Tetrahymena thermophila: TTHERM_00585270
Help
Entry
TTHERM_00585270 CDS
T01020
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7824021
NCBI-ProteinID:
XP_001032632
TGD:
TTHERM_00585270
UniProt:
I7MCU9
LinkDB
All DBs
AA seq
1694 aa
AA seq
DB search
MGQNQVKKQKKYGEFDVKLDQLQLGFEQERKNNFAMERSTHPQQPLSKSEQPRPLAASRF
QMTESKNQKRSISSEKAYMALKFQQDKKKQRNDDPILKKMKEINKCQNVADFFLNGIQLQ
NVNCSLINTIQMNYNIIACQQRQEDATCTTKKAETSQFVVYLQNKVLTEVDRVEKIDFEE
LKHISVNYQAVDQENLNDSYQFDIYSQEKSKFQAVTKIERNKQKKQSEISQIISSKKNDN
SVYMQPYDQTSIQKSKYQSNLQQNRKQSTFNEFEEVYLELLSDKYQNDKNYDNQDAISTN
SNKIKLSQMVKNNNNIHSDQVSSNSSLIREKKNPQNYNFKSELGQQFKQPINIYEMPVYE
QQGDLDQEIVKKSPPSNIKSKITFNPLVKQESTPLNAYPDEYTKYPKEQTNSNLFNNQNN
PQNKNYNISQYNGLINNSDKIIKDESVHRVVNQLQFNSQNPGQFNQSPLSTYENKQSKQV
QDNANNYSNLQKNNQNLNQYKGLADNSDKINKDDSEFRIPHQFQNGSQLTEQNFSDPSNM
QNNPQNKNYNISQYKGLVNNSEKIINDGSIPRIVNQLQFNSQQPEQFNQSAINPPQSQHQ
QLIQGTDSFNYNNPQNNKNYNISQYNGLINNSEKIIKDGSVHRIVHQLQNGSSQLQSNTA
NFNNIANSQIIDNQQVSGLNSQIKTNPQNQNYNISQYNGLINNSDNIIKDNSVNRIVNHL
QNGLQNDSQNQFNPNNNNFDVQASLRPASNNLTSNPNISNGQSQFQIRSNQGPNSFIKKQ
ESGDIQDFQANLNQKVPENIVSANNLTQERKNPVTYMNIRDNNLESQASISNKGQHINSQ
VNGMESLQIQSFQPIQNTTNLKQIRDLKQSNQSNQDIDNLISINQQQKQQQAEFQSNQNS
NQSSNFINDQRKIPIKNVQQITQTQPLAQNLDFETESIPKKITKSQNNPVGADKMLQNNH
RDNKKVLNPNLDFEEPLLNQNKKNKAEVDLLKSSQASENFSSNFINEKGAQQKILIEDSR
KNETHSNQQQLEVNNQIPQPIQKNVQQNLPQININYYQGDSHKSSTHSDRNQINGNNFST
NKANNNFNNNSNTQTQYITPQKTQYSSTYIDSTNIIKNMKEPYAQNIDSQDTKQNKNQIP
MNGNQHHLSYTQQPTQFQSNFAKQEPVQRSRASSTQNLDQQQNIFSSNIRLKDQVDPNYN
SQAINQRSRVNSNHTQDSQFQYHNNFNQLASNGGPQSNTYQTNPNAYSVNNKQDSFNKFD
NKNLNSAPNLIKGQNNQALINNQNQINSNQQFNPISNQTQKINQNEDYTINNQNGIRDPG
QFNHPNINNAKTDQQKDQGQRKIIQLGGKTYNQPSNQNSQQKNYQMMESPYRSSDEKSNH
QSKSSISKTQINQNKYFAPNLEKTSPSRVKYAQTNTPIQNVIYYLSEDQQQPNNIKQNQF
DANDKNSIQNLIQNRNKLRGQQNDSRYNSRSINQQSPEFSKTQSPNIRINRQQENIKKFY
ESKQEQLERLSNTKQSESSSIIRNENLSNSSGNLNKYILPKTTSQNNQKIQGNIGINLSK
LNKTQIPQNNNDQSSLQSQFQKRMNNSQISPSKLTQIIVKEKQSNFDDSFANKDYSEFNP
TKVQGSQNQISSYSHIKSMIQETQSNLRINQQIETMSQKSKLNSKGRIFSEEKLYSPMNS
KLSQTAREYNRFNN
NT seq
5085 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggataaaattaagtaaaaaagtaaaaaaagtatggagaatttgatgtgaaattagat
taactatagctaggttttgagtaagaaagaaaaaataattttgccatggagagatcaact
catcctcaataacctcttagtaaatctgaatagcctagacctttagcagcttctcgtttt
taaatgacagagagtaagaatcaaaaaagatcaatttcatcagagaaagcttatatggca
ttaaaattttagcaagataaaaagaaatagagaaacgatgacccaatattaaagaagatg
aaagaaataaataagtgtcaaaatgtagctgacttttttttgaatggaatctaacttcaa
aatgttaactgctcattaataaatactattcaaatgaattataatattattgcatgttaa
taaagataagaagatgctacgtgtacaactaaaaaagctgaaacaagttaatttgtagtt
tatttataaaataaagtacttacagaagtagatagggtagaaaaaatagattttgaggaa
ttgaagcacataagcgtaaactatcaagctgtcgattaagagaatttaaacgactcatat
caatttgatatttactcataagagaagagtaaatttcaagcagtgactaagatagagaga
aacaaacagaaaaagcaatcagaaattagttaaataatttctagcaagaaaaatgataac
agtgtatacatgcaaccatacgattaaacttctatttaaaaaagcaaatattaatctaac
ctgtaatagaatagaaaataatcaacttttaatgaatttgaagaggtttatttagaattg
ttatcagataagtattaaaatgacaaaaattatgataactaagatgcaatttctacaaat
tccaataaaataaaattgtcttaaatggtaaaaaataataacaatattcactctgatcaa
gtttcttcgaacagcagtcttattagagaaaagaaaaatcctcaaaattataactttaaa
agtgaattagggtaacaatttaaacagcccatcaacatttatgaaatgcctgtttatgaa
taataaggagatttagattaggagatcgttaaaaaatctcctccttctaatattaaaagt
aaaattacatttaaccctctagtaaaataagaatctactcctttgaatgcatatccagat
gaatacactaagtatcctaaagaatagacaaattctaatctttttaataatcagaataat
ccataaaataaaaactataacatcagttaatataacggacttataaataactctgataaa
ataataaaagatgagtcagttcatagagtagtaaattagttatagtttaattcttaaaat
cctggttaatttaattaatctcctctttctacatacgaaaataagcaatcaaaataagtt
taggataatgcaaataattatagcaatctctaaaaaaataattagaacttaaaccaatat
aaaggacttgctgataactcagataaaattaataaagatgattcagaatttagaataccg
cattaattttagaatggttcataactcactgaatagaatttttctgatccttcaaatatg
taaaacaacccataaaataaaaactataatattagctaatacaaaggacttgtgaataac
tcagaaaagattataaatgatgggtcaattccaagaatagtaaattagttatagtttaat
tcttagtaacctgaacaatttaattaatcagctattaatcctcctcaaagctaacattaa
taactaatctaaggaactgatagctttaattataataatccttaaaataataaaaattac
aatataagttaatataatggacttatcaataattcagaaaaaattattaaagatggctca
gtacacagaatagtgcaccaattatagaatggttcttcttagcttcaatcaaatacagct
aattttaacaatattgctaatagttaaataatagataactaataagtaagcggcttaaat
agttaaattaaaactaatccttagaattagaattataacataagctaatataatggctta
ataaataactctgataatataataaaagataactcagtcaataggatagtaaaccatctc
caaaatggattgtaaaatgatagccagaactaatttaacccaaataataataactttgat
gtataggcaagtctccgccctgcatcaaacaatctaacttcaaatccaaatatttcaaat
ggataatcttaattttaaataagaagcaattaaggtccaaatagttttattaagaaataa
gaaagtggtgacatttaggatttttaggcaaacttaaactaaaaggtacctgaaaatatt
gtaagcgcaaataacttgacataggagaggaaaaatccagtcacttatatgaatattagg
gataacaacttagagagctaagcaagcatatctaataaaggatagcatattaactctcaa
gtaaatggtatggaatctttataaatttaatcattttaaccgatttaaaatacaacaaat
ttaaaataaattagagatttaaaataaagtaaccaaagtaattaagatattgataattta
atatcaattaattagtaataaaagcagcagtaggctgaattttaaagtaactaaaattct
aactaatcatctaactttattaatgaccaaagaaagattcctataaaaaatgtttaataa
ataacttaaacacagcctttagcataaaatttagactttgagactgaatctattccaaaa
aaaattactaaatctcaaaacaatccagttggagctgataaaatgttataaaataatcat
agagataacaaaaaggtattaaatcctaatttggatttcgaagaacccttactaaattaa
aataaaaaaaataaagctgaagttgatttgcttaagagtagttaagcatcggagaatttc
agttcaaattttattaatgagaaaggagcttagtagaagattttaattgaagatagtaga
aaaaatgaaactcacagcaactaataataactcgaagtaaacaatcaaataccatagcct
atctaaaaaaatgtttaatagaatttaccataaataaatataaattattattaaggcgat
tctcataaaagttccactcatagtgacaggaatcaaataaatggcaataattttagcact
aacaaagcaaataacaattttaataataattctaatacataaactcaatatataacacca
tagaaaacacaatactcctcaacttatattgactccacaaatattatcaaaaatatgaaa
gaaccctatgctcaaaacatcgatagttaggatacaaaataaaataaaaactaaatacct
atgaatggaaattaacatcatctaagctatacataacagccaacctaattttaaagcaat
tttgcaaaataagaacctgtttaaagatcaagagctagctcaacacaaaatttagattaa
tagcaaaatattttttcttcaaatattagattaaaagattaggtagacccaaattataat
tcttaagccattaattaacgatcaagggttaattcaaatcatacttaagattcttaattt
taatatcacaataattttaatcagcttgcatctaatggaggaccttagtcaaatacttat
caaactaatcctaatgcttacagtgtaaataataagtaagactcttttaacaaatttgat
aataaaaatttaaattcagctccaaacctgattaagggttaaaataattaagctttgata
aacaactaaaaccaaattaatagtaattagtagtttaatcctattagtaaccaaactcaa
aaaattaactaaaatgaagattatactattaataactaaaatggaataagagatcctggg
tagtttaaccatcctaatattaataatgctaaaacagattaataaaaagattagggttaa
agaaagataatttaattaggaggaaaaacttacaattaaccttcaaaccagaattctcaa
taaaaaaattattaaatgatggagtcaccatatagatctagtgatgagaaaagcaaccac
taaagcaaaagttcaatatcaaaaacatagattaattaaaataaatactttgctcctaat
ttggaaaagacttccccaagtagagtaaaatatgcttagacaaatacacctatataaaat
gtaatttactatctctctgaagattaataataaccaaataatataaagtaaaactaattt
gatgccaatgataaaaacagcatttaaaacttaatttaaaatagaaataaattaaggggt
taataaaatgactcaagatacaattctcgtagtataaattaataatctcctgaattttct
aagacataatctccgaatattagaataaatagacaacaagaaaatatcaagaaattttat
gaaagcaagtaagagtagctagaaaggctttcaaacacaaaataaagtgaaagttctagt
atcataaggaacgaaaatttatctaactcatctgggaatttaaataaatacattcttcct
aaaacgactagttaaaataattaaaagatttaaggtaatattggaattaatttaagtaaa
ttaaataaaacttaaatccctcaaaacaataacgatcaatcttctttacaaagccaattc
caaaaaaggatgaacaactcttagatttctccttctaaacttacatagattattgtaaaa
gaaaagcagtcaaatttcgatgattcttttgctaataaagactattctgaatttaatccc
accaaagtttaaggttcacaaaattaaatctcctcatattcacatataaaaagcatgata
taggaaacataatctaatttgagaataaatcaacaaatagaaaccatgtcacaaaaatca
aaattaaattcaaaaggaagaatttttagcgaagaaaaattatattcacctatgaatagc
aagctttctcaaactgcaagagaatacaacagatttaataattga
DBGET
integrated database retrieval system
