Tetrahymena thermophila: TTHERM_00571760
Help
Entry
TTHERM_00571760 CDS
T01020
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7823903
NCBI-ProteinID:
XP_001027682
TGD:
TTHERM_00571760
UniProt:
Q24HZ8
LinkDB
All DBs
AA seq
1557 aa
AA seq
DB search
MSRNNLKVQLQQLQDKQTMMLKNDSTIKSELIKSNQKELLMKGQAIQIKNKENMHSQLYL
QASTKESSQLLQKKNSQNEQTIHSDIFNTSNNSKIQGVLALKFSNTYTQPLQARGEIQST
VSDVYTLESIETLNTNRSNNNYNQKIVIGEDNKIHSQHISLQNDRNLVQQNRRYSINSNS
SFQQHKQQNEYKTIQNKMYNNYALKIESSEERILNACQLNFDDRLSSQQNEEQDPSIYNY
NDANNANTKTTHRNQSQDSTFNNNACNRNSPFYFTHNAKENLNFHKKNLNCNQENAQSNL
QKGEFLQNVITKNANDELNLKKNTQNQHLTNTFSKQEVCNSNFFSIGENEGERQIVKSTK
GIYPKEQKNNQSKTELINTLNFNTETEDKKFQENIFTTNSDMPSIILHKTLKSEASNIFE
RGFTLNDQPSSKNQMSFINEVEDENTQRSRGTNHKAYQNGNDELINQFNSSQRVLTLNPN
QDIHENQNTQNIYSNIPQNIQNEDSSSQHFFYQTNQQCTFQNNIYNTPTLKGRLTENTNN
SLDFQENKQEPQINQFTVCNNNPQKSDEYIQKEPKNFEYPSMFDRNSKFYHESEASVCNE
MQEIYSANNDKPQLKTLNIPNKVNNPALLSSHATEDNNSFLNSHRNQMPSKLDSESFSGI
KNEFAQIEAQQDNRQQIKKQNMQEQVKNTQNNKQEQFLQQYENKRPHFLSQEIQIPIVSD
NYFMNKNNEYKGQLNNLTKQNTFSNDCSDEDQFTKNLNSLINNNQENEHLKNNEKCQIVN
YQPQMKRDSEEQTQRCISKNNIIQNIEQNNQVFAEYNQEKIKKMNEEIRQKLKQINLNQT
TLNSTIQISQTPTTQREQEEKLYNFINSEQSQLADQTQRHRNQSQVSLNQSISQHQGQPN
SQQFPQNQGQIQPSSSQKNKQGYSILPISYQINQSQISNEQSKSQSFLNQENQEKCFNTT
CSNILQYQDINPNLNKSDTRVQEDSSSQSSIMVDHKNKQQQIQSTQSTLSSGLNKRSMSN
SRYEKFECKENTNRTTQNPSPNRFVQLNQSIIPENKDDNNIQKEQKQQKTVKQNPPQLDP
NLSYGDDLQINPLDVISPQEKIANCISFQTGQQEDPHMYPSFQQPSSYYNNYPLFANHDT
EMEIQNNKILENIDNTSSAKNSFYQQKSEQQNHQLQNDLFQDKNNQKIQNKNTIKNAQLN
VSKYLTAAQENFQKNNKINISNLNYTNDAILPPSCSSKNSTGSNQNANHYNAFSYKQFIM
NMKKNLDSSLIKETTKKQKQNDSFIKKVQTNKKPIATGNLQNDKNSQNKDFEKLNKLIDQ
QIQKNVIRPLIKRQRGDKEIVQDQNNCRSKASLSHHTPSTPKYNVNSIPNSQRPVPIEIP
SNLDISLQHYISNQYSQKNSTIQSNKSKSKISAKSTSATPKQNKQPVNNQFQAGKPQLKN
TNFIMNNNISFNGTPSTSKSNIDRNHSFCIPKDRSLSNNKRDSLNNKRNTSSKSPVSRVA
CFSNVNTNQNLMIHEDIGFNNDNILNFGLQTGFYTNKNQNLMKRDQSLSFIKHSSKK
NT seq
4674 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctcgaaataacttaaaggttcaattacaatagctttaagataaataaacaatgatg
ttaaaaaatgatagtactatcaaaagtgaacttattaaatcaaattagaaggaactttta
atgaagggataggcaatttaaattaaaaataaagagaatatgcattcttagctatactta
taagcttcaacaaaagagtcaagttaactattatagaaaaaaaattcatagaatgagcaa
acaattcattctgatatttttaacacaagcaacaatagcaaaatttaaggagtgctagca
ttaaagttctctaatacctatactcagcctttgtaagcaagaggagagatttaatcaact
gtttctgatgtttacactttagagagtattgaaacactgaatacgaacagatcaaacaat
aactacaactaaaaaatagtaattggggaagacaacaaaattcacagttagcatatttct
ctataaaatgatagaaatttagtttagtagaatagaagatattcaattaatagtaacagc
tctttttagcagcacaaataacaaaacgaatacaagaccatttaaaataagatgtacaat
aactatgcattgaaaattgagagctcagaagaaagaattttgaatgcgtgctaactaaac
tttgatgatagattgagttctcagtaaaatgaagaataagacccttcaatttataattat
aatgatgcaaataatgctaatacaaaaacaactcatagaaattaatcttaagattctact
tttaataataatgcatgcaatagaaatagcccattttattttactcataatgctaaagaa
aatctgaattttcataaaaaaaatctaaattgtaatcaagaaaatgcatagtctaattta
taaaaaggagaatttttataaaatgttataacaaaaaatgctaatgatgaattaaatttg
aaaaagaatactcagaatcaacacttaacaaacactttttcaaagtaagaggtctgcaat
tcgaacttttttagtattggtgaaaatgagggagaaaggtaaatagttaagtccaccaaa
ggaatttatccaaaagaataaaaaaataatcaatctaaaactgaattaattaacactcta
aattttaacactgaaacagaagataagaaattctaagagaatatttttacgaccaactct
gatatgccaagtatcattcttcataaaactttaaaaagtgaagcgagtaatatttttgag
aggggattcaccttaaacgattaaccttcgtctaagaattaaatgtcctttataaatgaa
gtggaagatgaaaatacctaaagatcaagaggtactaatcataaagcatattaaaatgga
aacgacgaattgatcaattaatttaattcctcttaaagagtattaactctcaatcctaat
taagatattcatgagaattaaaacacttaaaatatttatagtaacataccataaaatatt
taaaatgaagatagcagctcataacattttttctactaaactaactagcaatgtaccttt
caaaataatatttataataccccaactttgaaaggtagattaactgaaaatacaaacaat
agtttagatttttaagaaaataagcaagagccttagattaattagtttactgtttgtaat
aataacccttagaaaagtgatgaatacatttaaaaggaaccaaaaaactttgaataccct
tcaatgtttgataggaattcaaaattttaccatgaatcagaagcatctgtatgcaacgaa
atgcaagagatatacagtgctaataacgataaaccatagttaaaaactcttaacattcca
aacaaggtaaataatcctgctttgttatcctcccatgcaactgaagataataattctttt
ttgaattcccacagaaaccaaatgccatcaaaattagacagtgaaagtttttcaggaata
aaaaatgaatttgcttagattgaagcttaacaagataatagacaataaattaaaaagcaa
aatatgcaagaataggttaaaaatacacagaataacaaataggaataatttttgcaacaa
tatgaaaataaaagacctcattttttaagtcaagaaatataaattccaatagtttccgac
aattattttatgaataaaaataatgaatataaaggatagttaaataatttaactaagtaa
aataccttttctaatgattgctctgatgaagattaattcacaaagaaccttaatagtctt
attaataataatcaagaaaatgaacatttaaaaaacaatgaaaaatgttaaattgtcaac
taccaaccctaaatgaaaagagattcagaggaataaacttaaagatgcatatctaaaaat
aacataattcaaaacattgaataaaataattaagtttttgctgagtataattaagagaaa
attaaaaaaatgaacgaagaaataagataaaaattaaaatagattaatcttaactaaact
accttaaattcaactatttaaatttcataaacacctactacttaaagagagcaagaggaa
aaattatataattttatcaattcagaataatcttaattagcagattaaacttaaagacat
agaaatcagagttaagtgagcttaaattaatcaataagttaacatcaaggataacctaat
tcgtagcaattcccttagaattaaggttaaatacaaccttcttcttcttaaaaaaacaaa
taaggttattctattcttcctatttcctattaaataaatcaatcataaatttcaaatgaa
taaagtaagagttagtcctttttaaattaagagaaccaagagaaatgttttaatactact
tgttctaacattttgtaatatcaagatattaaccctaatttaaataaatcggacactagg
gtttaagaagattcatcttcataatcttcaattatggttgatcataaaaacaagtagcag
taaattcaaagcactcaatcaactttatcatcaggtctaaataaaagaagtatgtctaat
agccgttatgaaaagtttgagtgtaaagaaaatactaataggactactcaaaatccttca
ccaaaccgttttgtttaattaaattaaagtataataccagaaaataaagatgataataac
atttaaaaagaataaaaatagtaaaaaactgtcaagcaaaatccaccatagttagatcca
aatttgtcttatggtgatgatctttaaattaatcctcttgatgttatttctccttaagaa
aaaatagctaactgcattagtttttagacagggtagtaagaagatcctcacatgtatcct
tcattttagcaaccttcttcttattataacaattaccctctgtttgctaaccatgatact
gaaatggaaatttagaataataagattttggaaaatattgataacacttcatctgcaaaa
aatagcttttattaataaaaaagtgagtaataaaatcattaactataaaatgatttattt
caagacaaaaataattaaaaaatataaaacaaaaatacaattaaaaatgctcagctaaat
gtgtcaaaatatttaacagctgcttaggaaaacttttaaaagaataataaaataaatatc
agcaatttgaactatactaacgatgctatacttcctccttcatgctcttctaaaaatagc
acagggtctaattaaaatgctaatcactataatgctttctcatataaataatttataatg
aatatgaagaagaatctagattcaagtcttataaaagaaaccactaagaaataaaagcag
aatgactcgtttattaagaaagtgcaaacaaataaaaaacctattgcaacaggaaatttg
taaaatgataaaaattcttaaaataaagattttgagaaactcaacaaattaattgattaa
taaatacaaaaaaatgtgattagaccacttataaagagataaagaggtgataaagaaatt
gtgtaagattaaaataattgtaggagtaaagcttctttatctcatcacactccatccact
cctaaatacaatgtaaacagcattccaaattcataaagacctgtacctatagaaatacct
tcaaatttagatataagcttacagcattacatatctaactaatattcacaaaagaattct
actatttaaagcaataaatctaaaagtaagatttcagcaaaaagtacatcagcaactcct
aagtaaaacaaataaccagtcaataattaattccaagctggaaagccatagttaaaaaat
acaaattttataatgaataataatatttcattcaatggtactccatctacttcaaaaagt
aatattgatagaaatcactctttctgtatacctaaagatagatctctaagtaataataaa
agagatagtttaaataataaaagaaatacctcttcgaaatcgccagtatctagagtagct
tgtttttctaatgtaaatacaaactaaaatttaatgattcatgaagatattgggtttaac
aatgacaatatattaaattttggtcttcagacaggattttatacaaataaaaattaaaat
ttgatgaaaagagaccaatccctaagctttataaagcactcttctaagaagtga
DBGET
integrated database retrieval system
