Tetrahymena thermophila: TTHERM_00628520
Help
Entry
TTHERM_00628520 CDS
T01020
Name
(RefSeq) DEAD/DEAH-box helicase family protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DSHCT
DEAD
Helicase_C
DEXQc_Suv3
MTR4-like_stalk
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7846213
NCBI-ProteinID:
XP_001019538
TGD:
TTHERM_00628520
UniProt:
Q23RU6
LinkDB
All DBs
AA seq
1415 aa
AA seq
DB search
MNGQEDQLLQAFDWLIYANQSRIPKILDFEQQLFQFDVKDQALPSHFQVVINNPERQNTQ
LYLNNHFTSVHYEESFADLKYIKKGQLERRILKDIYEHDVDLMGFQFDQNQVESEMLDIG
YKRALDEVDLHLKNPFTTTFSYDYMDNEFTGFQDQMVQNNSFKNYSTDQSQDNTQQQQKG
QQLLNEYYNQGNASQEINAQQVQGYQSQNNIVEDFQVLGNQVEQYLAELRQKQQSIKNRI
NIPQLSLEDLIKVNKFSRVLSIFQKAGQKEAKKHKVIQKSTVDMDPEEIFKQLKSEWVEE
QKEEEELKQSYELQILANLDFDVMIDKVEEKIQFEEQQLLEKVKKMQEELKSQSFEMQED
QIYSLGQQNKMEQFNKIKLVDTQEINEKKLQLSSSYDWAVEDQFNLAKFYEEVPKEKMAQ
QYPFELDAFQKRSVYRIERKESVFVCAHTSAGKTVVAEYAIAISKKLNRKAIYTSPIKAL
SNQKYRDFKQKYGDDVGLVTGDVQLNPNANCLIVTTEILRNMLYRNNDIIRDIEWVIFDE
VHYLNNPERGLVWEETIIMLPETVGFVMLSATVPNYMEFANWVGRTKKRKIYVQKTDFRP
VPLEHSIYLNGSIEVIKQGDNRFNATDYDQFKNRIIKTYMNQKNQLTAQKKSLKLEKYQK
GILKNTNTSMRNKRTMKAITEKFIKSTDEDDYNSSSSTNEGFNLMQLLIKCQNENLLPCV
IFCFSKRKIDEIANQIKQLNFCDYEETVRIEYYFRQCSRKIKSRDLNVPQIQTIKDLLLR
GIGIHHGDVIPFMKEVVEILFSQSLIKVLIATETFAMGINMPTKTVIFHSLKKFDSSGER
LLNSSEFTQMSGRAGRRGLDVKGNVIIFVNSIEQLPSKNDLNIIMDTKGQYLESKFKITY
ETIINLLNSNVLNVIDMMKKSYQENHKYAQLPNNIKKIKELKLKYLELKNMKCKLQPPGI
DELPIEKYIQSSQIMRQLNKNYFQQVKTYMVEKMELPSYCVMYDDVYKFYFGMIIYINLK
DKYEDRFLYVLYVDSIDVQQGPIFNFQEDAFHSHVVENHHYCDESNDYKEYTYKIFKLPV
SCICKIYEDDPGIEDGELEDQEYVQSCVKLLISKKNQFKEVFLSEEISSKKMKRKKFLDM
KFQNTTDISKSALNNNLDSIQTSLCHQCDIKDLHISQVFERKQIKTDLEELIKKVDENDL
NQRTSFESKLKILKRFGYVDLVNKPTFKARIAKEIQNIYVTEVIFQESLESLEECDIAAL
LSGFVCQAKSKSAVKYDPIDDFSPFYPNYDNFMESYLEIIQSVKAVISYECQFGVIQCGN
EDDYMFDQVYIRDLIEVVYQWMNGMDFQNICEMTSIQEGAIVRSFLRLENLLKNVRNGYI
IMGNYAMGVKLDRCMEMLKKDIIFSKSLYLDQDDH
NT seq
4248 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatggataagaagattaactactttaggcatttgactggttaatatatgctaactaa
agcagaattccaaaaatattagattttgaataacagttattttagttcgatgtgaaagac
caagctctccctagtcatttttaggttgtgattaataatccagaaagataaaatacataa
ttatatctcaataatcatttcactagcgttcactatgaagaatcttttgcagatttaaaa
tatattaaaaaagggtaattagaacgaagaattttaaaagatatttatgagcatgatgta
gatttaatgggtttttaattcgattaaaattaagttgaatctgaaatgttagatataggc
tataagcgcgcattagatgaagtagatttacacttaaaaaatccttttacaacaactttt
agctatgattatatggataacgaatttacaggattttaagactaaatggtgtagaataat
tcatttaagaattattcaacagatcaatcttaagataatacacaacaacaataaaaaggc
tagtaattattaaacgaatattacaatcaaggtaatgcaagctaagaaataaatgcttaa
taagtttaaggttattaatcgcaaaataatatagttgaggacttttaagtcttgggaaat
caggtagaataatacttagctgaactaagataaaaatagcaaagcattaaaaatagaatt
aatattccttagctttcactagaagatctcattaaagtgaataaatttagcagagtcctt
tctattttctaaaaagcaggttaaaaagaagcaaaaaagcacaaagttatttaaaaatct
actgtagacatggacccagaagagattttcaaacaattaaaaagtgagtgggtagaagaa
taaaaagaagaggaagaattaaaataatcttatgagctgtaaattttagcaaatttagat
tttgatgttatgatagacaaagtagaagaaaaaatacaatttgaggaatagcaactactt
gaaaaggtcaaaaagatgtaggaagaattaaaatctcaaagcttcgagatgcaagaagac
caaatttattctctaggatagcaaaataaaatggaataatttaataaaattaaattggtg
gatacttaagaaatcaatgaaaaaaaattataattgtcttcatcttacgattgggcagtc
gaagatcagtttaatttagctaaattttatgaggaagtacccaaagaaaaaatggcgtaa
taatatccttttgagctcgatgctttccaaaagaggtcagtttacagaatagaaagaaaa
gaaagtgtttttgtttgtgctcatacatctgcaggtaaaacagtagttgctgaatacgca
atagctatttctaaaaagcttaatagaaaagcaatttatacttctcctattaaagcttta
tcaaaccaaaagtatagagattttaagtaaaaatacggtgatgatgtaggtctagttact
ggtgatgtgtaactcaaccccaatgcaaattgtttaattgtaacaacagaaattttgaga
aatatgctctacagaaacaacgatataattagagatattgaatgggttatatttgatgaa
gttcattatttaaataatcctgagagaggtctggtttgggaagaaacaattattatgctt
cctgagacagtcggttttgtaatgctcagtgcaacagttccgaattacatggaattcgct
aattgggtaggaagaactaaaaaaagaaaaatttatgtataaaaaactgattttagacct
gttcccttagaacattctatttatttaaatggctcaatagaagtaattaagcaaggagac
aatcgttttaatgccactgattatgactaatttaagaacagaattataaaaacatacatg
aatcagaagaattaattaactgcataaaagaaatcattaaagcttgaaaagtatcaaaaa
ggaattctaaaaaatacaaatacatcgatgagaaacaaaagaacaatgaaagcaatcact
gaaaaattcattaaatccactgatgaagacgattacaattcttcaagcagtacaaacgaa
ggatttaatttgatgtaactcctaattaaatgctaaaatgaaaacttactaccctgtgtt
attttctgcttttctaaaaggaaaatagacgaaatagcaaattaaattaaataacttaac
ttttgtgattatgaggaaactgtaagaatagaatattatttcaggtagtgttccagaaag
attaagtcaagagatttaaatgtgccttaaatacaaaccattaaagatttacttcttaga
ggtataggtatccatcatggtgatgttattcctttcatgaaagaagttgttgaaattctt
ttctcacaaagccttataaaagttctaattgctacagaaacatttgctatgggtattaat
atgcctacaaaaacagttattttccactctcttaaaaagtttgactcttctggtgaaaga
ctgctgaattcatcagaatttacttaaatgagtggtagagcaggtagaagaggtttagat
gtaaagggaaatgttataatttttgttaattcaattgagtagcttccatctaaaaatgac
ttaaatatcataatggacactaagggataatatttggaatctaaatttaaaatcacatat
gaaacaatcatcaacttgcttaattctaatgtacttaatgtaattgatatgatgaagaaa
agttattaagagaatcacaaatatgcttagttaccaaacaatatcaagaaaataaaagaa
cttaaattaaaatatttagaattaaagaatatgaaatgcaaattacaacctccaggaatc
gatgaacttcctattgagaaatacatataaagttcttaaattatgagataattaaataaa
aactatttctaacaagtaaaaacatacatggtagaaaagatggagcttccttcttactgt
gtcatgtacgatgacgtttacaaattctattttgggatgattatttatatcaatcttaaa
gataaatacgaagacagattcctatatgttttatatgtagatagtattgatgtccaacaa
ggacctatttttaatttccaagaagatgcattccactcacatgttgtcgaaaatcaccat
tactgtgatgaatctaacgactacaaagaatatacttacaaaatatttaagctgcccgtt
tcttgcatttgtaagatatacgaagatgaccctggaattgaagatggagaattagaagat
taagaatatgtttaatcatgcgttaagttgcttatttctaaaaaaaattaatttaaagag
gtttttctatctgaagaaatctcatctaaaaaaatgaagaggaaaaaattcttggatatg
aaattctaaaacacaactgacatatcaaaatctgcactaaataataatttagactcaata
taaacttcactttgtcattaatgtgatatcaaagatttgcatattagccaagtcttcgaa
agaaagtaaattaaaactgatctagaagaacttattaaaaaagtagatgaaaatgactta
aatcaaagaacaagttttgaaagtaaattgaagattttgaaaagatttggttatgttgat
ttagttaacaaacctacttttaaggctcgtatagctaaagaaatacaaaatatttatgtc
acagaggtaatattctaagaatctcttgaatctttagaagaatgtgacatagcagctctt
ctaagtggttttgtatgttaagctaaatctaaaagtgcagttaaatatgacccaatagat
gactttagccctttctatcctaattatgataattttatggaatcttatctagaaattata
taatctgtcaaggctgttatctcttacgaatgttaattcggagttattcaatgtggtaat
gaagatgactatatgtttgatcaagtttatataagagacttaattgaagttgtatactaa
tggatgaatggaatggatttctaaaatatttgcgaaatgacatctatataagaaggtgct
atagtaagaagcttccttagacttgaaaatttactcaaaaatgtaagaaatggttatatt
attatgggaaattatgcaatgggagttaaactagacagatgcatggaaatgctcaagaaa
gatataattttttctaaaagtttgtatttagactaagacgatcattga
DBGET
integrated database retrieval system
