Tetrahymena thermophila: TTHERM_00627270
Help
Entry
TTHERM_00627270 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sp-DndD
AsnC_trans_reg2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7846235
NCBI-ProteinID:
XP_001019512
TGD:
TTHERM_00627270
UniProt:
Q23RX2
LinkDB
All DBs
AA seq
1404 aa
AA seq
DB search
MGFCLENLSHLSTHQFEIFIRQICQNLNYFYEDYMEHKQGVFFESLYITHISQCSKSNSQ
KFCFCSKFTNNYKSDSTQEINIERILGQEFRQQFILNYISNLYSNYLNQVDKFHKKQIEF
SYLSFLIEKSKNKTKSLKELFKIQQEYSKNKNWTNLIYIKNLINRASSLSQNFEGNKTNE
NQTIKMHDPITFDFLMTEFKNRLKSQILKQIEYFKYLCSNYFNLEELMNVSKLNLKQIQN
VRTLQKLLYDIHPNNLALNSLSQIFQSTLDFYSTNPKKLQNSKLQNTSSIIPLKDLFSPQ
SCSIYCSLINKTIDIKRTSLNFSQIFETQQVAIIGKQVSNLLPKDLFDAHELTMDEFINL
GNTDSTISQGERFVFAINGNGFIFPINIRIKVESIYDDFGVTAFIKKVNDQKQYIFFNEL
FQITDISHTIYQKIFSQEYSLNQLKNQLILNFIPLLDGIFSDKSLSQENYYNSCLLLKRR
KETSLEINSFKSNLKQTFYVNERMFSLVFRIRNLKSQNMKHIKYLEIENFAEEKSIYEKR
QSLNLLSKCLDLDFQLDDFLIRETQENDQKSEQMSNRQDNLFLKLLNSNEKCKDKNQEYS
TSFKVDSKIDLESQIQLNIQDQQSNTNFGYAEEETNNFKRNNSQNNYYQSNSASKKNQCE
QQIENLSSRIEINSFQNLQSSRPLNPHTFSNLTSVFKNATNESEKQKINQKSSQFHKEFL
SRQLNTTIQFDRPNQECTPIMFSVCNYFQNDKSSGSPESIIQNHKSIQAAAAAAEEEEEE
EEYNSYNFEKQIKMQPSKQNISEMKLNKLKEEEYQHSLNESQSSSKSIRKSIIKKITQNT
HTKIIRIIIFTGLMSIALLQTCALGFYFININNLISISNLFKKFNYANLINESVYQFLKE
QGFYYDTLHYRQILDLDRYIINPQNSSQIIKEISYRQAVSQKRQRNAAGQFSKNINQILK
SQDEEFFQYISETEIATISDFYDQVIFTRETKNNTILYTMLLFSSNLNQLYLQGTNPDYY
PESVVYANLETFNSSILKIQVMIYDQLINSYQWLKDIQQYQLIQILVSCVCLIAIALPFL
FYFNSQQYQILKLLGSFPPSLLQSQISLFYISLNHLEQLQKKEIQPKSRSSNIMQQVKPQ
SAKQLFPEQVYDKQNLIQFNNKNGQQKSSNKAENINFGNQIVSKRQRQIASFKQSRPFKL
KYIMASLLVAIPFMIQPIYNLVSVNQFVDESTSTLTQRQILFSSSQYILNFEVVHYKIWE
TIFYQPIFDWNFFYQYGKNITQQSEQVLGGIKNITHYETSSRYEKEQRKMYFSNLLEDNL
CNHIDIINNSAQQNPYFKKQTTSEECQKLLSKNFERGFILAFQYLTNLYRDWFQIKCYKN
TANEEQPFRHLQFQCLILITNLLF
NT seq
4215 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtttttgcttagagaacctctctcacctttctacccactaatttgaaatatttatt
agacaaatatgctaaaatttaaattacttttatgaagactacatggagcataaataagga
gtgttttttgaaagtctatacataactcatatcagtcaatgctcaaaaagcaattcataa
aaattctgcttttgttccaaatttactaataactataaaagtgatagcactcaagagata
aatatagaaagaatattaggataagaatttagatagtaatttattttaaattacatttct
aatctctatagtaattatttaaattaagtggataaatttcacaaaaaataaattgaattt
tcttatttaagttttttaattgaaaaatctaaaaataaaacaaaatcgctcaaagaactt
tttaaaatacaacaagaatattccaaaaataaaaattggactaatttgatttacattaag
aatctaattaacagagcttcttctctaagctaaaactttgaaggaaataaaactaatgag
aactaaacaattaaaatgcatgaccctattacatttgatttcctaatgacagaattcaaa
aatagattaaaatcttagattttaaaataaatagaatatttcaaatatctttgctcaaat
tattttaatttagaagagcttatgaatgtttctaaattaaatttgaaataaatttaaaat
gtaagaacactctaaaagctactctatgatattcacccaaataatttagcccttaatagt
ctttcacaaatattttaatctactttagatttttactctactaatcctaaaaagctttaa
aatagcaaattataaaacacaagctcaattattccattaaaagatttattttctccttaa
tcttgttcaatttattgcagtcttataaacaaaaccatagatattaaaagaacttcctta
aatttctcataaatatttgaaacatagtaagttgcgattatagggaaataagtttctaat
ttgttaccaaaagatttatttgatgcgcacgagctaactatggatgaatttattaattta
ggaaatactgattcaactataagctaaggtgagagatttgtatttgctattaatggaaat
ggtttcatatttccaataaatataagaataaaagtggaaagcatatatgatgatttcgga
gtgactgctttcatcaaaaaagttaatgattaaaagcaatatatattttttaatgaattg
ttttaaataactgatatcagtcacactatttatcagaaaatattttcttaggagtattca
ttaaattaattaaagaatcaactaatcttgaattttatccctttacttgatggaattttt
agtgataaaagtttgtcttaagaaaactattataactcttgtcttttgttaaaaagaaga
aaagaaacatctctagaaataaattcttttaaaagtaatcttaaatagactttttacgta
aacgagagaatgttttctcttgtgtttagaataagaaacctcaagtcttaaaatatgaag
catataaaatatttagaaatagaaaactttgcagaggaaaaatcaatttatgagaaaaga
caatctctgaatttgcttagtaaatgcttagacttagacttttaattggatgattttttg
attagagaaacttaagaaaatgattaaaaatctgaacaaatgtcaaatagacaagataat
ttattcttaaaattactaaatagtaacgaaaaatgtaaagataaaaattaagaatattct
acttcatttaaggttgattcaaagattgatttagaaagttaaattcaattaaatatttaa
gattaacaatcaaatacaaattttggttatgcagaagaagaaacaaacaactttaaaaga
aataattcttagaacaattattattaaagtaattctgcttctaaaaagaaccagtgtgaa
caacaaattgaaaatttatcttctaggattgaaatcaatagcttctagaatttgtaatcg
agcagacctttaaatcctcatacattttctaatttaactagtgtttttaaaaatgctaca
aatgaaagtgagaagcaaaaaattaattaaaaatcttctcaatttcataaagaattttta
agtagataattgaatacaactattcagtttgacagacctaattaagaatgtactcccata
atgttttcagtgtgcaattatttttaaaatgataaatcatcaggatcacctgaaagcata
atttaaaaccataaaagcatccaggcagcagcagcagcagcagaggaggaggaggaagaa
gaagaatataattcttataattttgaaaaataaattaaaatgcaacctagtaaataaaat
atctcagaaatgaagctaaataaattaaaagaagaagaatattaacactcgctaaatgaa
agccaaagctcatcaaaatcgataagaaagagtatcataaaaaaaataacttaaaacaca
cacactaagattattagaattattatattcacaggactgatgtctattgctttactataa
acttgtgctttaggattttattttattaacattaataatctcatttcaatttctaattta
tttaaaaaatttaactatgctaatttaattaacgaatcagtttactaatttctcaaggaa
taaggattttattacgacactctacattatagacaaattttagatctggatcgatacata
attaacccttaaaacagctcctaaatcattaaagaaatatcttacagacaagcagtaagc
caaaagcgctaaagaaatgcagctggacaatttagtaaaaacattaatcaaattcttaag
tcttaagatgaagaattcttttaatatatttctgaaactgaaattgcaactataagtgac
ttttatgatcaagttatttttacaagagaaactaaaaataatacaatattatacacaatg
cttttattctcatcaaatttaaattagttatatttgtaaggaacaaaccctgattattac
cctgaatcagttgtttatgccaacttagagactttcaatagctctatcttaaaaatccaa
gttatgatatatgattaattaataaactcttactagtggcttaaggatatataataatat
tagctaatatagatactagtttcttgcgtatgtttaatagccatagcattgcctttcctg
ttttactttaattctcaataatatcaaatactaaaacttttaggatcgtttccaccttca
cttttacaatcctaaattagcttgttttatattagcttgaatcacttagagcagctttaa
aaaaaagaaatttaacccaaaagcagatcctcaaatattatgtaataagtaaagccttaa
agtgcaaaataactttttcctgaacaagtgtatgacaaataaaatttaattcaatttaat
aacaaaaacggttaataaaaatcttcaaataaggcggaaaatataaattttggtaattaa
atagtttctaaaagataaagataaatagcttctttcaaataatctagaccttttaagtta
aaatatattatggcttctcttttagttgcaattccattcatgatttaaccaatttataat
ttagttagtgtaaattaatttgtagatgaatctacatctactttaacttaaagacaaatt
cttttcagctcttcataatatatacttaactttgaagttgttcattacaagatatgggaa
actattttttattaacctatttttgattggaattttttttattaatatggaaaaaatata
acttagtaaagtgaacaagttttaggtggaatcaaaaacataacacattatgaaacgagc
tcaagatatgaaaaagaataaagaaagatgtactttagcaatttattggaagataatttg
tgcaatcatattgatattattaataatagcgcataacaaaatccatattttaagaaataa
actaccagcgaggagtgccaaaaattattgagtaaaaatttcgaaagaggattcatttta
gcttttcagtatttaacaaacttatacagagactggttttaaataaaatgttataaaaat
acagcaaacgaagaataaccttttagacatttacaattctaatgtcttattttaataact
aatcttctcttttga
DBGET
integrated database retrieval system
