Tetrahymena thermophila: TTHERM_00715950
Help
Entry
TTHERM_00715950 CDS
T01020
Name
(RefSeq) zinc finger, C3HC4 type (RING finger) protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
zf-C3HC4_3
zf-C3HC4
zf-RING_2
zf-C3HC4_2
DUF3397
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7831862
NCBI-ProteinID:
XP_001031952
TGD:
TTHERM_00715950
UniProt:
I7M651
LinkDB
All DBs
AA seq
1218 aa
AA seq
DB search
MNIQKKKKIEKITQYIIYLLILLFLYLLLNRKIKKQSQKLQKTMNIYLLALAFLLGSVVG
QGYEQSLIRYELLDEIQIRTDQTNPNVRTLLISEANTVLLISESSIAAYDMKTLNYLSQI
SIHSDSKIKEVNYLNVETQQSLYIVIQTESQEFKYFKFFTASQIIIQQKHSIIYPLLYPI
IYDLNLNNTSNTADQESEDQKKYIYILESHPQVEQDIVQRNSLSIMQYSKNSQRINSFCQ
ITYQFDKEDLSVKCKEVSYLNSEQNKFAIDLNEQYFFQKIDSQNHIFFFNKSEIITLHNS
ERMSHYSLIDDFKFENEPILNDHEAFKNFTFWKMGQIASQQFVFIYSDNQFFYIVIYNIM
AKKITKIDKLDSFMNQYQYNIKDHFNVDILFYNKKILFQSQYDFIEVIINDNSFAQTTQY
QTVNKSFDGFSNNVRFLELSYTHEGQVAQFAISRSLFSNSTYNIYIQNCMSSQNNQNDSE
KGSYFANEFSCRKLSCSSHLMFQSRYSINQQVCLLLDIQKEKKQSNQWYKPPIFILLSIV
LGIIGMKQVIKYIKKIIDKVRQYRTGNSIENKNLLKQDISEREKDGENYKMRGDIELTSQ
NNEVVIQSPNIQSNVNDKVQKLLNEQISDLNSQSSGSSVGLNKQNSNNNEGITPTQQDDL
LTNKLIKQQDDLKDSYYNKSQLYSQQVQKEEKIKQLKLLQQQQLQLMIEKKNKTQIIQQS
KSVQHIPIDQPFNPQIFHNYGGYQGNNIIPPYNQINNQNNQFQNQNANNLYYPYNRAING
GVAGGQQFLLNQNILNNPNLNNQNLNNQNQNLDNPNLNQYNQNIQQEALTAQPIEPIING
QFDVGQSVYIPQQKQNQQVNNNQIIPANNIANNNNNMIQNNFYQANLIQNEKQNNNQQFN
NQNNQGMKNTHLNITQQLKFFQWALDQQFGFNQLNQVPLPHIIGDSLFQKSQSNLSNSNQ
IQQNQSIPGQQQLQQSLSSFQQFLSMELGDSSSYADNKPFILSHSQIEKLTQTLHQQYEV
YKNSGINNLQKKEESELFQMFIKNELKSDLVFNQANEQFQQVQDDLKSTAVTSAVQPSSL
MSNSQNQGNQNQQLLVYEEQKQQREENLNKKYNNINIGFQKQRSVEFLEDTQGLNTIAKI
NSQNHPDNPNKTSKNASHNHTLSKEDARLCQICYQHEKDSAYKCGHRYCYSCALEVKKKF
GKCSFCNFEIEDVIKLYD
NT seq
3657 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatatacaaaaaaaaaaaaaaattgaaaaaattacataatatattatatatttatta
atattattatttctttatcttcttttgaatagaaaaattaaaaagtagagtcaaaaactt
taaaagactatgaatatttatttattagcactagcttttttactaggaagtgttgtaggt
taaggttatgagtaatctttaataagatatgagcttttagatgaaatttaaattagaact
gatcaaacaaatccaaatgtccgtacgcttttgattagcgaagctaatacagtgcttcta
atatcagaaagctctatagcagcttatgatatgaaaacattaaattatttatcttagatt
agtattcattcagattcaaaaatcaaagaagttaactatttaaatgtagaaacttagcaa
agcttgtacattgttatttaaacagaatctcaggagttcaaatattttaaattcttcaca
gcatcttaaataataatacaataaaaacattctattatctatcctctactttatcctatt
atttatgatttgaatttaaacaatacctctaatactgctgattaagaaagtgaagatcaa
aaaaagtatatctatattttagaaagtcatccttaagtagaataagatatagtttaacga
aatagtctatctattatgcagtacagcaaaaatagctaaagaataaattcattttgttaa
ataacatattaatttgataaagaagacctttcagttaagtgtaaagaggtttcctaccta
aattctgagcaaaataaatttgcgattgatttgaatgagcaatattttttttagaaaatt
gattcttaaaatcatatatttttttttaacaaatctgaaatcattacacttcacaattct
gaaagaatgagccattacagcttaatagacgattttaaatttgaaaatgaaccaatctta
aatgatcatgaagcatttaaaaattttactttttggaagatgggttaaattgcttcgcaa
taatttgttttcatttactcagataatcagtttttttatattgtaatatataacatcatg
gcaaaaaagattacaaaaattgacaaattggatagttttatgaattagtatcaatataac
ataaaagaccattttaatgttgatattctattctacaataaaaaaatcttatttcaatca
taatatgattttattgaggtaattataaatgataattcttttgcttaaactacttagtat
taaactgtgaataaaagctttgatggcttttcaaataatgttagatttttagaattatct
tatactcatgaaggataggttgctcagtttgcgatatctaggtcattattttcaaactct
acttataatatatatatttaaaattgcatgagttcttaaaataactaaaatgatagcgaa
aaaggtagttattttgctaacgaattttcttgtagaaaattaagttgcagctctcatcta
atgttttagtccagatatagcataaattaataagtgtgtctacttttagatatttaaaaa
gaaaagaaataatctaactaatggtataaaccaccaatctttattctattaagcattgta
ctaggaattataggtatgaagcaagttatcaaatatattaaaaaaataatcgataaagtt
aggtaatatagaacaggtaatagcatagaaaataaaaatttattaaaataagatatttct
gaaagagaaaaagatggagaaaattataaaatgagaggagacatagaattaacttctcaa
aacaacgaagtggttatttagtctcctaatatttaaagtaatgttaatgacaaagtgtaa
aaactattaaacgagtaaattagtgatctaaattcgcaatcttcaggcagttcagttggt
cttaataaataaaatagcaataataatgaaggaataactcctacctaataggatgatcta
cttacaaataagttaattaaacagtaagatgacttaaaagatagttactataataaatct
caactatatagtcagtaagtatagaaagaagaaaaaattaaacaattaaagctcttataa
tagcagtaactatagcttatgatagagaagaagaataaaactcaaattatttagtaatca
aaatctgtctaacatatcccaatagattaaccttttaatccttaaattttccataattat
ggtgggtattaaggaaataatataatccctccttataattaaataaataatcaaaataac
caattctaaaattaaaatgcaaataatttgtactatccttataacagagctataaatgga
ggagtagcaggaggataataatttttattaaatcaaaatatattaaacaatcctaattta
aataattaaaatctaaataaccaaaatcaaaatttagataatccaaatttaaattagtat
aaccaaaatatttaataagaagcacttacggcctaaccaattgagcctatcataaatgga
taatttgatgtagggtaatcagtttatattccataacaaaaataaaactagcaagtaaat
aataattagattattcctgcgaataatattgcaaataataataataatatgatttaaaac
aatttttaccaagctaatttaatataaaatgaaaaataaaataataactaataatttaat
aattagaacaattaaggaatgaaaaacactcatttaaatattacataatagcttaaattc
ttttagtgggcattagactaataatttggatttaactagttaaattaagttcccttacct
catattattggtgatagtttattctaaaaatcatagagtaatttatccaattccaatcaa
atccaataaaactaatcaatacctggccagtaatagttgtagtaatctttgtctagtttt
taatagttcttatcaatggagcttggcgattctagtagttatgcggataataaacctttt
attttatctcattctcaaatcgaaaaattaacataaactctccactaatagtatgaagta
tacaaaaattctggaattaataatttgtaaaaaaaagaggaaagcgaattattttaaatg
tttataaaaaatgaattaaaatctgatttagtattcaattaagcaaatgaacaatttcaa
taagtttaagatgacttgaaatccactgctgtaactagtgctgttcaacctagtagttta
atgtcaaactcacaaaattaaggtaattagaattaacagttacttgtttatgaagaacag
aagtagtaaagagaggaaaacttaaataaaaagtataataatattaatataggattctaa
aaataaaggagtgtggaatttttagaagatacctaaggtttaaatactatagcaaaaatt
aattcataaaatcatccagataatccaaacaaaacaagtaagaatgcatctcataatcat
actttaagcaaagaagatgcaagactttgttagatttgttattaacatgaaaaagattct
gcatataaatgtggtcacagatattgctattcctgtgctttagaagtaaaaaagaaattc
ggtaagtgttctttctgcaactttgaaatagaagacgtaattaaactatatgactga
DBGET
integrated database retrieval system
