Tetrahymena thermophila: TTHERM_00773300
Help
Entry
TTHERM_00773300 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3970
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7830238
NCBI-ProteinID:
XP_001031583
TGD:
TTHERM_00773300
UniProt:
I7LSY8
LinkDB
All DBs
AA seq
1556 aa
AA seq
DB search
MWQLFNQNKKIKNLNQLDQIIRLELFNEKQNIKQIESQLINLLSLNAQNQEYDSLKNECL
KIQNYELNISASFEVNMEINKIKSTLCSEYQRVYNQQGEKNEKYLFLLSLVEFFKNYKVY
WITYMRFFQLKEIGIKDKQIANSIHQKFVKFKKQCEQSIAYQQKEKIVYGDLNHQEQQIS
ENQNLFYNGFLKILTYEEIVQETYNQIQNASNLKLEVLSIMKNKDVNVKELLCLATELDL
QVRRVRINLKAISELNYSNSQLYDLKIFYLNTIAFCEDEVSFASQNQRIHHMKYIEIKEE
QNILQKGQCVLFCTINDKQSVLIKKASQQIQRIFGISQKYAYNKSISILMPNSIGAIHDD
IIFQYFNIAKQQSNYFEENKKKNDQQYNLMEQNLIFAQVNHFKTNLIVTPVKISLQLNQF
LERSESSKGLIQNFGFTAEIKDINEKNQLDYILYFTDTLLVQGITKNLYYFLFNINPQIF
SQANYINISELFPFLSEQFGFSSYASQNLNNLNAYFKLLQSQIITDSLRLKQKYEIQKIE
FPMIQKKFQHVCLIINYQNLQQNLKQLAYKMLNINQLSEIILEQITFVSMEIQLVNPKYQ
YFKNLQYLEVSKLIILNPLNKNNEIIEHLLNNLNNYLGVYSFEFIEFLIFILQNSTNQNL
EKVLEREIDLSCLLDIQKQNEINQQKSHISKQQIDLNVQNRDNGEPIQQILNLDERTMSE
SYQKQSKQNLERKDVYAKNNIDIKSSNQIYLNEEISTRGYLYSIDSPSLLNQHKQQQQFQ
IDSLGNRKQFGKNTKVNSQINLNSQRQKNTIDNQQQTQITKNISSFQSLDKQFDQTQRCQ
LQFSSRLKSQESSLQLSPKSHEKLFALNCNKQAYFQKHEDYKFNQQSKGSSIQEEDETKQ
SIGLDEEENHKKLKRKLEEQIEIESQKSKESQLAHSKGRLQRYLNNNQSSNVISMTKIIG
LLSYFVMIGLTIFLFIQVITVAQNSFSNSSYFVWPMKYSSNLSQIFKTQNLALLLSFKEI
QTPSFQNQNQKNAYIQNLKYQLNSTLLQSFMQYISSVEHIGAKQTVFSLMNDNKLIFWLG
KYYDPKNLVGSNSIPNTFPYVALNISVVYSDTLISSTVFRYIAGLGNGRPEFYSSKNIQT
LVTTLTSIQNKMLQQQKSKDDTIDQQLIIYMTTVIVISFLCIATIQPLYWYIQNQRQIIL
GLFTTFPVEQLDTMILQVNQAQEHHRNKISQTLKQPPKKIENRSEIKKQTIGRISNLQKL
SWALMIVMLFIYFLILINPILNKINTTSYLNSVENISYTGQLIYEVQAYILESLSINYLS
LILKLRPNLKPMQLSQYQDYLQDLLQRSQQIQSNLYYLIQNQYTIKSYNSQDFDDFFFKI
LEGDICDTLNKYKKYQTDYIASQSQSCYSIHQGLLSQGLNTSFKNLISILPELHNLLQQN
NQINIDKALNQFNQDYDLKQFNDFEEFIVETISSIGLFLNDLSQQNYDNFIRFQTIILIY
QLILLSTIFLVFWIRFGGFLNSQLIRTKKLLRIIDLNNLLQNQYICLYFKNCMKSF
NT seq
4671 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggtagctctttaatcaaaataaaaaaataaaaaacttaaattaacttgactagatt
attagattagagttatttaacgaaaagcaaaatattaaataaatagagagctagcttatt
aacctacttagtttaaacgcacagaattaagaatatgattcccttaaaaatgaatgctta
aaaatataaaattatgaactaaatatttctgcttcctttgaagtaaatatggaaataaat
aaaatcaaaagtactttgtgctctgaatattaaagagtttataattaataaggggagaaa
aatgaaaaatatctttttttactatcattagtagaattttttaaaaattacaaggtttat
tggattacttatatgcgcttcttttaattaaaggaaatagggatcaaggataaataaatt
gctaattctatccatcaaaaatttgttaaatttaaaaaatagtgtgaatagtctattgca
tattagcaaaaagaaaaaattgtctatggtgatttaaaccattaagaatagcaaatatca
gaaaatcaaaatcttttttacaatggatttttaaaaatattgacatatgaagagatagtg
taagaaacatacaattaaatttaaaatgcttccaatttgaagctagaggtactaagtatt
atgaagaataaagatgtcaatgttaaagaactcttatgtttggcgactgagttagactta
caagtgaggagagttagaataaatttaaaagcaatttcagaactgaattactctaattcg
taactttatgatttgaaaatattttacttgaacacaatagcattttgtgaagatgaagtt
agttttgcatcataaaatcaaaggattcatcatatgaaatatatagaaatcaaagaagaa
taaaatattctgtaaaaaggccagtgcgttttgttttgcacaattaacgataaatagagt
gttctaataaagaaagcatcttaataaatttaaagaatatttgggataagttaaaaatat
gcttacaataaatctatatctattttgatgcctaattcaataggtgcaattcatgacgat
attatatttcaatattttaatattgctaagtaacaaagcaattactttgaagaaaataag
aagaaaaatgattaacagtataatttaatggaatagaatttaatatttgctcaagtaaat
cattttaaaacaaatcttattgttactcctgtcaaaatatctttgcagctaaactaattt
ttagaaagaagtgaatcatcaaaaggattaatacaaaactttggatttactgctgaaatt
aaagatataaacgaaaaaaactaattagattacattctctactttacagatactctttta
gtttaaggaataacaaaaaatctgtactactttcttttcaatattaatccttaaatattt
agttaagctaattacataaatatctctgaattatttccttttttgagtgaatagtttgga
ttttcttcatatgctagctaaaacttaaataatttgaatgcctattttaaactattacaa
agttaaattataactgattcgctacgattaaaataaaaatatgaaattcaaaaaattgaa
tttccaatgatataaaaaaaattttaacatgtctgcttaattataaattactaaaattta
taataaaatttaaagtaacttgcttataaaatgctaaatataaattaattatcggaaatt
attttagaataaattacttttgtctctatggagatccaactagttaacccaaaatattaa
tactttaaaaatttgtaatacctagaagtatcaaagttgataattcttaaccctttaaat
aaaaataatgagattatagagcatcttttaaataatctcaataattacttgggtgtttac
tctttcgaatttattgaatttttgattttcatcttataaaacagcacaaattaaaattta
gaaaaagttttagaaagagaaatagatttatcttgtttattagatatataaaaataaaat
gaaattaatcaataaaaaagtcacatttcaaaatagcaaattgatttgaatgtctaaaat
agagataatggtgagccgattcagtaaattctaaatttggatgaaagaacaatgagcgaa
tcttattaaaagtaatctaaataaaatttagaaagaaaagatgtttatgcaaaaaataat
attgacatcaaatcttctaattaaatttatttaaatgaagagatttctaccagaggatat
ctttactcaatcgatagtccatctctacttaatcagcataaataataataataattccaa
attgactcattaggtaatagaaagcaattcggaaaaaacacaaaagtaaactcttaaata
aatctaaattcctagagatagaaaaacacgattgataattaatagtaaacttaaataaca
aagaacatatctagttttcaatcactagacaaacagtttgaccaaacttaaagatgctaa
ttataattttcaagcagattaaaatcataggaaagtagcttataacttagcccaaagagt
catgaaaaattattcgctctaaactgtaataaacaggcatatttttaaaaacacgaagat
tataaatttaattaataatcgaaaggttcaagcatttaagaagaagatgaaacgaaataa
tcaataggattagatgaagaagagaatcataaaaaactgaaaagaaagttagaagaataa
atagaaattgaatcttaaaaatcaaaagaatcttaacttgcacactccaaaggaagattg
cagaggtatctgaacaataattaatcatctaacgttatttctatgaccaaaattattggt
ttacttagctactttgttatgataggattaactatatttttattcatctaagtcattacc
gtagcacaaaactcatttagcaatagcagttattttgtttggcccatgaaatactcttct
aatttatcttaaattttcaaaacttaaaacttagctttgctcctttcatttaaagaaata
taaactccctcttttcaaaattaaaactaaaaaaatgcctacatctaaaatttaaaatat
tagcttaattctaccctgttataaagttttatgcagtacatcagcagtgtagaacatata
ggtgcaaagtaaacggtttttagcttaatgaatgataataaattaatcttttggcttgga
aaatactatgatccaaaaaatctcgttggctcaaattctatacctaacacctttccttat
gttgccctaaatatttctgttgtttacagtgatacgctgatttcttctacagttttccgt
tatatcgctggattaggaaacggaaggcctgaattttattcttctaaaaatatttagact
ttagtaacaactttgacaagtattcaaaacaaaatgctttaataacagaaaagtaaggat
gacacaattgatcaataattgataatttacatgactacagtcatcgtcatttctttttta
tgtatagccactatatagcctttatattggtacattcaaaactaaaggcaaattattctt
gggctatttacaaccttccctgttgaatagttagatactatgattttacaagttaatcaa
gctcaagaacatcatagaaataaaatttctcaaacattaaaatagccaccaaaaaaaata
gaaaaccgcagtgagattaaaaagtagacaataggtagaatttcaaatttataaaaatta
agctgggcactcatgatagtgatgctatttatctattttttaatcttaatcaatcctatt
ttgaataaaattaatactacaagctacctcaattctgttgaaaatatctcttacactgga
taattgatctatgaagtctaagcgtacatacttgaaagtttgtctataaattatttaagt
ttaatattaaagctaagacctaacttaaaacccatgcaacttagttaatattaagattat
ttataagatttgctataaagaagctaataaatacaaagtaatttatattacctaattcaa
aattaatatacaataaagagctataattcttaggattttgatgacttctttttcaaaata
ttggaaggagacatttgtgatactctgaataaatataagaaatattaaactgattatata
gctagttaatcataatcttgttacagtattcaccaaggtttgctttcgtaaggtctaaac
acttcatttaaaaatttaatttctattcttcctgaattgcataacttgctccagcaaaat
aattaaatcaacattgataaagctttaaactagtttaattaggattacgatcttaagtaa
tttaatgattttgaagaatttatagtagaaacaataagttcaattggactttttttaaat
gatctgagtcaataaaattatgataattttattagatttcaaactattattttaatttat
taattgattttgctctccacaatttttttggttttttggataagatttggaggtttttta
aatagccaactaatacgcactaaaaaacttttaaggataatagatttgaataatttattg
taaaattaatacatatgtttatactttaaaaattgtatgaaatcattttga
DBGET
integrated database retrieval system