Tetrahymena thermophila: TTHERM_00717710
Help
Entry
TTHERM_00717710 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Chlam_PMP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7839531
NCBI-ProteinID:
XP_001015091
TGD:
TTHERM_00717710
UniProt:
Q23EA7
LinkDB
All DBs
AA seq
2058 aa
AA seq
DB search
MQINIQKFNLLINLLQYLKQISTNCIPNTNQFSEDLLHGTIISRTYQLIIFYNQFSIRVY
SLKEQIYKLNYYSSHFTAYSVYFDRFSSIIIFGEYFSQDFLILNLITYKIQPTPFPLFNT
KNLEDQYKFYFFSDQKRVMLLSSYVSFIQIYDLDTQASPQTIQLQYQFNQQSQVVVDENL
NLVMFIDNQNQIEIISYQANQIVKTYQLDYIKNEVNAYQKVLIWDSFKRKIFVSSNNIFY
ILDYDNNNFICKYQFQRTIFDIYISFNKNQIFVTDYLNLRVFDYSIIEFDQILIPQYLIP
KFLQINQNQYILFDDSQSTIKNIVQGEVKDFKYFNSLHHAPFYFNFYNNNSSQFYLITFN
QLYILQISSTKLTTIFYQLLDSQIITFISESDSEVLFLTQKQTLYCLTKNLINPQLIALT
YISTGIGEFIMINNTYLIYSSTKNSSQWNKITLQNTQSDSNAIKLEQFIFNLEKNDTVKQ
LIKIDNTLSVIMLTKKYIQIIDAQTGNIQQSTLLDFQNQYSQIYFDALYGRILYSDRIIG
VKVYDNQLQAIKSSLPSSGIRLKIKDSFLFMLSFNSVSIYLRKDLQFFQVIRNFNSTQSL
IDIEYTGYNYIFLLYFDKQITFMQVSPFQQPQLVDILSVSNYVILSKQVNQKNSEYLVVN
MTILTFEYTIEYITELNIGGYQNKFCSAQLQIKTSQSDQLTKMQQTDYLNLLSLKQLLIQ
NIIYSLYIDNGEQTDLMYPFISSSSVTTDYSLKIQAQNSNSIYLKTQNSTDQNIVELQLN
SLKLSFQNINKTQYLFGNQTFQKLARLYLNDIELLEIGNNQLIFQGIDHIFITNLIINGE
SIQLSNNKTIIFQDINFVIVQNITLINCQFSNIFNIFSFSNINQLIISNLYIRLNKLASI
INQNSLINISNINNLTINNTYILQNSIENVEIFKIRNVTEVSINSMIFSENQIIINQDID
LQGIIFYFETIPYISINQIQFNKLSISSISSLSLLKFSNINQTLQFKDLIFKYSIISDNQ
NNFVSNQEYFIIECEGIVLSNFSNISISNSDRISFVYMHQQTNIKGIIIYNQISIISNYC
HYNSDTNQLMILNAQQINIQNSNFTSISNQNSNSALVQIQVSQNLLLDQINITNISIKEN
SFISILKSQQVVIQYIEAKYIYTKSKASTIYFEQIQQLIMKNNKFILNLSYLDGGAIYMN
QINEIDLINNTFQENQSQTGNGGAIYCYNSIFSKFESNNFIQNSCTSGSGGALQLNNCDI
QEMVENTFKQNKALIGGAFRYQGIQPKVLQKSNVSQRILTLSINQFIKNSAQLYGKDIGS
YPVLLDVKNQFDDDNRASKAKLENLQSGSTSTPILIRLIDEEMREVSFLKNTSNINQEIL
IEFGNYLLEVQSQQVGLDGNLRQNYNFDQFGFVFNVSYSYYPNSNSTILIKTVSTIPVLN
RTTFKFDEQELSLYIDVNFRKCQQGEILQAFQKYKICYTCQQGNYCLEDPDQNENLQCLK
CPLGSKNCHSNVIQLYNGFWSLSLNSDQIYQCINPQNCISEDPSNKFGCLQGYIGALCES
CDSHGTVWGKKYGKSNDGVQCQECIQQNQIYSIIILCLLLVMFCCYLIFQAHKQLEFLQK
KMSWFYLRKLKIMLLYSQNIRSNSQYIQILTNYLQFLALVNNLGIQKQEYLSVIEIGGGD
PSQHTVYSLDCFFNSLNIQLPLYAIRVLFINCQIIIIYLLMQLLNQLINMFKIEKDQFQI
SSFISVYLFFSSSVIKVLIQSLSCREISSKLYIIQEMQYECYTNQHNRIIFYLIGPLLLI
WFILIPFIFTLHLYRKRSKLQSLILLKKFGLLYQKYKEESYYWDLVRNQAKASLVIFLNL
IRTSPLLKSQYLQLLMFIYFRFLKIVSPYQRQQMNRIDQLSCKFVMLSIFLIQLIILTDN
SKFQQILQVILIVFNVYFIGILILLIVQKPIPQIAKNRNMYQIFLVQLSKLIPNSIYQVQ
YQKQVNILRINSLWKKVKSSLRQIIEFEADVKNQKWVQSKLSKTQELNKSKKLRTSHLQR
VHFQIEFQKSMNIDKNIK
NT seq
6177 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtaaatcaacatttaaaaatttaatttattaatcaatttgttataatatttaaagcaa
atttctacaaactgcatccctaacacgaattaatttagtgaagatttattgcatgggact
atcatatcgagaacatatcaattaattatattttataattaatttagtataagggtatat
tctttaaaagaataaatatacaaattgaactattactcatctcattttacagcttattct
gtatattttgatagatttagtagtataataatttttggagaatattttagctaagatttt
ttaatattaaatttaataacatacaaaatacaacctacccccttccctctatttaacaca
aaaaatttagaagactaatataagttttattttttttcagatcaaaaaagagtgatgctg
ctttcctcatatgtttctttcatacaaatatatgacttagatacctaagccagtccgtaa
actatttagctttaatactagtttaattagtagagtcaagtagttgttgatgaaaatctt
aatttagttatgtttatagataactaaaactaaattgaaatcatatcatatcaagctaat
caaattgttaagacatattaattggactatattaaaaatgaagtaaatgcatattaaaaa
gtattaatttgggatagctttaagagaaagatctttgtcagctcaaacaatatattttat
attttagactatgataacaataattttatttgcaaatactaatttcagcgaacaattttt
gatatttatataagctttaataaaaatcaaatttttgttacagactatttgaatttaaga
gtttttgactattctataatagagtttgattaaatcctaataccttagtatttaatacct
aaatttttacaaataaattaaaactaatacatattatttgatgatagttaatcaacaatt
aaaaatattgttcaaggagaagtaaaggactttaaatactttaattcactacatcatgca
cctttttacttcaatttttataataataatagctcatagttttatttaattacatttaac
tagctttatatattataaattagttcaactaagctaactacgatattttatcaattgctt
gactcttaaataatcacttttatcagtgaatctgattcagaagttctttttttaacataa
aagtaaactttatattgccttactaaaaatctaattaacccacaactaattgccttaaca
tatatctcaactggaataggagaatttataatgatcaacaatacttacttaatttatagc
tcaacgaaaaactcgagttaatggaataagataactctttaaaatacttagtctgattca
aatgcaattaaattagaacaatttatatttaatttagaaaaaaatgatacagttaaacaa
cttattaaaatagataatactttaagtgttataatgctaaccaaaaaatatatacaaata
attgatgcttaaacaggaaatatctaatagagtactttattagatttctaaaaccaatat
tcttaaatttatttcgatgccctttatggtagaattttatattcagataggattattgga
gtcaaggtatatgataatcaattataagcaattaaaagtagtttacctagttcaggtata
agattaaaaattaaagattccttcttatttatgctttcttttaattcagtgagtatatat
ttaagaaaagacctctaatttttttaagtaattagaaactttaacagtacccaatcacta
atcgatatagaatacacaggatataattatatctttcttttatattttgataaatagatt
actttcatgtaggtttcacctttctaataaccatagctagttgatattttatcagtaagt
aattatgtaatattatctaaataagtaaattagaagaattctgaatacttggtagttaat
atgactattttaacttttgagtacacaattgaatacatcactgagctaaatattggtgga
tattaaaataaattttgttctgcttaactacaaataaaaacaagttaaagtgatcaacta
acaaaaatgcaataaacagattatttaaatttactatcacttaaataacttttaatttag
aacattatttatagtttatacatagataatggtgaatagactgatttaatgtatcctttt
attagctctagctctgtaactacagattattcactcaaaatttaagcttaaaactctaat
agtatttatctaaaaactcaaaacagtacggattaaaacattgtagaactgtaacttaac
agtttaaaactttcattttaaaatataaataagacttaatacttatttggtaattagaca
ttctaaaaattagctaggctgtatttaaatgatattgaattattagaaatcggtaataat
tagctaatattttaaggaatagatcatatttttattacaaatctaattataaatggggaa
tcaatctaattatctaataataagacaatcattttctaagatattaattttgtaattgtt
taaaacattacattaataaattgctaatttagcaatatttttaatatattctcatttagc
aatataaattaattgattataagcaatctttatattagattaaacaagttagcttctatt
attaatcaaaattcacttataaatatctcaaatattaataatctcactataaacaatact
tatattttataaaattctatagaaaatgttgaaatatttaaaataaggaatgttactgaa
gttagcattaatagcatgatattttctgaaaactaaataattattaactaagatatcgat
ttgtaaggaatcatattctattttgaaacaatcccatatatttctataaatcaaattcaa
tttaacaaattgagcatttcttccatctcctctctttctctgctaaaattttcaaatatt
aattaaactttacaatttaaagatcttatttttaaatactctataatcagtgacaatcaa
aataactttgtatctaattaagagtattttattatagaatgtgaagggatagttttatcg
aatttctcaaacatctctataagtaattctgatagaataagctttgtttatatgcattaa
tagacaaacataaagggaattattatttataattaaatatctatcattagtaattactgt
cattataattcagatacaaatcaacttatgatactaaacgcataataaataaatatataa
aattccaattttacatctatttctaatcaaaattctaattctgctttagtttaaatttaa
gtcagctaaaatttgctattagattaaattaacataacaaatattagtattaaagaaaat
agctttattagcatcctaaaaagctagtaagtagtaatctaatatattgaagctaaatat
atttatacaaaaagtaaagcaagtactatttactttgagtaaatttaataattaatcatg
aaaaataacaaatttatcttgaacttatcttatttggatggaggagcaatatatatgaat
tagataaatgaaatcgatttgattaataataccttttaggaaaattaatcacaaactgga
aatggaggggcaatatactgttataatagtatcttttctaaatttgagagtaacaatttc
atatagaattcatgcacttcaggttcaggaggagctttgtaattgaataactgtgatatc
taagaaatggtagaaaatacattcaagtaaaataaagccctaataggaggagcttttaga
tattaaggaatataacctaaagttttacaaaaatctaatgttagctaacggatacttacc
ttaagtataaattaatttattaagaactcagcataattatatggaaaagatataggctcc
tatccagttttattggatgtgaaaaattaattcgatgatgataatagagcttcaaaagct
aaattagaaaatttgtaaagtggcagtacatctacaccaatattgatccgactaattgat
gaagaaatgagagaagtaagctttttaaaaaacacatcaaacataaattaggaaatccta
atagaatttggaaattatttgctagaagtttaaagttagtaagttggactagatggaaat
ctaagataaaattataattttgattaatttggttttgtctttaatgtatcttattcttat
tatcctaactctaattccactattctaatcaaaacagtaagcactattcctgttcttaat
agaacaacttttaaatttgatgagcaagaactaagtttatatattgatgtcaattttagg
aaatgttaataaggagagattttataagcttttcaaaaatataaaatatgttatacttgt
caataaggcaattattgcttagaagatccagactaaaatgaaaatttatagtgtttaaaa
tgtcctttgggttctaaaaattgtcattcaaatgtcatttaattatataatggattttgg
agtttaagtttgaactcagactaaatttattaatgcattaatcctcagaactgcatttct
gaagatccttcaaataaatttggatgtttacagggatatattggggctttatgtgaatcc
tgcgatagtcatggcactgtttggggaaaaaaatatggtaaaagtaatgatggagtttaa
tgttaagaatgcatttaataaaattaaatttattctattattattttgtgcttattattg
gttatgttttgctgctatttaatcttttaagctcataagtagctagaattcttataaaaa
aaaatgagctggttttatttgaggaaacttaaaattatgttgctttatagccaaaacata
aggagcaattcataatatatctaaattcttactaactatttacagtttttagcacttgtt
aataatttaggcatttaaaaataggaatatttaagtgttattgaaattggaggtggtgat
ccttcttagcatacagtttatagcttagattgtttttttaatagcttaaatatatagctt
cctttgtatgctattagagttttgttcattaattgctaaataattattatctatttattg
atgtaattactaaactagctaataaatatgtttaaaatagaaaaagattaatttcaaata
tcttcttttatatcagtttacttattctttagttcatctgtaataaaagtgctaatacaa
tctttatcttgcagagaaatatctagtaagttatatataatttaagaaatgcagtatgag
tgctatactaattaacacaatcgcattattttctacttaataggacccttgcttttgata
tggtttatattaattccatttatttttactttgcatttgtacagaaaaagatcaaaatta
taaagcttgatattattaaagaaatttgggcttctgtattaaaaatacaaagaagagtct
tattattgggatttagtaagaaactaagcaaaggcttcactagttatatttttaaatttg
attagaacttcaccgttgctgaaatcttaatatttataacttctaatgtttatttacttt
agatttttaaagatagtaagtccatattaaagacagcaaatgaatagaatagattaacta
tcttgtaaatttgttatgttgagtatattcttaatatagttgataatacttacagataat
tcaaaattttaacaaatattgtaagtaattttgattgttttcaatgtttatttcatagga
atcctaattttactgattgtacaaaaaccgattccctaaattgcaaaaaacagaaatatg
tattagatattcttagtttaattgtcaaaactaatacctaattctatatattaagtttaa
tattaaaagcaggttaatatattgaggataaactctttatggaaaaaagttaaaagctcc
ttaagataaattattgaattcgaagcagatgttaaaaattaaaaatgggtttaatcaaag
cttagtaagacataagaattaaataaaagcaaaaaattaagaacaagtcatcttcaaagg
gtacatttctaaatagaattttagaaaagtatgaacatcgataaaaatataaaatga
DBGET
integrated database retrieval system