Tetrahymena thermophila: TTHERM_00564310
Help
Entry
TTHERM_00564310 CDS
T01020
Name
(RefSeq) Vps52/Sac2 family protein
KO
K20298
vacuolar protein sorting-associated protein 52
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tet00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
tet04131
]
TTHERM_00564310
Membrane trafficking [BR:
tet04131
]
Protein recycling
Others
EARP complex
TTHERM_00564310
Endosome - Golgi transport
Tethering complex
GARP complex
TTHERM_00564310
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Vps52_C
Vps52_CC
Sec3_CC
Nup49_C
DUF1664
GCN5L1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7842545
NCBI-ProteinID:
XP_001022030
TGD:
TTHERM_00564310
UniProt:
I7M9H9
LinkDB
All DBs
AA seq
713 aa
AA seq
DB search
MDSQNNNQEDKKNKSSLFSDATLDPITQRYIHSKYKLAEGEQNFANIDLRNMCENVVDEL
ETLESEAAYDYLKVENEMKDLDVEIDKSDSILSELEKVLENFRDHLNEIKSQMTVLQERS
LKMNISLTNRKNLQKLMNTFMDSAVLDPKLIDAINSAPIDQAYVQHIKVLCQKLEYLQNT
KLPDASVVKELEPELNKLKNKACGRVRQFLLDKIDILKKPTTNIEIQQKNVLLDYRVFTE
FLKCHYEEIYAELCNKYAEVMSKVYSQLFEKNVKELQKLWVELYNKSDTLVCDNASNMRT
FITIKNGGKLVDVYPDKNKSIFDLMDRDLILKNERLNDGFIFYASASKENQRFTIEQIFR
SMSKLILSTVVSEIAFSSQFFNLTNAQNSKIFKEIFSQTFKSLYNFLQTMLTESYDCNGM
VLIILINESYQREYSEMYAQSQVLQEYFNYINMLVWPRFEKVFEGHCQSISEKNLKQYKL
LEKQFSFKPIVQRYADIIISFYRLYSYFQDNKMIFIRIEKLRKDFINMIKKNAQDIGKGI
DRCKYLLLIYDLIFTNIPTKKEYQKEITEIEKEQQIYITEFVNIFLKELFGDMIDFINQN
LTNKNNGEEIQDQNQKNYSQNQSNPADHERLVKTICGDFNSSRNKRIDTFKHECEKIFEG
TQILKKILKRFLNTFIQYYGTFYRYCQQKHPQAAATLIHYNEINSDIQSSYGI
NT seq
2142 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacagttagaataataattaagaagataaaaaaaacaagagtagccttttttcagat
gccacacttgatcctattacatagcgttacatacattcaaaatataagctagcagaagga
gagtaaaattttgcaaatatagaccttagaaatatgtgcgaaaatgtagttgatgagctt
gagacattagaaagtgaagccgcttatgattatttaaaggtagaaaatgaaatgaaagac
ttagatgttgaaatagataaaagcgattctattttgtcagaattagaaaaagtcttagaa
aattttagagatcacttaaatgaaataaagagttaaatgactgttttgcaagagagatct
cttaaaatgaatatttctttaacaaaccgtaaaaatctataaaaattaatgaatacattc
atggattcagctgttttagatccaaaattaatagatgcaattaattcagcacctattgat
taagcttacgttcaacatattaaagttctatgctaaaagttagagtatcttcagaatacg
aaactgccagatgcctcagttgtaaaagaattggaacctgaattaaacaaactgaaaaac
aaagcttgtggcagagttagataatttttgcttgacaaaattgatatccttaaaaagcct
accactaatattgaaattcaataaaaaaatgtacttttagactatcgtgtatttactgaa
tttttgaagtgtcactatgaggaaatttatgcagaattatgcaacaaatatgctgaagta
atgtcaaaagtatactcctaattgtttgaaaagaatgtaaaagaactttaaaaattatgg
gtcgaactatacaacaaatcggatactttagtctgtgataatgcctcaaacatgagaaca
tttatcactataaaaaacggaggaaagttagttgatgtataccctgataaaaacaaatca
attttcgatttaatggatcgtgatttaatcttaaaaaatgaaaggttaaatgatggcttt
atattttatgcttcagcctctaaagaaaatcagcgctttaccattgaacaaattttcaga
agcatgagcaagttaattttaagtacagttgtcagtgaaatagctttttcaagttaattc
tttaacttaacaaatgcacaaaattccaagatatttaaagaaatttttagttaaactttt
aaaagcttatacaacttcttataaactatgttgactgaaagttatgactgcaatggtatg
gtactcattattttgattaacgaatcttactaacgtgaatactctgaaatgtatgcttaa
tcttaagtacttcaagaatattttaactatattaacatgttagtttggccacgtttcgaa
aaagtattcgaaggtcactgctaatcaatatcagaaaaaaatttaaagtaatacaaatta
cttgaaaaataatttagcttcaagccgattgtgcagcgttatgcagatataattatatct
ttttatagactttattcatatttctaagacaacaaaatgatatttattcgtatcgaaaaa
ctacgtaaagattttataaatatgatcaagaagaatgcataagatataggaaaaggtatt
gacagatgcaagtatcttctccttatttatgatttaatatttaccaacataccaactaag
aaagagtaccaaaaggaaataactgaaattgaaaaagagtaataaatttacataactgaa
tttgttaatattttcctcaaagaactctttggtgatatgattgattttattaactaaaat
cttactaataaaaataatggtgaagagatataagactaaaattagaaaaattattcataa
aattaatctaaccctgctgatcatgaacgtttagttaaaacaatttgtggtgatttcaat
agctcacgtaataaacgtatagacacatttaaacatgaatgtgaaaaaatatttgaaggt
actcaaatccttaaaaagatcctcaagcgttttttgaatacttttatttaatactacgga
actttctaccgttattgccaacaaaagcatccataggcagctgccactcttatacattac
aatgaaatcaatagtgatatctaaagctcatatggaatttga
DBGET
integrated database retrieval system
