Tetrahymena thermophila: TTHERM_00653970
Help
Entry
TTHERM_00653970 CDS
T01020
Name
(RefSeq) nephronophthisis protein, putative
KO
K16478
nephrocystin-4
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tet00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
03037 Cilium and associated proteins [BR:
tet03037
]
TTHERM_00653970
Cilium and associated proteins [BR:
tet03037
]
Primary cilia and associated proteins
Nephronophthisis-related proteins
TTHERM_00653970
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4211
Bromo_TP_like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7825428
NCBI-ProteinID:
XP_001013949
TGD:
TTHERM_00653970
UniProt:
Q23AY0
LinkDB
All DBs
AA seq
1714 aa
AA seq
DB search
MSQAFRNPQDGQNYNRNHQGAGPQQKQKQIKIDPNDLELMSISKWNKLRQDVKIRPAYSL
RITNPNRESDCYRLTPKGLDGLNYSPKSRETKRLAIKFNFSFYSNQLKEFFGRSYLTGAY
GLRSEQQGYNYQFEYSHPFSLFFHTQLEKSAATLIIFEAYILEIGNHDIILSTFSCGVGE
ININNLLKEPQSVALKNNTMRGYVSKASTEEQRIANTSIRFNFILDYFPLLQKIKHLFPE
SVLVSTNDPIPGLAEQWLDTKFQENQTLKIDQVFEIMMDLLPTYKLYLVNVQILIRDNVE
KELVRQVQQFLEVSKSINNKVIFKEKKLICGFHNGWDFVNRGGGSNRVTLKQQIKEVIKN
KDGQDSNVISLEYSGMHEIDNVFDSDQSCIVLQLEYDIEYVAQARQIATRVISWLPISVS
GKLQSQSELIVQEVMLHGPGKSVDGQKMISLPFREEFEIQVSAGFRVVPPGTNENNLYEE
IQKARVVQQDYRSQQMQSQQDQSRQPGQPVHQAKPLPFPQQQLNRMPTGADLQLQMLDQQ
LMNERRRLEQINDQILQRRQLQNAGGAPFNIQDYQQITWEPRNEQERYLKQLQQQEMMMK
QQIEQFQRERDQIQMGLTQEYKMMREELVKTRQSASAPGFYKKATKIQPVRQSPQKQQGG
YNYENDLDEDEIIEGRQLDFNPIRSQVTYQGEKDQPLIIHLNQPMYGKRELSQKDKLELI
NQGVTGLLDDIPPMNTKEQYADEKTILEEDMKDQLKAQTVIFRIFSIKPDIYQGLPKRMF
LTFNFFDFPKYKTESFSYESKDDQNAILKMIENKSPLLVYREAFFKGEEEKFMSFKFDID
PSKSKYNDLFKDFIKYLIKKQLHVDIWDADTQMLYGSFKIPLHKIRRQGQNKKTTQLDLD
IVNPNFVGYRGSIQIQIDNIGKEEAFPNKRKDQEYENKINSVNQWQNKQTDKIKVISDSQ
ITIPINYIKNQRTNNASKVSKLDDQNNADAGVRSDEQVRKVERVKRFKNNTLNQAAMLFN
EDDQTMLNKISLGYDISKIKELSQHRITQIDEIKSKKKPDFVKSVISKFLNEEKVLSVSY
GRQEIVPYLLQNPTATIQTFSIIIEDADEDILNHSEFEPVTDSTEWKYWISALNLTELPS
YDIIQGNTLVLEPNQKVHVLFKFMTYRNIDPQLKDKQDAERISQQRDAEYRQKHINPRSI
NVFFSLKQQTIVGGFRIKVEPHQQIIDHIFRYYERATKTVNITLPPLYLKDQAPMLKPTL
HVTDNKVAVEWVNEQEIAIYTKMPNISKIMRFNILVYNSDLRSNLLSNIQVELHGLEGVD
VHVNMGQTTQFKLNLPGDIPRVVQLYSSMTNILWFSSPYDTTFTLPPGKITQIETAVKSL
STGSQRIQVNAVDVHSNELIHSWIVRIETDIPKPNKVFELTATALKESIQVFEYRNKSQK
TKTFQFLSSDPSILEVLDPSKQILGNSGEEIAVRVVPREYKAPEAQVIIFASDYDETVFD
TMKFRIRYIFNDEAQSLQAFNRLKQQKDMILQQQAQQSMNLEDQQHQIGYQSGNNFYNNN
DPYYQSSSNWQNDDGYGNQGNYQPNDSRYGQNSFYNDGRRQNNYEDNRRYQGNYQDYGQN
NNQYNYQQNYDENPKRRGNSNQNYDNQYQDYGRNQPSLQRGGASNYDDYNARQGNNNNNY
DQYNQGQQNRQNKKVKFDQQQNYNNYGRNNYNQY
NT seq
5145 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttaagcttttagaaacccataagatgggtaaaattataataggaatcattaagga
gctggtccttagcaaaaataaaaataaattaaaatcgaccctaatgatttagaactcatg
tcaataagcaaatggaataagttaagataagatgtaaaaattagacctgcatactcacta
agaatcacaaatcctaatagggaatccgattgttacagacttactcctaaaggattagat
ggtttaaattattcacctaagtcaagagagacgaaaaggttggccataaaatttaatttc
tcattttattcgaattaactcaaagaattctttggtcgttcttaccttactggagcttat
ggacttaggtctgaataatagggatacaattattaatttgaatattcccatcctttcagt
ttatttttccacacacagcttgaaaaatcagctgctactttgattatttttgaggcatat
atcttagaaataggaaatcatgatattatattaagtactttttcttgtggtgttggtgaa
atcaacattaacaacttgctaaaagaaccttaatctgtggctttaaaaaataatacgatg
agaggatatgtcagcaaagcttcaactgaggaatagagaattgctaatacatctattaga
tttaatttcattttagattatttccctttactataaaaaataaaacatctctttccagag
agtgtgttagtttctactaatgaccctattcctggattagcagaataatggctagataca
aaattttaagaaaattaaactcttaaaatagatcaagtgtttgagattatgatggatctg
cttcctacttataaattatatctcgtaaatgtataaatcttaattagagataatgttgaa
aaagagttagttaggcaagtttaacaattcttagaagtatcaaaatcaatcaataataaa
gtcattttcaaagaaaaaaaacttatttgtggttttcataacggttgggattttgtcaat
agaggtggaggctcaaatagagttactttaaagcaataaattaaagaagtcataaaaaat
aaagacggataagactctaatgttatcagcttagaatatagtggtatgcatgaaatcgac
aacgtttttgattctgattaaagttgtattgttctttaattagagtatgatatagagtat
gttgcttaagcaaggtaaattgctacaagggttataagctggctcccaatatctgtgtct
ggaaaattataatcttaatctgagttaattgtgcaagaagttatgcttcatggaccagga
aagagtgttgatggataaaaaatgatatctctcccttttagagaagagtttgagatttaa
gtatctgctggatttagagttgttccaccaggaactaatgagaataatctttatgaagaa
attcaaaaagcaagagttgtatagtaagattacagaagttagtaaatgcaatcataatag
gattagagcagatagcctggatagcctgtacattaagcaaaacctttaccttttcctcaa
tagcagttaaatagaatgccaacaggggcagatttataactttagatgttagactaatag
ttgatgaatgaaaggagaagattggagcagattaatgattaaattttataaagaaggcag
ttgtagaatgcaggtggagcacctttcaatatttaagattatcaatagataacttgggaa
ccaagaaacgagtaagagcgttacttaaagtaactttagtaataagaaatgatgatgaag
tagtaaatagagtaattttagagagaaagagattaaatataaatgggtcttacataggaa
tacaaaatgatgagagaagaacttgttaaaacaagataaagtgcaagtgcccctggcttt
tataaaaaagcaactaaaatttaacctgttagataatctccttaaaaatagtagggaggc
tataactatgaaaatgatttagatgaggatgaaatcattgaaggaagataactagacttt
aatcctataagatcttaagtaacatactaaggagaaaaagattaacccctcattatccac
cttaattaacccatgtacggtaaaagagaattatcttaaaaagataaactcgagttaatt
aattaaggagttactggattactcgatgatatcccacctatgaatactaaggaataatat
gctgatgaaaaaactattttagaagaagatatgaaagattaattaaaagcttaaactgtc
atatttagaatattttccattaaacctgatatttattagggtcttccaaagagaatgttt
ttaacatttaatttttttgattttcctaaatataaaactgagagcttttcttatgaatca
aaagatgactaaaatgctattttaaaaatgattgagaataagtcacctcttcttgtttat
agagaagctttctttaaaggtgaagaagagaagttcatgtcattcaaatttgatattgat
ccctctaaatcaaaatacaatgacttgtttaaagactttataaaataccttataaaaaaa
taacttcatgttgacatttgggatgctgatactcaaatgctctatggatcttttaaaata
cctttgcataaaattaggagataaggacaaaataaaaagactactcaactagatctcgat
attgttaaccctaattttgtaggttataggggttcaattcagatataaattgataatata
ggaaaagaagaggctttccctaataaaagaaaagattaagaatatgagaataaaataaat
tctgtaaattaatggtagaataagtaaactgataagataaaggtaatctctgattcacag
ataacaattcctataaattatataaagaatcaaagaactaataatgcttcaaaagtttct
aaactagatgattaaaataatgctgatgcaggtgtaagatcagatgagtaagttagaaag
gttgagagagtaaaaaggttcaagaataatactcttaactaagctgctatgttatttaat
gaagatgactaaactatgttaaataaaatatctcttggctatgatatcagcaaaatcaaa
gaactatcataacacagaatcacgcaaatagatgagataaaaagcaagaaaaaaccagat
tttgttaagagtgttattagcaaattcttaaatgaagagaaagtattatcagtttcatat
ggaagataggaaatagttccttatttattacaaaatcctacagccacaatttaaactttc
tcaattataattgaagatgcagatgaagacatcttaaatcatagtgagtttgaacccgtt
actgattcaactgaatggaagtactggatttcagcacttaatttgacagagttaccatct
tatgatattattcaaggaaatactttggttttagagcccaactaaaaagtgcacgtttta
tttaaatttatgacatatagaaatattgatccctagctaaaagataaataggatgcagaa
agaatttcatagcaaagagatgctgaatatagataaaagcacatcaatccgagatcaatt
aatgtattttttagcttgaaacagcaaactattgttgggggttttagaataaaagtagag
cctcatcaatagattatagatcacatattcagatactatgaaagagcaacaaaaactgtt
aatattacacttcctcctttatatttaaaagactaagcgccaatgctaaaacctactttg
catgtaacagataataaagttgcagttgaatgggttaacgagcaagaaatagctatttat
actaaaatgcctaacatttcaaaaataatgagatttaatattttagtgtataactctgac
cttcgctctaatttattgtctaatattcaagtagaactacatggactcgaaggggttgat
gttcatgtaaatatgggtcagacaacataattcaaattaaacttacctggagatatccca
agagtagtataattatacagttcgatgaccaatattctttggtttagctctccatacgac
acaacttttactttaccaccaggaaaaataacataaatagaaacagctgtcaaatcgcta
tcaacaggatcttaaagaatctaagtaaatgccgttgatgttcattcaaacgaacttata
cactcttggatagtccgtatagagacagatattccaaaacccaataaagtttttgaatta
actgcaactgcgttaaaagagtctatttaagtatttgaatatagaaataagtctcaaaag
actaaaactttctagttcttatcctcagatccatcaattttagaagttttggacccctct
aaacaaattcttggtaatagcggagaagaaatagctgttagagtcgttcctagagaatac
aaagctcctgaagcccaagttattatattcgcttcagattacgatgagactgtctttgat
acaatgaaattcaggataaggtatatttttaatgatgaagcacaaagcttgcaagccttt
aataggctaaagtagcaaaaagatatgattttgcagtaataagcacaataatccatgaac
ttagaagattaataacattagattggttattaatcaggaaataatttttataataataac
gatccttactactagtcaagttcaaactggtaaaatgatgatggatatggaaatcaagga
aattattaaccaaatgatagtagatatggataaaatagcttttataacgacgggagaaga
tagaacaattacgaagataacagaaggtattaaggaaattactaagattatgggtaaaat
aataattaatacaattatcaataaaactatgatgaaaatccaaaaagaagaggaaattcc
aattaaaattatgacaactaataccaagattatggaagaaaccaaccaagtctttaaaga
ggaggtgctagtaattatgatgattacaatgctagataaggaaacaataataataactat
gattaatataattaaggatagcagaatcgctaaaacaaaaaggtgaaatttgactaatag
taaaattataataattatggaagaaataactataattaatattga
DBGET
integrated database retrieval system