatccctatg
aatcaaatttagcaaaatgtaggcaacatacaaaattaaaatatgaataacaataataat
agtgggcctatgaataataatagcaataataataacaacaacaattacaataataacagt
aacaacaataatggttacaaccatcataacaataacaacaacaaccaccattcatagcat
cataataattaaaataataacaataatcatattaatcataataactataaaaagaattac
aacagtaataaccattattga
DBGET
integrated database retrieval system
