Tetrahymena thermophila: TTHERM_00583460
Help
Entry
TTHERM_00583460 CDS
T01020
Name
(RefSeq) UvrD/REP helicase amine-terminal domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD_C_2
AAA_22
zf-C2HE
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7839503
NCBI-ProteinID:
XP_001018986
TGD:
TTHERM_00583460
UniProt:
Q23Q43
LinkDB
All DBs
AA seq
2990 aa
AA seq
DB search
MDPYTYLPEITSTLEENIQKIHFLCTKLPYRGVNWTYYHNINSIIVEWMRQQTIRFEQQE
QSGEFYQKYKDLYLLGRKSVEAELRYQNLLHKSIFKCNYTDNFVNEFSKNSIQKQKVIFS
YMNYIAQGYFRQIKDIFDIFEVPHKGQELEKMFCVKVMHNKYLVFLVTVQTIPVHSNHRK
LAKMNFTQVIVFLDILTPAQADQLKNKAHPKVYTKVLQNYVSEPGYMINHKMLNPYTCSE
KNLFIYDNGRYIYNYPPQSQDPALHSNNPFYESVLSYLPNNFYQHKFQDSDQETYYYDAR
KQRWVLQDQNFLRDLQSMRDYQQQVSNHVISQCLNFGSAQKLVNVLQKIPNFKVKLSSEQ
SHIISCSGNVVCIGRSGTGKTTSAVLRMFALEMLFKYRLHVYHNRHMKLASQTRFNPKDL
DKMVGLRCIFVTASPVLTNEIKRYYDRLTKQLKEELIKRDEKLHAEQLEKLIQQKKDQQN
DEKQDKTESNEADKELDAEKEEIEILMEKQFENLQLNKEISTDGAAQNDAEDAQQEIKEE
KITFEDDDAEKLEKEMDKYENLSNMSPQDFPAFMTVRNLIMLIDASLSYPFFKRNKEGKI
KGQTAQNTWHNEQKGTLYINNFHKHQINESNLKDADQIMEKMNIGLEDDDEEEEIQNIDN
LNEYQINQQYQQTIRQQQKKINQIAASKAKQVSKAKKMAYEIDFEYFKRFFWKRIQNKVI
GFKSLDVHFVWTEIYSIIKGSSQSCFYWSGVSYGLSKYIYTQQQTRLKSHEIDKLYEIYQ
EYERWKDQEGSYDFMDIVNYVIRSINYGFNKNIQYLHYIMVDEVQDLPMNILYLLKKMTT
NGIFYSGDTAQTIAQGVGFRYGSLKSLFDNKSVGQYYTDSKSITDDVTIQQLTVNFRSHN
KILYLANSVIDLLEFFFPETIDRLKKEKSSIDGPKPIILGESDPDLLFCILTGDSSFKSE
RHSSNQGAMGRNPIEFGCSQVVIVRNQESKKNLPPMLAHALCLTIYEAKGLEFDDVILYN
FFQDSTMQPQKWNLLRYVSYLNQFMTKEKFNEMIEEQEIERLHRIHYIQLLRTEIIEQDW
KDKQAMNKLQYIMDNEKRLSQLKILNDRAVQREQKMEELQQQEQALQSDAVYGTPVKGEE
NLIKVVKLNLNQEEFKKNNISQKDFSQLCLELKQLYVAITRPKNRVIIYDENADARQIIQ
EYWENLGCVEVITSEVLSGMVDQKNVQESGINIKDALLRKSDSNQWKQQGLRMMKMRYFQ
QAMLCFEKAGCQEYMEQAKIFHLADHAKEMLEEAQREYIFLDQGIMEYSSMSKTEKDTKK
AQINLQMKIARKEFTQVGEIFYNREQYKQAAKCFFSALNYQRAADCYIKIGNIRSAAECY
YIIQDYVRASELFLEGKEYVKAIECNDLLENWGKILEIINLAKGSMTLKTRELYIKKYAP
LALEELVSNIGLSKIEVTTKQQQKQKKILELIVQEQINEEEEDEENATLEQSQQKNKENE
SEEEEEIEDEKSGQQKEQADQQKETKSILDDLNKQEEEEDKDDEEDEDEHDSVDKIDLDD
ISQDESVEKINKTKQTQKSAADNNKSVSNADFSVIDKTQGQMQDVSVIEKSVKQSRHDNT
SFIDNISFNDSSKDEDANEDLNLSSLTLDFIKSKNQLSDFEHLSEFDPEDEWLKMETGSI
AEVIQKSRDSGIFSCSEFSSLNIADMMSTKAQMIKTSADIFIQDEIMQQVIKYMSMFSDN
FKTEILKIKSKDALLTSRNEQHDDTLTEYGANELLIDLDNIDINFLYLILDTLEYYNIFR
LAIFVCNRYKLSKKVGRYLISIAHKFSFLAHEDASLDFTLLNLTPEKQKKIEKAIIANIA
IHNLFEVINPEFIRLKEADEVPNENNSLGIEVYRGFLSLGYWKKILFIMDYKRSLELAYF
FSDFNSYKTIFLNFNKKYKNKAACISSIKNGEPDFQCLPFDIPKTAEEIEFAIVVLEHVI
TFQNSKQKLSKSTTHNLSFSSRSQMMNAEGQYEKIPQFPSYFTYNAIFWKYINHKVSKGF
AKQNNEDSQFFKYVGQCAKNALEILDKKDNFESDLINLRIFDVFSFLSNLFFQLQFQDKL
FQILIQHLDLDDFQNFVLIINRILKMFSNINTEQRKSYLILRALVSPLKVRLNMNTTDLL
SAFGQTKVNIHKSSRLIAYFLQKKNEAAAKLKVENVIIKIMQFEEFCLKKRGKILKQYEK
EYRQYRNETNQLQAQITALLNKGDKRSIQEASYLVNNVEEKENLMNYVKQIEFLEKKQKN
KYYFLDLDCEFIAAPIQDVLQFFQENLYKLTIPLVHRKISTSIKLSGTKNYTIERLFLIS
AYNIAFSQILKETDQIMKSTEGYDLLSKTKGYVPPEYKKYKKSNPLYKFFKLEYLKQIEE
QNEEEEDEDIQQYMEYEGIKKKSKKINYPLLKKCKRQLSQCLQNIYQGYWEVSISPYVRN
VLLQIVLKTINSYEFSSPFDFKSIQKYAQFLNIVNHTSYLNNFKVSQNLRIDAKLIIENV
YNHRNGLIQKYINNTLSILDKHFDQLEFQEKMHQLEYCAIWATLSYLASKGDTFNFYLNQ
NFLKLLPPLKFTEFTTDQKDDNVISVPARFALEVSIQPIKSLDTIVEIFQFIADIFTKQG
TQIVQRKAVFQRLLQLIFIVLFNLKKINNDLAQEILTLIDLLDQEEQLQKIIDKIDFWED
LIQCQNEKEIEEIIPLMISENLFEFEESYEKADIVQEIQIENIISKSITEEVRQKITNQQ
ILHDQIQHSKKITASRIILNNYNYNKQEMWKAQSRLCKNQTQLLILSRFNNKHMLPTESL
ISANLKNSQIFNFFEENDNIVSDIICNMTSNSVFDPLDYHYLLLLLDQADRRQGEYEKHL
LSLVKENDQSKNQFINKLVQEIQKKKEELLNWATQQFSKENQDPQVFFLQNKMSIAIKWA
KMGYINDAKKLVTDINDDFKLKEAQSLKLNMNNQPPKIGNKFKKNKQAKK
NT seq
8973 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatccatatacttatttacctgaaatcacttcaactttagaagaaaacattcaaaaa
atacactttttatgcacaaaattaccctatagaggtgttaattggacttattatcataat
atcaacagtatcattgttgaatggatgagataatagacaataagattcgaataacaagaa
taaagtggtgaattttatcaaaaatataaagatttatatttattaggaagaaaatcagtt
gaagctgaattgagatactaaaatctattacacaaatctatttttaaatgcaattacact
gataattttgttaatgagttcagcaaaaatagcatccaaaagtaaaaagtcatattctcc
tatatgaattatattgcttaaggttatttcagataaatcaaagacatatttgatattttt
gaagttccacacaagggataggagttagagaaaatgttttgtgtaaaagtaatgcataat
aaatacttggtatttttggtaacagtttaaacaattccagttcacagcaatcatagaaaa
ttagccaaaatgaactttacttaagttatagtctttttagatatcttaactccagcataa
gctgattagttaaaaaacaaagcacatcctaaagtttataccaaagtacttcaaaactat
gtctctgaacctggctacatgataaatcataaaatgctaaatccttatacctgctctgaa
aagaatttatttatttatgataatggtagatacatttataattatccaccttaatcttaa
gatcctgctttacattctaacaatcctttctatgaaagcgttctcagttatttgcctaac
aatttttatcaacacaaattttaagatagcgattaagaaacctattactatgatgctaga
aaatagagatgggtcctttaagattaaaatttcttaagagatttgtaatcaatgagagat
tactaacaataagtttctaatcatgttatttctcaatgtttgaactttggctctgcttaa
aaactggttaatgttctctagaaaatccctaacttcaaagttaaattaagtagtgaacaa
tctcatattatcagttgtagtggaaatgttgtttgcataggtaggtcaggaacaggtaaa
acaacaagtgctgtgcttagaatgtttgctttagaaatgctttttaagtacagattgcac
gtttatcataatagacatatgaaattagcaagttaaactagatttaacccaaaagatttg
gataaaatggttggtctaagatgcattttcgtaacagcttctccagttctcacaaatgaa
attaaaagatactatgatagattaactaaataattgaaagaagaactcatcaaaagggat
gaaaaattacatgcagagtagcttgaaaagttaattcaataaaaaaaagattaatagaat
gatgaaaaataagataaaaccgagtcaaatgaagcagataaagagcttgatgcggaaaag
gaagaaatagaaattctaatggagaagcaattcgaaaatctctaattaaacaaagaaatt
agcactgatggtgctgcataaaacgatgcagaggatgctcaataagaaataaaagaggaa
aaaattactttcgaggatgatgatgctgaaaaattagaaaaagagatggacaaatatgaa
aatttatcaaatatgtctcctcaagatttccctgcttttatgactgttagaaatttgatc
atgctcatagacgcatcactctcctatcctttctttaagagaaacaaagagggtaaaata
aaaggataaactgcctaaaatacttggcacaatgagcaaaaaggtactctttatatcaac
aatttccacaaacaccaaataaatgaatccaacctcaaagacgcagattaaattatggag
aaaatgaacataggattagaagatgatgatgaggaagaagaaatttaaaatattgataat
ttaaatgaataccaaatcaatcagtaatattaacaaactataagacaatagcaaaaaaaa
attaatcagatagcagcctcaaaagctaaataagtttcaaaggctaagaaaatggcttat
gaaattgattttgagtatttcaagagattcttctggaagagaatatagaataaagttata
ggctttaagtcattagatgttcattttgtatggacagaaatatactcaataataaaagga
tcatcccaatcttgcttttactggtctggtgtatcttatggattatcaaaatatatctat
actcaatagtagactcgtttaaaaagtcatgaaatcgataaattatatgaaatctatcaa
gagtatgaaagatggaaagattaagaaggtagctacgatttcatggatattgtaaactat
gtaattagatccataaattatggttttaataaaaatatttaatatcttcactatatcatg
gttgacgaagtttaagatcttccaatgaatattctttatcttttgaaaaaaatgacaaca
aatggtattttttattcaggagacacagcttaaacaatcgcttaaggtgttggtttccgc
tatggtagtcttaaatctctttttgataataaatctgttggctaatactatactgattct
aaatcaataacagatgatgttactatctaacagctcacagtaaacttcagatctcataat
aaaatcctgtatttggctaactctgtaattgatttacttgaattcttcttccctgagaca
atcgatagattgaaaaaggaaaaatccagtattgatggacctaagcctataattttaggt
gagagtgatccagacctactcttttgcattcttacaggagattctagcttcaagagtgaa
agacattcttcaaattaaggtgctatgggaagaaatcctattgagtttgggtgcagctag
gtagttattgttagaaattaagaaagtaagaagaatttacctcccatgctagcccatgca
ctttgcttgactatttatgaagctaagggtttggaattcgatgatgttattctttataat
ttcttttaagactcaaccatgcaaccttagaaatggaacctactcagatatgtttcttac
ttaaattaatttatgaccaaagagaaatttaatgaaatgattgaagagtaagaaatagaa
agactccacagaattcactatatttaacttttgagaactgaaattattgaataagattgg
aaagataagtaagctatgaataaacttcaatacattatggataatgaaaaaagattatcc
taattgaaaatattaaatgatcgtgctgtgtaaagagaatagaaaatggaagaattgtaa
taacaagaacaagctttacagagtgatgctgtatatggcactcccgtcaaaggagaagaa
aacttaatcaaagttgttaaattgaatttgaattaggaggagtttaagaaaaataatatt
tcttagaaagatttttctcaactttgcttagagttaaagtagctttatgttgcaattaca
cgtcctaagaatcgtgttattatttatgatgaaaatgcagatgcaagacaaatcattcaa
gagtattgggaaaatctaggatgtgttgaagttattacatctgaagttctatctggtatg
gttgattaaaagaacgttcaagaaagtggtattaatatcaaagatgctctcttgcgtaaa
agtgactcaaactaatggaagtaataaggtttgagaatgatgaaaatgcgctatttctaa
caagctatgctttgctttgaaaaggccggatgctaagaatatatggagcaagctaaaatt
ttccatttagctgaccatgccaaggaaatgttagaagaagcacaacgtgaatatattttc
ttggactaaggtattatggaatattcctccatgagcaagactgagaaagatacaaagaaa
gcttaaattaacttgtaaatgaaaatagcaagaaaagaatttacttaagttggtgagata
ttctacaatcgtgaatagtataaacaagcagctaaatgctttttcagtgctttaaattat
taaagagcagcagattgttatattaaaattggtaatatcagatcagctgcagagtgttat
tatataatttaagattatgtaagagccagtgaattatttttagaaggcaaagagtacgtt
aaagccatagaatgcaatgatcttctagaaaattggggcaaaattcttgaaattattaat
cttgctaaaggtagtatgactttaaaaacaagagaattgtacattaagaaatatgctcca
ttagcacttgaagagctagtttcaaatattgggttatctaaaattgaagttactaccaaa
taataacaaaaacaaaagaaaatcttagaattaattgtctaagaataaattaacgaagaa
gaggaagatgaagaaaatgccacactagaacaatcttaataaaaaaataaagaaaatgaa
agtgaagaagaagaagaaattgaagatgaaaaatcaggctaacaaaaagaataagctgat
caataaaaagaaacaaaatctatacttgatgacttaaacaagcaagaagaagaagaagat
aaggatgatgaagaagacgaagatgaacatgattccgttgataaaatagatcttgatgat
attagctaagatgaaagtgttgaaaaaataaataaaaccaagcaaacttaaaagagtgca
gcagataataataaatctgttagcaacgctgatttctcagtgatagataaaacacaaggc
tagatgtaagatgtttctgttattgagaaaagtgttaaataaagcagacatgataatact
tctttcatagataatatatcttttaacgatagttctaaggatgaagatgcaaatgaagat
cttaatttaagcagtcttactttagatttcataaaatctaagaaccagttaagcgatttt
gaacatttaagtgaatttgatcctgaagacgagtggcttaagatggaaactggttcaatt
gctgaagtaatttaaaagagtagagacagtggtatcttttcttgtagtgagttttcatct
ttaaatattgcagatatgatgtctaccaaagctcaaatgatcaagacaagtgctgatatc
tttatttaagacgaaatcatgtaataggtcataaagtacatgtcaatgtttagcgataat
ttcaaaacagagatattaaaaataaaatctaaagatgcccttctcacttcaagaaatgag
taacatgatgatactctcactgagtatggagccaatgaacttttaatcgatctggacaat
atagacattaacttcctctaccttatcttagacactcttgagtactataacattttcaga
cttgctattttcgtttgcaatagatataagcttagtaagaaagtaggaagatatttaatt
tctattgcccataaattctcctttttagctcatgaagacgcatcccttgactttacactc
cttaatcttactccagagaaacaaaagaaaattgaaaaggctataattgcaaatattgcc
attcacaatttgtttgaggtcataaatccagagtttattagattaaaagaagctgatgag
gtacctaatgaaaataattctcttggtattgaagtttatagaggtttcctttctttggga
tactggaaaaagatacttttcataatggattacaagagatctttagagttggcttatttc
ttcagcgacttcaatagttataagactattttcttgaatttcaacaagaaatataagaat
aaggctgcttgcatttcttctattaaaaacggagaaccagacttctaatgcttgcccttc
gatattcctaagacagccgaagaaatcgaatttgctatagtagtattagaacatgtaatt
accttctaaaattcaaaataaaaattatctaaatctactacccataatctttcattctct
tcaagaagctaaatgatgaatgcagaagggtagtatgaaaaaatcccttaattcccaagt
tatttcacctacaacgctattttctggaaatatattaatcacaaagttagcaaaggattt
gctaaataaaacaatgaagatagctaattctttaaatatgttggtcaatgtgcaaagaat
gctcttgaaattttagataaaaaagataattttgaatctgacttaattaacttaagaata
tttgatgtttttagctttttgagcaatctctttttctaattacaattctaagacaagcta
ttttaaattttaatctaacatttagatcttgatgacttttagaacttcgtattgatcatt
aacagaatattgaaaatgtttagtaacataaatacagaataaagaaaaagctatttaatt
ctgagagctcttgtttctcctttaaaagtcagacttaacatgaataccactgacttactc
tctgcttttggttaaacaaaagttaatattcacaagagcagtaggttaattgcttacttc
ttgcaaaaaaaaaatgaagctgctgctaaattaaaagtagagaacgtgataattaaaata
atgcaatttgaagaattctgcttgaaaaaacgtggcaaaattcttaaataatatgaaaaa
gaatatagacaatatagaaatgaaaccaattaattacaggcctaaataacagcattgtta
aataagggagataaaagatcaatttaagaggcttcttatcttgtaaacaatgttgaagaa
aaagagaacttaatgaactatgttaaacaaatagaatttttggaaaaaaaataaaagaat
aaatattatttcttggatttggactgtgaatttattgctgctccaatttaagacgtttta
caattcttttaagaaaatttatataagctcacaattcctttagttcatagaaagatttct
acttctattaagttgtctggaactaagaattatacaattgagcgcctcttcttaatttca
gcttacaatattgctttcagttaaattcttaaagaaacagatcaaataatgaaaagtact
gaagggtatgacttattaagcaaaaccaagggttatgtgcctcccgaatataaaaaatac
aaaaagagtaaccctctatataagttctttaagttagaatacttgaaatagatagaagaa
taaaatgaagaagaagaagatgaagatatctagcaatatatggaatatgaaggaattaaa
aagaaatccaagaaaataaactatcctctattgaaaaagtgtaaacgttaactctctcaa
tgcttataaaacatataccaaggttactgggaagtttcaattagtccttatgtaagaaat
gtacttttacaaattgtattaaaaactatcaacagttatgagttcagctctccctttgac
tttaaaagtattcaaaaatatgcttaattcttgaatattgttaatcatacctcatacctg
aataattttaaagtgtcttaaaacttaagaatagatgccaagttaataatagaaaacgtt
tacaaccacagaaatggacttattcaaaaatatatcaataacactctcagcatcttagac
aagcactttgatcagcttgaattttaagaaaaaatgcactaattagaatattgtgcaata
tgggctactctatcttacttagcctctaagggtgataccttcaacttttatttgaattag
aatttcttgaagttacttcctcctttgaagttcactgagttcacaactgactaaaaggat
gataacgtaatcagtgtccctgctcgtttcgccttagaagtttcaatataacctattaaa
tctttagacacaattgttgagatattctaatttattgcagatattttcaccaaataaggc
acttaaatcgtttagagaaaggctgttttctaaagattactttaattaatttttatagtt
ctcttcaacttaaagaaaatcaacaacgatttagcttaagaaatattaactttaattgat
ttattagatcaagaagagtagctacaaaaaatcatagataagattgatttctgggaggat
ttaatttaatgctaaaatgaaaaagaaattgaagaaattattcctcttatgatttctgaa
aatttatttgagtttgaagagtcttatgaaaaggcagatatagtctaagaaatataaata
gaaaacattattagcaaatctattactgaagaagttaggcaaaaaattacaaattaatag
attctacatgactaaatttaacactcgaaaaagataactgcttccagaattattttgaat
aactataactacaataaataagaaatgtggaaagcttaatctagactttgcaaaaattaa
acttaacttttaattttatctcgtttcaacaataagcacatgttgccaacagagtcttta
ataagtgcaaatttaaagaattcacaaatattcaacttctttgaagaaaacgataatatt
gtttctgatatcatttgcaacatgacttcaaattcagtatttgatcctcttgattatcat
tacttattgctcctacttgattaagcagatagaagacaaggagaatatgaaaaacatctt
ctaagcttagttaaagaaaatgattaatctaaaaactagtttatcaataaattagtctaa
gaaattcaaaagaaaaaggaagagctccttaattgggcaacataataattctccaaagaa
aactaagatcctcaagttttcttcctacaaaacaaaatgagtattgccataaaatgggct
aaaatgggttatatcaatgatgctaagaaacttgtgacagatataaatgatgactttaag
ctaaaagaagcccaatctttaaagctcaacatgaataactaaccccctaaaattggaaat
aaattcaaaaaaaataaataagctaaaaaatga
DBGET
integrated database retrieval system
