Tetrahymena thermophila: TTHERM_00599900
Help
Entry
TTHERM_00599900 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_G_3
H_lectin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7844804
NCBI-ProteinID:
XP_001032464
TGD:
TTHERM_00599900
UniProt:
I7LT88
LinkDB
All DBs
AA seq
2675 aa
AA seq
DB search
MFLGNLKCFAFLASLLFTQIFAQSCNINSLISNKISCACSQSNYSINNYSYSSALTYGYS
IAGWIKTNTPSVNGNIVYAVYTTSGQRIYALHLQNQLSNIQVLLFGQSTNSIYQNTFPYA
ASQWVYTAVTIYQNSFDLFIMRPYNPTDLVSLANPVSNPDFQQVTAGFTLKACTHQYQTY
YSFCGYMAYFSLLTFNFKNLSSDDKLRLMYSGGLPLVVVKYDLTSFKTTNYEIDGTSTGH
NIYQSQYQLQTNNQNMFDLKVNRPTVPLMLNPIYPQDGDNFPYPGFTVSFWCYVTSIASQ
SNIFVFQNENASNNLLSVSSLNDAANGYFKFCVYNECYQSGSTNPANTWIQFTFSLRNQQ
INSLSDGAIIEYYTNGLFQKKIQFNTKYTENPYQTNVINFSSSTQNSVYLKYFIIQRGVM
VELTGSSCIASTQCLFSLMGYRCVLCAAGYSLTSDSDCSPPTNCKSSQLNKIYIKDPVLN
ICQEKCDKTCKDCDQSTRVCSTCFNTNINPPTCSCPANNIYKDDVRGFCSTTRADEHSQI
RVNSETTFANAGQVTKIVTLLKNQYNILNIIALTQLSINKNSNSQNDIQFYVSPQSDSSS
VSSSPFIHFKNANIMINNLVYSYIINQVGQQGITVKNIVISIPQTNSLRISGSGSYVQSY
AHQIRDYTPYVSIFLTGYGLVKGNLVDIQIQYSTVTREDMIITIQSQGDSPIYQVNLCIV
FSRFMTTEQQVQIPSYISTYPTDFQGARSVQSDFTVSQQQQYYVPFIYGLNSISYTATQD
MNFALTISKSTQTTYNYYLEVSSNTQIKSLKFTLLRFQPIATVDNTTTECFTSCTECSVS
SNTCTTCSDANRVPPLCSCAQSYFTKIDGTCSQCSQICKTCTLSATNCTQCFASNTLSPP
NCACMDGFTYVGTDYTQCLPCSNMCQTCSGTQSTCTKCNPGRINFPSCTCPDSQYDDGVS
KACQNCPPQCTKCTSNSSCSECKSGYVLIGNQCQQCSYKCSTCQNADVNNCSACSNSLRI
NAPGCNCQSGYFDTNTSNPVCQQCNIYCSTCVNSATNCQSCNGNRIFDGVSQCNCPPNSL
NPINGSAFCETCSISGATIQYSQDYSQIYITFTYSVLPSNTIASTITTFSAQNCQSVLGQ
SVVNNLGQGYTCALSADSKTFVIKLGYASTVSNNVIISFNNFQLKSNQPSCTSTYITSFA
NNQVIKPNTSQIPIALLSTNTQNYNVCQQIQIYVSSVQNSGGRSLQNFVWNEVSNKVQIP
SAYANQPILVFQPNTLTANTNYQFILTYTSSYGVAGQSTIQISTQDNSDMFYLQILNGID
GSSTYQFYTYQGIYLKATIQFNSCVSSFDTFTVQYIQWQQQFGSFNGIDLKSNKIENSSL
FFNQATFNFVVNPYIPVPKDKYQFNVEANVIYNGKNYLIQQTVYIQINQSPFIVQIIGGD
TVKQWNQQFTLAAYVFDPDSNQAFSNNNQVSISWTCTDQQTGANCLWQDGTLFKDQANNQ
LTVQVPERTFQYFQRIYLNVVVRKANLDGTIQQGSCKSQIVFLDYQLQSFQLSVPPQLSQ
GYISFTDKILFQVTDTNLISQFQNQIDSLAFKTSIQYQNNFYFTQALLSSFYQYISLKNL
FQLIQLDQKDTVNVLFEIDSPQAQTQFQTSYEVFVVDSPKSCVLNIATNAISVQNCISQY
QPLQYRISLYLAQMVQTITDMEQIQNHEYITLHGVPFSISNTFSFPQLSISFNILPSGST
QLGYVIQVMVQDSNGSVSSQVYKISNLVFQYNDNVSQNQQIPVEAQISIATIQSYLYIQQ
LTTNQKYLMSQLRLFNDEAMIHFNLYQSKNLEYQYKQQSSRRVLLSEKERFLVQSTIDQQ
IIQNIIGNITTYTIPQIFKYEVIWSSYKKFRIYHTQERLLFSTFRLIESLILTSSQGDVT
QMLYNTLISLCQQALVLTQINNQPLVYQGTTLAINLAQYTSQKLTTQLQIIPYNPSQSIA
QPYKVIQISQYSSTMFTNLNSFPEGIQRSPIITNFIRQSNSNIILNGVYPVYLKASLGKY
FNSDLFVCISYRTGSQNNNMAYPQQGQWTSQDCTTVMQPNTIDVICYCKTLDPVVLLEDT
HNIFINPSNTDLHSFRDIFSYPILILLISQLIVFIILSIYGVMNDEVDLVKVNQTVVPYS
LVVPNGANQKKLEQMQKYEKELQEKEKDIAAQKEQIAKDLNQLKQNIDYMKQVHDKKVQE
QQQQIIALQQEQNLKLENQQRAYEARIKELQQNYQNNYSLDKSGNQENIDQLQKSFQKQL
KEQHEQFSQQKQQLISKQKEEIKQIEEEEKDLKLKIEKQEKEMQAIIAQLNPEEEKNIPK
NPIQRVVWLMQKQKSKQDVVIDNPKSEKQTTPQITNDNFIEDISPLNVQANKNGNEKPAI
SIFEVEKMKLIENKPEERKYSNKDIISLIQIEDIEQRNLFEQKEQQPPVPIQSNQIKIPQ
QNIVLSQIQKDLNQENKQDAIPLSLNYNIVITLKVILKAFVYIHEFFSALITFENQISRP
IRFSLIFLKYILMAELLGLVQNSSQYSLDLIFSIPLVFVVSIISNIGIFFFKVLIRSQGF
KKCVGLILLSLSLIVVVSLLVLQFLNVKSPANKWWYAYLYSLGIDFILVEYAIILLKVSI
FTSLYRKKQFHNNFDIHMWLLVSTNDLTNFLLKNH
NT seq
8028 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttttaggcaatttaaagtgctttgcatttttagcatcactattatttacctaaatt
tttgcatagtcttgcaatattaattcattaattagtaataaaatttcatgcgcttgttct
tagtcaaattattctataaacaactattcatattctagtgctttgacatatggatacagc
attgcagggtggataaaaactaacactccttcagtgaatggaaatatagtttatgctgta
tatacaactagtggatagagaatatatgccttacatttgtaaaattaattatcaaatatt
caagttctattatttggatagtccacaaattcaatttattaaaatacatttccttacgct
gcttcttaatgggtttacacagcagtaactatctactaaaacagtttcgacctattcata
atgcgtccttataatccaactgatttagtatctctagctaacccagtaagtaatcctgat
ttttagcaggtgactgctggatttactctcaaggcttgtactcattaatatcagacatat
tactctttttgtggttacatggcatattttagtttacttacttttaattttaaaaatttg
agcagtgatgataaattgaggttaatgtattcgggaggattacctttagtagttgttaaa
tatgatttaactagttttaagaccacaaattatgagatagatggtacttcaacaggacat
aatatttactaaagttagtattagctataaactaataattaaaatatgtttgacttgaag
gttaatcgccctacagttcctctaatgctaaatcctatatatccttaagatggagataat
tttccctatcctggatttactgttagcttttggtgttacgtcacttctattgctagttag
tcaaatatttttgtgttttaaaatgaaaatgcttctaataatttattatctgtaagctca
ttgaatgatgctgctaatggatactttaaattttgtgtttataacgaatgctattaatca
ggttctactaaccctgctaacacttggattcaatttacctttagcttaagaaatcagtaa
ataaatagtttaagtgatggtgcaattattgaatattatactaatggattattccagaaa
aaaattcaatttaatacaaaatatactgagaatccttattaaacaaatgtaataaatttc
tctagttcaacatagaattctgtttatttaaagtacttcatcatttagagaggagtaatg
gtagaacttacaggttcatcctgcatagcttctacataatgtttattttctttgatgggt
tataggtgcgttctttgtgcagcaggatatagtttaacttctgattctgattgctctcct
ccaacaaactgtaaatcttcttaattaaataaaatttatattaaggatccggttcttaat
atctgctaagaaaaatgtgataaaacatgcaaagattgtgattaatctacaagagtatgt
tctacatgctttaatactaatattaatcctcctacctgctcgtgccctgcaaataatatt
tataaagatgatgtaagaggattttgttctaccactcgtgctgatgaacactcgcaaata
agagtgaattctgaaacaacttttgctaatgcaggataagttacaaagatagttactctt
ttaaaaaattagtataatattttgaatatcatagcactaacctagttaagtattaacaaa
aattctaactcataaaacgatatctaattctatgtctcaccttaaagtgatagttcatct
gtaagttcttcacccttcatacattttaaaaatgctaatattatgataaataacttagta
tattcttacatcattaactaagtaggacagtaaggaataacagtaaaaaacatagtaatc
agcattccataaactaattctttaaggataagtggcagtggttcctatgtataatcttat
gcgcattaaataagagattatactccttatgtttcaatattcttaacaggatacggttta
gtgaaagggaatttagtggatattcaaatttagtactcgactgttacaagagaagatatg
attattactatttaatcataaggagactctcctatctattaagttaatctttgtattgtt
ttctcgagatttatgacaactgagtaataagtctaaattcctagttatatttcaacttat
ccaactgatttttaaggagcaagatcagtgcaatcagattttactgtttcataatagcag
caatattatgtaccttttatatatggactgaattctatttcttacactgctacttaagat
atgaattttgcgctgacaatttctaaaagtacataaacaacatataattactatttagag
gtttcatctaacacataaattaaaagtcttaaatttactttgcttcgtttttagccaata
gctactgtagataatacaaccacagagtgttttacatcttgtacagaatgttctgtatct
tcaaatacttgtacaacatgctcagatgctaaccgagtaccacctttatgtagttgtgct
taatcttattttacaaaaattgatggaacatgttctcaatgttcataaatatgcaaaact
tgtactttatctgcaacaaattgtacttaatgctttgcaagtaatacattatctccccca
aattgtgcttgcatggacggatttacatatgttgggacagactatacttaatgcctcccc
tgctcaaatatgtgttaaacatgttcaggaacataatccacttgtacaaaatgtaatcca
ggaagaataaacttcccttcatgcacttgtccagacagctaatatgatgatggtgtaagt
aaagcctgctaaaattgtcctccttaatgtactaaatgcactagtaatagtagctgctca
gagtgtaaaagtggttatgtgttgataggaaaccaatgctaataatgcagttataaatgc
agtacttgctaaaatgctgatgttaataattgttcagcttgttctaatagcttacgtatc
aatgcaccaggatgcaattgctaaagtggatactttgatacaaacacaagcaatcctgtg
tgttaatagtgtaacatatattgctcaacttgtgtaaattcggcaaccaactgctaatct
tgcaacgggaatagaatatttgatggtgtaagctagtgcaactgtcctcctaactctctt
aaccctattaatggttctgcattctgtgaaacatgtagcataagtggagcaacaatatag
tattcataggattactcataaatttatattacatttacttactctgtattaccaagtaac
acaatagcttctactattactactttttctgctcaaaattgccaaagtgtgttaggttaa
tctgttgtaaataatctaggctagggttacacttgtgctttgtctgcagatagtaaaacg
tttgttataaaattgggatatgcctctacagtttctaataatgtaattatttctttcaac
aacttctagcttaaatcaaatcagcctagttgcacaagtacttacattacttcatttgca
aataattaagtaataaaaccaaatacttcctaaatacctatagcattattatcaacaaat
acttagaactataatgtttgtcaataaatttaaatttatgtttcatcagttcaaaattca
ggaggaagatcactctaaaattttgtatggaacgaggtgtctaataaggtttaaattcca
agtgcttacgctaattagcctatattagtattttaaccaaatactttaactgcaaatacc
aattattaattcatcctaacgtacacatctagttatggagtagctggctaatcaactata
caaatcagtacttaggataattctgatatgttctatcttcaaatattgaatggaatagat
ggatcaagcacttattaattctacacatatcaaggtatttacttgaaggcaactatttag
ttcaattcttgtgtttcttcatttgatacgtttacagtacagtatatttaatggtaacaa
taatttggtagcttcaatggaattgatttgaaatctaacaagatagaaaactccagctta
ttttttaattaagctactttcaattttgttgttaatccctatatacctgtccctaaagat
aaataccaatttaatgttgaggcaaatgtcatatacaatggaaaaaactatctcatataa
taaacagtgtacatttaaattaatcaaagtccatttatagtctaaattataggaggagat
acagtcaagtagtggaattagtaatttactttagctgcttatgtcttcgatcctgattcg
aaccaagcatttagtaataataattaagtaagtatatcttggacctgtacagattaataa
acaggagctaattgcttatggtaagatggtacattatttaaagactaggctaataattaa
ttaacagtttaagtaccagagagaactttctaatatttctagagaatctatttaaatgta
gtagttagaaaggcaaatttggatggaacaatttagtagggatcttgcaaatcttaaata
gtatttttagattattaactttaatcattttagttatcagtcccgccttaattgagctaa
ggttatatcagttttacagataagattttattttaagttacagacacaaatttaatatct
taattttaaaattaaatagattcactagcatttaaaacttctatttaatattagaataat
ttttatttcacttaggcactgctttctagtttctattaatacattagtttaaaaaatcta
ttttaattgatttagttagatcaaaaagatacggtaaatgtcttatttgaaatagattct
ccacaggcttaaacataattctaaacaagttatgaagtttttgttgttgattcacctaaa
agctgtgtgctaaatattgcaactaatgctatatctgtttaaaattgtatttcataatat
tagcctttgcaatatagaatatctttatatttagcttagatggtttaaaccattactgat
atggaataaatttaaaatcatgagtatattactctacatggtgttccattctctatttct
aatactttctcatttccttaacttagtatatctttcaacatattaccaagcggaagtaca
tagcttggttatgttattcaagtcatggtctaagatagcaatgggtcggtttcgagttag
gtgtataagattagtaatttagtcttccagtataatgataatgtatcatagaatcaatag
attccagttgaagcataaatttcaattgccacaatttaatcatatctttatatttaacaa
cttacaactaattaaaaatacttgatgtcataattaaggctgttcaatgatgaagctatg
attcacttcaatttgtactaatccaaaaatttagaatattaatataagcagtaaagctca
agaagggtattattatctgagaaagaaaggtttttagtttaatcaactattgattaataa
attatccaaaatataattggtaatattaccacatatacaattccttaaattttcaaatat
gaagtaatttggtcgagttataagaagtttaggatctatcacacccaagaaagactgctt
ttttcaactttcagattaatagaatcgctgatacttacatcaagctaaggagatgttact
taaatgttatataataccttaatttctttatgtcaataagctttagttctaacttaaata
aataatcagcctttggtttattagggaactaccttagctataaatttagcacagtatact
agttaaaagctaactacttaactttaaataataccttataatccatcttagagtatagct
tagccttacaaagttatttaaatatcataatattcatcaaccatgtttacaaacttaaat
agtttccctgaaggaatataaagatcgcctattataaccaattttattagacaatctaat
agtaatataattttgaatggtgtttatcctgtctatttaaaagcatctcttggtaaatat
ttcaactcagatttattcgtttgcattagttacaggacaggtagctaaaataataatatg
gcttatcctcaataaggttaatggacttcctaagactgcacaactgttatgcaacctaat
acaattgatgttatttgttattgcaagactttggatcccgtagttctgctagaagatact
cacaatatttttataaacccttctaatactgatttgcattcattcagagatatatttagc
tatcctattctaatacttttaatttcatagcttatagttttcattattctatctatttat
ggtgtaatgaatgatgaagtagatcttgtaaaagttaattaaactgtcgtcccttattca
ttagttgttccaaatggagcaaaccaaaaaaaacttgaataaatgtaaaaatatgaaaaa
gagctttaagaaaaggaaaaagatattgctgctcaaaaggaatagatagctaaggattta
aactagcttaaataaaatattgattatatgaagcaagtgcatgacaagaaagtttaagaa
tagtaataataaattattgctcttcaataagaatagaatttaaaactagaaaactaataa
cgtgcttatgaagcaaggataaaagagcttcaacaaaattactaaaacaattacagttta
gataaaagtggaaattaggaaaatattgattaattgcagaagagcttctaaaaataactt
aaagaacaacatgaacaattcagttagtagaagcagtaattaattagtaaataaaaagag
gaaattaaatagatcgaagaagaagaaaaagatttaaaactcaaaatagaaaaataagaa
aaggaaatgtaagccatcattgcgtaacttaacccagaagaggagaaaaatataccaaaa
aatcctatttaaagagtagtttggctaatgtaaaaacaaaaatcgaagtaagatgtagta
attgataatccgaaaagtgaaaaataaactacaccttaaatcactaatgataattttata
gaagacatatcccctcttaacgtttaagccaataaaaacggaaatgaaaaaccagctatt
tctatctttgaagttgaaaaaatgaaattgatagaaaataaacctgaagaaagaaaatat
tcaaacaaggatattatatctttaatacagatagaagatatagagtaaagaaatctattt
gaataaaaagaacagtaacctcctgtaccaattcaatcaaattaaattaaaattccatag
taaaatattgtactaagttagatatagaaagacttaaatcaagaaaataaataagatgct
attcccttaagcttaaattacaatattgttatcacacttaaagtgattttgaaagcattc
gtatatatacatgaattcttctctgccttaatcacttttgaaaatcaaatatcaagacct
atccgattcagtttgatatttttgaaatacattttaatggcagaattattaggcttagtt
caaaatagcagttaatatagtttagatcttatattcagcattcctttggtatttgttgta
tcaattatttctaatattgggatattctttttcaaagtattaattagatcttaaggtttc
aagaaatgtgttggcttaattttactctctctttctttgattgttgtagtatcgcttctt
gttttacaattcttaaatgtaaagtcacctgcaaataaatggtggtatgcttatctctat
tcattaggaatagattttatcttagttgaatatgctatcattctcctaaaagtaagcata
ttcacaagtctttatcgtaaaaaatagttccataataactttgacattcatatgtggtta
ctcgtatctacaaatgacttaaccaattttttattaaaaaatcattga
DBGET
integrated database retrieval system