Tetrahymena thermophila: TTHERM_00600030
Help
Entry
TTHERM_00600030 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UVSSA_N
DUF1236
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7844817
NCBI-ProteinID:
XP_001032477
TGD:
TTHERM_00600030
UniProt:
I7LZS2
LinkDB
All DBs
AA seq
1351 aa
AA seq
DB search
MTTQYEIPRQSQTEINAIQCDEPSNNQQCNDCFKKKYILKIYFNNLENEVKVKTKCLTRN
QIILGGIALVITISFLLAFLIPKSSSTEDNVKANNIPRIPITYATYQQDIMAGQQDNLIQ
IINVPNAQRQYNYTIINNKTIINSDGTTSIVSLPSVYSFSVVCVSVNQSEFDMILYFTQS
KITALNNISQIFQDYPINQGSNQQKTTVQNADYSGLLFDPTNFNQLQNLNSQEIQILKSL
NIDSQDFLNSNLPIVRFQILKNGQVGSIQKPLNMRYDLQQILLNVLEQISPNVQKSFYNT
TSYFKEGNKRMLKGPVKNTSNRFMNAQNNQTVLDAVVLSDFDGKLKKNYDNSDANDNTYQ
THYNQNLLFQNGALSQSNVSSQLQLFSNSQSLNQDLNVFRSAEINSQGQIQFWSQQDQVE
SQFLQQLIQDQEKMLKLNLTWQQAYDLQNKVQQYDNNNVSSNTGRLLQSQSLNQNIIGKA
IDSPIFQNYFSSINLQSNFFSECDNDSTLQKINCRSGFKAKFQDQIYQLQQQNLSQIYSN
VTIDKKVKQLNYLKNNVYNLMGTVTQKVSNQVQTAIDLINSLISRSSAFQNNIIQNLSNT
VNQNIQILNNTMNQFNAFTYNYSVSVINATSSFVKKYNDSLLSQYPAYVNLVNITFNNTV
IEFDSRIAKLRSLINNIIQNNLTISKNTYNALRNITDNEYLYFSIAFNQSQYWQPGYICS
LAQQTLNVTNFIQQNSNMDIYNQSVANYTPIWSQIRTNVTNGTSTKLQINLYNNFAAVLA
SMYVKSGPSVYLTYPVTVFSNQAQFQSSPFAIFYTTSSNQYAQGGIDDSALVDTIRQSEQ
ASDLDNQVAQLQALFDTPIDFRSTYQSFLNDFYQLLKTFTDDESAVQPQYQNYILDWMTQ
GYNKSFSLPKLLQEANLNVIGALNQTIPIVQNEYDQQTAIIGSTSSQILSQISSIYNTVN
AFLSDTNYPDNDPLSNQTPQEDTKFNSTVFGITNDYLAQQINQLANLLPQLHTVVDNLTN
YGPQISLLINDMRTYLQNYKIQLPQIPQAIFTPTFQTTFKTLISNYVAGFSLDADRALNN
LKLDTTGIANIQQFYSRLNQFISTDMQSSFTNNLMQQQNQMIHNYNLALTQIQSSKSNLI
TTDQLTFGNSKTQLNNYESKLQSINYTYVYPSPIGFNLKLNLQVNWTSGIQTTLTTQANN
ILFQTQSNLNLQVQGYFSALFGIVEVGAYINGSFLSAQFNSTINTNMTDNTGTNSLLAQY
DSSKIQIQGYSTQYIPQIVSSCTNNANIGNNNGIKSTVLSALYTNSSNVVGKIPHQQCQT
QVQASIIQSSIFNQINQDRKPQNQIIINQNY
NT seq
4056 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactacctaatatgaaatccctcgttaatcctagactgaaataaatgctatttaatgt
gacgagccttctaacaattaataatgtaatgattgctttaaaaaaaaatatatattaaaa
atttattttaataatttagaaaacgaagtcaaagtgaaaactaaatgtctcacaagaaat
taaatcatattaggtggtatagctttagtgatcacaatatcttttctattagcttttttg
attcctaaatcatcatcaacagaagataatgttaaagctaataacattcctcgtattcct
attacttatgctacttattaataagatattatggctgggtaacaagataatttaatataa
attattaatgtaccaaatgcttaaagacaatacaattatactataattaataataaaaca
attattaactcagatggtacaacttcaatagtaagtttaccatcagtctattcattcagt
gtggtttgtgtgagtgttaatcaatcagaatttgatatgattctctattttacccaatca
aaaataactgcgcttaataatatctctcagattttctaagattaccctataaaccaagga
agcaattaataaaaaaccacagtctaaaatgctgattatagtggtttattatttgatcca
acaaattttaattaattacaaaatttaaactcctaagaaatttaaatactaaagtcttta
aatattgactcttaggattttttaaacagtaatttaccaattgttagattttaaatatta
aagaatggctaagtaggttcaatacaaaaacctctaaatatgagatatgatttatagtaa
atattattaaatgttttagaataaatttcacctaatgtttagaagagcttttataatacc
acttcatattttaaagaaggaaataagagaatgctaaagggtcctgtaaaaaatacttct
aatagatttatgaatgcttaaaataatcaaacagttttggatgcagttgtattatctgat
tttgatggtaaacttaagaagaattatgataattctgatgctaacgataacacctattaa
actcattataattaaaatctccttttttaaaatggcgctctttcataatcaaacgtttca
tcataactttagctttttagtaactcttaaagcttaaattaagatttaaatgtatttaga
agtgcagaaattaattcttaaggtcaaatttaattttggtcttaataggatcaggtagaa
agttaatttttataacagctaatctaagattaagaaaaaatgctaaaattaaatttaact
tggtagtaagcttatgatttacaaaataaagtctagtagtatgataacaataatgtatct
tcaaatacaggacgacttctataaagttagtcattgaattaaaatattattggcaaggct
attgactcaccaatcttttaaaattactttagttctattaatttgcaatctaatttcttt
tctgagtgtgataatgattctactttacaaaaaattaattgccgttcaggatttaaagca
aaattctaagatcaaatttattagctttaataacaaaatctttcataaatatattcaaat
gttactattgataaaaaggtcaaataactcaactatttaaaaaataatgtctataatttg
atgggaactgtgacttaaaaagtctcaaatcaagtctagacagctattgatcttattaac
tctcttatctccagaagttcagcattctaaaataatattattcaaaatttgtctaataca
gttaatcaaaatatttaaatcctaaacaatactatgaatcagtttaatgctttcacgtat
aattactctgtaagtgtaattaatgcaacttcttctttcgttaaaaagtataatgatagc
ttattgtcttaataccccgcctatgtaaatcttgtcaatatcacctttaacaatacagtt
attgagtttgactctcgcatagcaaaacttagatctctcatcaataatatcatttaaaat
aacctcactatttcaaaaaacacttataatgcgttaagaaatatcacagacaatgaatac
ctttattttagtatagctttcaattaatcttaatactggtaacctggctacatctgcagt
ttagcataatagactttgaatgttactaactttatttaataaaattctaatatggatatc
tataattaatcagtggctaactatacccctatatggtctcaaataagaactaatgtaaca
aatggtacttccacaaaattgtaaattaatctttataataactttgctgctgtgcttgct
agcatgtatgttaaaagtggtccaagtgtatatttaacttatccagtcacagttttctca
aatcaagcttaattttaaagtagtccatttgcaatattttatactactagctcaaattaa
tatgcttaaggaggaatagacgattctgcattagtagatacaattcgttaatctgagcaa
gcaagcgatctcgataatcaagttgcctagttgtaagcgctatttgatactcctatcgat
ttcaggagtacttattaaagctttttaaatgatttttattaacttcttaaaactttcact
gatgacgagtctgctgtatagccacaatattagaactatatattagattggatgacataa
gggtataataaaagtttcagcttacctaaattactctaagaagcaaatttaaatgtaatc
ggtgctcttaattaaactattccaatagtataaaatgagtatgactagtagacagctatt
ataggtagcacttcttcttaaattctatctcaaattagcagcatctataatacagtgaat
gcatttttaagtgatacaaactatcctgataatgatcctctaagcaatcaaacaccacaa
gaagacactaagtttaatagtacggtttttggaattacaaacgattacttagcttaataa
ataaattaacttgcaaatttacttcctcaattgcacacagtcgttgataatctaacaaac
tatggtccataaatttcattattaatcaatgatatgagaacttacttgcaaaactataag
attcaactaccttagatcccctaagcaatatttactccaacatttcaaactacattcaaa
acccttatttcaaattatgttgctgggttttctcttgatgcagatagagctttgaataat
ttgaaattagatacaactggtatagctaatatccaacaattttatagtagactgaactaa
tttataagcactgatatgtaaagtagttttactaataatttgatgtagtaataaaattaa
atgattcataattataatttagctttaacttaaatctaaagctcaaaatctaatttaatt
actacagattaactaacttttggaaatagtaaaacttaacttaataattatgaatctaaa
ttacaaagtataaactacacatatgtttatccaagtcctattggatttaacttaaaatta
aatctttaagtaaactggacttctggtatttagactaccctaactacttaagccaataac
attttattttaaacttaatctaatttaaacttgtaggtttaaggatatttttctgcttta
ttcggtattgtagaagtaggagcttacataaacggttcatttttgagcgcttaatttaac
tctacaatcaacacaaacatgactgataatactggaactaatagtcttttagcttagtat
gactcttcaaaaatataaatttaaggttatagcactcaatatattccttaaatagtttca
tcttgtactaataacgcaaatattggaaataataatgggattaagtctacagtattatca
gcactatacaccaatagctcaaatgttgttggtaaaatacctcatcaacaatgttaaacc
taagtataagcatcaattatttaatcgagcattttcaattaaataaattaagatagaaaa
ccttaaaattaaattatcattaattaaaattattga
DBGET
integrated database retrieval system
