Tetrahymena thermophila: TTHERM_00732830
Help
Entry
TTHERM_00732830 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Orf78
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7847098
NCBI-ProteinID:
XP_001023681
TGD:
TTHERM_00732830
UniProt:
Q245C8
LinkDB
All DBs
AA seq
1442 aa
AA seq
DB search
MQQLSSQCHNITSTIQTILMFDNKKYSFSLMNSYSLLKIVAIYKAYVNNQIRQSIQYELK
AADLVKREACSNSELITNSDIIKGNVVTIQASFLKAKGKIINSNKEKITSFFGYKLEEEQ
RIQNLNDIIPSFINKIHPQLMNNLIIKGYSPYINQNLHTYSINKQGFIFPINLKFDYINT
IKDDFVLNGCIQKYDNLNEYILIDSLGFIQGVTEQIYHQIFDFAKNMKTNTLKQQNNSVQ
KLNLEQIIDKINIFYIMPSLFQYIQTQSSNQIKSFQSLKSVDDFSKSNFNYENQLNNQKA
IITLPINLQKISNQLNENRKKNQPQSIPERGDKLLNQSQLNDLSGEQNFFHKYQLYFEKN
RQFWSDQNSLNKLIIQFNIIEKQFTYMVNDLEQVSQKYYVLEINDISQLDIQIPKLEEQS
TQSNSLTHKSQAMENEIVSLKIRNRVESFMQNPSQLQIPILTNNNSTPLLSFTRGQEDSD
TFKGGYDTFRIDEIERSYSKRLIKPVVVNTMEQHHNQGNTTNTILGGIQQIYFNQDKSLV
SAQKNEFSFESESHQSSIKKAEIEERQGIGSFIAKDFKNQENQAYQYDGNNISQSELQIQ
IINSLQSPTNRDKYFTLNNLISPKSPNEILLPTYQKAEGDDANKIVTQVENDIYSYRNGR
SSFSQIEIPESPIKLYKNQSSILNISDINLMEQNSIRKSRNKSSKRQTITFNMTESSKSN
KQQETSLLWKRVSLNKQATVFKFNSGGINEILQHQFSEVSKDDKTQVSNQRVSDLLKSED
QKEDNINNKYIIKNQPSITTLSSFTKCTDNDVIQSIAFKKNPRIINLLNLVLIGRFTIIL
FLLLSASIILIVDAQQLIDDFGLIQKFKSSYQLYIQEFITGLNLFGMNDGSIYSSEITQK
YQSSLQQQIYQFGEDFSDMAKQNSILYSLYLSNSNLQPINTVIYSGQQFNFQAAVQPLEF
VMKTFNALLSLAFSSDRSNIEGLFYLVANSLSSLQTFQSLEEQFSDSFYDTYSNLSERYI
ICGIIVGSTLICIFVITQFFLCQLARYQEKIIFLVTKLDLNDVQYEISKLSNCYTALNKE
NDQWLSINFSNIMFQFNYKKNIEDISLSYKIQEKNTKGDKKQSKKQKQNQQIQNQGKNKS
NLQFSSTIQGQSVSTVKFQLLLTVVLVLCLILFTVILTLSYNKSLKMNPSITLQKKTTQL
IYATNTALLFTDLLSVKQMTQNQYFPQIQTSQYISVSLQSVNVIRNYINSFVTYTENIGN
YDQNFQSDLNDYFSSDLCNLYDSNQFCTDTANIDYQIRRSFVSSGLSGLFSRYNQYFGNI
ISALTNQNSSQAKSEIYNFMNSYDYEILILQGFQLPMLSLKDFLDLINQNIINTANSLKN
TEIIYYIIFCSIFLVMLLAIDSKVRQQIIEQVSKLNFSLTFIPIHKQHEEVMIQMLKQIN
NS
NT seq
4329 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtagtaactaagttcataatgccataacataactagtactatttagacaatacttatg
tttgataacaaaaaatactccttcagtttgatgaatagctattctttattgaagatagta
gctatttacaaagcttatgtcaacaattaaataagacaatctatttagtatgaactgaaa
gcagcagatttggtaaaaagagaagcttgcagtaattctgagcttataacgaattctgat
attatcaaaggtaatgttgtaaccatacaagcaagttttctgaaagcaaaagggaaaata
ataaacagtaataaagagaaaatcacaagcttttttggttacaaattagaagaagaataa
agaatttaaaatctaaatgatattattccttcatttattaacaaaatccatccacaattg
atgaacaatctaattattaagggatattctccatacataaattaaaatttgcatacttac
tctataaataaataaggatttattttcccaattaacttaaaatttgattatataaacaca
attaaggatgactttgtgcttaatggatgcatccaaaaatatgataacctaaatgaatat
attcttatagattcactaggatttatttaaggtgtaactgaataaatctaccactaaata
ttcgattttgccaaaaatatgaaaacaaacacactaaagcaataaaataactctgtataa
aaattgaaccttgagcaaataattgataaaattaatatcttttatatcatgccttcctta
tttcaatatatctagacgtaatcttccaattaaataaaatcttttcaatctctaaaaagt
gttgatgatttttctaaaagcaactttaattacgaaaattagctcaataactaaaaggca
ataattactctgcctattaatttataaaaaatatcaaattaattaaatgaaaacagaaaa
aagaatcagccttaatctatacctgaaagaggagacaaattattgaaccagagctaactt
aatgatttgtctggagaacaaaattttttccacaaatattaactttactttgaaaagaac
agatagttttggagtgactaaaatagcctaaataaattaattatacaatttaatataata
gaaaagcagtttacttatatggttaatgatttagaataagtgagctaaaaatattatgtc
ttagaaataaacgatattagttagcttgatatttaaattccaaagcttgaggaatagtca
acttagagtaatagcttaactcataaatcataagcaatggaaaatgagattgttagcttg
aaaataagaaatagggtagaaagttttatgtaaaatccttctcaattgtaaatacccatt
ttaaccaataataactccactccattactgagtttcacgagaggctaagaagattctgac
acttttaaaggtggttatgacacttttcgtatagatgaaatagaaagatcttattcaaaa
agacttataaaaccagtagttgtaaatacaatggaatagcatcataattaaggaaataca
acaaatactatcttaggaggtatttagtaaatatattttaactaagataaaagtttagtc
tctgcataaaaaaatgaattttcatttgaatcagaaagccactaaagctctattaaaaaa
gcagagatcgaggaaagatagggaataggctcgtttatagcaaaggactttaaaaattaa
gaaaatcaagcttattaatatgatggaaacaatatttcttagagtgagttacagatatag
attattaactctcttcagagtcccactaatagagataaatactttacattaaataattta
attagtcctaaatcaccaaatgaaatattgctaccaacttattagaaagcagaaggagat
gatgcaaataaaatagttacttaagtagaaaatgatatttattcttacagaaatggaaga
tcatcattttcacaaatagaaataccggaatctcctataaaattatataaaaattaatca
agtattttaaatataagtgatattaatttgatggaataaaacagcattagaaagtcgaga
aataaatctagcaaaagataaacaataacatttaacatgacagaatctagcaaatctaat
aaatagtaagaaacctctttattatggaaaagagttagtttaaacaaataggcaactgta
tttaagttcaattcaggtggtataaatgaaatcctttaacattaattctcagaagtttct
aaagacgacaaaacttaagtctcaaattagagagtttctgatttattaaaatctgaagac
taaaaagaagataatataaacaataaatatataattaagaattaaccatctataacaaca
ctttcttcttttactaaatgtaccgacaatgatgtaatttaatcaatagcattcaagaaa
aatccaagaattatcaatcttttaaaccttgtattaattggtcgttttacaattattctc
tttttactgctctctgcatctattattttgatagtagatgcttagtagcttattgatgac
tttggactaattcagaaatttaagagtagctactaactttatattcaagagtttataaca
ggcttaaatctttttggcatgaatgacggatcaatatatagctctgaaattacttaaaaa
tactagtcaagtttatagcaataaatttatcaatttggagaagatttttctgatatggca
aagtaaaattcaatactgtattctctttatctttcaaacagtaacttataacctattaac
acagtgatttacagtgggcagtaatttaatttttaggctgctgtataacctttagagttt
gttatgaaaacatttaatgctttgctctcacttgcattttcttctgaccgctcaaatatt
gaagggcttttctatttagttgctaattctctatcttctcttcaaacttttcaatcttta
gaagaataattttcagacagtttctatgatacttattcaaatttaagcgagagatatatt
atttgtggaattattgtaggatctactctaatttgcatatttgtcataacttaattcttc
ttatgctaattagctagataccaagaaaaaattatttttttagttactaaactagaccta
aatgacgtttaatatgaaatcagcaagctgtctaactgttacactgctttgaataaagaa
aatgattaatggctatcaataaattttagcaatataatgttttaatttaactataaaaaa
aatattgaagatatttcactttcttataaaatacaagaaaaaaacacaaaaggtgataaa
aagcaatcaaaaaaataaaaacaaaatcaataaatataaaattaaggcaagaataagtca
aatctataattttcttctacaatctagggttagtcagttagtactgtaaaattttagctt
ttgctgactgttgttcttgtactatgtttaatattgtttactgtaattttgacactatct
tacaacaaaagtttaaaaatgaatccaagtataaccttgtaaaaaaagactacatagctt
atctatgcaactaacacagctttgctattcactgatttgctttctgtgaaatagatgact
taaaattaatactttccataaattcaaacttcatagtatatatcagttagtttgtaaagc
gtaaatgtaattagaaattatattaactcatttgtgacctacacagagaatataggaaac
tatgactaaaatttttagagtgatttaaatgattattttagttctgatttgtgcaattta
tatgactcaaattaattctgtaccgatactgcaaatatagattattaaataaggagatcc
tttgtttcttctggtttgtcaggacttttctcaagatataattaatattttgggaatata
ataagtgcattaacaaatcaaaatagttcccaagctaaatctgagatatacaacttcatg
aatagttatgattatgaaatacttattttacaaggattttagcttcctatgctgtcttta
aaagactttttagacttaattaactaaaatatcatcaatacagctaattctttgaaaaat
actgaaattatatactatattatattctgctctatttttttggttatgcttttagcaata
gatagcaaagtaagatagcaaataatagaataagtctctaaactaaatttctctctaaca
tttattccaattcataagcagcatgaagaagtaatgatacagatgctcaaataaattaat
aattcttga
DBGET
integrated database retrieval system